Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Энтони Уильямс
Тони Уильямс, ACS Spring, 2018.jpg
Родившийся
Энтони Джон Уильямс

Сент-Асаф , Денбишир , Уэльс
НациональностьВеликобритания
Альма-матер
Известен
Награды Премия Джима Грея в области электронной науки (2012)
Научная карьера
Поля
Учреждения
ТезисЯМР высокого давления и релаксационные исследования систем алкильных цепей  (1988)
ДокторантДункан Дж. Гиллис [ необходима ссылка ]
Веб-сайтwww .chemconnector .com

Энтони Джон Уильямс - британский химик и эксперт в области спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР) и хеминформатики в Агентстве по охране окружающей среды США . [2] [3] Он является основателем веб-сайта ChemSpider, который был приобретен Королевским химическим обществом в мае 2009 года. Он является научным блоггером, [4] одним из авторов вики-сайта SciMobileApps, [5] сообщества на основе вики для Scientific Mobile Apps и автора. [6] [7] [8] [9] [10] [11] [12]

Ранняя жизнь и образование [ править ]

Энтони Уильямс родился в Сент-Асаф , Уэльс , в июне 1964 года в семье Эрнеста Эдварда Уильямса, владельца строительной подрядной фирмы, и Эйрлис Элизабет Уильямс. У него есть старшая сестра Рэй. Он вырос в маленькой деревушке недалеко от Кервиса .

Уильямс учился в начальной школе в Холивелле и Наннерче до 1975 года. С одиннадцати лет он посещал школу Алан, где получил аттестат зрелости по математике , географии и химии .

Уильямс получил свою степень бакалавра наук в области химии из Университета Ливерпуля , в 1985 году, написав студенческую диссертацию по теме «спектроскопических исследований витамина Е систем , связанных с » , где он применяется как электронного парамагнитного резонанса (ЭПР) и спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР) в изучение молекул, похожих по структуре на витамин Е.

Уильямс получил докторскую степень. в 1988 г. при финансовой поддержке Royal Dutch Shell из Royal Holloway, Лондонский университет, написал диссертацию, озаглавленную «ЯМР высокого давления и релаксационные исследования систем алкильных цепей». [13] Он получил медаль Борна Лондонского университета за эту работу и разработал объединяющую теорию для моделирования данных релаксации ЯМР для изучения молекулярных движений алкильных цепей. [14] Он также использовал химический сдвиг ЯМР кобальта-59 для гексацианида кобальта (III) как датчик температуры и давления. [15] Во время учебы в докторантуре он проявил интерес к персональным компьютерам и написал программы, соответствующие данным релаксации ЯМР.

Уильямс продолжил свою работу в области спектроскопии в Национальном исследовательском совете (Канада), используя спектроскопию ЭПР для проведения монокристаллических исследований металлоорганических соединений.

Карьера [ править ]

В 1991 году Уильямс присоединился к Оттавскому университету в качестве менеджера их лаборатории ЯМР. Он продолжил свои личные интересы в области многоядерного ЯМР для проведения экспериментов 2D-ЯМР, исследующих обмен селена в смешанных галогенных системах. [16] Он также выполнил исследования ЯМР кремния-29 и теллура-125 .

В 1992 году Уильямс уехал из Канады в Рочестер, штат Нью-Йорк, чтобы работать в компании Eastman Kodak в качестве лидера в области технологий ЯМР. В Kodak он использовал свой предыдущий опыт в изучении систем, связанных с алкильными цепями, для изучения мицелл . [17] Он участвовал в раннем внедрении жидкостной хроматографии- ЯМР в компании и в разработке лаборатории открытого доступа для химиков, использующих роботизированные аналитические приборы для получения данных. В Kodak он был частью команды из трех человек, которые разработали веб- систему системы управления лабораторной информацией (LIMS) под названием WIMS [18].веб-система управления информацией и первая в мире веб-система LIMS для управления химическими структурами и спектральными данными. Ему были предоставлены два патента, пока он работал в Kodak, [19] [20]

