OpenPHACTS

Открыть ФАКТЫ
Формирование	2011 г.
Тип	Государственно-частное партнерство
Цель	Семантическая совместимость для открытия лекарств через открытые инновации
Членство	27 членских организаций
Ключевые люди	Энтони Джон Уильямс Кэрол Гобл Баренд Монс Герхард Эккер
Веб-сайт	www .openphacts .org github .com / openphacts

Open PHACTS (Open Pharmacological Concept Triple Store ) - это европейская инициатива государственно-частного партнерства между научными кругами, издателями, предприятиями, фармацевтическими компаниями и другими организациями, работающими над улучшением, дешевизной и быстротой открытия лекарств . ^[1]^[2]^[3]^[4] Он финансировались инновационной инициативой лекарственных средств , ^[5] выбран в рамках трех проектов «методы проектирования для общих стандартов и обмена данных для более эффективного развития наркотиков и лечения пациентов в будущем". ^[6]^[7]

Партнерство [ править ]

Всего было задействовано 27 партнеров, в том числе:

Academia: Маастрихтский университет , Университет Сантьяго - де - Компостела , Венский университет , Университет Манчестера , Университет Бонна , Швейцарского института биоинформатики , Европейского института биоинформатики , Врийе Universiteit Амстердам, Технический университет Дании , Университет Гамбурга
Фармацевтические компании: Pfizer , Merck KGaA , Eli Lilly and Company , Novartis , GlaxoSmithKline , AstraZeneca
Другие компании: ChemSpider , Biovia , Eagle Genomics, Entagen
Издатели: Королевское химическое общество , Thomson Reuters

Открытие лекарств [ править ]

Открытое фармакологическое пространство, созданное консорциумом, предназначено для поддержки открытых инноваций и внутренних непубличных исследований по открытию лекарств ^[8] путем устранения узких мест в разработке лекарств . ^[9]^[10] Ресурсы проекта общедоступны на GitHub . ^[11]

Чтобы уменьшить препятствия на пути к открытию лекарств в промышленности, академических кругах и для малого бизнеса, консорциум Open PHACTS создал платформу Open PHACTS Discovery. Эта платформа была в свободном доступе, она объединяла фармакологические данные из различных информационных ресурсов и предоставляла инструменты и услуги для проверки этих интегрированных данных для поддержки фармакологических исследований.

Ссылки [ править ]

^ Уильямс, AJ ; Harland, L .; Groth, P .; Петтифер, С .; Чичестер, С .; Willighagen, EL; Эвело, Коннектикут; Blomberg, N .; Эккер, Г .; Гобл, К .; Монс Б. (2012). «Открытые ФАКТЫ: семантическая совместимость для открытия лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 17 (21–22): 1188–1198. DOI : 10.1016 / j.drudis.2012.05.016 . PMID 22683805 .
^ Эккер, GF; Уильямс-Джонс, Б. (2012). «Открытые инновации в открытии лекарств» . Молекулярная информатика . 31 (8): 519. DOI : 10.1002 / minf.201280004 .
^ Грей, Аласдер JG; Грот, Пауль; Лойзу, Антонис; Аскьяер, Суне; Бреннинкмейер, Кристиан; Бургер, Кис; Чичестер, Кристина; Эвело, Крис Т .; Гобл, Кэрол ; Харланд, Ли; Петтифер, Стив ; Томпсон, Марк; Ваагмистер, Андра; Уильямс, Энтони Джон (2014). «Применение подходов связанных данных к фармакологии: архитектурные решения и реализация». Семантическая сеть . 5 (2): 101–113. arXiv : 1005.2643 . DOI : 10.3233 / SW-2012-0088 .
^ Ciccarese, P; Soiland-Reyes, S; Belhajjame, K; Грей, AJ; Гобл, C; Кларк, Т. (2013). «Онтология PAV: происхождение, создание и управление версиями» . Журнал биомедицинской семантики . 4 (1): 37. arXiv : 1304.7224 . DOI : 10.1186 / 2041-1480-4-37 . PMC 4177195 . PMID 24267948 .
^ «Открытые ФАКТЫ в IMI - Инициатива инновационных лекарственных средств» .
Перейти ↑ Watson, R. (2011). «Европа выделяет 172 миллиона евро на исследования инновационных лекарств». BMJ . 342 : d1577. DOI : 10.1136 / bmj.d1577 . PMID 21393337 .
^ Гобл, С .; Серый, AJG; Harland, L .; Карапетян, К .; Loizou, A .; Михайлов, И .; Ранка, Ю.Н.; Senger, S .; Ткаченко, В .; Уильямс, AJ ; Виллигаген, EL (2013). «Включение коммерческих и частных данных в платформу открытых связанных данных для обнаружения лекарств». Семантическая сеть - ISWC 2013 . Конспект лекций по информатике. 8219 . п. 65. DOI : 10.1007 / 978-3-642-41338-4_5 . ISBN 978-3-642-41337-7.
^ Müller, S .; Вайгельт, Дж. (2010). «Открытое государственно-частное партнерство для открытия новых лекарств - новые подходы». IDrugs: журнал исследуемых препаратов . 13 (3): 175–180. PMID 20191434 .
^ Dalgleish, R .; Molero, E .; Kidd, R .; Jansen, M .; Прошлое, D .; Робл, А .; Mons, B .; Diaz, C .; Mons, A .; Брукс, AJ (2012). «Устранение узких мест в обмене данными в науках о жизни» . Мутация человека . 33 (10): 1494–1496. DOI : 10.1002 / humu.22123 . PMID 22623360 .
^ Монс, Б .; Van Haagen, H .; Чичестер, С .; Hoen, PB 'T .; Den Dunnen, JT; Van Ommen, G .; Van Mulligen, E .; Singh, B .; Hooft, R .; Roos, M .; Hammond, J .; Кизель, Б .; Giardine, B .; Velterop, Дж ; Groth, P .; Шультес, Э. (2011). «Ценность данных». Генетика природы . 43 (4): 281–283. DOI : 10.1038 / ng0411-281 . PMID 21445068 .
^ «Открыть ФАКТЫ на GitHub» . Проверено 10 июля 2012 .

