В этой статье слишком много ссылок на первоисточники . ( Март 2009 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения ) |
Biorepository является биологические материалы , хранилище , которое собирает, хранит и распространяет biospecimens для поддержки будущих научных исследований [1] Biorepositories может содержать или управлять образцами от животных, включая человека, и многих других живых организмов. Позвоночные , беспозвоночные , членистоногие и другие формы жизни - это лишь некоторые из многих классов живых организмов, которые можно изучать, сохраняя и храня взятые образцы.
Цель [ править ]
Цель биорепозитория - хранить биологические образцы и связанную с ними информацию для будущего использования в исследованиях. Биорепозиторий обеспечивает качество и управляет доступностью и распределением / размещением биологических образцов в своей коллекции.
Операции [ править ]
Четыре основных операции биорепозитория: (i) сбор, (ii) обработка, (iii) хранение или инвентаризация, и (iv) распределение биологических образцов.
(i) Сбор или присоединение - это первая операция, при которой образцы регистрируются как поступившие. Сегодня это обычно выполняется путем сканирования образца штрих-кода с помощью устройства сканирования штрих-кода. Информация об образце передается в систему управления лабораторной информацией («LIMS»). Типичные собранные данные будут источником данных выборки и регистрации данных / времени прибытия в LIMS.
(ii) Обработка образцов - это обычно процесс проверки качества, который выполняется одинаково для каждого из образцов, чтобы минимизировать отклонения из-за обращения с образцом и подготовить образец для хранения. Обычно этот процесс облегчает долгосрочное хранение образцов определенного типа - например, образцы ДНК обрабатываются в солевом буфере (водном растворе) с надлежащим pH для стабилизации ДНК для хранения.
(iii) Хранение и инвентаризация - это место, где все образцы хранятся до того, как они будут запрошены посредством запроса на распространение. Система инвентаризации состоит из ящиков для хранения образцов, которые хранятся в морозильных камерах различных типов в зависимости от требований к хранению образцов.
(iv) Распространение - это процесс извлечения одного или нескольких образцов из системы инвентаризации биорепозитория.
Стандартные рабочие процедуры [ править ]
Стандартные операционные процедуры (СОП) играют решающую роль в индустрии биорепозиториев. Они важны по ряду причин:
- СОП снижают вероятность появления проблемных переменных в образцах и процессах хранения, предоставляя стандартизированные рекомендации по надлежащему хранению и уходу. [2]
- Образцы биопрепаратов должны быть очень похожи на биопрепараты в их естественном состоянии. СОПы помогают в этом.
- СОПы обеспечивают стандартизированную структуру того, как проводить операции в биохранилище. Они обеспечивают бесперебойную и надежную реализацию всех операций. [3]
Важные биорепозитории [ править ]
Репозиторий ДНК и клеточных линий NINDS Human Genetics
Репозиторий ДНК и клеточных линий NINDS Human Genetics ориентирован на открытие генов как способ определения генетических причин состояний, влияющих на нервную систему. Образцы берутся у пациентов с эпилепсией, цереброваскулярным заболеванием, заболеванием двигательных нейронов, синдромом Туретта и паркинсонизмом. Также собираются контрольные образцы.
Репозиторий генетических клеток человека NIGMS
Репозиторий генетических клеток человека NIGMS предоставляет ресурсы для генетических и клеточных исследований. Образцы включают четко очерченные клеточные линии и высококачественную ДНК, которые демонстрируют множество хромосомных аномалий, болезненных состояний и внешне здоровых людей.
Репозиторий стареющих клеток NIA
Хранилище клеток старения NIA помогает проводить молекулярные и клеточные исследования причин старения и механизмов дегенерации, с которыми они связаны. Ячейки в этих отчетах были собраны за последние 30 лет с использованием строгих диагностических критериев. Исследователи используют эти жизнеспособные и хорошо охарактеризованные культуры для проведения исследований таких заболеваний, как паркинсонизм, синдром Вернера, болезнь Альцгеймера и прогерия .
Репозиторий плюрипотентных стволовых клеток человека (hPSC) CIRM
Репозиторий плюрипотентных стволовых клеток человека (hPSC) CIRM - это большое хранилище с сотнями различных линий плюрипотентных стволовых клеток, созданных для лечения множества заболеваний. К ним относятся расстройства аутистического спектра и другие нарушения нервного развития, болезнь Альцгеймера, болезни слепящих глаз, болезни легких, печени и сердца, а также контрольные образцы.
