Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Десульфоспоросинус
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Фирмикуты
Класс:
Clostridia
Заказ:
Clostridiales
Семья:
Peptococcaceae
Род:
Десульфоспоросинус

Stackebrandt et al. 1997 [1] исправить. Вацурина и др. 2008 [2]
Разновидность

D. acididurans D. acidiphilus
D. auripigmenti
D.
burensis
D. hippei
D. lacus
D. meridiei
D. orientis
D. youngiae

Desulfosporosinus - это род строго анаэробных сульфатредуцирующих бактерий , часто встречающихся в почве .

Виды типа D. Orientis был выделен в 1959 году [3] с именем предложили Desulfovibrio Orientis , а затем был назначен к роду Desulfotomaculum . [4] На основании данных о последовательности гена 16S рРНК Desulfotomaculum orientis был реклассифицирован как Desulfosporosinus orientis в 1997 году. [1]

Виды [ править ]

Этот список неполный ; вы можете помочь, добавив недостающие элементы из надежных источников .
РазновидностьТип штаммаИзолированный отЗаметкиРекомендации
D. acididuransM1 ( DSM 27692 )Кислый осадокумеренно ацидофильный[5]
D. acidiphilusSJ4 ( DSM 22704 )Кислотный осадок шахтного дренажаумеренно ацидофильный[6]
D. auripigmentiOREX-4 ( DSM 13351 )Пресноводный осадок( [7] ) [8]
D. burensisBSREI1 ( DSM 24089 )Скважина[9]
D. hippei343 ( DSM 8344 )Вечномерзлый грунт[2]
D. lacusSTP12 ( DSM 15449 )Пресноводный осадок[10]
D. meridieiS10 ( DSM 13257 )Загрязненные газолином грунтовые воды[11]
D. orientisСингапур I ( DSM 765 )Почва( [3] [4] ) [1]
D. youngiaeJW / YJL-B18 ( DSM 17734 )Построенные водно-болотные угодья / дренаж кислых отложений[12]

Геномы [ править ]

Доступны пять полных геномов Desulfosporosinus , а еще два генома находятся в процессе секвенирования.

