Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Мультигенный гаплотип, человек
HLA-mini.png
Область HLA на хромосоме 6
Класс I, A1-Cw7-B8
Никнеймы«HL A1,8; HL A1, A8; HLA A1-B8;
HLA A * 01-B * 08, HLA A * 01: 01-B * 08: 01»
LociГенАллельСеротип
HLA-F
в
HLA-A		HLA-F* 0101-
HLA-G* 0101-
HLA-A* 0101A1
HLA-EHLA-E* 0101-
Cw-BHLA-C* 0701Cw7
HLA-B* 0801B8
Узлы
Максимум населенияFreq. Максимум
Западная Ирландия> 15,0%
Размер и расположение
ГеныРасположениеразмер (кбит / с)
-66п21.31400

HLA A1-B8 (Также: HL A1,8 ; HL A1, A8 ; HLA A1-Cw7-B8 ; HLA A * 01-B * 08 , HLA A * 0101-B * 0801 , HLA A * 0101-Cw * 0701 -B * 0801 ; HLA - A * 01: 01-C * 07: 01-B * 08: 01 ) представляет собой MultiGene гаплотип , который охватывает МНС класса I область человеческого главного комплекса гистосовместимости на хромосоме 6 . Мультигенный гаплотип - это набор унаследованных аллелей, охватывающих несколько генов, или ген-аллели; общие мультигенные гаплотипы, как правило, являются результатом идентичности по происхождениюот общего предка (имеют недавнего общего предка для этого сегмента хромосомы). Хромосомная рекомбинация фрагментирует мультигенные гаплотипы по мере того, как расстояние до этого предка увеличивается в количестве поколений.

Гаплотип можно записать в расширенной форме, охватывающей основные локусы гистосовместимости, следующим образом:

HLA A * 01: 01  : Cw * 07: 01  : B * 08: 01

Однако внутри гаплотипа есть много других генов-аллелей. В Европе A1-B8 встречается, как правило, как часть гаплотипа HLA A1-B8-DR3-DQ2 . Этот гаплотип составляет 4,7 миллиона нуклеотидов в длину и является вторым по длине гаплотипом, идентифицированным в геноме человека . В Африке A1-B8 и Индии A1-B8 ассоциирован с другими генами и другими вариантами A * 01 и B * 08.

Ассоциации болезней [ править ]

С философской точки зрения A1-B8 - это больше, чем просто два гена-аллеля. Эти аллели генов являются маркерами гаплотипа, участка хромосомы 6, который содержит множество аллелей генов. В своей естественной истории этот гаплотип претерпел некоторый атипичный отбор, в конце периода эволюции он стал преобладающим гаплотипом у северо-западноевропейских предков. Однако сегодня сбор генов связан с увеличением числа случаев некоторых заболеваний. Несмотря на то, что ассоциации были известны почти столько же, сколько были известны A1 и «A8», роль факторов, влияющих на болезнь, все еще не ясна.

A1-B8 и аутоиммунные заболевания [ править ]

Серотип A1-B8 был связан с рядом заболеваний, поскольку антигены "HL-A" были впервые описаны . Среди них были целиакия , аутоиммунный активный хронический гепатит , миастения , гиперфункция коры надпочечников - синдром Кушинга , первичный билиарный цирроз . [1] [2] [3] [4] [5] [6]

Лимфотоксин альфа кодируется участком HLA AB.

Однако по мере увеличения размеров исследования и более подробного описания серотипов D ассоциация этих локусов переместилась из локусов MHC класса I в локусы MHC класса II . В основе этого шага лежал гаплотип HLA A1-B8-DR3-DQ2, гаплотип, который находится в остром неравновесном сцеплении в европейской популяции. [7] [8] [9] [10] [11] Это неравновесие показало, что A1 и другие аллели гена I класса были факторами болезни, когда эти аллели были прикреплены только к длинному сегменту консервативной ДНК, который имел ассоциированный с заболеванием гены на другом конце. По крайней мере, при 2 заболеваниях риск аутоиммунного заболевания выходит за пределы области класса II гаплотипа.

