Фибробактерии | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | F. succinogenes |
Биномиальное имя | |
Fibrobacter succinogenes (Hungate, 1950) Montgomery et al., 1988 | |
Подвиды | |
| |
Синонимы | |
|
Fibrobacter succinogenes - этовидцеллюлолитических бактерий из рода Fibrobacter . Он присутствует в рубце крупного рогатого скота. Бета-глюканы являются его предпочтительным субстратом в рубце, а продукты его переваривания включают формиат, ацетат и сукцинат. Fibrobacter succinogenes образует характерные протяженные бороздки в кристаллической целлюлозе , а также довольно легко отделяется от субстрата при пробоподготовке. [1]
Близкое родство сукциногенов Fibrobacter с Bacteroidetes и Chlorobi phyla [ править ]
Филогенетические исследования, основанные на последовательностях белков RpoC и Gyrase B, показывают, что Fibrobacter succinogenes тесно связана с видами из филы Bacteroidetes и Chlorobi . [2] Fibrobacter succinogenes и виды из этих двух других типов также разветвляются в одном и том же положении на основе консервативных инделей сигнатур в ряде важных белков. [3] Наконец, что наиболее важно, сравнительные геномные исследования выявили две консервативные сигнатурные индели (вставка из 5-7 аминокислот в белке RpoC и вставка из 13-16 аминокислот в серингидроксиметилтрансферазу ) и один сигнатурный белок (PG00081), которые являются уникально разделяется сукциногенами Fibrobacterи все виды из Bacteroidetes и Chlorobi phyla. [4] Все эти результаты предоставляют убедительные доказательства того, что сукциногены Fibrobacter разделяли общего предка с видами Bacteroidetes и Chlorobi, за исключением всех других бактерий, и эти виды следует признать частью единого супертипа «FCB» . [2] [4]
См. Также [ править ]
- Fssl , рестрикционный фермент, обнаруженный в F. succinogenes.
- Список метаногенов пищеварительного тракта жвачных животных
Ссылки [ править ]
- ^ Palmquist, DL (1995). «Усвояемость хлопкового волокна и цельных семян масличных культур микроорганизмами рубца». Наука и технология кормов для животных . 56 (3–4): 231–42. DOI : 10.1016 / 0377-8401 (95) 00830-6 .
- ^ а б Гупта RS (2008). «Характеристики филогении и сигнатурных последовательностей Fibrobacteres, Chlorobi и Bacteroidetes». Критические обзоры в микробиологии . 30 (2): 123–43. DOI : 10.1080 / 10408410490435133 . PMID 15239383 . S2CID 24565648 .
- ↑ Griffiths E, Gupta RS (сентябрь 2001 г.). «Использование сигнатурных последовательностей в различных белках для определения относительного порядка ветвления бактериальных делений: свидетельство того, что Fibrobacter разошлись в одно и то же время с Chlamydia и Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides» . Микробиология . 147 (Pt 9): 2611–22. DOI : 10.1099 / 00221287-147-9-2611 . PMID 11535801 .
- ^ a b Гупта RS, Лоренцини E (май 2007 г.). «Филогения и молекулярные сигнатуры (консервативные белки и инделки), специфичные для видов Bacteroidetes и Chlorobi» . BMC Evolutionary Biology . 7 : 71. DOI : 10.1186 / 1471-2148-7-71 . PMC 1887533 . PMID 17488508 .
Внешние ссылки [ править ]
- Fibrobacter_succinogenes в браузере таксономии NCBI
- Типовой штамм Fibrobacter succinogenes в Bac Dive - база метаданных по разнообразию бактерий