HLA-A1 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
( МНС класса I , клеточной поверхности антиген) | ||||||||||
О | ||||||||||
Протеин | трансмембранный рецептор / лиганд | |||||||||
Структура | αβ гетеродимер | |||||||||
Подразделения | HLA-A * 01-, β 2 -микроглобулин | |||||||||
Старые имена | HL-A1 | |||||||||
Подтипы | ||||||||||
| ||||||||||
Редкие аллели | ||||||||||
| ||||||||||
Ссылка аллелей на базу данных IMGT / HLA в EBI |
HLA-A1 (A1) представляет собой серотип лейкоцитарного антигена человека в группе серотипа HLA-A "A". Серотип определяется по распознаванию антителом подмножества α 1 α-цепей HLA-A. Для A1 альфа-цепь "A" кодируется группой аллеля HLA-A * 01, а β-цепь кодируется локусом B2M . [1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 0101. A1 и A * 01 почти синонимы по значению. A1 более распространен в Европе, чем где-либо еще, он является частью длинного гаплотипа, который, по-видимому, часто встречался у древних народов Северо-Западной Европы. A1 - частый компонент гаплотипа AH8.1.. Позитивный серотип A1 примерно связан с большим количеством воспалительных заболеваний и состояний, которые, как считается, имеют поражение иммунной системы. Из-за его сцепления с гаплотипом AH8.1 многие исследования показали ассоциацию с A1 или A1, B8 только позже, чтобы показать дрейф ассоциации в сторону аллелей гена области класса II, DR3 и DQ2.5. Хотя неясно, какую роль A1 играет в инфекционном заболевании, некоторая связь с уровнем инфицирования ВИЧ остается ассоциированной с областью A1 гаплотипа.
Серотип [ править ]
A * 01 | A1 | Образец |
аллель | % | размер (N) |
* 0101 | 99 | 5612 |
* 0102 | 95 | 129 |
* 0103 | 78 | 9 |
Во всех случаях до сих пор было обнаружено, что HLA-A1 связан с заболеванием ассоциативно, но лишь немногие из них определяют, что HLA-A1 имеет преобладающий генетический риск по сравнению с другими генами-аллелями в непосредственной близости от гена A1 в большей степени. гаплотип.
A1 и аутоиммунные заболевания [ править ]
Серотип A1 был связан с рядом заболеваний, так как антигены "HL-A" были впервые описаны . Ассоциации быстро расширились и стали включать HLA-B8 «HL-A8» , поскольку было обнаружено, что HLA A1 и B8 обычно связаны. Поскольку DRw3 был охарактеризован, аутоиммунный риск сместился в область класса II.
Гаплотип A1-B58 (A1-B17, где B58 является доминирующим) может оставаться связанным с цитоплазматическим антителом против нейтрофилов (ANCA) [3]
A1 при диабете [ править ]
За исключением диабета 1 типа, большая часть доказательств прямой связи A1 с аутоиммунными заболеваниями испарилась, когда были охарактеризованы гены DR3 и DQ2. Хотя диабет 1 типа демонстрирует расширенную ассоциацию с гаплотипом HLA A1-B8-DR3-DQ2, эта ассоциация, по-видимому, не распространяется за пределы локуса HLA-B. [4] Недавнее исследование фенотипа DR3-DQ2 / DR4-DQ8 показало, что A1-cw7-B8 на самом деле ниже, чем ожидалось, по сравнению с другими типами AB, что указывает на то, что гены, связанные с риском, расположены между B8 и DR3. Однако исследование в другом месте показало, что A * 0101, по-видимому, изменяет риск диабета 1 типа, но не Cw7-B8. [5] Пример диабета 1 типа показывает сложность, присущую использованию только анализа связей для шифрования риска.
A1 и аллергические заболевания, чувствительность [ править ]
В начале исследования HLA была обнаружена связь между HL A1, B8 при аллергическом заболевании, они связаны с расширенной областью HLA A1-B8.
Как ни странно, A1 был также связан с циррозом печени, индуцированным метотрексатом . [6] В то время как A1 была обнаружена отрицательно связанная с другими заболеваниями, такими как пневмокониоз угольных рабочих и проказа. [7] [8] [9]
A1 и инфекционное заболевание [ править ]
В ранних исследованиях было обнаружено, что A1 ассоциирован с некоторыми инфекционными заболеваниями или защищен от них. [10] [11] [12] Некоторые заболевания, связанные с A1, на самом деле связаны с расширенным гаплотипом A1-B8, вирусный гепатит и ускоренное прогрессирование ВИЧ являются примерами.