Системная красная волчанка [ править ]

Было обнаружено, что «фенотип HL-A1,8» связан с тяжелой системной красной волчанкой (СКВ) (поражение почек и центральной нервной системы) у пациентов европеоидной расы. [12] Двухточечный гаплотипический анализ между TNFB (аллель B * 01) и HLA показывает, что аллель находится в неравновесном сцеплении с HLA-A1, Cw7, B8, C4A (Null), DR3, DQ2.5. [13]

Диабет 1 типа [ править ]

Хотя диабет 1 типа демонстрирует расширенную ассоциацию с гаплотипом HLA A1-B8-DR3-DQ2, эта ассоциация, по-видимому, не распространяется за пределы локуса HLA-B. [14] Недавнее исследование фенотипа DR3-DQ2 / DR4-DQ8 показало, что A1-cw7-B8 на самом деле ниже, чем ожидалось, по сравнению с другими типами AB, что указывает на то, что гены, связанные с риском, расположены между B8 и DR3. A * 0101, по-видимому, изменяет риск диабета 1 типа, но не Cw7-B8. [15] Пример диабета 1 типа показывает сложность, присущую использованию только анализа связей для шифрования риска.

Фенотип без IgA или его отсутствие связан с рядом воспалительных заболеваний.

A1-B8 и аллергическая болезнь [ править ]

В аллергическом заболевании A1, B8 были обнаружено ассоциироваться с аллергическими реакциями в новорожденных. [16] У детей с бронхиальной астмой и низким уровнем IgA было обнаружено повышенное содержание A1, B8. [17] Однако некоторые из этих реакций можно отнести к связи гаплотипа HLA A1-B8-DR3-DQ2 с фенотипом без IgA. [18] Более прочная связь была обнаружена с атопиями . [19] [20] [21] A1, B8 чаще встречаются при сенной лихорадке, осложненной астмой или атопией, по сравнению с просто сенной лихорадкой. [22] [23] [24] В дальнейшем пациенты с астмой с отрицательными кожными пробами имели тенденцию к более высоким серотипам A1, B8. [25]

A1-B8 и инфекционное заболевание [ править ]

Ген комплемента 4A удален в A1-B8

ВИЧ [ править ]

В середине 1980-х годов связь с A1-B8-DR3 и прогрессированием ВИЧ появилась вскоре после открытия вируса. [26] A1-B8 ассоциировался с более быстрым прогрессированием серопозитивности и был тесно связан с быстрым снижением количества Т4-клеток и развитием симптомов, связанных с ВИЧ, в течение четырех лет после инфицирования. [27] Наиболее сильные ассоциации наблюдались с гаплотипом A1-Cw7-B8. C4 (комплемент 4) продуцирует нулевой аллель в локусе C4AQ. Этот локус входит в состав гаплотипа HLA A1-B8-DR3-DQ2 (маркеры - A1, CW7, B8, BfS, C4AQ0, C4B1, DR3, DQ2), поэтому одно исследование пришло к выводу, что C4AQ0 может объяснить повышенную инфекционность ВИЧ. [28] Гаплотип был дополнительно связан со спленомегалией ложной опухоли, лимфоцитозом CD8 и высоким уровнем IgG. [29]

Вирусный гепатит [ править ]

Была замечена связь между вирусным гепатитом и HLA-A1. [30] [31] Однако связь A1 с аутоиммунным гепатитом без антивирусных антител была сильнее, чем с хроническим активным гепатитом с антивирусным титром. [32] Впоследствии была продемонстрирована связь с вирусным гепатитом, и пациенты с антинуклеарными антителами с большей вероятностью имели A1-B8-DR3. [33] В настоящее время исследования указывают на проксимальную ассоциацию локусов Cw * 0702-B * 0801.

