| Acinetobacter | |
|---|---|
 | |
| Acinetobacter baumannii | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Протеобактерии |
| Учебный класс: | Гаммапротеобактерии |
| Заказ: | Pseudomonadales |
| Семья: | Moraxellaceae |
| Род: | Acinetobacter Brisou & Prévot 1954 г. |
| Разновидность | |
Acinetobacter albensis [1] | |
Acinetobacter является родом из грамотрицательных бактерийпринадлежащих кширокому классу гаммы-протеобактерии . Acinetobacter видов являются оксидаза-отрицательным , проявляют подергивание моторики , [2] и происходят в парах при увеличении.
Они являются важными почвенными организмами , где они способствуют минерализации , например, ароматических соединений . Виды Acinetobacter являются основным источником инфекции у ослабленных пациентов в больнице, в частности, виды Acinetobacter baumannii .
Описание [ править ]
Виды родов Acinetobacter являются строго аэробными , неферментирующими , грамотрицательными бациллами . В основном они демонстрируют коккобациллярную морфологию на неселективном агаре. В жидких средах преобладают палочки, особенно в период раннего роста.
Морфология видов Acinetobacter может быть весьма изменчивой в клинических образцах человека, окрашенных по Граму, и не может использоваться для дифференциации Acinetobacter от других распространенных причин инфекции.
Большинство штаммов Acinetobacter , за исключением некоторых штаммов A. lwoffii , хорошо растут на агаре МакКонки (без соли). Хотя официально они классифицируются как не ферментирующие лактозу, они часто частично ферментируют лактозу при выращивании на агаре МакКонки. Они отрицательны по оксидазе , положительны по каталазе , отрицательны по индолу, неподвижны и обычно отрицательны по нитратам .
Бактерии рода Acinetobacter, как известно, образуют внутриклеточные включения полигидроксиалканоатов при определенных условиях окружающей среды (например, при недостатке таких элементов, как фосфор, азот или кислород в сочетании с избыточным поступлением источников углерода).
Этимология [ править ]
Acinetobacter - сложное слово из научного греческого языка [α + κίνητο + βακτηρ (ία)], что означает неподвижный стержень. Первый элемент acineto- появляется как несколько барочная интерпретация греческой морфемы ακίνητο-, обычно транслитерируемой на английском языке как akineto- , но на самом деле происходит от французского cinetique и был принят непосредственно на английский язык.
Таксономия [ править ]
Род Acinetobacter включает 38 правильно названных видов. [3]
Идентификация [ править ]
Идентификация видов Acinetobacter затруднена из-за отсутствия стандартных методов идентификации. Первоначально идентификация была основана на фенотипических характеристиках, таких как температура роста, морфология колоний , питательная среда, источники углерода, гидролиз желатина, ферментация глюкозы и другие. Этот метод позволил идентифицировать A. calcoaceticus – A. baumannii за счет образования гладких округлых слизистых колоний при 37 ° C. Близкородственные виды не могли быть дифференцированы, а отдельные виды, такие как геномные виды A. baumannii и Acinetobacter 3, не могли быть идентифицированы фенотипически.