В 1997 году он начал работать в новой канадской компании Advanced Chemistry Development (ACD / Labs) в качестве старшего менеджера по продукции. Он отвечал за управление всей спектроскопией , чертежами структуры и номенклатурой IUPAC , [21] [22] продуктов. В то время как в этой роли программное обеспечение для управления аналитическими данными было расширено, чтобы включить поддержку масс-спектрометрии , инфракрасной спектроскопии , УФ-видимой спектроскопии , хроматографии и других форм аналитических наук. Его научные интересы в то время включают разработку алгоритмов предсказания ЯМР ( [23] и [24]) и, в частности, разработка программных подходов к Computer Assisted Structure Elucidation , так называемых CASE-систем. [25] [26] [27] [28] [29] [30] Инструменты CASE использовались с целью пересмотра структуры, в результате чего было продемонстрировано, что алгоритмы превосходят интерпретацию спектральных данных человеком. [31] В то время как в ACD / Labs Уильямс участвовал во многих отраслевых новостях [ необходима ссылка ], в том числе

  1. создание химического словаря на КПК и КПК, [32]
  2. работая с Гэри Э. Мартином и другими коллегами над разработкой новых методов обработки ЯМР с использованием подходов, основанных на ковариации , [33] [34] [35] [36]
  3. внедрение основанных на нечеткой логике подходов к компьютерному выяснению структуры и 4) подходов к автоматизированной верификации структуры. [37]

Находясь в компании, он инициировал хобби-проект по объединению химических баз данных в Интернете. Этот проект назывался ChemSpider . ChemSpider был официально объявлен на собрании ACS в Чикаго в марте 2007 года с базой данных, содержащей более 10 миллионов соединений, полученных от PubChem . В 2007 году, когда он покинул ACD / Labs, он был главным научным сотрудником. Он стал независимым консультантом, работая с рядом компаний-разработчиков программного обеспечения в области хеминформатики, таких как SimBioSys , а также с исследовательскими организациями для поддержки их усилий в области хеминформатики. Параллельно он продолжал разрабатывать платформу ChemSpider с небольшой группой единомышленников, заинтересованных в разработке сетевых систем для обслуживания химиков [38] [39]Сайт представляет собой краудсорсинговое сообщество химиков, в котором химики размещают свои коллекции структур, спектральных данных и молекулярных свойств. Уильямс сосредоточен на просвещении сообщества по вопросам качества данных, связанных с базами данных химии в Интернете. [40] [41]

В мае 2009 года Королевское химическое общество объявило о приобретении ChemSpider. [42] Уильямс присоединился к RSC в качестве вице-президента по стратегическому развитию ChemSpider.

В мае 2015 года он присоединился к Агентству по охране окружающей среды США для работы над разработкой веб-сайтов, обеспечивающих публичный доступ к данным EPA [43] и инструментам для масс-спектрометрии . [44]

Уильямс внес свой вклад в мир «мобильной химии» [45] , внося свой вклад в разработку ChemMobi, приложения для iPhone для доступа к миллионам химических соединений и связанным с ними данным.

Уильямс является сторонником Open Notebook Science и судьей конкурса Open Notebook Science Challenge . Он работал с Жан-Клодом Брэдли над созданием сетевой игры для обучения интерпретации спектральных данных с использованием данных краудсорсинговой спектроскопии, размещенных на ChemSpider . [46]

Пропаганда открытой науки [ править ]

Уильямс представил журнал открытого доступа ChemSpider Journal of Chemistry, а группа разработчиков предоставила новую технологию онлайн-разметки (ChemMANTIS - интегрированная система преобразования разметки и номенклатуры), позволяющую краудсорсинговую разметку терминов, связанных с химией, связанных, где это возможно, с базой данных ChemSpider. . Уильямс - судья конкурса Open Notebook Science Challenge . Он продвигает использование открытых данных , особенно спектральных данных, публикует статьи в журналах открытого доступа и является сторонником Open Notebook Science . [47] Уильямс является сторонником публикации доклинических данных фармацевтической промышленности в Интернете. [48] [49] [50]Уильямс тесно сотрудничал с Шоном Экинсом, выступая за предоставление сообществу предконкурентных фармацевтических данных. Он также участвовал в анализе и обзоре открытых фармацевтических данных, предоставленных сообществу. [51] [52] [53]

