Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Clostridiaceae семья из бактерий класса клостридий и содержат род Clostridium .

Семейство Clostridiaceae (научное название) определяется таксономическим контуром Бергей Руководства по систематической бактериологии содержит в качестве своего основного рода Clostridium ( в буквальном смысл ), а также Acetivibrio , Acidaminobacter , Alkaliphilus , Anaerobacter , Caloramator , Caloranaerobacter , Coprobacillus , Dorea , Natronincola , Oxobacter , Sarcina , Sporobacter , Thermobrachium , Thermohalobacter , иТиндаллия . Предыдущее включение этих дополнительных родов (как показано справа) в семейство Clostridiaceae по большей части основано на том, что типовые виды этих родов во многих случаях филогенетически связаны с неправильно классифицированными видами рода Clostridium . Однако, за исключением Anaerobacter , Caloramator , Oxobacter , Sarcina и Thermobrachium , эти роды находятся вне зоны действия того, что можно считать истинным семейством Clostridiaceae, и теперь считаются принадлежащими к другим семействам с низким G + C, Gram- положительный тип.

Эта неправильная классификация является результатом хорошо известных проблем современной таксономической структуры традиционного рода Clostridium . Филогенетический анализ Коллинза (1994) был первым крупномасштабным сравнением последовательностей гена 16S рРНК видов рода Clostridium и родственных ему таксонов. Тот факт, что виды рода Clostridium не образуют монофилетическую группу, был показан в ряде исследований, в которых небольшие группы видов Clostridium сравнивались еще в 1981 году. Сравнительное исследование Коллинза (1994) и последующие исследования можно использовать для вывода, что более половины видов, отнесенных в настоящее время к этому роду, на самом деле не имеют близкого родства с типовым видом C. butyricum, и с филогенетической точки зрения не должны включаться в новый род Clostridium . [2]

Это обширное генетическое разнообразие рода Clostridium было продемонстрировано с помощью исследований гибридизации 23S рРНК: ДНК еще в 1975 году Джонсоном и Фрэнсисом, но подход к последовательности генов 16S рРНК выявил фактические филогенетические отношения между видами этого рода и другими родами.

Род Clostridium в настоящее время включает 152 достоверно описанных вида в номенклатуре. [3] Однако на основе анализа последовательностей гена 16S рРНК только 73 из них попадают в зону действия типовых видов рода Clostridium .

Подразделения [ править ]

  • Алкалифил
  • Анаэромикробий
  • Анаэрозолибактер
  • Аноксинатрон
  • Бедуини
  • Брассицибактер
  • Butyricicoccus
  • Caldanaerocella
  • Калдисалинибактер
  • Калораматор
  • Caloranaerobacter
  • Каминицелла
  • Clostridiisalibacter
  • Clostridium
  • Крассаминицелла [4]
  • Desnuesiella
  • Энтероклостер
  • Falcatimonas
  • Фервидицелла
  • Fonticella
  • Геоспоробактер
  • Haloimpatiens
  • Hathewaya
  • Hungatella
  • Inediibacterium
  • Кератинибакул
  • Khelaifiella
  • Лакримиспора
  • Лактонифактор
  • Линмингия
  • Лютиспора
  • Маледивибактер
  • Мариниспоробактер
  • Массилиоклостридиум
  • Мордавелла
  • Натронинкола
  • Oceanirhabdus
  • Оксобактер
  • Парамаледивибактер
  • Proteiniclasticum
  • Салимезофилобактер
  • Sarcina
  • Сенегалия
  • Серпентиницелла
  • Sporosalibacterium
  • Термопрахиум
  • Thermohalobacter
  • Thermotalea
  • Тиндаллия
  • Wukongibacter
  • Youngiibacter
  • " Ca. Arthromitus "
  • " Ca. Savagella " Thompson et al. 2012 г.

Ссылки [ править ]

  1. ^ Pribram, Эрнст Август  [ де ] : Классификация Schizomyceten. Ф. Дойтике, Лейпциг, (1933), стр. 1–143.
  2. ^ Коллинз, Мэриленд; Лоусон, Пенсильвания; Виллемс, А; Кордова, JJ; Фернандес-Гарайзабал, Дж .; Гарсия, П.; Цай, Дж; Hippe, H; Фэрроу, Дж. А. (октябрь 1994 г.). «Филогения рода Clostridium: предложение пяти новых родов и одиннадцати новых комбинаций видов» . Международный журнал систематической бактериологии . 44 (4): 812–26. DOI : 10.1099 / 00207713-44-4-812 . PMID  7981107 .
  3. ^ www.bacterio.net
  4. ^ Lakhal, R; Pradel, N; Postec, A; Оливье, Б; Cayol, JL; Годфрой, А; Фардо, ML; Гале, Г. (сентябрь 2015 г.). «Crassaminicella profunda gen. Nov., Sp. Nov., Анаэробная морская бактерия, выделенная из глубоководных отложений» (PDF) . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 65 (9): 3097–102. DOI : 10.1099 / ijsem.0.000386 . PMID 26296351 .