Поскольку рутинная идентификация в лаборатории клинической микробиологии пока невозможна, изоляты Acinetobacter делятся и сгруппированы в три основных комплекса:
- Комплекс Acinetobacter calcoaceticus-baumannii : негемолитический, окисляющий глюкозу ( A. baumannii можно идентифицировать с помощью типирования OXA-51)
- Acinetobacter lwoffii : негемолитический глюкозотрицательный
- Acinetobacter haemolyticus : гемолитический
Различные виды бактерий рода в этом могут быть идентифицированы с использованием флуоресцентно-лактозы денитрификации , чтобы найти количество кислоты путем метаболизма из глюкозы . Другой надежный идентификационный тест на уровне рода - анализ трансформации хромосомной ДНК. В этом анализе естественно компетентный ауксотрофный мутант Acinetobacter baylyi по триптофану (BD4 trpE27) трансформируют тотальной ДНК предполагаемого изолята Acinetobacter, и смесь для трансформации высевают на агар для инфузии сердца мозга. Затем рост собирают после инкубации в течение 24 часов при 30 ° C и высевают на Acinetobacter.минимальный агар (AMA) и инкубирование при 30 ° C в течение 108 часов. Рост на AMA указывает на положительный анализ трансформации и подтверждает принадлежность изолята к роду Acinetobacter . E. coli HB101 и A. calcoaceticus MTCC1921T могут использоваться в качестве отрицательного и положительного контролей соответственно. [4]
Некоторые из молекулярных методов, используемых при идентификации видов, включают повторяющуюся экстрагенную ПЦР на основе палиндромных последовательностей, риботипирование, гель-электрофорез в импульсном поле (PFGE), случайную амплифицированную полиморфную ДНК, полиморфизм длины амплифицированных фрагментов (AFLP), рестрикционный анализ и анализ последовательности тРНК и 16S- Спейсеры гена 23S рРНК и рестрикционный анализ амплифицированной 16S рибосомной ДНК (ARDRA). PFGE, AFLP и ARDRA - это проверенные общепринятые методы, используемые сегодня из-за их отличительной способности. Однако самые последние методы включают мультилокусное типирование последовательностей и мультилокусную ПЦР и масс-спектрометрию с ионизацией электрораспылением, которые основаны на амплификации высококонсервативных генов домашнего хозяйства и могут использоваться для изучения генетического родства между различными изолятами. [5]
Хабитат [ править ]
Виды Acinetobacter широко распространены в природе и обычно встречаются в почве и воде. [6] Их способность выживать на влажных и сухих поверхностях, а также выдерживать воздействие различных распространенных дезинфицирующих средств позволяет некоторым видам Acinetobacter выживать в условиях больницы. [6] Кроме того, виды Acinetobacter могут расти в широком диапазоне температур, что позволяет им выживать в самых разных средах. [6]
Клиническое значение [ править ]
Acinetobacter часто выделяется при внутрибольничных инфекциях и особенно распространен в отделениях интенсивной терапии , где обычны как спорадические случаи, так и эпидемические и эндемические случаи. A. baumannii - частая причина внутрибольничной пневмонии , особенно поздней пневмонии, связанной с искусственной вентиляцией легких . Он может вызывать различные другие инфекции, в том числе кожные и раневые инфекции, бактериемию и менингит , но в основном за последний отвечает A. lwoffi .
Из Acinetobacter , А. baumannii является главной причиной заболевания человека, будучи замешаны в ряде внутрибольничных инфекций , такие как бактериемии, инфекция мочевых путей (ИМП), вторичный менингит, инфекционный эндокардит, и раневые и ожоговые инфекции. [7] В частности, A. baumannii часто выделяется как причина внутрибольничной пневмонии среди пациентов, поступающих в отделение интенсивной терапии.. Факторы риска включают длительную интубацию и аспирацию трахеи или легких. В большинстве случаев пневмонии, связанной с вентилятором, оборудование, используемое для искусственной вентиляции легких, такое как эндотрахеальные трубки или бронхоскопы, служит источником инфекции и приводит к колонизации нижних дыхательных путей A. baumannii . В некоторых случаях бактерии могут попадать в кровоток, что приводит к бактериемии со смертностью от 32% до 52%. ИМП, вызванные A. baumannii, по-видимому, связаны с постоянной катетеризацией, а также с терапией антибиотиками. Сообщалось также, что A. baumannii поражает кожу и мягкие ткани при травмах и послеоперационных ранах. А. бауманнийобычно поражают ожоги и могут привести к осложнениям из-за сложности лечения и искоренения. Хотя это и менее распространено, некоторые данные также связывают эту бактерию с менингитом, чаще всего после инвазивной хирургии, и, в очень редких случаях, с внебольничным первичным менингитом, при котором большинство жертв были детьми. [8] Сообщения о случаях заболевания также связывают A. baumannii с эндокардитом, кератитом, перитонитом и очень редко со смертельным исходом неонатальный сепсис. [9]
Клиническое значение A. baumannii отчасти объясняется его способностью развивать устойчивость ко многим доступным антибиотикам. Отчеты показывают, что он обладает устойчивостью к цефалоспоринам широкого спектра действия , β-лактамным антибиотикам , аминогликозидам и хинолонам . Также все чаще сообщается о резистентности к карбапенемам . [10] [11] A. baumannii может выживать на коже человека или на сухих поверхностях в течение нескольких недель и устойчив к различным дезинфицирующим средствам, что делает его особенно легким для распространения в больничных условиях. [12] Гены устойчивости к антибиотикам часто передаются из плазмид, а плазмиды присутствуют вШтаммы Acinetobacter могут передаваться другим патогенным бактериям путем горизонтального переноса генов .