Williams, сам давний участник Википедии был вокальным в сомнению требования значительности из самой Википедии, сравнивая порнозвезда и ученый. [54] [55]

Научные мобильные приложения [ править ]

Уильямс совместно с Шоном Экинсом разработал ныне несуществующую Wiki под названием Science Mobile Applications [56], запущенную 21 июня 2011 года. [57] Первоначально это выросло из желания отслеживать химические приложения [58] (для представленной статьи), а затем Apps по естествознанию на уроке химии. [59]

Награды и награды [ править ]

Уильямс был лауреатом премии Джима Грея в области электронной науки в 2012 году [60] и премии Американского химического общества Северной Каролины «Выдающийся спикер года» в 2016 году [61].

Ссылки [ править ]

  1. ^ Уильямс, AJ ; Harland, L .; Groth, P .; Петтифер, С .; Чичестер, С .; Willighagen, EL; Эвело, Коннектикут; Blomberg, N .; Эккер, Г .; Гобл, К .; Монс Б. (2012). «Открытые ФАКТЫ: семантическая совместимость для открытия лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 17 (21–22): 1188–1198. DOI : 10.1016 / j.drudis.2012.05.016 . PMID  22683805 .
  2. ^ Публикации Энтони Джона Уильямса, проиндексированные Google Scholar
  3. ^ Персонал. «2014-BIT-Brochure» (PDF) . 2014 Выставка Bio-IT World Expo . Кембриджский институт Healthtech. С. 3 (столбец 2) . Проверено 15 июня +2016 . Энтони Уильямс, доктор философии, вице-президент по стратегическому развитию; Руководитель отдела химинформатики Королевского химического общества (RSC)
  4. ^ Веб-сайт ChemConnector
  5. ^ "SciMobileApps Wiki" . Архивировано из оригинала на 2012-03-26 . Проверено 14 ноября 2018 .
  6. ^ Практическая интерпретация спектров ЯМР P-31 и компьютерная проверка структуры, Луи Куин и Энтони Уильямс, ISBN 978-0-9735913-0-9 
  7. ^ Совместные вычислительные технологии для биомедицинских исследований , Шон Экинс, Мэгги Хупси и Энтони Уильямс, ISBN 978-0-470-63803-3 
  8. ^ Публикации Энтони Джона Уильямса из Europe PubMed Central
  9. ^ Энтони Уильямс на LinkedIn.com
  10. ^ Профиль Уильямса Mendeley
  11. ^ Энтони Уильямс ChemConnector блог Archived 28 января 2011 года, в Wayback Machine
  12. ^ Публикации Энтони Джона Уильямса индексируется Scopus библиографической базы данных. (требуется подписка)
  13. ^ Уильямс, Энтони Джон (1988). ЯМР высокого давления и релаксационные исследования систем алкильных цепей (кандидатская диссертация). Ливерпульский университет.(требуется подписка)
  14. ^ Bratt, PJ; Gillies, DG; Сатклифф, LH; Уильямс, AJ (1990). «ЯМР релаксационные исследования внутренних движений: сравнение мицелл и родственных систем». Журнал физической химии . 94 (7): 2727. DOI : 10.1021 / j100370a001 .
  15. ^ Гиллис, Д.Г. Сатклифф, LH; Уильямс, AJ (2002). «Исследование высокого давления при переменных температурах методом ЯМР-спектроскопии кобальта-59 водного K3 \ Co (CN) 6]». Магнитный резонанс в химии . 40 : 57–64. DOI : 10.1002 / mrc.955 . S2CID 98518973 . 
  16. ^ Milne, J .; Уильямс, AJ (1992). «Обменные процессы в дигалогенидах диселена и селена-серы, Se2X2 и SeSX2 (X = Br, Cl). Исследование селена-77 2D-EXSY». Неорганическая химия . 31 (22): 4534. DOI : 10.1021 / ic00048a018 .
