Апостольский нунций в Баварии — бывший церковно-дипломатический пост Святого Престола, представлявший интересы Папства в католической Баварии — государства, которое, последовательно входило в состав Священной Римской империи, имело собственный суверенитет, а затем было частью Германской империи, Веймарской республики, и, наконец нацистской Германии. Резиденция Апостольской нунциатуры в Баварии находилась в Мюнхене с 1785 года по 1936 год. До этого, была одна Апостольская нунциатура в Священной Римской империи, также был Апостольский нунций в Кёльне, аккредитованный при архиепископах-курфюрстах Кёльна, Майнца и Трира.
Новая Апостольская нунциатура была учреждена Папой Пием VI в Мюнхене в 1785 году, по просьбе Карла Теодора, курфюрста Баварии.[1] Назначение Джулио Чезаре Дзольо апостольским нунцием возмутило курфюрстов-архиепископов Кёльна, Майнца и Трира, которые рассматривали апостольского нунция в Кёльне быть подходящим для всей Империи.[1] Иосиф II, император Священной Римской империи занял сторону курфюрстов, и заявил, что он признает нунциев, только, в их «политическом характере».[1] Таким образом, существовало два нунция: один в Кёльне, и один в Мюнхене, разделение юрисдикции которых стало делом раздоров.[1]
Последнему апостольскому нунцию в Кёльне, Аннибале делла Дженга, при курфюрстах-архиепископах Кёльна, Майнца и Трира оккупированных Францией в 1795 году и ликвидированных в 1803 году, соответственно, пришлось проживать в Аугсбурге, который был присоединён к Баварии в 1803 году. С роспуском Империи в 1806 году Бавария получила полный суверенитет, а традиция апостольского нунция в Кёльне была продолжена апостольским нунцием в Австрии, в Вене, правомочным лишь для Австрийской империи.[1]
В 1800—1818 годах апостольская нунциатура в Мюнхене была закрыта, из-за давления Наполеона на Святой Престол. Тем не менее, после подписания Баварского конкордата 1817 года, взаимоотношения были возобновлены в 1818 году. Таким образом Австрия и королевство Бавария сохранили свои отдельные отношения с Папой, а также после того, как они оба присоединились к Германскому союзу в 1815 году, который не был государством, но был лишь Конфедерацией. В то же время преобладающие лютеранские или кальвинистские немецкие государства в рамках Германского союза, упраздненного в 1866 году, не имели дипломатических отношений со Святым Престолом.[1] Ни одно из государств Северогерманского союза, конфедерации без Австрии и Южной Германии, не имели отношений со Святым Престолом. Когда большинство немецких государств, кроме Австрии, объединились с Северогерманским союзом, в целях формирования единой Германской империи, в 1871 году, Бавария была единственным государством-членом с апостольской нунциатурой.