A1 с B8 показали повышенный риск заражения корью [13], однако значимость не была согласованной. [14] В более поздней статье показана связь A * 0101 с реакцией на противокоревую вакцину ниже среднего . [15] Что касается краснухи, A1-B8 чаще обнаруживается у людей, инфицированных в результате передачи инфекции от матери. [16] Также было обнаружено, что A1 связан с околоротовым герпесом . [10] Также была описана связь между A1 и герпесом . [17] Впоследствии также была показана ассоциация простого герпеса . [18]
A1 в лимфоме [ править ]
В лимфоме Ходжкина HLA-A1 [19], но DR3 выше не обнаружен. [20] Гаплотип A1-B8-DR3-DQ2 имеет известную связь с Т-клеточной лимфомой , ассоциированной с энтеропатией , примерно 70% пациентов являются гомозиготами по DQ2, по крайней мере, с одной копией DR3-DQ2.
Аллели [ править ]
Исследуемая популяция | Freq. (в%) [21] |
---|---|
Южная Ирландия | 25,0 |
Англия Ланкастер | 21,5 |
Уэльс | 21,1 |
Ирландия Северная | 20,2 |
Англия Шеффилд | 19,7 |
Англия Ливерпуль | 19,4 |
Англия Ньюкасл | 19,3 |
Испания Basque Arratia Vall… | 19,2 |
Англия Лидс | 19,1 |
Англия Манчестер | 18,9 |
Австралия Новый Южный Уэльс | 18,7 |
Западная Австралия | 18,5 |
Шотландия Оркнейские острова | 17.0 |
Южная Африка Натал Тамил | 17.0 |
Бельгия | 15.5 |
Северная Италия (1) | 15.4 |
Израильские евреи | 15,2 |
Юго-Восток Франции | 15.0 |
Немецкий Эссен | 14,4 |
Россия Архангельск Поморы | 14.0 |
Надор Металса (берберский) | 13,7 |
Швеция Стокгольм | 13,6 |
Испания Баскский Гипускоа Pro… | 13,5 |
Буркина-Фасо Фулани | 13,3 |
Пакистанский синдхи | 13,3 |
Сербия | 13,2 |
Центр Португалии | 13,0 |
Швеция округ Упсала | 13,0 |
Чехия | 12,7 |
Индия Андхра-Прадеш Голл… | 12,5 |
Израиль Газа палестинцы | 12,4 |
Индия Мумбаи Маратхи | 12,3 |
Тунис | 12,3 |
Алжир1 | 12,3 |
румынский | 12,2 |
Италия | 12.1 |
Россия Северо-Запад | 11,9 |
Кения Нанди | 11,8 |
Испания Восточная Андалусия | 11,4 |
Македония (4) | 11,3 |
Тунис | 11.2 |
Турция (I) | 10.9 |
Испания Северная Кантабрия | 10,8 |
Греция Северная | 10.0 |
Хорватия | 9,7 |
Италия Южная Кампания | 9,7 |
Греция (3) | 9.2 |
Бразилия | 9.1 |
Финляндия | 8.9 |
Саудовская Аравия | 8,7 |
Испания Каталония Жирона | 8,6 |
Пакистан Карачи Парси | 8,3 |
Уганда Кампала | 8,3 |
Монголия Халха | 8.0 |
Иордания Амман | 7.9 |
Испания Северный Кабуэрниго | 7,6 |
Кения Луо | 7,4 |
Болгария | 7.3 |
Россия Чуваши | 7.3 |
Оман | 7.2 |
Сингапур яванский индон… | 7.0 |
Грузия Тибилиси Курды | 6,7 |
Франция Корсика | 6.5 |
Грузия Тибилиси Грузинская… | 5,7 |
Грузия Сванети Сваны | 5,6 |
Китай Цинхай Хуэй | 5.5 |
Мыс австралийских аборигенов… | 5,3 |
Суданский | 5.0 |
Италия Сардиния (3) | 4.5 |
Россия Мурманск Саоми | 4.0 |
Испания Пас Вэлли | 3.8 |
Замбия Лусака | 3.5 |
Буркина-Фасо Римайбе | 3,2 |
Сингапур Риау Малайский | 3,2 |
Кения | 3.1 |
Россия Ненецкий | 3.1 |
Камерунский пигмей бакола | 3.0 |
Таиланд | 2,8 |
Австралийский абориген Groo ... | 2,7 |
Сенегал Ниохоло Манденка | 2,7 |
Камерун Бамилеке | 2,6 |
Индия Джалпайгури Тото | 2,5 |
Китай Шанхай | 2,4 |
Тайланд Северо-Восток | 2,4 |
Представлены только частоты аллелей |
Исследуемая популяция | Freq. (в%) [21] |
---|---|
Индия Северный Дели | 3.3 |
Кения Нанди | 2,7 |
Кабо-Верде Юго-восток I… | 1.6 |
