Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
«Верхняя» часть ( область Fab ) антитела. Определяющие комплементарность области тяжелой цепи показаны красным ( PDB : 1IGT ).

Определяющие комплементарность области ( CDR ) являются частью вариабельных цепей в иммуноглобулинах (антителах) и рецепторах Т-клеток , генерируемых В-клетками и Т-клетками соответственно, где эти молекулы связываются со своим специфическим антигеном. Набор CDR составляет паратоп . Как наиболее вариабельные части молекул, CDR имеют решающее значение для разнообразия антигенных специфичностей, генерируемых лимфоцитами .

Расположение и структура [ править ]

Эскиз антитела с доменами переменных , показанных в синем цвете, и CDR , (которые являются частью вариабельных доменов) , в светло - голубом.

Есть три CDR , (CDR1, CDR2 и CDR3), расположенных последовательно , не на аминокислотной последовательности в виде вариабельный домен рецептора антигена. Поскольку рецепторы антигена обычно состоят из двух вариабельных доменов (на двух разных полипептидных цепях, тяжелой и легкой цепи ), существует шесть CDR для каждого рецептора антигена, которые могут вместе вступать в контакт с антигеном. Одна молекула антитела имеет два рецептора антигена и, следовательно, содержит всего двенадцать CDR. На вариабельный домен в антителах приходится три петли CDR. Шестьдесят CDR можно найти на пентамерной молекуле IgM .

Поскольку большая часть вариаций последовательностей, связанных с иммуноглобулинами и рецепторами Т-клеток, обнаруживается в CDR, эти области иногда называют гипервариабельными областями . [1] В вариабельном домене CDR1 и CDR2 находятся в вариабельной (V) области полипептидной цепи, а CDR3 включает часть V, все разнообразие (D, только тяжелые цепи) и соединяющиеся (J) области. [2] CDR3 - наиболее изменчивый.

Третичная структура антитела имеет важное значение для анализа и разработки новых антител. Трехмерные структуры не-H3 CDR антител были сгруппированы и классифицированы Chothia et al. [3] и совсем недавно North et al. [4] Гомологическое моделирование - это вычислительный метод построения третичных структур из аминокислотных последовательностей. Так называемые H3-правила - это эмпирические правила для построения моделей CDR3. [5]

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Abbas AK и Lichtman AH (2003). Клеточная и молекулярная иммунология (5-е изд.). Сондерс, Филадельфия. ISBN 0-7216-0008-5.
  2. ^ Уильям Э. Пол (2008). Фундаментальная иммунология (6-е изд.). Липпинкотт Уильямс и Уилкинс. ISBN 978-0-7817-6519-0.
  3. ^ Аль-Lazikani, В .; Леск AM; Чотиа, К. (1997). «Стандартные конформации канонических структур иммуноглобулинов». Журнал молекулярной биологии . 273 (4): 927–948. DOI : 10.1006 / jmbi.1997.1354 . PMID 9367782 . 
  4. ^ Север, B .; Lehmann, A .; Данбрак-младший, Р.Л. (2011). «Новая кластеризация конформаций петли CDR антитела» . Журнал молекулярной биологии . 406 (2): 228–256. DOI : 10.1016 / j.jmb.2010.10.030 . PMC 3065967 . PMID 21035459 .  
  5. ^ Сираи, H; Кидера, А; Накамура, Х (1999). «H3-правила: идентификация структур CDR-H3 в антителах» . Письма FEBS . 455 (1-2): 188–97. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 00821-2 . PMID 10428499 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Дополнительность + определение + регионов в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • PyIgClassify - сервер для классификации CDR конформаций