Частоты [ править ]

Частоты HLA A1-B8
[34]Ирландия14,41
словацкий11,91
[35]Северная Ирландия11,511
Шведский11,51
[36]Голландские Нидерланды9,8
Югославский9,71
Британский9,71
Венгерский9,41
[37]CEPH Франция8,511
[38]Немецкий8,31
Чешский7,81
[39]Швейцарский6,73
Бельгия5.52
Австрия4.52
[40]Тосканская италия4.3
Украина4.33
Италия4.21
Баскский4.2
португальский4.22
Польский4.0
[41]Уганда3,71
Уральский3.13
испанский2,84
[1]Румыния2,8
Албания2,5
Греческий2.3
[2]Северная Греция2.1
[42]Крит1.9
[41]Луо Кения1,72
[41]Нанди Кения1.42
[43]Оманская Аравия1.4
Японский0,1
1 Cw * 0701 (Eur.), ²Cw * 0704 (Afr.)

Ссылки [ править ]

  1. ^ Кларк AK, Гэлбрейт RM, Гамильтон EB, Уильямс R (февраль 1978). «Ревматические нарушения при первичном билиарном циррозе» . Аня. Реум. Дис . 37 (1): 42–7. DOI : 10.1136 / ard.37.1.42 . PMC  1000187 . PMID  305233 .
  2. ^ Lada G, Gyódi E, GLAZ E (1977). «Антигены HLA у пациентов с гиперфункцией коры надпочечников». Acta Med Acad Sci Hung . 34 (4): 213–26. PMID 618054 . 
  3. ^ Людвиг Н, Polymenidis Z, Granditsch G, G Фитиль (ноябрь 1973 г.). «[Ассоциация HL-A1 и HL-A8 с детской глютеновой болезнью]». Z Immunitatsforsch Exp Klin Immunol (на немецком языке). 146 (2): 158–67. PMID 4282973 . 
  4. ↑ Mackay IR, Morris PJ (октябрь 1972 г.). «Ассоциация аутоиммунного активного хронического гепатита с HL-A1,8». Ланцет . 2 (7781): 793–5. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (72) 92149-6 . PMID 4116233 . 
  5. ^ Feltkamp TE, ван ден Берг-Лунен PN, Engelfriet CP и др. (Июнь 1974 г.). «[Типирование HL-A и аутоантитела у пациентов с миастенией гравис]». Ned Tijdschr Geneeskd (на голландском языке). 118 (23): 895–6. PMID 4839444 . 
  6. ^ Hammarström L, Smith E, Мёллер E, Franksson C, Matell G, Von Reis G (август 1975). «Миастения гравис: исследования антигенов HL-A и субпопуляций лимфоцитов у пациентов с миастенией гравис» . Clin. Exp. Иммунол . 21 (2): 202–15. PMC 1538268 . PMID 1081023 .  
  7. ^ Gazit E, Sartani A, Мизрахи Y, Ravid M (март 1977). «Антиген HLA у еврейских пациентов с ювенильным сахарным диабетом». Diabete Metab . 3 (1): 55–8. PMID 858444 . 
  8. ^ Vogten AJ, короче RG, Opelz G (июнь 1979). «HLA и клеточный иммунитет при HBsAg-отрицательном хроническом активном гепатите» . Кишечник . 20 (6): 523–5. DOI : 10.1136 / gut.20.6.523 . PMC 1412459 . PMID 89064 .  
  9. ^ Ercilla G, Парес А, Арриаг Ф, и др. (Ноябрь 1979 г.). «Первичный билиарный цирроз печени, связанный с HLA-DRw3». Тканевые антигены . 14 (5): 449–52. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1979.tb00874.x . PMID 12731577 . 
  10. Перейти ↑ Robinson BN, Roberts DF, Mather BA, Nelson R, Rowlatt AS (октябрь 1980 г.). «Целиакия и HLA: семейное исследование». J. Immunogenet . 7 (5): 381–91. DOI : 10.1111 / j.1744-313X.1980.tb00732.x . PMID 7430678 . 