У здоровых людей наличие колоний Acinetobacter на коже коррелирует с низкой частотой аллергии ; [13] Считается, что Acinetobacter защищает от аллергии. [14]
Лечение [ править ]
Виды Acinetobacter обладают врожденной устойчивостью ко многим классам антибиотиков, включая пенициллин , хлорамфеникол и часто аминогликозиды . Сообщалось о резистентности к фторхинолонам во время терапии, что также привело к повышенной устойчивости к другим классам лекарств, опосредованной активным оттоком лекарств . Резкое увеличение устойчивости к антибиотикам в Acinetobacter штаммов сообщили в Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) и карбапенемы признаны как золотой стандарт и лечение последней инстанции. [15] Acinetobacterвиды необычны тем, что они чувствительны к сульбактаму , который обычно используется для подавления бактериальной бета-лактамазы, но это пример антибактериальных свойств самого сульбактама. [16]
В ноябре 2004 года CDC сообщил о росте числа инфекций кровотока A. baumannii у пациентов в военных медицинских учреждениях, где проходили лечение военнослужащие, раненые в регионе Ирака / Кувейта во время операции «Иракская свобода» и в Афганистане во время операции «Несокрушимая свобода» . [17] Большинство из них имели множественную лекарственную устойчивость. Среди одного набора изолятов из Армейского медицинского центра Уолтера Рида 13 (35%) были чувствительны только к имипенему , а два (4%) были устойчивы ко всем протестированным препаратам. Одно противомикробное средство, колистин(полимиксин E), использовался для лечения инфекций, вызванных A. baumannii с множественной лекарственной устойчивостью ; однако испытание на чувствительность к противомикробным препаратам колистина не проводилось для изолятов, описанных в этом отчете. Поскольку A. baumannii может выживать на сухих поверхностях до 20 дней, они представляют высокий риск распространения и заражения в больницах, потенциально подвергая пациентов с ослабленным иммунитетом и других пациентов риску развития лекарственно-устойчивых инфекций, которые часто приводят к летальному исходу и, как правило, дорого обходятся. относиться.
Сообщения предполагают, что эта бактерия восприимчива к фаговой терапии . [18]
Антисмысловые олигомеры, подавляющие гены, в форме, называемой пептид-конъюгированными фосфородиамидат- морфолиноолигомерами , также, как сообщалось, ингибируют рост в тестах, проводимых на животных, инфицированных устойчивым к антибиотикам A. baumannii . [19] [20]
Асептическая техника [ править ]
Частота нозокомиальных инфекций в британских больницах побудила Национальную службу здравоохранения исследовать эффективность анионов для очистки воздуха, обнаружив, что повторяющиеся воздушно-капельные инфекции Acinetobacter в палате были устранены установкой отрицательного ионизатора воздуха - уровень заражения упал до нуля. [21]
Естественная трансформация [ править ]
Бактериальная трансформация включает перенос ДНК от донора к бактерии-реципиенту через промежуточную жидкую среду. Бактерии-реципиенты должны сначала войти в особое физиологическое состояние, называемое способностью получать донорскую ДНК. A. calcoaceticus становится компетентным для естественной трансформации путем разбавления стационарной культуры свежей питательной средой. [22] Компетенция постепенно теряется во время длительного экспоненциального роста и в течение периода после перехода в стационарное состояние. Полученная ДНК может быть использована для восстановления повреждений ДНК или как средство обмена генетической информацией путем горизонтального переноса генов. [22] Естественное преобразование A. calcoaceticusможет защитить от воздействия повреждающих ДНК условий в естественной среде обитания этих бактерий, что, по-видимому, имеет место в случае других видов бактерий, способных к трансформации. [23]
Ссылки [ править ]
- ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r Parte, AC «Acinetobacter» . LPSN .
- ^ Битриан, Мариана; Гонсалес, Родриго Х .; Пэрис, Гастон; Hellingwerf, Klaas J .; Нудель, Клара Б. (01.09.2013). «Зависящее от синего света ингибирование подвижности подергивания у Acinetobacter baylyi ADP1: аддитивное участие трех белков, содержащих BLUF-домен». Микробиология . 159 (Pt 9): 1828–1841. DOI : 10.1099 / mic.0.069153-0 . ISSN 1465-2080 . PMID 23813679 . S2CID 42820743 .
