Станица расположена в Сальских степях, в 90 км от Ростова-на-Дону. Площадь её территории — 12,36 км².
Через станицу проходит железнодорожная линия Батайск — Сальск, на которой расположена железнодорожная станция Мечётинская, входящая в состав Ростовского региона Северо-Кавказской железной дороги.
Во время второго Кубанского похода, в июне 1918, в станице Мечётинской умер генерального штаба генерал-лейтенант Сергей Леонидович Марков, один из лидеров Белого движения на Юге России и организаторов Добровольческой армии.
С 1924 по 1960 годы станица была районным центром упразднённого Мечётинского района Ростовской области.
В сентябре 1960 года район был упразднён и вместо него был образован Зерноградский район Ростовской области и райцентр был перенесен из Мечётинской в Зерноград.
На данный момент станица является вторым по площади и по населению населенным пунктом Зерноградского района. Станица Мечетинская — старейший населенный пункт Зерноградского района.