  11. ^ Този Р., Висмара Д., Танигаки Н. и др. (Сентябрь 1983 г.). «Доказательства того, что целиакия в первую очередь связана с аллельной специфичностью локуса DC». Clin. Иммунол. Immunopathol . 28 (3): 395–404. DOI : 10.1016 / 0090-1229 (83) 90106-X . PMID 6192959 . 
  12. Перейти ↑ Goldberg MA, Arnett FC, Bias WB, Shulman LE (1976). «Антигены гистосовместимости при системной красной волчанке» . Ревматоидный артрит . 19 (2): 129–32. DOI : 10.1002 / art.1780190201 . PMID 1259797 . 
  13. ^ Парки CG, Пандей JP, Дули М., и др. (Июнь 2004 г.). «Генетический полиморфизм фактора некроза опухоли (TNF) -альфа и TNF-бета в популяционном исследовании системной красной волчанки: ассоциации и взаимодействие с полиморфизмом С / Т интерлейкина-1альфа-889» (PDF) . Гм. Иммунол . 65 (6): 622–31. DOI : 10.1016 / j.humimm.2004.03.001 . PMID 15219382 .  
  14. ^ Благородный JA, Мартин А., Вальдес AM и др. (2008). «Риск диабета типа 1 для гаплотипов человеческого лейкоцитарного антигена (HLA) -DR3 зависит от генотипического контекста: ассоциации локусов DPB1 и HLA класса I среди итальянских пациентов с DR3 и DR4 и контрольной группы» . Гм. Иммунол . 69 (4–5): 291–300. DOI : 10.1016 / j.humimm.2008.02.003 . PMC 2505335 . PMID 18486765 .  
  15. ^ Благородный J, Вальдес A, Бугаван T, Apple R, Thomson G, Erlich H (2002). «Локус IA класса HLA влияет на предрасположенность к диабету 1 типа» . Hum Immunol . 63 (8): 657–64. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (02) 00421-4 . PMC 4049513 . PMID 12121673 .  
  16. ^ Soothill JF, Стокс CR, Turner MW, Норман П., Тейлор B (июль 1976). «Предрасполагающие факторы и развитие реагиновой аллергии в младенчестве». Clin. Аллергия . 6 (4): 305–19. DOI : 10.1111 / j.1365-2222.1976.tb01911.x . PMID 963861 . 
  17. ^ Остергаард PA, Эриксен J (август 1979). «Связь между HLA-A1, B8 у детей с внешней астмой и дефицитом IgA». Евро. J. Pediatr . 131 (4): 263–70. DOI : 10.1007 / BF00444347 . PMID 477683 . 
  18. ^ Амбрус M, Хернади E, Bajtai G (май 1977). «Преобладание антигенов HLA-A1 и HLA-B8 при селективном дефиците IgA». Clin. Иммунол. Immunopathol . 7 (3): 311–4. DOI : 10.1016 / 0090-1229 (77) 90062-9 . PMID 872455 . 
  19. Перейти ↑ Dasgupta A, Misri N, Bala S (1977). «Популяционные и семейные исследования для демонстрации генов Ir: гаплотип HLA при атопической аллергии». Monogr Allergy . 11 : 75–9. PMID 327293 . 
  20. ^ Mackie RM, Dick HM (февраль 1979). «Исследование распределения антигена HLA в семьях с атопическим дерматитом». Аллергия . 34 (1): 19–23. DOI : 10.1111 / j.1398-9995.1979.tb01996.x . PMID 453484 . 
  21. ^ Хейккиля М, Койстинен Дж, Лохмэн М, Koskimies S (май 1984 г.). «Повышенная частота HLA-A1 и -B8 в сочетании с полным отсутствием, но не с дефицитом сывороточного IgA». Тканевые антигены . 23 (5): 280–3. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1984.tb00046.x . PMID 6611606 . 
