Эта статья поднимает множество проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалить эти сообщения-шаблоны ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения )
|
Clostridiaceae | |
---|---|
Микрофотография из Clostridium ботулинического бактерии окрашивали кристаллическим фиолетовым | |
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Фирмикуты |
Класс: | Clostridia |
Заказ: | Clostridiales |
Семья: | Clostridiaceae Pribram 1933 [1] |
Clostridiaceae семья из бактерий класса клостридий и содержат род Clostridium .
Семейство Clostridiaceae (научное название) определяется таксономическим контуром Бергей Руководства по систематической бактериологии содержит в качестве своего основного рода Clostridium ( в буквальном смысл ), а также Acetivibrio , Acidaminobacter , Alkaliphilus , Anaerobacter , Caloramator , Caloranaerobacter , Coprobacillus , Dorea , Natronincola , Oxobacter , Sarcina , Sporobacter , Thermobrachium , Thermohalobacter , иТиндаллия . Предыдущее включение этих дополнительных родов (как показано справа) в семейство Clostridiaceae по большей части основано на том, что типовые виды этих родов во многих случаях филогенетически связаны с неправильно классифицированными видами рода Clostridium . Однако, за исключением Anaerobacter , Caloramator , Oxobacter , Sarcina и Thermobrachium , эти роды находятся вне зоны действия того, что можно считать истинным семейством Clostridiaceae, и теперь считаются принадлежащими к другим семействам с низким G + C, Gram- положительный тип.
Эта неправильная классификация является результатом хорошо известных проблем современной таксономической структуры традиционного рода Clostridium . Филогенетический анализ Коллинза (1994) был первым крупномасштабным сравнением последовательностей гена 16S рРНК видов рода Clostridium и родственных ему таксонов. Тот факт, что виды рода Clostridium не образуют монофилетическую группу, был показан в ряде исследований, в которых небольшие группы видов Clostridium сравнивались еще в 1981 году. Сравнительное исследование Коллинза (1994) и последующие исследования можно использовать для вывода, что более половины видов, отнесенных в настоящее время к этому роду, на самом деле не имеют близкого родства с типовым видом C. butyricum, и с филогенетической точки зрения не должны включаться в новый род Clostridium . [2]
Это обширное генетическое разнообразие рода Clostridium было продемонстрировано с помощью исследований гибридизации 23S рРНК: ДНК еще в 1975 году Джонсоном и Фрэнсисом, но подход к последовательности генов 16S рРНК выявил фактические филогенетические отношения между видами этого рода и другими родами.
Род Clostridium в настоящее время включает 152 достоверно описанных вида в номенклатуре. [3] Однако на основе анализа последовательностей гена 16S рРНК только 73 из них попадают в зону действия типовых видов рода Clostridium .
Подразделения [ править ]
- Алкалифил
- Анаэромикробий
- Анаэрозолибактер
- Аноксинатрон
- Бедуини
- Брассицибактер
- Butyricicoccus
- Caldanaerocella
- Калдисалинибактер
- Калораматор
- Caloranaerobacter
- Каминицелла
- Clostridiisalibacter
- Clostridium
- Крассаминицелла [4]
- Desnuesiella
- Энтероклостер
- Falcatimonas
- Фервидицелла
- Fonticella
- Геоспоробактер
- Haloimpatiens
- Hathewaya
- Hungatella
- Inediibacterium
- Кератинибакул
- Khelaifiella
- Лакримиспора
- Лактонифактор
- Линмингия
- Лютиспора
- Маледивибактер
- Мариниспоробактер
- Массилиоклостридиум
- Мордавелла
- Натронинкола
- Oceanirhabdus
- Оксобактер
- Парамаледивибактер
- Proteiniclasticum
- Салимезофилобактер
- Sarcina
- Сенегалия
- Серпентиницелла
- Sporosalibacterium
- Термопрахиум
- Thermohalobacter
- Thermotalea
- Тиндаллия
- Wukongibacter
- Youngiibacter
- " Ca. Arthromitus "
- " Ca. Savagella " Thompson et al. 2012 г.
Ссылки [ править ]
- ^ Pribram, Эрнст Август : Классификация Schizomyceten. Ф. Дойтике, Лейпциг, (1933), стр. 1–143.
- ^ Коллинз, Мэриленд; Лоусон, Пенсильвания; Виллемс, А; Кордова, JJ; Фернандес-Гарайзабал, Дж .; Гарсия, П.; Цай, Дж; Hippe, H; Фэрроу, Дж. А. (октябрь 1994 г.). «Филогения рода Clostridium: предложение пяти новых родов и одиннадцати новых комбинаций видов» . Международный журнал систематической бактериологии . 44 (4): 812–26. DOI : 10.1099 / 00207713-44-4-812 . PMID 7981107 .
- ^ www.bacterio.net
- ^ Lakhal, R; Pradel, N; Postec, A; Оливье, Б; Cayol, JL; Годфрой, А; Фардо, ML; Гале, Г. (сентябрь 2015 г.). «Crassaminicella profunda gen. Nov., Sp. Nov., Анаэробная морская бактерия, выделенная из глубоководных отложений» (PDF) . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 65 (9): 3097–102. DOI : 10.1099 / ijsem.0.000386 . PMID 26296351 .