[1] Уильямс, AJ ; Harland, L .; Groth, P .; Петтифер, С .; Чичестер, С .; Willighagen, EL; Эвело, Коннектикут; Blomberg, N .; Эккер, Г .; Гобл, К .; Монс Б. (2012). «Открытые ФАКТЫ: семантическая совместимость для открытия лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 17 (21–22): 1188–1198. DOI : 10.1016 / j.drudis.2012.05.016 . PMID 22683805 .

[2] Эккер, GF; Уильямс-Джонс, Б. (2012). «Открытые инновации в открытии лекарств» . Молекулярная информатика . 31 (8): 519. DOI : 10.1002 / minf.201280004 .

[3] Грей, Аласдер JG; Грот, Пауль; Лойзу, Антонис; Аскьяер, Суне; Бреннинкмейер, Кристиан; Бургер, Кис; Чичестер, Кристина; Эвело, Крис Т .; Гобл, Кэрол ; Харланд, Ли; Петтифер, Стив ; Томпсон, Марк; Ваагмистер, Андра; Уильямс, Энтони Джон (2014). «Применение подходов связанных данных к фармакологии: архитектурные решения и реализация». Семантическая сеть . 5 (2): 101–113. arXiv : 1005.2643 . DOI : 10.3233 / SW-2012-0088 .

[4] Ciccarese, P; Soiland-Reyes, S; Belhajjame, K; Грей, AJ; Гобл, C; Кларк, Т. (2013). «Онтология PAV: происхождение, создание и управление версиями» . Журнал биомедицинской семантики . 4 (1): 37. arXiv : 1304.7224 . DOI : 10.1186 / 2041-1480-4-37 . PMC 4177195 . PMID 24267948 .

[5] «Открытые ФАКТЫ в IMI - Инициатива инновационных лекарственных средств» .

[6] Перейти ↑ Watson, R. (2011). «Европа выделяет 172 миллиона евро на исследования инновационных лекарств». BMJ . 342 : d1577. DOI : 10.1136 / bmj.d1577 . PMID 21393337 .

[7] Гобл, С .; Серый, AJG; Harland, L .; Карапетян, К .; Loizou, A .; Михайлов, И .; Ранка, Ю.Н.; Senger, S .; Ткаченко, В .; Уильямс, AJ ; Виллигаген, EL (2013). «Включение коммерческих и частных данных в платформу открытых связанных данных для обнаружения лекарств». Семантическая сеть - ISWC 2013 . Конспект лекций по информатике. 8219 . п. 65. DOI : 10.1007 / 978-3-642-41338-4_5 . ISBN 978-3-642-41337-7.

[8] Müller, S .; Вайгельт, Дж. (2010). «Открытое государственно-частное партнерство для открытия новых лекарств - новые подходы». IDrugs: журнал исследуемых препаратов . 13 (3): 175–180. PMID 20191434 .

[9] Dalgleish, R .; Molero, E .; Kidd, R .; Jansen, M .; Прошлое, D .; Робл, А .; Mons, B .; Diaz, C .; Mons, A .; Брукс, AJ (2012). «Устранение узких мест в обмене данными в науках о жизни» . Мутация человека . 33 (10): 1494–1496. DOI : 10.1002 / humu.22123 . PMID 22623360 .

[10] Монс, Б .; Van Haagen, H .; Чичестер, С .; Hoen, PB 'T .; Den Dunnen, JT; Van Ommen, G .; Van Mulligen, E .; Singh, B .; Hooft, R .; Roos, M .; Hammond, J .; Кизель, Б .; Giardine, B .; Velterop, Дж ; Groth, P .; Шультес, Э. (2011). «Ценность данных». Генетика природы . 43 (4): 281–283. DOI : 10.1038 / ng0411-281 . PMID 21445068 .

[11] «Открыть ФАКТЫ на GitHub» . Проверено 10 июля 2012 .

[1]