  22. ↑ Turner MW, Brostoff TJ, Wells RS, Stokes CR, Soothill JF (январь 1977 г.). «HLA при экземе и сенной лихорадке» . Clin. Exp. Иммунол . 27 (1): 43–7. PMC 1540890 . PMID 849649 .  
  23. ^ Jeannet M, Girard JP, Varonier HS, Mirimanoff P, Joye P (1977). «Антигены HLA при поллинозе трав». Monogr Allergy . 11 : 69–73. PMID 876128 . 
  24. ^ Oehling A, Baena-Cagnani CE, Sanz ML, Криски CD (1979). «HLA и поллиноз». Allergol Immunopathol (Мадр) . 7 (6): 423–6. PMID 539526 . 
  25. ^ Моррис MJ, Vaughan H, Lane DJ, PJ Morris (1977). «HLA при астме». Monogr Allergy . 11 : 30–4. PMID 876121 . 
  26. ^ Steel CM, Ludlam CA, Beatson D и др. (Май 1988 г.). «HLA гаплотип A1 B8 DR3 как фактор риска заболеваний, связанных с ВИЧ». Ланцет . 1 (8596): 1185–8. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (88) 92009-0 . PMID 2897006 . 
  27. ^ Kaslow РА, Duquesnoy R, VanRaden М., и др. (Апрель 1990 г.). «Комбинация антигенов HLA A1, Cw7, B8, DR3, связанная с быстрым снижением количества Т-хелперных лимфоцитов при ВИЧ-1 инфекции. Отчет из многоцентрового когортного исследования СПИДа». Ланцет . 335 (8695): 927–30. DOI : 10.1016 / 0140-6736 (90) 90995-H . PMID 1970024 . 
  28. ^ Cameron PU, Mallal SA, французский MA, Докинз RL (декабрь 1990). «Основные гены комплекса гистосовместимости влияют на исход ВИЧ-инфекции. Гаплотипы предков с нулевыми аллелями C4 объясняют различные ассоциации HLA». Гм. Иммунол . 29 (4): 282–95. DOI : 10.1016 / 0198-8859 (90) 90042-N . PMID 1981061 . 
  29. ^ Oksenhendler Е, Autran В, Gorochov G, D'Ага М.Ф., Seligmann М, Clauvel JP (июль 1992). «CD8-лимфоцитоз и псевдотуморальная спленомегалия при ВИЧ-инфекции». Ланцет . 340 (8813): 207–8. DOI : 10.1016 / 0140-6736 (92) 90471-E . PMID 1353138 . 
  30. ↑ Hug G (май 1976 г.). «Генетические факторы и аутоиммунитет при вирусных гепатитах». Являюсь. J. Clin. Патол . 65 (5 Suppl): 870–5. PMID 218441 . 
  31. ^ Деки В, Jungers Р, Naret С, Degott С, Zingraff Дж, Бах И. Ф. (1977). «Связь HLA-A1, B8-фенотип и эволюция антигенемии HBs у 440 гемодиализованных пациентов». Пищеварение . 15 (4): 271–7. DOI : 10.1159 / 000198012 . PMID 67978 . 
  32. ^ Freudenberg Дж, Баумана Н, Арнольд Вт, Бергер Дж, Büschenfelde КН (1977). «HLA при различных формах хронического активного гепатита. Сравнение взрослых пациентов и детей». Пищеварение . 15 (4): 260–70. DOI : 10.1159 / 000198011 . PMID 863130 . 
  33. ^ Czaja AJ, Карпентер HA, Santrach PJ, Moore SB (январь 1995). «Иммунологические особенности и ассоциации HLA при хроническом вирусном гепатите». Гастроэнтерология . 108 (1): 157–64. DOI : 10.1016 / 0016-5085 (95) 90020-9 . PMID 7806037 . 
  34. ↑ Finch T, Lawlor E, Borton M, Barnes C, McNamara S, O'Riordan J, McCann S, Darke C (1997). «Распространение генов и гаплотипов HLA-A, B и DR в ирландской популяции». Exp Clin Immunogenet . 14 (4): 250–63. PMID 9523161 . 