  17. ^ Antalek, B .; Уильямс, AJ; Garcia, E .; Texter, J. (1994). «ЯМР-анализ переходов межфазной структуры, сопровождающих пороговый переход электронного переноса в обратных микроэмульсиях». Ленгмюра . 10 (12): 4459. DOI : 10.1021 / la00024a014 .
  18. ^ Браун, D .; Уильямс, А .; Маклафлин, Д. (1997). «Интернет-система управления информацией». Тенденции TrAC в аналитической химии . 16 (7): 370. DOI : 10.1016 / S0165-9936 (97) 00046-0 .
  19. ^ Фотографическая эмульсия с улучшенным быстродействием. Патент США 6040129
  20. ^ Процесс производства дигидропиримидинов, Патент США 5,576,432.
  21. ^ Уильямс, А .; Ерин, А. (1999). «Необходимость систематического присвоения имен программным средствам для обмена химической информацией» . Молекулы . 4 (9): 255. DOI : 10,3390 / 40900255 .
  22. ^ Уильямс, А .; Ерин, А. (2008). «Автоматическая идентификация и преобразование химических названий в информацию с возможностью поиска по структуре». Химическая информационная горная промышленность . п. 21. DOI : 10.1201 / 9781420076509.pt2 . ISBN 978-1-4200-7649-3.
  23. Перейти ↑ Williams, A. (2000). «Последние достижения в области прогнозирования ЯМР и программного обеспечения для автоматического определения структуры». Текущее мнение в области открытия и разработки лекарств . 3 (3): 298–305. PMID 19649862 . 
  24. ^ Блинов, К.А.; Смурный Ю.Д .; Эльяшберг, МЭ; Чуранова ТС; Кваша, М .; Steinbeck, C .; Лефевр, BA; Уильямс, AJ (2008). «Проверка производительности прогнозирования ЯМР 13C на основе нейронной сети с использованием общедоступного источника данных». Журнал химической информации и моделирования . 48 (3): 550–555. DOI : 10.1021 / ci700363r . PMID 18293952 . 
  25. ^ Эльяшберг, МЭ; Блинов, К.А.; Молодцов С.Г .; Уильямс, AJ; Мартин, GE (2007). "Создание нечеткой структуры: новый эффективный инструмент для компьютерного выяснения структуры (CASE)". Журнал химической информации и моделирования . 47 (3): 1053–1066. DOI : 10.1021 / ci600528g . PMID 17385849 . 
  26. ^ Эльяшберг, МЭ; Уильямс, AJ; Мартин, GE (2008). «Компьютерные средства проверки структуры и выяснения структуры в выяснении структуры на основе ЯМР». Прогресс в спектроскопии ядерного магнитного резонанса . 53 (1–2): 1–104. DOI : 10.1016 / j.pnmrs.2007.04.003 .
  27. ^ Смурный, Ю.Д .; Эльяшберг, МЭ; Блинов, К.А.; Лефевр, BA; Мартин, GE; Уильямс, AJ (2005). «Компьютерное определение относительной стереохимии и трехмерных моделей сложных органических молекул по двумерным спектрам ЯМР». Тетраэдр . 61 (42): 9980. DOI : 10.1016 / j.tet.2005.08.022 .
  28. ^ Мартин, GE; Хадден, CE; Рассел, диджей; Калузный, БД; Guido, JE; Duholke, WK; Stiemsma, BA; Thamann, TJ; Крауч, Р. К.; Блинов, К .; Эльяшберг, М .; Мартиросян, ER; Молодцов С.Г .; Уильямс, AJ; Шифф, PL (2002). «Идентификация продуктов разложения сложного алкалоида с использованием технологии криозонда ЯМР и анализатора структуры / ACD». Журнал химии гетероциклов . 39 (6): 1241. DOI : 10.1002 / jhet.5570390619 .
  29. ^ Блинов, К .; Эльяшберг, М .; Мартиросян, ER; Молодцов С.Г .; Уильямс, AJ; Tackie, AN; Шараф, ММН; Schiff, PL; Крауч, Р. К.; Мартин, GE; Хадден, CE; Guido, JE; Миллс, KA (2003). «Хиндолинокриптотакиин: выяснение новой структуры алкалоидов индолохинолина с помощью компьютерного выяснения структуры и 2D ЯМР» . Магнитный резонанс в химии . 41 (8): 577. DOI : 10.1002 / mrc.1227 .
