Битопные белки (также известные как однопроходные или однопроходные белки) представляют собой трансмембранные белки, которые покрывают липидный бислой только один раз. [1] Эти белки могут составлять до 50% всех трансмембранных белков , в зависимости от организма, и вносят значительный вклад в сеть взаимодействий между различными белками в клетках , включая взаимодействия через трансмембранные спирали . [2] Обычно они включают один или несколько водорастворимых доменов, расположенных по разные стороны биологических мембран , например, при однопроходномтрансмембранные рецепторы . Некоторые из них являются небольшими и служат регуляторными или структурно-стабилизирующими субъединицами в больших мультибелковых трансмембранных комплексах, таких как фотосистемы или дыхательная цепь .
Классификация на основе топологии [ править ]
Битопные белки подразделяются на 4 типа, в зависимости от их трансмембранной топологии и положения трансмембранной спирали в аминокислотной последовательности белка. Согласно Uniprot : [3]
- Тип I - это битопический белок с N-концом на внеклеточной стороне мембраны и удаленным сигнальным пептидом ;
- Тип II - это битопический белок с N-концом на цитоплазматической стороне мембраны и трансмембранной спиралью, расположенной близко к N-концу, где он работает как якорь;
- Тип III - это битопический белок с N-концом на внеклеточной стороне мембраны и без сигнального пептида ;
- Тип IV - это битопический белок с N-концом на цитоплазматической стороне мембраны и трансмембранной спиралью, расположенной рядом с C-концом, где он работает как якорь.
Следовательно, белки типа I прикреплены к липидной мембране с помощью якорной последовательности стоп-переноса, и их N-концевые домены нацелены на просвет ER во время синтеза (и внеклеточное пространство, если зрелые формы расположены на плазмалемме ). Тип II и III заякорены с помощью сигнально-якорной последовательности, при этом тип II нацелен на просвет ER с его C-концевым доменом, тогда как у типа III их N-концевые домены нацелены на просвет ER. Тип IV подразделяется на IV-A, с их N-концевыми доменами, нацеленными на цитозоль, и IV-B, с N-концевым доменом, нацеленным на просвет. [4] Последствия для деления на четыре типа особенно проявляются во время транслокации и трансляции, связанной с ER, когда белок должен пройти через мембрану ER в направлении, зависящем от типа.
Базы данных [ править ]
- База данных мембраном - это база данных битопических белков нескольких модельных организмов.
- Битопические белки в базе данных OPM
Ссылки [ править ]
- ^ Структурная биология мембран: с биохимическими и биофизическими основами, Мэри Лаки, 2014, Cambridge University Press , стр.91.
- ^ Звилинг, Моти; Кочва, Узи; Аркин, Исайя Т. (2007). «Насколько важны трансмембранные спирали белков битопической мембраны?». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны . 1768 (3): 387–392. DOI : 10.1016 / j.bbamem.2006.11.019 . PMID 17258687 .
- ^ Определения топологии в Uniprot, см. [1] , [2]
- ^ Харви Лодиш и др .; Молекулярная клеточная биология , шестое издание, стр. 546
 | Эта статья по биологии - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
