Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Мультигенный гаплотип, человек
HLA-mini.png
Область HLA на хромосоме 6
HLA A1-B8-DR3-DQ2
Никнеймы«Супер-В8», «АН8.1», «наследственный MHC 8.1»
LociГенАллельСеротип
I классHLA-A* 0101A1
HLA-C* 0701Cw7
HLA-B* 0801B8
HLA-DRHLA-DRB1* 0301DR3
HLA-DRB3* 0101DR52
HLA-DQHLA-DQA1* 0501
HLA-DQB1* 0201DQ2
Узлы
Максимум населенияFreq. Максимум
Западная Ирландия> 11,0%
Размер и расположение
ГеныРасположениеразмер (кбит / с)
31166п21.34700
Сопутствующие заболевания
Гаплотип
(ген)		Заболевания
DQ2.5Глютеновая болезнь
DR3-DQ2Юношеский диабет , саркоидоз
B8 :: DQ2Аутоиммунный гепатит , первичный билиарный цирроз печени , миастения гравис , герпетиформный дерматит

Гаплотип HLA A1-B8-DR3-DQ2 (также: AH8.1 , COX , [1] Super B8 , предковый гаплотип MHC 8.1 [2] или предковый гаплотип 8.1 [3] ) - это мультигенный гаплотип, который охватывает большинство основных человеческих комплекс гистосовместимости на хромосоме 6 (не путать с гетеродимером HLA-DQ DQ8.1 ). Мультигенный гаплотип - это набор унаследованных аллелей. охватывающие несколько генов или генов-аллелей; общие мультигенные гаплотипы обычно являются результатом общего происхождения (имеют недавнего общего предка для этого сегмента хромосомы). Хромосомная рекомбинация фрагментирует мультигенные гаплотипы по мере того, как расстояние до этого предка увеличивается в количестве поколений.

Гаплотип можно записать в расширенной форме, охватывающей основные локусы гистосовместимости, следующим образом:

HLA A * 0101  : Cw * 0701  : B * 0801  : DRB1 * 0301  : DQA1 * 0501  : DQB1 * 0201 или сокращенно A1 :: DQ2

Внутри гаплотипа есть много других генов-аллелей, в том числе более 250 кодирующих локусов, которые продуцируют транскрипты.

Имея длину 4,7 миллиона нуклеотидов , A1 :: DQ2 является вторым по длине гаплотипом, идентифицированным в геноме человека . [1] A1 :: DQ2 создает загадку для эволюционного изучения рекомбинации . Длина гаплотипа примечательна, поскольку высокая скорость эволюции в локусе HLA должна приводить к деградации таких длинных гаплотипов. A1 :: DQ2 трудно отследить, выдвигались предположения об общем предке в Иберии или Африке. Хотя место его происхождения не определено, существует согласие, что носители европейского AH8.1 несут гаплотип, связанный общим происхождением. [3] A1 :: DQ2 - самый частый гаплотип своей длины, обнаруживаемый у кавказцев в США, ~ 15% несут этот общий гаплотип. [4]

Исследования показывают, что выдающееся положение A1 :: DQ2, вероятно, связано с положительным отбором в период до неолита и изоляцией в странах, где пшеница не была широко распространенным злаком. Помимо DR3-DQ2 с известной ассоциацией с аутоиммунным заболеванием , другие факторы в пределах A1 :: DQ2, как полагают, также вносят вклад в аутоиммунное заболевание. [3] Также десяток воспалительных заболеваний иммунной системы может приписать гаплотип некоторый риск. Некоторые заболевания, такие как целиакия, в первую очередь связаны с определенными генами. В то время как другие заболевания, такие как диабет 1 типа, могут иметь несколько очень разных генов, которые определяют риск. Другие болезни, такие как миастения, не имеют определенной связи с гаплотипом.

Динамика рекомбинации [ править ]

У каждого человека есть уникальные хромосомы , кроме однояйцевых близнецов. Эти уникальные хромосомы образуются путем рекомбинации каждой уникальной хромосомы, передаваемой каждым дедушкой и бабушкой каждому родителю. Эти хромосомы химеризуются в репродуктивных клетках каждого родителя, которые затем передаются развивающемуся человеку во время оплодотворения. Рекомбинация, которая создает эти смешанные хромосомы, происходит почти случайным образом по длине, 1 Морган на поколение. В пределах 100 поколений людей (около 2100 лет в древние времена) можно ожидать, что несколько сотен таких «смешанных» событий произойдут на одной хромосоме, средний размер составляет 1 сантиметр моргана (или 1 сМ). Средняя длина этих «гаплотипов» составляет около 1 миллиона нуклеотидов.

Мультигенные гаплотипы, следующие стандартной динамике, существуют только в устойчивых популяциях в течение короткого времени, среднее расстояние между генами составляет около 200000 нт, что означает, что в течение 250 поколений (~ 5000 лет) ожидается, что 1/2 соседних генов будет иметь новые ген-аллели. , если только гены не маленькие и очень близко друг к другу. Эта динамика может измениться, если популяция быстро расширяется от нескольких особей, которые жили изолированно, пока сохраняются другие гаплотипы.

A1 :: DQ2 не следует ожидаемой динамике. Другие гаплотипы существуют в регионе Европы, где этот гаплотип сформировался и расширился, некоторые из этих гаплотипов также являются предковыми и также довольно крупными. При длине 4,7 миллиона нуклеотидов и ~ 300 генах локус сопротивлялся эффектам рекомбинации либо в результате обструкции рекомбинации внутри ДНК, либо в результате повторного отбора для всего гаплотипа, либо из-за того и другого.

