eTOX - это временный консорциум, созданный в 2010 году для обмена и использования токсикологических данных. Это предконкурентное сотрудничество, основная цель которого - создание и распространение инструментов для прогнозирования побочных эффектов лекарств на основе доклинических экспериментов. Целями являются лучшая in silico предсказуемость потенциальных нежелательных явлений и сокращение использования животных в токсикологических исследованиях. eTOX финансируется Инициативой инновационных лекарственных средств (IMI). [1]
eTOX | |
---|---|
Часть Инициативы инновационных лекарственных средств | |
Ключевые слова | Открытие Drug , разработки лекарственных средств |
Тип проекта | Совместная технологическая инициатива |
Финансирующее агентство | Седьмая рамочная программа Европейской федерации фармацевтических предприятий и ассоциаций (EFPIA) |
Цель | Разработка in silico стратегий и программных инструментов для прогнозирования токсикологических профилей малых молекул. |
Координатор проекта | Новартис , Байер |
Участников | EFPIA: AstraZeneca , Boehringer Ingelheim , Esteve , GlaxoSmithKline , Janssen Pharmaceutica , Lundbeck , Pfizer , Hoffmann-La Roche , UCB , Sanofi , Servier Academia: Erasmus Universitair Medisch Центр, Fraunhofer Gesellschaft, Fundacio Institut Mar d'Investigacions Mèdiques, Фундасьон Centro Nacional де Investigaciones Oncológicas Carlos III, Европейская лаборатория молекулярной биологии , Ливерпуль Джон Мурс университет , Технический университет Дании , Universitat Политекник де Валенсия, Университет Лестера , Университет Вены , Университет VU Амстердама SME: Lhasa Limited, Inte: Ligand , Molecular Networks, Chemotargets, Lead Molecular Design, Synapse Research Management Partners |
Бюджет |
|
Продолжительность | 2010 - 2016 |
Веб-сайт | www |
Цели
Официальное название консорциума - «Объединение подходов биоинформатики и химиоинформатики для разработки экспертных систем, позволяющих прогнозировать токсичность in silico (eTOX)». eTOX направлен на создание инструментов in silico для прогнозирования токсичности малых молекул на ранних этапах разработки лекарств. [2] Консорциум собирает прогностическую модель на основе набора токсикологических отчетов, подготовленных фармацевтическими компаниями, присоединившимися к консорциуму. В духе IMI, eTOX объединяет частные компании, производящие доклинические данные, и академических партнеров-экспертов по хеминформатике , биоинформатике и обработке естественного языка . Вклад в общественное достояние алгоритмов, [3] [4] [5] программного обеспечения и онтологий [6] является частью дорожной карты.
Организация
Для достижения этой цели был создан консорциум, объединяющий 25 фармацевтических компаний, биотехнологических компаний и университетов. Проект стартовал в 2010 году, изначально он финансировался в течение 5 лет партнерами консорциума и Европейским союзом . Консорциум действительно выиграл от расширения ENSO и продлится до конца 2016 года. Общий предполагаемый бюджет составляет 18,7 миллионов евро.
Партнеры
eTOX сотрудничает с OpenPHACTS , еще одним консорциумом IMI, для повторного использования общедоступных клинических данных. В 2014 году был запущен консорциум IMI iPiE (Интеллектуальная оценка фармацевтических препаратов в окружающей среде), цели аналогичны eTOX, но исходные данные взяты из химических веществ, собранные в соответствии с европейскими правилами REACH [7] . Было согласовано, что будет осуществляться тесное сотрудничество по вопросам разработки баз данных, систем прогнозирования и интеллектуальной собственности.
Результат и распространение
Проект eTox в настоящее время запущен и планируется завершить в декабре 2016 года. Внутренняя работа постепенно становится видимой извне: по состоянию на август 2014 года 3046 отчетов о 4291 исследованиях на животных были вручную собраны и сохранены в базе данных. [8] Еще две тысячи находятся в стадии обработки, и семьдесят четыре модели были построены и проверены, в основном на основе общедоступных данных. [8] Консорциум начал распространение информации, и была опубликована обзорная статья о проекте. [2]
Список научных публикаций (включая статьи и доклады) доступен на публичном сайте eTOX .