- ^ Виска P, Зайферт H, Towner KJ (декабрь 2011). «Инфекция Acinetobacter - новая угроза здоровью человека». IUBMB Life . 63 (12): 1048–54. DOI : 10.1002 / iub.534 . PMID 22006724 .
- ^ Рохбахш-Замин, Ф .; Сачдев, Д.П .; Kazemi-Pour, N .; Инженер А .; Зинджарде, СС; Дакефалкар, ПК; Чопаде, BA (2012). «Характеристика способствующих росту растений признаков видов Acinetobacter, выделенных из ризосферы Pennisetum glaucum». J Microbiol Biotechnol . 21 (6): 556–566. DOI : 10,4014 / jmb.1012.12006 .
- ^ Устойчивость к антибиотикам является основным фактором риска эпидемического поведения Acinetobacter baumannii. Инфекционный контроль Hosp Epidemiol 2001; 22: 284–288.
- ^ a b c Дугари HJ; Ndakidemi PA; Человек IS; Бенаде S (2011). «Экология, биология и патогенез Acinetobacter spp.: Обзор» . Микробы и окружающая среда . 26 (2): 101–112. DOI : 10,1264 / jsme2.me10179 . PMID 21502736 .
- ^ Дент Лемюэль, L; Маршалл, Д.Р .; Пратап, S; Hulette, RB (2010). «Acinetobacter baumannii с множественной лекарственной устойчивостью: описательное исследование в городской больнице» . BMC Infect Dis . 10 : 196. DOI : 10,1186 / 1471-2334-10-196 . PMC 2909240 . PMID 20609238 .
- ^ Зигман-Игра, Y; Бар-Йосеф, С; Гореа, А; Аврам, Дж (1993). «Нозокомиальный менингит, вызванный Acinetobacter, вторичный по отношению к инвазивным процедурам: отчет о 25 случаях и обзор». Clin Infect Dis . 17 (5): 843–849. DOI : 10.1093 / clinids / 17.5.843 . PMID 8286623 .
- ^ Falagas, ME; Карвели, Э.А.; Келесидис, I; Келесидис, Т. (2007). «Внебольничные инфекции Acinetobacter». Eur J Clin Microbiol Infect Dis . 26 (12): 857–868. DOI : 10.1007 / s10096-007-0365-6 . PMID 17701432 .
- ^ Ху, Q; Ху, Z; Ли, Дж; Тиан, B; Сюй, Н; Ли, Дж (2011). «Обнаружение карбапенемаз и интегронов OXA-типа среди карбапенем-резистентных Acinetobactor baumannii в учебной больнице в Китае». J Basic Microbiol . 51 (5): 467–472. DOI : 10.1002 / jobm.201000402 . PMID 21656808 .
- ^ Фурнье, Пьер Эдуард; Рише, Х (2006). «Эпидемиология и борьба с Acinetobacter baumannii в медицинских учреждениях» . Clin Infect Dis . 42 (5): 692–699. DOI : 10.1086 / 500202 . PMID 16447117 .
- ^ Пелег А.Ю.; Seifert H; Патерсон Д.Л. (июль 2008 г.). « Acinetobacter baumannii : появление успешного патогена» . Обзоры клинической микробиологии . 21 (3): 538–582. DOI : 10.1128 / CMR.00058-07 . PMC 2493088 . PMID 18625687 .
- ^ Hanski, I .; Von Hertzen, L .; Fyhrquist, N .; Koskinen, K .; Торппа, К .; Laatikainen, T .; Karisola, P .; Auvinen, P .; Паулин, Л .; Макела, MJ; Vartiainen, E .; Косунен, ТУ; Alenius, H .; Хаахтела, Т. (2012). «Биоразнообразие окружающей среды, микробиота человека и аллергия взаимосвязаны» . Труды Национальной академии наук . 109 (21): 8334–8339. Bibcode : 2012PNAS..109.8334H . DOI : 10.1073 / pnas.1205624109 . PMC 3361383 . PMID 22566627 .
- ^ Дебарри, Дж .; Hanuszkiewicz, A .; Stein, K .; Holst, O .; Гейне, Х. (2009). «Аллергозащитные свойства Acinetobacter lwoffii F78 придает его липополисахарид». Аллергия . 65 (6): 690–697. DOI : 10.1111 / j.1398-9995.2009.02253.x . PMID 19909295 .