Хранилище образцов NHGRI для генетических исследований человека
В апреле 2003 года хранилище образцов NHGRI для генетических исследований человека успешно завершило секвенирование генома человека. Их миссия сейчас - принять участие в широком спектре исследований, направленных на понимание функции и структуры этого генома и его роли в здоровье и болезнях.
Коллекция клеток Аллена
Коллекция клеток Аллена - это ресурс индуцированных человеком плюрипотентных стволовых клеток, происходящих из родительской линии WTC-11, в которой информация о пациенте не идентифицирована.
Ресурсы по исследованию аутизма
Ресурс по исследованию аутизма, финансируемый штатом Нью-Джерси, был создан для поддержки исследований аутизма в семьях, где один ребенок страдает, а другой проявляет признаки связанного с ним значительного нарушения развития или где затронуты несколько детей.
Американская диабетическая ассоциация, исследование GENNID
Цель исследования GENNID Американской диабетической ассоциации - создать банк клеток и национальную базу данных, состоящую из генетического материала и информации из известных семей с инсулинозависимым диабетом. Центр предоставляет исследователям образцы и информацию, необходимую для проведения исследований генетической связи и поиска генов этого состояния.
Репозиторий CHDI
ДНК Хантингтона доступны в репозитории CHDI, и вскоре будут доступны другие белки, такие как антигенные пептиды и антитела, а также клеточные линии.
Хранилище клеток и ДНК CDC
Образцы ДНК, полученные из трансформированных клеточных линий для использования в молекулярно-генетическом тестировании, доступны в Программе координации эталонных материалов для генетического тестирования Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC). Эти образцы взяты из таких заболеваний, как болезнь Хантингтона, муковисцидоз, синдром ломкой Х-хромосомы, альфа-талассемия и синдром Мюнке.
Репозиторий USIDNET
Репозиторий USIDNET был создан для предоставления функциональных лимфоидных клеток и ДНК, полученных от пациентов с многочисленными заболеваниями, связанными с первичным иммунодефицитом. К ним относятся редкие нарушения, связанные с функцией иммунных клеток, и нарушения, вызванные аномалиями комплемента, антител и других механизмов иммунной системы.
Эталонный геном человека Института Дж. Крейга Вентера (HuRef)
Справочный геном человека Института Дж. Крейга Вентера (HuRef) предоставляет доступ к ДНК от Дж. Крейга Вентера, чей геном был секвенирован и собран. Образцы ДНК получены из линии лимфобластоидных клеток из образца периферической крови человека.
Генетический репозиторий NEI-AREDS
Генетический репозиторий NEI-AREDS был создан для того, чтобы узнать, как развиваются и прогрессируют катаракта и дегенерация желтого пятна, поскольку они являются двумя основными причинами потери зрения у пожилых людей. В исследовании также были проверены определенные минералы и витамины, чтобы определить, могут ли они помочь замедлить или предотвратить эти состояния. [4]
Межгорный биорепозиторий Межгорный биохранилище - лучший в своем классе биобанк, который Intermountain начал в 1970-х годах. Межгорный биорепозиторий - один из крупнейших и наиболее полных доступных биорепозиториев. хранит более 4,5 миллионов биологических образцов, сохраненных в формалине и залитых парафином. Эти исторические образцы имеют возраст 10 лет и старше и больше не используются для оказания немедленной клинической помощи.
См. Также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ Информационный бюллетень ISBER Том № 1, Выпуск № 1
- ^ «Геномная медицина: стандартные операционные процедуры (СОП) биобанкинга» . Внутри биобанкинга . 2015-12-08 . Проверено 16 октября 2017 .
- ^ «Важность стандартных операционных процедур (SOPS) в биобанкинге» . Биорепозиторий . Проверено 16 октября 2017 .
- ^ "Архивная копия" . Архивировано из оригинала на 2017-10-07 . Проверено 7 октября 2017 .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
Внешние ссылки [ править ]
- Список центральных биорепозиториев образцов , всемирный список активных биобанков и биорепозиториев
- База данных клинических образцов и хранилище коллекций образцов
- Биорепозиторий LIMS , программное решение LIMS для биобанков и биорепозиториев
- Глобальный каталог биобанков, банков тканей и биорепозиториев
- Репозиторий образцов на ВИЧ / СПИД Национального института аллергии и инфекционных заболеваний
- Международное общество биологических и экологических хранилищ («ISBER»)
- ProMedDx BioServices cGMP Биохранилище и биорепозиторий - Консультационный дизайн биорепозитория
- Cell & Co Biorepository - первый французский эко-биобанк