U1 представляет собой компонент малой ядерной РНК (мяРНК) сплайсосомы и участвует в сплайсинге пре-мРНК .
Сплайсосомная РНК U1 дрожжей | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | U1_yeast |
Рфам | RF00488 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Джин ; мяРНК ; сращивание |
Домен (ы) | Эукариоты |
ИДТИ | GO: 0000368 GO: 0030627 GO: 0005685 |
ТАК | ТАК: 0000391 |
Структуры PDB | PDBe |
В процессе сплайсинга 5'- конец мяРНК U1 образует комплементарную пару оснований с 5'-сплайсинговым соединением интона, подлежащего вырезанию, тем самым определяя 5'-донорный сайт интрона.
Существуют значительные различия в последовательности и вторичной структуре между мяРНК U1 многоклеточных животных и дрожжей, причем последняя намного длиннее (568 нуклеотидов по сравнению с 164 нуклеотидами у человека). Тем не менее, предсказания вторичной структуры подтверждают, что все U1 snRNAs имеют "общее ядро", состоящее из спиралей I, II, проксимальной области III и IV. [1] [2] вторичная структура модель показывает предсказание структуры для больших последовательностей дрожжей.
Рекомендации
- ^ Zwieb С (1997). «База данных Урна» . Nucleic Acids Res . 25 (1): 102–3. DOI : 10.1093 / NAR / 25.1.102 . PMC 146409 . PMID 9016512 .
- ^ Крецнер Л, Крол А, Росбаш М (1990). «Вторичная структура малой ядерной РНК Saccharomyces cerevisiae U1 содержит как универсальные, так и дрожжевые домены» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (2): 851–5. DOI : 10.1073 / pnas.87.2.851 . PMC 53364 . PMID 2405391 .