- ^ Рахаль J (2006). «Новые комбинации антибиотиков против инфекций, вызываемых почти полностью устойчивыми видами Pseudomonas aeruginosa и Acinetobacter » . Clin Infect Dis . 43 Дополнение 2: S95–9. DOI : 10.1086 / 504486 . PMID 16894522 .
- ↑ Wood GC, Hanes SD, Croce MA, Fabian TC, Bougher BA (2002). «Сравнение ампициллин-сульбактама и имипенема-циластатина для лечения пневмонии, связанной с вентилятором, вызванной Acinetobacter » . Clin Infect Dis . 34 (11): 1425–30. DOI : 10.1086 / 340055 . PMID 12015687 .
- ^ Центры по контролю и профилактике заболеваний (2004). « Инфекции Acinetobacter baumannii среди пациентов в военных медицинских учреждениях, лечящих раненых военнослужащих США, 2002–2004 годы». MMWR Morb Mortal Wkly Rep . 53 (45): 1063–6. PMID 15549020 .
- ^ Matsuzaki S, Rashel M, Uchiyama J, et al. (Октябрь 2005 г.). «Бактериофаготерапия: оздоравливающая терапия против бактериальных инфекционных заболеваний». J. Infect. Chemother . 11 (5): 211–9. DOI : 10.1007 / s10156-005-0408-9 . PMID 16258815 .
- ^ Геллер Б.Л., Маршалл-Бэтти К., Шнелл Ф.Дж. и др. (Октябрь 2013). «Антисмысловые олигомеры, подавляющие гены, ингибируют рост Acinetobacter in vitro и in vivo. J. Infect. Diseases». Цитировать журнал требует
|journal=( помощь ) - ^ «Помимо антибиотиков: PPMOs предлагают новый подход к бактериальной инфекции» . 2013-10-15 . Проверено 15 октября 2013 года .
- ^ «Ионизаторы воздуха уничтожают больничные инфекции» . Новый Ученый . Проверено 30 августа 2006 .
- ^ a b Палмен Р., Фосман Б., Буйсман П., Брик К. К., Хеллингверф К. Дж. (февраль 1993 г.). «Физиологическая характеристика естественной трансформации Acinetobacter calcoaceticus» . J. Gen. Microbiol . 139 (2): 295–305. DOI : 10.1099 / 00221287-139-2-295 . PMID 8436948 .
- ^ Michod RE Бернштейн H, Nedelcu AM (май 2008). «Адаптивное значение секса у микробных патогенов». Заразить. Genet. Evol . 8 (3): 267–85. DOI : 10.1016 / j.meegid.2008.01.002 . PMID 18295550 . http://www.hummingbirds.arizona.edu/Faculty/Michod/Downloads/IGE%20review%20sex.pdf
Дальнейшее чтение [ править ]
- KJ Towner; Э. Бергонь-Березен; CA Fewson (30 июня 1991 г.). Биология Acinetobacter: таксономия, клиническое значение, молекулярная биология, физиология, промышленное значение (серия симпозиумов FEMS) . Springer. ISBN 0306439026.
- Дунъю Лю (13 апреля 2011 г.). Молекулярное обнаружение бактериальных патогенов человека (1-е изд.). Crc Pr Inc. ISBN 978-1439812389.
- Дунъю Лю (1 марта 2013 г.). Микробиология заболеваний, передающихся через воду: микробиологические аспекты и риски (2-е изд.). Академическая пресса. ISBN 978-0124158467.
- Narciso-Da-Rocha, C .; Вас-Морейра, И .; Svensson-Stadler, L .; Мур, Еврорадио; Manaia, CLM (2012). «Разнообразие и устойчивость к антибиотикам Acinetobacter spp. В воде от источника до крана» . Прикладная микробиология и биотехнология . 97 (1): 329–340. DOI : 10.1007 / s00253-012-4190-1 . ЛВП : 10400,14 / 10027 . PMID 22669636 .
Внешние ссылки [ править ]
 | В Wikispecies есть информация, связанная с Acinetobacter . |
- Альянс за разумное использование антибиотиков
- Acinetobacter sp. Страница генома ADP1
- CycSim: метаболическая модель Acinetobacter baylyi adp1 (на английском языке)