Сенегал Ниохоло Манденка | 1.6 |
Мали Бандиагара | 1.1 |
Тунис | 1.0 |
Гвинея-Бисау | 0,8 |
Мадейра | 0,8 |
Афроамериканцы в США (3) | 0,7 |
Аргентина Тоба Росарио | 0,6 |
США испаноязычный | 0,6 |
Кения Луо | 0,4 |
Камерун Бети | 0,3 |
Россия Тува (2) | 0,3 |
Уганда Кампала | 0,3 |
Представлены только частоты аллелей |
Исследуемая популяция | Freq. (в%) [21] |
---|---|
Израиль ашкенази и не ... | 2.1 |
Кения Нанди | 1,7 |
Суданский | 1.5 |
Кения | 0,7 |
Саудовская Аравия Гураят и… | 0,7 |
Иран Белудж | 0,6 |
Гл. Гуандун Мэйчжоу Хан | 0,5 |
Китай Пекин Шицзячжуань… | 0,2 |
Представлены только частоты аллелей |
Большая часть риска заболевания, связанного с A * 0101, представлена либо риском серотипа A1, либо риском серотипа A1-B8 (в Европе A1-B8 почти всегда состоит из A * 0101 и B * 0801). Другие аллели, A * 0102 и A * 0103, могут представлять определенные риски. Например, было обнаружено, что A * 0102 связан с типом инсульта, который часто наблюдается у детей с серповидно-клеточной анемией. [22]
Сообщается, что в сомалийских общинах в США 2/3 носителей A1 имеют изоформу A * 0103.
Гаплотипы A1-B [ править ]
- A1-B8 Западная Ирландия , Северная Ирландия, Шотландия, Уэльс, Северо - Западная Англия, Скандинавия, Югославия, Россия, ....
- A1-B7 Армения, Австрия, Северо-западная Европа (региональный рекомбинантный вариант между A1-B8 и A2 / A3-B7)
- A1-B13 Уральский
- A1-B35 (Албания, Бельгия, Италия, Греция, Франция - восточное Средиземноморье по происхождению)
- A1-B37 Якуты, Трайбл-Индия, Иерс-Индия, Монгол, Индия, Орочон, Румынский, Югославия, Корейский, Албания, Французский, Немецкий, Маньчжурский
- A1-B51 Югославия, Германия, Иберия, Италия
- A1-B52 Бхаргавас-Индия, Трайбл-Индия, Италия, Иберия, Франция
- A1-B57 (См. Таблицы на странице обсуждения)
- A1-B58 (См. Таблицы на странице обсуждения)
Ссылки [ править ]
- Перейти ↑ Arce-Gomez B, Jones EA, Barnstable CJ, Solomon E, Bodmer WF (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены . 11 (2): 96–112. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x . PMID 77067 .
- ^ Форма запроса аллеля IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Shankarkumar U, Гош К, ПРАДХАН В, Badakere S, Mohanty D (2005). «Иммуногенетическая ассоциация у пациентов с антинейтрофильными цитоплазматическими антителами (ANCA) из Мумбаи, Махараштра, Индия». J Autoimmun . 24 (3): 227–33. DOI : 10.1016 / j.jaut.2005.01.009 . PMID 15848045 .
- ^ Благородный JA, Мартин А., Вальдес AM и др. (2008). «Риск диабета типа 1 для гаплотипов HLA-DR3 зависит от генотипического контекста: ассоциация локусов DPB1 и HLA класса I среди сопоставимых с DR3 и DR4 итальянских пациентов и контрольной группы» . Гм. Иммунол . 69 (4–5): 291–300. DOI : 10.1016 / j.humimm.2008.02.003 . PMC 2505335 . PMID 18486765 .
- ^ Благородный J, Вальдес A, Бугаван T, Apple R, Thomson G, Erlich H (2002). «Локус IA класса HLA влияет на предрасположенность к диабету 1 типа» . Hum Immunol . 63 (8): 657–64. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (02) 00421-4 . PMC 4049513 . PMID 12121673 .
- ^ Zachariae Н, Kragballe К, Thestrup-Pedersen К, Kissmeyer-Нильсен F (1980). «Антигены HLA при циррозе печени, вызванном метотрексатом». Acta Derm. Венереол . 60 (2): 165–66. PMID 6155028 .
