Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

В кристаллографии , А система дробных координат представляет собой систему координат , в которой ребра элементарной ячейки используются в качестве основных векторов для описания положения атомных ядер. Элементарная ячейка представляет собой параллелепипед, определяемый длинами его краев и углами между ними .

Общий случай [ править ]

Рассмотрим систему периодической структуры в пространстве и используйте , и как три независимых вектора периодов, образующих правую триаду, которые также являются краевыми векторами ячейки системы. Тогда любой вектор в декартовых координатах можно записать как линейную комбинацию векторов периодов

Наша задача состоит в том, чтобы вычислить скалярные коэффициенты , известные как дробные координаты , и , предполагая , , и известны.

Для этого вычислим следующий вектор площади поверхности ячейки

тогда

а объем ячейки равен

Если мы сделаем векторное внутреннее (точечное) произведение следующим образом

тогда мы получаем

По аналогии,

мы приходим к

а также

Если есть много s, которые нужно преобразовать по отношению к одним и тем же векторам периодов, для ускорения мы можем иметь

где

В кристаллографии [ править ]

В кристаллографии , длины ( , , ) из и углов ( , , ) между кромкой (период) векторами ( , , ) от параллелепипеда элементарной ячейки известны. Для простоты он выбран так, чтобы вектор кромки в направлении положительной оси, вектор кромки в плоскости с положительной компонентой оси, вектор кромки с положительной компонентой оси в декартовой системе, как показано на рисунке ниже.

Определение элементарной ячейки с использованием параллелепипеда с длинами , , и углами между сторонами , данными , и [1]

Тогда векторы ребер можно записать как

где все , , , , положительны. Затем выразим все компоненты известными переменными. Это можно сделать с помощью

потом

Последний продолжается

где

Вспоминая , и будучи позитивным, человек получает

Поскольку модуль площади нижней поверхности ячейки равен

объем ячейки параллелепипеда также можно выразить как

. [2]

После того, как объем рассчитан, как указано выше,

Подведем итог выражению векторов ребер (периодов)

Преобразование из декартовых координат [ править ]

Давайте сначала вычислим следующий вектор площади поверхности ячейки

где

Другой вектор площади поверхности клетки

где

Последний вектор площади поверхности ячейки

где

Подвести итоги

В результате [3]

где , , являются компоненты произвольного вектора в декартовой системе координат.

Преобразование в декартовы координаты [ править ]

Чтобы вернуть ортогональные координаты в ?? Ангстремах из дробных координат, можно использовать первое уравнение сверху и выражение векторов краев (периодов) [4] [5]

Для частного случая моноклинной ячейки (общий случай), когда и , это дает:

Поддерживаемые форматы файлов [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Определение элементарной ячейки с использованием параллелепипеда с длинами a , b , c и углами между краями, заданными как α , β , γ " . Ccdc.cam.ac.uk . Архивировано из оригинала на 2008-10-04 . Проверено 17 августа 2016 . CS1 maint: discouraged parameter (link)
  2. ^ "Преобразование системы координат" . www.ruppweb.org . Проверено 19 октября 2016 .
  3. ^ "Преобразование системы координат" . Ruppweb.org . Проверено 19 октября 2016 . CS1 maint: discouraged parameter (link)
  4. ^ Sussman, J .; Holbrook, S .; Церковь, G .; Ким, S (1977). «Процедура уточнения наименьших квадратов структурного фактора для макромолекулярных структур с использованием ограниченных и ограниченных параметров». Acta Crystallogr. . 33 (5): 800–804. Bibcode : 1977AcCrA..33..800S . CiteSeerX 10.1.1.70.8631 . DOI : 10.1107 / S0567739477001958 . 
  5. ^ Россманн, М .; Блоу, Д. (1962). «Обнаружение субъединиц в кристаллографической асимметричной единице». Acta Crystallogr . 15 : 24–31. CiteSeerX 10.1.1.319.3019 . DOI : 10.1107 / S0365110X62000067 .