Цистатин

Ингибитор протеиназы I25, цистатин

Кристаллическая структура иммуномодулирующего цистатина слюны мягкого клеща Ornithodoros moubata из PDB, запись 3L0R . ^[1]

Идентификаторы

Символ

Prot_inh_cystat

Клан пфам

Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum	краткое изложение структуры
PDB	PDB : 1a67 PDB : 1a90 PDB : 1cew PDB : 1cyu PDB : 1cyv PDB : 1dvc PDB : 1DVD PDB : 1eqk PDB : 1g96 PDB : 1GD3

В цистатины представляют собой семейство цистеиновых протеаз ингибиторов , которые разделяют последовательность гомологии и общую третичную структуру альфа - спирали , лежащей на верхней части анти-параллельного бета - листа. Семья подразделяется, как описано ниже.

Цистатины проявляют сходство с фетуинами , кининогенами , гликопротеинами, богатыми гистидином, и белками, родственными цистатину . ^[2]^[3]^[4] Цистатины в основном ингибируют ферменты пептидазы (другой термин для обозначения протеаз ), принадлежащих к семействам пептидаз C1 ( семейство папаина ) и C13 ( семейство легумаина ). Известно, что они неправильно сворачиваются с образованием амилоидных отложений и вызывают ряд заболеваний. ^[^{необходима цитата}^]

Типы [ править ]

Семейство цистатина включает:

Цистатины типа 1 являются внутриклеточными и присутствуют в цитозоле многих типов клеток, но также могут появляться в жидкостях организма в значительных концентрациях. Это одноцепочечные полипептиды примерно из 100 остатков, которые не имеют ни дисульфидных связей, ни углеводных боковых цепей. Цистатины 1 типа также известны как Стефины (в честь Института Стефана, где они были впервые обнаружены ^[5] ).
Цистатины типа 2, которые в основном представляют собой внеклеточные секретируемые полипептиды, в значительной степени кислые, содержат четыре консервативных остатка цистеина, которые, как известно, образуют две дисульфидные связи , могут быть гликозилированы и / или фосфорилированы . Они синтезируются с сигнальным пептидом, состоящим из 19–28 остатков. Они широко распространены и содержатся в большинстве жидкостей организма. ^{[ необходима цитата ]}
Цистатины 3-го типа, которые являются мультидоменными белками. Представители этой группы млекопитающих являются кининогенами . У млекопитающих существует три различных кининогена: H- (высокомолекулярный, InterPro : IPR002395 ) и L- (низкомолекулярный) кининоген, которые обнаружены у ряда видов, и T-кининоген, который обнаружен. только у крыс. ^{[ необходима цитата ]}
Неклассифицированные цистатины. Это цистатин-подобные белки, обнаруженные в ряде организмов: фитоцистатины растений, фетуин у млекопитающих, цистатины насекомых и цистатин из ядовитого яда, который ингибирует металлопротеазы семейства пептидаз MEROPS M12 (астацин / адамализин). Также было показано, что ряд цистатиноподобных белков лишен ингибирующей активности. ^{[ необходима цитата ]}

Цистатины человека [ править ]

CST1 , CST 2 , CST 3 (цистатин С, маркером функции почек), CST 4 , CST5 , CST6 , CST7 , CST8 , CST9 , CST11 , CSTA (цистатин А), CSTB (цистатин B) ^{[ править ]}

Цистатины растений [ править ]

Цистатины растений обладают особыми характеристиками, которые позволяют отнести их к особому классу под названием фитоцистатин. Один из них - это наличие N-концевой альфа-спирали, которая присутствует только в цистатинах растений. Фитоцистатины участвуют в нескольких процессах, включая прорастание и защиту растений. van Wyk et al. обнаружили около 19 различных цистатинов, похожих на оризацистатин-I, в сое вместе с родственными цистеиновыми протеазами. ^[6]

Проницаемость мембраны [ править ]

Цистатин цыпленка быстро прошел через мембрану neo T-клеток MCF-10A и ингибировал катепсин B, когда он был ацилирован жирными ацильными остатками с 6-18 атомами углерода. ^[7]^{[ актуально? - обсудить ]}

См. Также [ править ]

Аффимер , тип сконструированного белка, основанный на цистатиновой основе.

Ссылки [ править ]