- ^ Вагнер М., Darke C (август 1979). «Частота антигенов HLA-A и B у валлийских угольщиков с пневмокониозом и синдромом Каплана». Тканевые антигены . 14 (2): 165–8. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1979.tb00834.x . PMID 91226 .
- ^ Heise ER, Mentnech MS, Olenchock SA и др. (Июнь 1979 г.). «HLA-A1 и пневмокониоз угольщиков». Являюсь. Преподобный Респир. Дис . 119 (6): 903–8. PMID 453710 .
- ^ Shankarkumar U, Гош К, Badakere S, Mohanty D (2003). «Новые аллели HLA класса I, связанные с индийскими больными проказой» . J. Biomed. Biotechnol . 2003 (3): 208–211. DOI : 10.1155 / S1110724303210019 . PMC 400212 . PMID 12975536 .
- ^ a b Рассел А.С., Шлаут Дж (октябрь 1975 г.). «Трансплантационные антигены HL-A у субъектов, восприимчивых к рецидиву герпеса на губах». Тканевые антигены . 6 (4): 257–61. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1975.tb00640.x . PMID 1198581 .
- ^ Heise ER, Major PC, MS Mentnech, Пэрриш EJ, Jordon А.Л., Морган WK (сентябрь 1975). «Преобладание антигенов гистосовместимости W18 и HL-A1 у горняков, устойчивых к осложненному пневмокониозу угольщиков». Вдыхаемая часть . 4, Пет. 2: 495–507. PMID 1236236 .
- ↑ Hug G (май 1976 г.). «Генетические факторы и аутоиммунитет при вирусных гепатитах». Являюсь. J. Clin. Патол . 65 (5 Suppl): 870–5. PMID 218441 .
- ^ Honeyman MC, Дорман DC, Menser MA, Форрест JM, Guinan JJ, Кларк P (февраль 1975). «Антигены HL-A при врожденной краснухе и роль антигенов 1 и 8 в эпидемиологии естественной краснухи». Тканевые антигены . 5 (1): 12–8. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1975.tb00520.x . PMID 1138435 .
- ↑ Harcourt GC, Best JM, Banatvala JE, Kennedy LA (декабрь 1979). «Антигены HLA и ответы на вакцинацию против краснухи» . Дж. Хиг (Лондон) . 83 (3): 405–12. DOI : 10.1017 / S0022172400026231 . PMC 2130160 . PMID 512353 .
- ^ Овсянникова И.Г., Райан Дж. Э., Виркант Р. А., Панкрац В. С., Якобсон Р. М., Польша Г. А. (декабрь 2005 г.). «Иммунологическое значение генов HLA класса I в иммунных ответах цитокинов IFN-гамма и IL-4, специфичных для вируса кори». Иммуногенетика . 57 (11): 828–36. DOI : 10.1007 / s00251-005-0061-6 . PMID 16331510 .
- ^ Форрест Дж. М., Тернбулл FM, Шоллер Г. Ф. и др. (2002). «Пациенты с врожденной краснухой Грегга 60 лет спустя» . Med. J. Aust . 177 (11–12): 664–7. PMID 12463994 .
- ^ Рассел С., Schlaut J (декабрь 1977). «Ассоциация антигена HLA-A1 и предрасположенность к рецидивирующему герпесу». Arch Dermatol . 113 (12): 1721–2. DOI : 10.1001 / archderm.113.12.1721 . PMID 596908 .
- Перейти ↑ Jabbar AA, al-Samarai AM, al-Amar NS (1991). «Антигены HLA, связанные с восприимчивостью к инфекции вируса простого герпеса». Дис. Маркеры . 9 (5): 281–7. PMID 1797451 .
- ^ Ор - J, Доссе J (1983). «HLA и предрасположенность к болезни Ходжкина». Иммунол. Ред . 70 : 167–92. DOI : 10.1111 / j.1600-065X.1983.tb00714.x . PMID 6403456 .
- ^ Hansen JA, Young CW, Whitsett C и др. (1977). «HLA- и MLC-типирование у пациентов с болезнью Ходжкина». Прог. Clin. Биол. Res . 16 : 217–27. PMID 143667 .
- ^ a b c Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены . 61 (5): 403–407. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x . PMID 12753660 .
- ^ Хопп С, Klitz Вт, Благородный Дж, бдение л, Vichinsky Е, Стили L (апрель 2003 г.). «Четкие ассоциации HLA по подтипу инсульта у детей с серповидно-клеточной анемией» . Кровь . 101 (7): 2865–9. DOI : 10.1182 / кровь-2002-09-2791 . PMID 12517810 .