Внешний информационный бюллетень [ постоянная битая ссылка ] отпускаются каждый 3 месяца с основными достижениями в рамках проекта, начиная с ноября 2011 года.
Будущее
Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США будет запрашивать в электронном виде исходные данные исследований на животных с использованием Стандарта обмена неклиническими данными при подаче заявок на получение лицензии на новые исследуемые лекарства и биологические препараты . Это широко рассматривается как потенциальный фактор, способный изменить правила игры в токсикологической дисциплине, где обмен данными и интеллектуальный анализ больших массивов данных не являются нормой. Это могло бы позволить автоматический импорт в базу данных, подобную eTOX.
Смотрите также
- Рамочные программы исследований и технологического развития
- Седьмая рамочная программа
Рекомендации
- ^ «eTOX - IMI - Инициатива инновационных лекарственных средств» . europa.eu . Проверено 27 марта 2015 года .
- ^ а б Бриггс, К; Шкафы, М; Слышал, диджей; Пастор, М. Pognan, F; Sanz, F; Шваб, Швейцария; Steger-Hartmann, T; Саттер, А; Уотсон, ДК; Wichard, JD (2012). «Попытки предсказать токсикологию in vivo - введение в проект eTOX» . Международный журнал молекулярных наук . 13 (3): 3820–46. DOI : 10.3390 / ijms13033820 . PMC 3317745 . PMID 22489185 .
- ^ Carrió, P; Пинто, М; Ecker, G; Sanz, F; Пастор, М. (2014). «Анализ области применимости (ADAN): надежный метод оценки надежности прогнозов свойств лекарственного средства». Журнал химической информации и моделирования . 54 (5): 1500–11. DOI : 10.1021 / ci500172z . PMID 24821140 .
- ^ Готье, L; Табуро, О; Audouze, K (2013). «Влияние сетевой биологии на токсикологию лекарств». Экспертное заключение по метаболизму и токсикологии лекарств . 9 (11): 1409–18. DOI : 10.1517 / 17425255.2013.820704 . PMID 23937336 .
- ^ Васкес, Мигель; Краллингер, Мартин; Лейтнер, Флориан; Валенсия, Альфонсо (2011). "Анализ текста для лекарств и химических соединений: методы, инструменты и приложения". Молекулярная информатика . 30 (6–7): 506–519. DOI : 10.1002 / minf.201100005 .
- ^ Харди, B; Apic, G; Carthew, P; Кларк, D; Повар, D; Дикс, я; Эшер, S; Гастингс, Дж; Слышал, диджей; Елязкова, Н; Джадсон, П; Matis-Mitchell, S; Mitic, D; Myatt, G; Шах, я; Spjuth, O; Череменская, О; Тольдо, L; Watson, D; Белый, А; Ян, C (2012). «Перспективы онтологии токсикологии» . АЛЬТЕКС . 29 (2): 139–56. DOI : 10.14573 / altex.2012.2.139 . PMID 22562487 .
- ^ Николотти, О; Benfenati, E; Каротти, А; Гадалета, Д; Гисси, А; Mangiatordi, GF; Новеллино, Э (2014). «Методы REACH и in silico: привлекательная возможность для медицинских химиков». Открытие наркотиков сегодня . 19 : 1757–68. DOI : 10.1016 / j.drudis.2014.06.027 . PMID 24998783 .
- ^ а б Шкафы, М; Бриггс, К; Steger-Hartmann, T; Pognan, F; Marc, P; Kleinöder, T; Шваб, Швейцария; Пастор, М. Wichard, J; Санс, Ф (2014). «Проект по обмену данными eTOX для продвижения в прогнозировании токсичности, вызванной препаратами Silico» . Международный журнал молекулярных наук . 15 (11): 21136–54. DOI : 10.3390 / ijms151121136 . PMC 4264217 . PMID 25405742 .
Внешние ссылки
- Официальный веб-сайт
- Интервью на eTOX с Мишелем Гольдманом, исполнительным директором IMI