Расположена в 14 км к юго-востоку от Фатежа на правом берегу ручья Никовец, притоке Руды. Высота над уровнем моря — 215 м[2][3].
Алисово, как и весь район, расположено в поясе умеренно континентального климата с тёплым летом и относительно тёплой зимой[4] (Dfb в классификации Кёппена).
Деревня Алисово, как и вся Курская область, находится в часовой зоне МСК (московское время). Смещение применяемого времени относительно UTC составляет +3:00[5].
Вплоть до начала XVIII века на территории Алисово, а также в соседних деревень Шуклино и Кромская, стояли заградительные сторожевые отряды, охранявшие русские земли от набегов ногайцев и крымских татар[6]. В XIX веке деревней владели помещики Ребиндеры[7].
По состоянию на 1955 год в деревне находился центр колхоза имени Калинина[8]. До 2010 года входила в состав Любимовского сельсовета.
Алисово находится в 12 км от автодороги федерального значения М2 «Крым» (Москва — Тула — Орёл — Курск — Белгород — граница с Украиной) как часть европейского маршрута E105, в 13 км от автодороги регионального значения 38К-038 (Фатеж — Дмитриев), в 3,5 км от автодороги межмуниципального значения 38Н-679 (38К-038 — Солдатское — Шуклино), на автодороге 38Н-680 (38Н-679 — Алисово), в 31 км от ближайшего ж/д остановочного пункта 552 км[12] (линия Навля — Льгов I).