Bibliome представляет собой совокупность биологического текста корпуса . Этот термин был введен около 2000 года в EBI ( Европейский институт биоинформатики ) для обозначения важности биологической текстовой информации. Реже используются аналогичные термины - литературом и текстом . [ необходима цитата ] По приблизительной аналогии с широко используемыми терминами, такими как геном, метаболом, протеом и транскриптом, этот -ome будет правильно относиться к литературе определенной или контекстуально подразумеваемой области, следовательно: биологический библиом , политический библиом и т. д. [ цитата необходимо ]Однако этот термин (пока) не применялся за пределами биологических и медицинских наук, поэтому в настоящее время он по умолчанию применяется только к биомедицинским областям. Было бы бессмысленно применять его к определенному корпусу текстов, таких как MEDLINE, несмотря на естественную аналогию, которая может показаться предполагающей это: термины геном , протеом , каннелом , метаболом и транскриптом обычно предполагают конкретный организм или набор клеток. и (кроме генома) конкретный момент времени. Причина, по которой следование этой аналогии не имеет большого смысла, состоит в том, что для этой цели уже существует установленный термин корпус .
Из библиома биологи и компьютерные ученые собирают данные для открытия новых генных мишеней и лекарств . Библиомика - это биоинформатическое исследование библиомы. Библиом не является псевдоумом, потому что это полезная концепция, которую используют биоинформатисты.
Онлайн-приложения
EAGLi - это механизм биомедицинского поиска для MEDLINE. GOCat - это автоматический классификатор / браузер GO для функциональной аннотации биомедицинских текстов; также полезен для функциональной характеристики списков названий белков и генов, созданных в результате высокопроизводительных экспериментов.
Внешние ссылки
- «Разработка библиомы» (аннотация)
- Гривелл, Лес (15 марта 2002 г.). "Копание библиомы: поиск иголки в стоге сена?" . EMBO Reports . 3 (3): 200–203. DOI : 10.1093 / embo-reports / kvf059 . PMC 1084023 . PMID 11882534 .