Dryad - это международное хранилище данных исследований с открытым доступом , особенно данных, лежащих в основе научных и медицинских публикаций (в основном по эволюционной, генетической и экологической биологии). Dryad - это тщательно подобранный репозиторий общего назначения, который делает данные доступными для обнаружения, свободного повторного использования и цитирования. Научная, образовательная и благотворительная миссия Dryad заключается в обеспечении инфраструктуры и поощрении повторного использования данных научных исследований.
Разработчики) | Национальный центр эволюционного синтеза , Исследовательский центр метаданных UNC-CH , Оксфордский университет , Британская библиотека , Калифорнийская цифровая библиотека |
---|---|
Первый выпуск | Январь 2008 г. |
Репозиторий | |
Написано в | Рубин |
Лицензия | Новая лицензия BSD |
Веб-сайт | datadryad |
Видение Dryad - это научная коммуникационная система, в которой научные общества, издатели, исследовательские и образовательные учреждения, финансирующие организации и другие заинтересованные стороны совместно поддерживают и продвигают сохранение и повторное использование данных исследований.
Dryad стремится позволить исследователям проверять опубликованные результаты, исследовать новые методологии анализа, перенаправлять данные для вопросов исследования, которые не были предвидены первоначальными авторами, и выполнять синтетические исследования, такие как формальный метаанализ. Для многих публикаций существующие репозитории данных не охватывают весь пакет данных. В результате многие важные наборы данных не сохраняются и больше не доступны или не могут использоваться в то время, когда их ищут более поздние исследователи. [1]
Dryad служит репозиторием для таблиц, электронных таблиц, плоских файлов и всех других видов опубликованных данных, для которых специализированные репозитории еще не существуют. В оптимальном случае авторы отправляют данные в Dryad вместе с публикацией статьи, чтобы ссылки на данные могли быть включены в публикуемую статью. Все файлы данных в Dryad связаны с опубликованной статьей и доступны для повторного использования в соответствии с условиями отказа Creative Commons Zero .
Dryad также является некоммерческой членской организацией, зарегистрированной в США, предоставляя форум всем заинтересованным сторонам для определения приоритетов хранилища, участия в планировании, обмена знаниями и координации действий в отношении политик данных.
Дриада внесена в Реестр хранилищ исследовательских данных re3data.org. [2]
Функции
Dryad позволяет авторам, журналам, обществам и издателям упростить архивирование данных во время публикации, когда данные легко доступны. Данные в Dryad получают постоянный уникальный идентификатор цифрового объекта (DOI), который может быть включен в опубликованную статью, чтобы читатели могли получить доступ к данным. Авторы могут архивировать данные в Dryad и быть уверены в их сохранности, одновременно выполняя мандаты журналов и исследовательских агентств по распространению результатов своих исследований. [3]
Авторы отправляют данные в Dryad либо когда соответствующая статья находится на рассмотрении, либо когда она принята к публикации. Выбор зависит от того, включает ли журнал данные, попадающие в компетенцию рецензента. Авторы также могут отправлять данные после публикации статьи.
Подачу данных способствуют журналы, отправляющие в Dryad уведомления о новых рукописях. Это избавляет авторов от необходимости повторно вводить библиографические данные при загрузке файлов данных.
Кураторы Dryad просматривают представленные файлы данных и осуществляют контроль качества описаний метаданных перед включением нового контента в репозиторий. Подход Dryad с использованием метаданных подчеркивает простоту и функциональную совместимость, поддерживаемую профилем приложения метаданных Dublin Core . Центр исследований метаданных, который сейчас находится в Колледже вычислительной техники и информатики Университета Дрекселя , раньше служил центральным центром курирования Дриады, а основная деятельность по курированию теперь осуществляется через некоммерческую организацию в Северной Каролине. [4]
Dryad координирует отправку данных в специализированные репозитории, где (а) снижает нагрузку на пользователя за счет оптимизации рабочего процесса отправки и (b) позволяет Dryad и специализированным репозиториям обмениваться идентификаторами и другими метаданными для обеспечения перекрестных ссылок на различные связанные продукты данных. с данной публикацией. Первыми двумя партнерами по установлению связи являются TreeBASE и GenBank , которые партнерские журналы Dryad ранее определили как необходимые точки депонирования данных филогенетического дерева и последовательностей ДНК, соответственно.
