Кринивирус , ранее принадлежавший к группе вирусов инфекционной желтизны салата , представляет собой род вирусов , принадлежащих к семейству Closteroviridae . [1] Это линейные одноцепочечные вирусы с положительной смысловой РНК (следовательно, они относятся к группе IV ). [2] В этом роду 14 видов. [1] Заболевания, связанные с этим видом, включают: пожелтение и некроз, особенно поражающие флоэму. [1] [3]
Кринивирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Kitrinoviricota |
Класс: | Alsuviricetes |
Заказ: | Мартелливиралес |
Семья: | Closteroviridae |
Род: | Кринивирус |
Разновидность | |
См. Текст |
3'-концевой псевдоузел в SPCSV | |
---|---|
Идентификаторы | |
Рфам | RF01091 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Снг |
Домен (ы) | Кринивирус |
Структуры PDB | PDBe |
Примеры видов, чьи полные геномы были секвенированы , которые в настоящее время классифицируются в этот род, включают вирус хлоротической остановки роста сладкого картофеля (SPCSV) и вирус инфекционной желтизны салата (LIYV). [4] [5]
Генетика
Вирусы этого рода имеют сегментированные двудольные геномы, которые в сумме составляют до 7 500–19 500 нуклеотидов в длину. Их геномы также кодируют белки, которые не входят в состав частиц вириона, а также структурные белки. Универсальная база данных вирусов описывает, что их геномные последовательности около их 3'-концов способны образовывать шпильки-петли, а также полагают, что их 5'-концы могут иметь метилированные шапки. [5] Каждая из молекул вирусной РНК содержит четыре шпильки и псевдоузел в 3'UTR . Псевдоузел необычен тем, что внутри петли L1 он содержит небольшую структуру « стебель-петля» . [6] В родственном роду Closterovirus эти вторичные структуры оказались важными для репликации вирусной РНК. [7]
Состав
Вирусы рода Crinivirus не имеют оболочки и имеют двудольную нитевидную геометрию. Диаметр около 10-13 нм, длина 700-900 нм. Геномы бывают линейными и двудольными, длиной около 17,6 килобайт. [1] [3]
Род | Состав | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Кринивирус | Нитчатый | Без оболочки | Линейный | Одно-, двух- или трехчастные |
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина за счет движения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через переносчика (bemisia tabaci). Маршрут передачи - механический. [1] [3]
Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Кринивирус | Растения | Никто | Вирусное движение; механическая инокуляция | Вирусное движение | Цитоплазма | Цитоплазма | Механическая инокуляция: насекомые (белокрылка) |
Таксономия
К роду отнесены следующие виды: [8]
- Вирус желтизны абутилон
- Вирус бобово-желтого цвета
- Вирус псевдоожеллы свеклы
- Вирус, связанный с желтой жилкой ежевики
- Вирус задержки роста тыквенного желтого
- Вирус хлороза вен диодных вен
- Вирус хлороза салата
- Вирус инфекционной желтизны салата
- Вирус желтой жилки картофеля
- Вирус, связанный с клубничным паллидозом
- Вирус хлоротичного роста сладкого картофеля
- Вирус хлороза жилок теттерворта
- Вирус томатного хлороза
- Вирус инфекционного хлороза томатов
Рекомендации
- ^ a b c d e "Отчет ICTV Closteroviridae" .
- ^ Управление ICTVdB (2006). 00.017.0.02. Кринивирус. В: ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 4. Бюхен-Осмонд, К. (Эд), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.
- ^ а б в «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
- ^ Журнал вирусологии. 2002 сентябрь; 76 (18): 9260–9270
- ^ a b Управление ICTVdB (2006)
- ^ Livieratos IC, Eliasco E, Müller G и др. (Июль 2004 г.). «Анализ РНК вируса желтой жилки картофеля: данные о трехчастном геноме и консервативных 3'-концевых структурах среди представителей рода Crinivirus» . J. Gen. Virol . 85 (Pt 7): 2065–75. DOI : 10.1099 / vir.0.79910-0 . PMID 15218192 .
- ^ Сатьянараяна Т., Гауда С., Айллон М.А., Альбиах-Марти М.Р., Доусон В.О. (август 2002 г.). «Мутационный анализ сигналов репликации в 3'-нетранслируемой области вируса тристезы цитрусовых». Вирусология . 300 (1): 140–52. DOI : 10.1006 / viro.2002.1550 . PMID 12202214 .
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 . Дата обращения 14 мая 2021 .
Внешние ссылки
- Отчет ICTV : Closteroviridae
- Вирусная зона : Кринивирус
- Запись rfam для 3'-концевого псевдонима в SPCSV
- Запись Rfam для 3'-концевого псевдонима CuYV / BPYV
- Запись rfam для 3'-концевого псевдоузла в PYVV