Channelome , иногда называемый « ионный channelome », полный набор ионных каналов [1] и поринов [2] , выраженных в биологической ткани или организма. [3] Это аналог генома , метаболома (описывающего метаболиты), протеома (описывающего общую экспрессию белка ) и микробиома . Характеристика ионного канала, называемая каналомикой , является разделом физиологии , биофизики , нейробиологии.и фармакология , с особым вниманием к экспрессии генов . [4] [5] [6] Это может быть выполнено с помощью различных методов, включая электрофизиологию с фиксацией патч-кламп , ПЦР и иммуногистохимию . [4] [7] Каналомика используется для проверки и открытия новых лекарств. [4] [8]
Функциональные исследования
Структура и функция мембранных каналов тесно связаны [9] [10], но, пожалуй, самой известной работой по изучению структуры ионных каналов является статья Doyle et al . 1998, что привело к Нобелевской премии по химии за Родерик Маккиннон . [1] Аномалии структуры каналов, следовательно, приводят к их физиологической неправильной функции. Каналомические исследования включают систематическое изучение заболеваний, возникающих в результате такого неправильного функционирования. Такое заболевание называется каннелопатией . [4] [8] Кроме того, каналомные исследования проводят скрининг потенциальных лекарств на предмет их эффективности при каннелопатиях путем изучения аффинности связывания лекарственных соединений-кандидатов. [4] [8]
Рекомендации
- ^ a b Дойл, Д.А., Мораис-Кабрал, Дж., Пфуэцнер, Р.А., Куо, А., Гулбис, Дж. М., Коэн, С.Л., Чайт, Б.Т., Маккиннон, Р. (1998) Структура калиевого канала: молекулярная основа K + проводимость и селективность. Science 280 : 69–77.
- ^ Preston GM, Carroll TP, Guggino WB, Агра P (1992). Появление водных каналов в ооцитах Xenopus, экспрессирующих белок CHIP28 эритроцитов. Наука 256 (5055): 385–387.
- ^ Барретт-Джолли, Р., Р. Льюис и др. (2010). Возникающий канал хондроцитов : границы в физиологии мембран и биофизике. DOI : 10,3389 / fphys.2010.00135
- ^ a b c d e Lehmann-Horn, F .; Юркат-Ротт, К. (2003). «Нанотехнологии нейронных ионных каналов» . Журнал неврологии, нейрохирургии и психиатрии . 74 (11): 1466–1475. DOI : 10.1136 / jnnp.74.11.1466 . PMC 1738249 . PMID 14617700 .
- ^ Юркат-Ротт, К .; Леманн-Хорн, Ф. (2004). «Техника фиксации патча в исследовании ионных каналов». Текущая фармацевтическая биотехнология . 5 (4): 387–395. DOI : 10.2174 / 1389201043376715 . PMID 15320769 .
- ^ Габашвили, С .; Sokolowski, H .; Morton, C .; Giersch, B. (сентябрь 2007 г.). «Экспрессия гена ионного канала во внутреннем ухе» . Журнал Ассоциации исследований в области отоларингологии . 8 (3): 305–328. DOI : 10.1007 / s10162-007-0082-у . ISSN 1525-3961 . PMC 2538437 . PMID 17541769 .
- ^ Perraud, AL; Schmitz, C .; Шаренберг AM (2006). Обзоры и протоколы в DT40 Research . Субклеточная биохимия. 40 . С. 257–270. DOI : 10.1007 / 978-1-4020-4896-8_15 . ISBN 978-1-4020-4895-1.
- ^ а б в Камерино, округ Колумбия; Tricarico, D .; Desaphy, JF (апрель 2007 г.). «Фармакология ионных каналов» . Нейротерапия . 4 (2): 184–198. DOI : 10.1016 / j.nurt.2007.01.013 . PMID 17395128 .
- ^ Коэн, BE; Grabe, M .; Ян, LY (2003). «Ответы и вопросы от структур KvAP» . Нейрон . 39 (3): 395–400. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (03) 00472-0 . PMID 12895415 .
- ^ Randall, A .; Mcnaughton, N .; Грин, П. (август 2006 г.). «Свойства потенциал-управляемых Na + -каналов в клеточной линии рабдомиосаркомы человека SJ-RH30: традиционный и автоматический анализ патч-зажима». Фармакологические исследования . 54 (2): 118–128. DOI : 10.1016 / j.phrs.2006.03.005 . ISSN 1043-6618 . PMID 16675265 .