Управление, история и финансирование
Дриадой управляет Совет директоров из двенадцати членов , избираемых его членами. Членами могут быть независимые журналы, общества, издатели, исследовательские и образовательные учреждения, библиотеки, спонсоры или другие организации, поддерживающие миссию Дриады. Организация координирует политику обмена данными и способствует долгосрочной устойчивости репозитория.
Dryad начала взимать плату за подачу материалов в сентябре 2013 года. Dryad - это некоммерческая организация, которая предоставляет долгосрочный бесплатный доступ к своему содержанию исследователям, преподавателям или студентам, независимо от национальности или институциональной принадлежности. Dryad может предоставить бесплатный доступ к данным благодаря финансовой поддержке со стороны участников и отправителей данных. Плата за подачу заявки Dryad предназначена для поддержки ее основных функций за счет возмещения основных затрат на кураторство и сохранение данных.
Дриада вышла из Национального эволюционного синтез центра (NESCent) семинара под названием «сохранение цифровых данных, совместное использование и открытие: вызовы для малых научных сообществ в цифровой эпохе» в мае 2007 г. Первоначальное финансирования Дриады было предоставлены по Национальному научному фонду в Национальный центр эволюционного синтеза и другие партнеры в США.
DryadUK был проектом, финансируемым Jisc, который осуществлялся Британской библиотекой и Оксфордским университетом в партнерстве с NESCent, Digital Curation Center и Charles Beagrie Ltd. Этот проект привел к созданию британского зеркала репозитория Dryad, базирующегося в Британской библиотеке. В рамках проекта также были улучшены инструменты, доступные для публикации и цитирования данных, расширен дисциплинарный диапазон участвующих журналов, а также усовершенствована бизнес-структура международной организации, занимающейся долгосрочным сохранением данных.
В 2019 году Dryad объявила о партнерстве с другим хранилищем данных Zenodo для совместной разработки новых решений, ориентированных на поддержку рабочих процессов исследователей и издателей, а также на лучшие практики в области программного обеспечения и курирования данных . [5]
Дриада является членом Сети наблюдения за данными для Земли ( DataONE ).
Программное обеспечение
Изначально Dryad была основана на программном обеспечении репозитория DSpace с открытым исходным кодом, разработанном Массачусетским технологическим институтом и Hewlett-Packard . В 2019 году Dryad перешла на платформу публикации данных Ruby-on-Rails с открытым исходным кодом под названием Stash.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Vision, TJ (2010) Открытые данные и общественный договор научных публикаций. BioScience 60 (5): 330-330. DOI : 10,1525 / bio.2010.60.5.2
- ^ "Запись дриады в re3data.org" . www.re3data.org . Проверено 21 июля 2014 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ Архивирование данных. Майкл К. Уитлок, Марк А. Макпик, Марк Д. Раушер, Лорен Ризеберг и Аллен Дж. Мур, Американский натуралист, Vol. 175, № 2 (февраль 2010), стр 145-146. DOI : 10,1086 / 650340
- ^ Гринберг Д., Белый, H., C, Carrier, С и Scherle, R. (2009). Лучшая практика метаданных для хранилища научных данных. Журнал библиотечных метаданных, 9: 3, 194–212. DOI : 10,1080 / 19386380903405090
- ^ Шельда, Мелиссанна (17.07.2019). «Финансируемое партнерство сближает Дриаду и Зенодо» . Новости и обзоры дриад . Проверено 8 ноября 2019 .
Внешние ссылки
- Dryad: datadryad.org официальный сайт репозитория Dryad
- Вики проекта Dryad Project
- Блог Дриады
- Открытый исходный код настройки Dryad DSpace
- Национальный центр эволюционного синтеза (NESCent)
- Центр исследования метаданных при Университете Дрекселя