  30. ^ Эльяшберг, МЭ; Блинов, К.А.; Мартиросян, ER; Молодцов С.Г .; Уильямс, AJ; Мартин, GE (2003). «Автоматизированное выяснение структуры - преимущества симбиотических отношений между спектроскопистом и экспертной системой». Журнал химии гетероциклов . 40 (6): 1017. DOI : 10.1002 / jhet.5570400610 .
  31. ^ Эльяшберг, М .; Уильямс, AJ; Блинов, К. (2010). «Структурные ревизии натуральных продуктов с помощью систем компьютерного выяснения структуры (CASE)». Отчеты о натуральных продуктах . 27 (9): 1296–1328. DOI : 10.1039 / C002332a . PMID 20480119 . S2CID 37849167 .  
  32. ^ "Базы данных химии в ладони и в кармане" . Архивировано из оригинала на 2010-12-18 . Проверено 17 февраля 2011 .
  33. ^ Блинов, К.А.; Ларин, Н.И.; Кваша, депутат; Moser, A .; Уильямс, AJ; Мартин, GE (2005). «Анализ и устранение артефактов в непрямых ковариационных спектрах ЯМР с помощью несимметричной обработки». Магнитный резонанс в химии . 43 (12): 999–1007. DOI : 10.1002 / mrc.1674 . PMID 16144032 . S2CID 26808858 .  
  34. ^ Блинов, К.А.; Уильямс, AJ; Hilton, BD; Ирландский, Пенсильвания; Мартин, GE (2007). «Использование несимметричных непрямых ковариационных методов ЯМР для получения эквивалента данных HSQC-NOESY». Магнитный резонанс в химии . 45 (7): 544–546. DOI : 10.1002 / mrc.1998 . PMID 17437315 . S2CID 46106410 .  
  35. ^ Мартин, GE; Ирландский, Пенсильвания; Hilton, BD; Блинов, К.А.; Уильямс, AJ (2007). «Использование несимметричной обработки непрямой ковариации для определения сетей связи 15N-13C». Магнитный резонанс в химии . 45 (8): 624–627. DOI : 10.1002 / mrc.2029 . PMID 17563910 . S2CID 34281811 .  
  36. ^ Мартин, GE; Hilton, BD; Ирландский, Пенсильвания; Блинов, К.А.; Уильямс, AJ (2007). «Применение методов ЯМР несимметричной непрямой ковариации для расчета спектров корреляции 13C↔15N HSQC-IMPEACH и 13C↔15N HMBC-IMPEACH». Магнитный резонанс в химии . 45 (10): 883–888. DOI : 10.1002 / mrc.2064 . PMID 17729230 . S2CID 41359162 .  
  37. ^ Голотвин, СС; Водопьянов, Э .; Pol, R .; Лефевр, BA; Уильямс, AJ ; Рутковске, РД; Спитцер, Т.Д. (2007). «Автоматическая проверка структуры на основе комбинации спектров 1D1H ЯМР и 2D1H-13C HSQC». Магнитный резонанс в химии . 45 (10): 803–813. DOI : 10.1002 / mrc.2034 . PMID 17694570 . S2CID 25476827 .  
  38. ^ Пенс, ОН; Уильямс, А. (2010). "ChemSpider: Интернет-ресурс химической информации". Журнал химического образования . 87 (11): 1123. Bibcode : 2010JChEd..87.1123P . DOI : 10.1021 / ed100697w .
  39. ^ Публичные базы данных соединений - Как ChemSpider изменил правила, делающие молекулы в сети бесплатными, Энтони Дж. Уильямс в Совместных вычислительных технологиях для наук о жизни, под редакцией Шона Экинса, Мэгги А.З. Хапси и Энтони Дж. Уильямса, отправлено для публикации в Wiley
  40. Перейти ↑ Williams, A. (2008). «Перспектива общедоступных / открытых баз данных по химии». Открытие наркотиков сегодня . 13 (11–12): 495–501. DOI : 10.1016 / j.drudis.2008.03.017 . PMID 18549975 . 
  41. ^ Уильямс, AJ; Экинс, С. (2011). «Предупреждение о качестве и призыв к совершенствованию работы с общедоступными химическими базами данных». Открытие наркотиков сегодня . 16 (17–18): 747–750. DOI : 10.1016 / j.drudis.2011.07.007 . PMID 21871970 . 