ШтаммСтатусГодРегистрационный номерРекомендации
D. acididurans M1Опубликованный черновик2015 г.LDZY00000000[13]
D. acidiphilus SJ4Завершено и опубликовано2012 г.CP003639[14]
D. meridiei S10Завершено и опубликовано2012 г.CP003629[14]
D. orientis Сингапур IЗавершено и опубликовано2011 г.CP003108[14]
D. sp. ОТЗавершено и опубликовано2011 г.AGAF00000000[15]
D. youngiae JW / YJL-B18Завершено и опубликовано2011 г.CM001441[14]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Stackebrandt, E; C Sproer; Ф.А. Рейни; Дж. Бургхардт; О Пойкер! H Hippe (1997). "Филогенетический анализ рода Desulfotomaculum : доказательства неправильной классификации Desulfotomaculum guttoideum и описания Desulfotomaculum orientis как Desulfosporosinus orientis gen. Nov., Comb. Nov" . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (4): 1134–1139. DOI : 10.1099 / 00207713-47-4-1134 . PMID  9336920 .
  2. ^ а б Вацурина, А; Д Бадрутдинова; П. Шуман; S Весна; М. Вайнштейн (2008). « Desulfosporosinus hippei sp. Nov., Мезофильная сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из вечной мерзлоты» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (5): 1228–1232. DOI : 10.1099 / ijs.0.65368-0 . PMID 18450718 . 
  3. ^ а б Адамс, Мэри Э; Дж. Р. Постгейт (1959). «Новый сульфатредуцирующий вибрион» . Журнал общей микробиологии . 20 (2): 252–257. DOI : 10.1099 / 00221287-20-2-252 .
  4. ^ а б Кэмпбелл, LL; Дж. Р. Постгейт (1965). «Классификация спорообразующих сульфатредуцирующих бактерий». Бактериологические обзоры . 29 (3): 359–363.
  5. ^ Санчес-Андреа, Ирен; Альфонс Дж. М. Стамс; Сабрина Хедрих; Иван Чанкучео; Д. Барри Джонсон (2014). " Desulfosporosinus acididurans sp. Nov .: ацидофильная сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из кислых отложений". Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях . 19 : 39–47. DOI : 10.1007 / s00792-014-0701-6 .
  6. ^ Алазар, Дидье; Манон Джозеф; Фабьен Батталья-Брюне; Жан-Люк Кайоль; Бернар Оливье (2010). « Desulfosporosinus acidiphilus sp. Nov .: умеренно ацидофильная сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из кислых дренажных отложений». Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях . 14 (3): 305–312. DOI : 10.1007 / s00792-010-0309-4 .
  7. ^ Ньюман, Дайан К .; Эрин К. Кеннеди; Джон Д. Коутс; Дайан Ахманн; Дебра Дж. Эллис; Дерек Р. Ловли; Франсуа М. М. Морель (1997). «Диссимиляционное восстановление арсената и сульфата в Desulfotomaculum auripigmentum sp. Nov». Архив микробиологии . 168 (5): 380–388. DOI : 10.1007 / s002030050512 .
  8. ^ Stackebrandt, Erko; Питер Шуман; Эстер Шюлер; Ханс Хиппе (2003). "Реклассификация Desulfotomaculum auripigmentum как Desulfosporosinus auripigmenti corrig., Comb . Nov" . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 53 (5): 1439–1443. DOI : 10.1099 / ijs.0.02526-0 . PMID 13130030 . 
  9. ^ Майе, Бруно; Мари-Лор Фардо; Манон Бартоли-Джозеф; Лори Казало; Аньес Винсо; Марк Лабат (2012). « Desulfosporosinus burensis sp. Nov .: спорообразующая, мезофильная, сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из глубокой глинистой среды». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 63 : 593–598. DOI : 10.1099 / ijs.0.035238-0 . PMID 22544786 . 
  10. ^ Рамамурти, S; H Sass; H Langner; П. Шуман; Р. М. Кроппенштедт; S Весна; Дж. Оверманн; РФ Розенцвейг (2006). « Desulfosporosinus lacus sp. Nov., Сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из нетронутых пресноводных озерных отложений» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 56 (12): 2729–2736. DOI : 10.1099 / ijs.0.63610-0 . PMID 17158969 . 
  11. ^ Робертсон, WJ; JP Bowman; П. Д. Францманн; Би Джей Ми (2001). « Desulfosporosinus meridiei sp. Nov., Спорообразующая сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из загрязненных газолином грунтовых вод» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (1): 133–140. DOI : 10.1099 / 00207713-51-1-133 . PMID 11211250 . 
  12. ↑ Ли, Юн-Джин; Кристофер С. Романек; Юрген Вигель (2009). « Desulfosporosinus youngiae sp. Nov., Спорообразующая сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из построенного водно-болотного угодья, обрабатывающего кислотный дренаж шахт» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (11): 2743–2746. DOI : 10.1099 / ijs.0.007336-0 . PMID 19625426 . 
  13. ^ Петч, Патрик; Похлейн, Аня; Джонсон, Д. Барри; Даниэль, Рольф; Шлеманн, Михаэль; Мюлинг, Мартин (2015). «Последовательность генома умеренно ацидофильного сульфатредуцирующего FirmicuteDesulfosporosinus acididurans (штамм M1T)» . Анонсы генома . 3 (4): e00881-15. DOI : 10,1128 / genomeA.00881-15 . ISSN 2169-8287 . PMC 4541271 . PMID 26251501 .   
  14. ^ a b c d Пестер, Майкл; Эвелин Брамбилла; Дидье Алазар; Томас Раттей; Томас Вайнмайер; Джеймс Хан; Сьюзан Лукас; Алла Лапидус; Ян-Фанг Ченг; Линн Гудвин; Сэм Питлак; Лин Петерс; Галина Овчинникова; Хадзуки Тешима; Джон К. Деттер; Клифф С. Хан; Роксана Тапиа; Miriam L Land; Лорен Хаузер; Никос С. Кирпидес; Наталья Н. Иванова; Иоанна Пагани; Марсель Хантманн; Чиа-Линь Вэй; Карен В. Давенпорт; Хайналка Далиго; Патрик С.Г. Цепь; Эми Чен; Константинос Мавроматис; Виктор Марковиц; Эрнест Сзето; Наталья Михайлова; Амрита Пати; Майкл Вагнер; Таня Войке; Бернар Оливье; Ханс-Петер Кленк; Стефан Спринг; Александр Лой (2012). «Полные последовательности генома Desulfosporosinus orientis DSM765 T ,Desulfosporosinus youngiae DSM17734 Т , Desulfosporosinus meridiei DSM13257 Т и Desulfosporosinus acidiphilus DSM22704 Т " . Журнал бактериологии . 194 (22): 6300-6301. DOI : 10,1128 / JB.01392-12 . ПМК  3486391 . PMID  23105050 .
  15. ^ Abicht, Helge K .; Стефано Манчини; Ольга Васильевна Карначук; Марк Солиоз (2011). «Последовательность генома Desulfosporosinus sp. OT, ацидофильной сульфатредуцирующей бактерии из отходов медной добычи в Норильске, Северная Сибирь» . Журнал бактериологии . 193 (21): 6104–6105. DOI : 10.1128 / JB.06018-11 . PMC 3194917 . PMID 21994931 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Desulfosporosinus в LPSN
  • Desulfosporosinus в NCBI
  • Desulfosporosinus в GOLD
  • Desulfosporosinus в NamesforLife