BLUPF90 семейство программ представляет собой статистический пакет программного обеспечения , используемый в количественных генетиках для животных и селекции растений . [1] [2] Он может соответствовать смешанным моделям с использованием ограниченного максимального правдоподобия, а также выборки Гиббса для оценки компонентов дисперсии и прогнозирования племенных значений с помощью наилучшего линейного несмещенного предсказания (BLUP).
Запрограммированный на Fortran , он может выполнять геномный отбор сотен тысяч генотипированных особей. [3]
Скомпилированные версии BLUPF90 находятся в свободном доступе для исследования и могут использоваться в Linux, Microsoft Windows и Mac OS X. [4] [5] Также существует надстройка к R (язык программирования) . [6]
Рекомендации
- ^ Мишталь, Игнатий (1999). «Сложные модели, больше данных: упрощенное программирование?». Бюллетень Interbull . 20 : 33–42.
- ^ Misztal, I; Цурута, S; Страбель, Т; Auvray, B; Друэт, Т; Ли, Д.Х. (2002). BLUPF90 и сопутствующие программы (BGF90) . 7-й Всемирный конгресс по генетике в животноводстве. Монпелье, Франция.
- ^ Агилар, я; Misztal, I; Цурута, S; Легарра, А; Ван, Х (2014). PREGSF90 - POSTGSF90: Вычислительные инструменты для реализации одношагового геномного отбора и общегеномной ассоциации с не генотипированными особями в программах BLUPF90 (PDF) . 10-й Всемирный конгресс генетики в области животноводства. Американское общество зоотехники, Шампейн, Иллинойс.
- ^ http://nce.ads.uga.edu/software/
- ^ http://nce.ads.uga.edu/wiki/doku.php?id=start
- ^ https://famuvie.github.io/breedR/