  42. ^ «выполнить свою стратегическую задачу по распространению знаний среди химического сообщества и развитию химических наук»
  43. ^ Личный профиль EPA
  44. ^ McEachran, AD; Собус, младший; Уильямс, AJ (2017). «Выявление известных неизвестных с помощью панели управления химии CompTox Агентства по охране окружающей среды США». Аналитическая и биоаналитическая химия . 409 (7): 1729–1735. DOI : 10.1007 / s00216-016-0139-Z . PMID 27987027 . S2CID 31754962 .  
  45. ↑ AJ Williams, Мобильная химия - химия в ваших руках и на вашем лице, Chemistry World, май 2010 г.
  46. ^ Брэдли, JC; Ланкашир, Род-Джерси; Ланг, ASD; Уильямс, AJ (2009). «Призрачная игра: Использование открытых данных и краудсорсинга для образования» . Журнал химинформатики . 1 (1): 9. дои : 10,1186 / 1758-2946-1-9 . PMC 3225864 . PMID 20298527 .  
  47. ^ Брэдли, JC; Owens, K .; Уильямс, А. (2008). «Краудсорсинг химии и открытая наука о ноутбуках» . Предшествующая природа . DOI : 10.1038 / npre.2008.1505.1 .
  48. ^ Ekins, S .; Уильямс, AJ (2010). «Доконкурентные доклинические данные ADME / Tox: разместите их бесплатно в Интернете, чтобы облегчить построение вычислительных моделей и помочь в разработке лекарств». Лаборатория на чипе . 10 (1): 13–22. DOI : 10.1039 / b917760b . PMID 20024044 . 
  49. ↑ AJ Williams, V. Tkachenko, C. Lipinski, A. Tropsha и S. Ekins, Бесплатные онлайн-ресурсы, позволяющие использовать краудсорсинг, Drug Discovery World Winter 2009/10, 33-39
  50. ^ Ekins, S .; Уильямс, AJ (2010). «Когда фармацевтические компании публикуют большие массивы данных: изобилие богатства или дурацкое золото?». Открытие наркотиков сегодня . 15 (19–20): 812–815. DOI : 10.1016 / j.drudis.2010.08.010 . PMID 20732447 . 
  51. ^ Ekins, S .; Уильямс, AJ (2010). «Когда фармацевтические компании публикуют большие массивы данных: изобилие богатства или дурацкое золото?». Открытие наркотиков сегодня . 15 (19–20): 812–815. DOI : 10.1016 / j.drudis.2010.08.010 . PMID 20732447 . 
  52. ^ Ekins, S .; Уильямс, AJ (2010). «Мета-анализ структур молекулярных свойств и фильтрация общедоступных наборов данных о противомалярийных« хитах »и лекарствах». MedChemComm . 1 (5): 325. DOI : 10.1039 / C0MD00129E .
  53. ^ Уильямс, AJ ; Harland, L .; Groth, P .; Петтифер, С .; Чичестер, С .; Willighagen, EL; Эвело, Коннектикут; Blomberg, N .; Эккер, Г .; Гобл, К .; Монс Б. (2012). «Открытые ФАКТЫ: семантическая совместимость для открытия лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 17 (21–22): 1188–1198. DOI : 10.1016 / j.drudis.2012.05.016 . PMID 22683805 . 
  54. ^ «» Почему порнозвезды более заметные , чем ученые на Википедию? ChemConnector блог» .
  55. ^ "Архивная копия" . Архивировано из оригинала на 2012-03-28 . Проверено 8 декабря 2011 .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
  56. ^ Вики SciMobileApps
  57. ^ Объявление о SciMobileApps Wiki
  58. ^ Химия в ваших руках и статья на вашем лице из мира химии
  59. ^ Уильямс, AJ; Пенс, HE (2011). «Смартфоны - мощный инструмент в классе химии». Журнал химического образования . 88 (6): 683. Bibcode : 2011JChEd..88..683W . DOI : 10.1021 / ed200029p .
  60. ^ Премия Джима Грея eScience, Энтони Уильямс
  61. ^ Выдающийся спикер года NC ACS, Энтони Уильямс

Внешние ссылки [ править ]

  • Официальный веб-сайт
  • Энтони Джон Уильямс в Twitter