  35. ^ Миддлтон D, Уильямс F, Хэмилл М, Мина A (2000). «Частота аллелей HLA-B в европеоидной популяции, определяемая двухэтапной стратегией типирования ПЦР-SSOP». Hum Immunol . 61 (12): 1285–97. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (00) 00186-5 . PMID 11163085 . 
  36. ^ Schipper R, G Schreuder, D'Амаро Дж, Аудсхорн М (1996). «Частота гена HLA и гаплотипов у голландских доноров крови». Тканевые антигены . 48 (5): 562–74. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1996.tb02670.x . PMID 8988539 . 
  37. ^ Bugawan Т, Klitz Вт, Блэр А, Н Эрлиха (2000). «Типирование HLA класса I с высоким разрешением в семействах CEPH: анализ неравновесия по сцеплению среди локусов HLA». Тканевые антигены . 56 (5): 392–404. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2000.560502.x . PMID 11144287 . 
  38. ^ Müller C, Ehninger G, Гольдман S (2003). «Частоты генов и гаплотипов для локусов hLA-A, hLA-B и hLA-DR на основе более чем 13 000 немецких доноров крови». Hum Immunol . 64 (1): 137–51. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (02) 00706-1 . PMID 12507825 . 
  39. ^ Grundschober С, Санчес-Мазас А, Экскофьер л, Langaney А, Жаннет М, Tiercy J (1994). «Полиморфизм ДНК HLA-DPB1 в швейцарской популяции: неравновесие по сцеплению с другими локусами HLA и популяционная генетическая аффинность». Eur J Immunogenet . 21 (3): 143–57. DOI : 10.1111 / j.1744-313X.1994.tb00186.x . PMID 9098428 . 
  40. ^ Маррони F, Curcio M, S Fornaciari, Lapi S, M Мариотти, Scatena F, Presciuttini S (2004). «Микрогеографические вариации частот гаплотипов HLA-A, -B и -DR в Тоскане, Италия: значение для набора доноров костного мозга». Тканевые антигены . 64 (4): 478–85. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.2004.00292.x . PMID 15361126 . 
  41. ^ a b c Cao K, Moormann A, Lyke K, Masaberg C, Sumba O, Doumbo O, Koech D, Lancaster A, Nelson M, Meyer D, Single R, Hartzman R, Plough C, Kazura J, Mann D, Sztein М, Томсон Дж, Фернандес-Винья М (2004). «Дифференциация африканских популяций подтверждается разнообразием аллелей и гаплотипов локусов HLA класса I». Тканевые антигены . 63 (4): 293–325. DOI : 10.1111 / j.0001-2815.2004.00192.x . PMID 15009803 . 
  42. ^ Arnaiz-Виллен А, Iliakis Р, Гонсалес-Hevilla М, Longas Дж, Гомес-Касады Е, Sfyridaki К, Trapaga Дж, Сильвер-Редондо С, Matsouka С, Мартинесом-Laso J (1999). «Происхождение критских популяций, определенное характеристикой аллелей HLA». Тканевые антигены . 53 (3): 213–26. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.1999.530301.x . PMID 10203014 . 
  43. ^ Williams F, Meenagh А, Darke С, Акоста А, Даар А, Городецкий С, Hammond М, Насименто Е, Мидлтон D (2001). «Анализ распределения аллелей HLA-B в популяциях пяти континентов». Hum Immunol . 62 (6): 645–50. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (01) 00247-6 . PMID 11390040 .