^ Salát J, Paesen GC, Rezácová P, Kotsyfakis M, Kovárová Z, Sanda M, Majtán J, Grunclová L, Horká H, Andersen JF, Brynda J, Horn M, Nunn MA, Kopácek P, Kopecký J, Mares M (июль 2010). «Кристаллическая структура и функциональная характеристика иммуномодулирующего цистатина слюны мягкого клеща Ornithodoros moubata» . Биохимический журнал . 429 (1): 103–12. DOI : 10.1042 / BJ20100280 . PMC 3523712 . PMID 20545626 .; визуализировано с помощью PyMOL
Перейти ↑ Rawlings ND, Barrett AJ (январь 1990 г.). «Эволюция белков надсемейства цистатина». Журнал молекулярной эволюции . 30 (1): 60–71. DOI : 10.1007 / BF02102453 . PMID 2107324 . S2CID 33504413 .
Перейти ↑ Abrahamson M, Alvarez-Fernandez M, Nathanson CM (2003). «Цистатины». Симпозиум Биохимического общества . 70 (70): 179–99. DOI : 10,1042 / bss0700179 . PMID 14587292 .
↑ Turk V, Bode W (июль 1991 г.). «Цистатины: белковые ингибиторы цистеиновых протеиназ». Письма FEBS . 285 (2): 213–9. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (91) 80804-C . PMID 1855589 . S2CID 40444629 .
^ Machleidt Вт, Borchart U, Фрица Н, Brzin Дж, Ritonja А, В Турке (ноябрь 1983). «Белковые ингибиторы цистеиновых протеиназ. II. Первичная структура стефина, цитозольного белкового ингибитора цистеиновых протеиназ из полиморфноядерных гранулоцитов человека». Hoppe-Seyler's Zeitschrift für Physiologische Chemie . 364 (11): 1481–6. DOI : 10.1515 / bchm2.1983.364.2.1481 . PMID 6689312 .
↑ van Wyk SG, Du Plessis M, Cullis CA, Kunert KJ, Vorster BJ (ноябрь 2014 г.). «Экспрессия и активность цистеиновых протеаз и цистатина во время развития и старения клубеньков сои» . BMC Plant Biology . 14 : 294. DOI : 10,1186 / s12870-014-0294-3 . PMC 4243279 . PMID 25404209 .
^ Kocevar N, N Obermajer, Kreft S (сентябрь 2008). «Проницаемость мембраны ацилированного цистатина зависит от длины ацильной цепи жирного ряда». Химическая биология и дизайн лекарств . 72 (3): 217–24. DOI : 10.1111 / j.1747-0285.2008.00693.x . PMID 18702630 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Цистатин: белок, который беспокоит! Интересная статья о структуре PDB на PDBe

Ли К., Бонгкам-Рудлофф Э., Солльнер К., Янен-Дечент В., Клаессон-Уэлш Л. (январь 2009 г.). «Цистатины 3-го типа; фетуины, кининоген и гликопротеин, богатый гистидином». Границы биологических наук . 14 (14): 2911–22. DOI : 10,2741 / 3422 . PMID 19273244 .

Внешние ссылки [ править ]

Цистатины в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR000010

Эта статья о белках незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid20545626-1] Salát J, Paesen GC, Rezácová P, Kotsyfakis M, Kovárová Z, Sanda M, Majtán J, Grunclová L, Horká H, Andersen JF, Brynda J, Horn M, Nunn MA, Kopácek P, Kopecký J, Mares M (июль 2010). «Кристаллическая структура и функциональная характеристика иммуномодулирующего цистатина слюны мягкого клеща Ornithodoros moubata» . Биохимический журнал . 429 (1): 103–12. DOI : 10.1042 / BJ20100280 . PMC 3523712 . PMID 20545626 .; визуализировано с помощью PyMOL

[PUB00003412-2] Перейти ↑ Rawlings ND, Barrett AJ (январь 1990 г.). «Эволюция белков надсемейства цистатина». Журнал молекулярной эволюции . 30 (1): 60–71. DOI : 10.1007 / BF02102453 . PMID 2107324 . S2CID 33504413 .

[PUB00014312-3] Перейти ↑ Abrahamson M, Alvarez-Fernandez M, Nathanson CM (2003). «Цистатины». Симпозиум Биохимического общества . 70 (70): 179–99. DOI : 10,1042 / bss0700179 . PMID 14587292 .

[PUB00001614-4] Turk V, Bode W (июль 1991 г.). «Цистатины: белковые ингибиторы цистеиновых протеиназ». Письма FEBS . 285 (2): 213–9. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (91) 80804-C . PMID 1855589 . S2CID 40444629 .

[5] Machleidt Вт, Borchart U, Фрица Н, Brzin Дж, Ritonja А, В Турке (ноябрь 1983). «Белковые ингибиторы цистеиновых протеиназ. II. Первичная структура стефина, цитозольного белкового ингибитора цистеиновых протеиназ из полиморфноядерных гранулоцитов человека». Hoppe-Seyler's Zeitschrift für Physiologische Chemie . 364 (11): 1481–6. DOI : 10.1515 / bchm2.1983.364.2.1481 . PMID 6689312 .

[6] van Wyk SG, Du Plessis M, Cullis CA, Kunert KJ, Vorster BJ (ноябрь 2014 г.). «Экспрессия и активность цистеиновых протеаз и цистатина во время развития и старения клубеньков сои» . BMC Plant Biology . 14 : 294. DOI : 10,1186 / s12870-014-0294-3 . PMC 4243279 . PMID 25404209 .

[7] Kocevar N, N Obermajer, Kreft S (сентябрь 2008). «Проницаемость мембраны ацилированного цистатина зависит от длины ацильной цепи жирного ряда». Химическая биология и дизайн лекарств . 72 (3): 217–24. DOI : 10.1111 / j.1747-0285.2008.00693.x . PMID 18702630 .

[1]