Томская православная духовная семинария — высшее специальное ученое заведение Русской православной церкви, готовящее священнослужителей, регентов церковных хоров и псаломщиков.
Открыта 21 сентября 1858 года стараниями епископа Парфения (Попова). Первоначально не имела своего помещения и располагалась в архиерейском доме, но заботами Макария (Невского) в 1899 году она перешла в специально построенное для неё в 1896—1899 годах здание на Никитской улице (ныне улица Никитина, 8) по проекту А. Морозова при участии Ф. Гута.
Открытый 3 октября 1899 года семинарский комплекс стал украшением Томска, включал в себя храм Святителя Иннокентия Иркутского (освящён в 1900 году), общежитие, учебные классы, больницу, столовую, баню, электростанцию, гимнастический зал, кегельбан, спортивную площадку для игр в мяч, зимой заливался ледяной каток; работали местная система отопления, водопровод.[1] В пойме протекавшей тогда неподалёку речки Игуменки (ныне зарыта) был устроен сад.[2] В 1910 году в саду была устроена пасека, при которой в летнее время проводились занятия по пчеловодству для учителей сельских школ.
В марте 1920 года семинарский комплекс был реквизирован, его помещения и бывший Семинарский сад последовательно отходили 25-й Томской пехотной школе командного состава РККА (1920—1925), артиллерийской школе (1925—1928), Томскому артучилищу (ТАУ, 1928—1945), ТОКЗАУ (Томскому ордена Красной Звезды артиллерийскому училищу), Томскому ордена Красной Звезды зенитно-артиллерийскому училищу и, наконец, с середины шестидесятых — Томскому высшему военному командному училищу связи (до марта 1999), затем — Томскому военно-медицинскому институту (1999—2010).[2] Был утрачен Cеминарский сад, пересыхающую реку Игуменку засыпали.
С момента закрытия ТВМИ в 2010 году комплекс стоял заброшенным[3]. В 2012 году архиепископ Томский Ростислав (Девятов) обратился в мэрию о возврате бывшего здания семинарии в собственность епархии[4]. Комплексу был придан статус объекта культурного наследия[5], а в 2013 году комплекс был передан администрации Томска[6].
12 февраля 2016 года главное здание пострадало в сильном пожаре (были уничтожены все три этажа)[7], что грозило полным разрушением комплекса[8].