Структура [ править ]

A1 :: DQ2 имеет длину 4731878 нуклеотидов. [1] Гаплотип начинается перед локусом TRIM27 примерно в 28,8 миллионов нуклеотидов от теломеры более короткого плеча хромосомы 6. AH8.1 простирается за SYNGAP1 примерно на 33,5 миллиона нуклеотидов от теломера. Однако заметное ухудшение происходит после гена DQB1 на 32,8 миллиона нуклеотидов. A1 :: DQ2 не самый длинный гаплотип, но самый длинный, HLA A3-Cw7-B7-DR15-DQ6 ( A3 :: DQ6 ), уже подвергся значительной рекомбинации и почти равен по частоте HLA A2-Cw7 :: DQ6 подшипниковая версия. У европеоидов США 57% гаплотипов с основным компонентом, Cw7-B8, простираются от локуса HLA-A1 к локусу DQ2. Это для сравнения с 25% Cw7-B7, которые распространяются на A3 :: DQ6.[4] Из 25 потенциальных генетических рекомбинантов A1 :: DQ2 ни один не превышает 10% от частоты Cw * 0702-B * 0801. Примечательныдва рекомбинанта A24 -Cw7 ~ DQ2, A1 :: B8- DR1-DQ5 . Таким образом, гаплотип A1 :: DQ2 является длинным и демонстрирует больший дефицит рекомбинации (так называемое неравновесие по сцеплению).

Эволюция [ править ]

Развитие A1 :: DQ2, по-видимому, является ключом к его структуре. Гаплотип, содержащий 4,7 миллиона нуклеотидов, существует в популяции с другими гаплотипами, которые при объединении превышают A1 :: DQ2 по частоте. Генетика рекомбинации у людей предполагает, что общие гаплотипы такой длины, что компонент Cw7-B8, должны быть в других гаплотипах, Ax-Cw7 :: DQ2, A1-B8-DRx-DQx или A1-B8-DR3-DQx (где Ax - не A1, DRx не DR3 или DQx не DQ2). Для гаплотипа такой длины процесс происходит быстро, потеря 50% полного гаплотипа в течение 500 лет. И все же гаплотип обнаруживается в основном у людей, которые переселились из Европы сотни лет назад.

Устойчивость к рекомбинации [ править ]

A1 :: DQ2 встречается в Исландии, поморах северной России, сербах севернославянского происхождения, басках и районах Мексики, где баски селились в больших количествах. Большое количество гаплотипов в наиболее изолированном географическом регионе Западной Европы, Ирландии, у скандинавов и Швейцарии, предполагает, что низкая численность во Франции и латинизированной Иберии является результатом смещений, имевших место после начала неолита . Это подразумевает присутствие в Европе более 8000 лет. SNP-анализ гаплотипа предполагает потенциальный эффект основания в 20 000 лет в Европе, хотя теперь очевидны конфликты в интерпретации этой информации. Последней возможной точкой сужения климата, вынуждающей его, был поздний дриас.до 11 500 календарных лет назад, и поэтому гаплотип принял различные формы названия, Ancestral European Haplotype, в последнее время названный Ancestral Haplotype A1-B8 (AH8.1). Это один из четырех видов, которые кажутся общими для западных европейцев и других азиатов. Если предположить, что частота гаплотипов составляла 50% в период позднего дриаса и снижалась на 50% каждые 500 лет, гаплотипы должны присутствовать только ниже 0,1% в любой европейской популяции. Следовательно, это почти в 100 раз превышает ожидаемую частоту для основополагающего гаплотипа.

Диета в эволюции [ править ]

Помимо частых интерпретаций этой природы, мало что известно о том, почему гаплотип не подвергся уравновешиванию. Гаплотип оказался резистентным к рекомбинации, он, по-видимому, также прошел положительный отбор по сравнению с другими гаплотипами в Европе, хотя в настоящее время случаи заболевания предполагают, что действует отрицательный отбор, основанный на зерновых. Одно из возможных объяснений связано с изучением останков донеолита. Если еда выбирает гаплотип сейчас, возможно, еда также положительно выбирала гаплотип в прошлом. В ранний период европейского заселения остатки прибрежных поселений свидетельствуют о высоком потреблении калорийности морской пищи и, в частности, моллюсков. Морской углеродный компонент рациона западноевропейских стран уменьшился с мезолита до настоящего времени.однако гаплотип не подвергся уравновешиванию, поэтому одна диета не может объяснить его устойчивость к рекомбинации.

Формирование [ править ]

Из упомянутых выше гаплотипов, A24-Cw * 0702 :: DQ2 или A1 :: B8-DR1-DQ5, ни один не является предком A1 :: DQ2. A1 :: DQ2 появляется в Индии, однако его основные антигенные гены внешне напоминают европейский A1-B8, и он, по-видимому, является гомопластическим рекомбинантным от общего предка DR3-DQ2, примерно 70 000 лет назад. [5]Компоненты гаплотипа встречаются в Европе (у басков есть два основных гаплотипа DR3-DQ2), а A1-B8 индийского происхождения имеет очень низкую частоту. В Марокко B8 :: DQ2, в Западной Сахаре гаплотип A1-B8, если он обнаружен, а также DQ2.5 обнаруживается с высокой частотой, но не как единственный гаплотип. В Кении два слегка изменчивых аллеля HLA-A и B для гаплотипа A1-B8. Одна из возможностей состоит в том, что народы из Центральной Азии или Ближнего Востока мигрировали в Иберию, когда народы из Африки пересекли в Иберию с юга до неолита, произошла рекомбинация, которая привела к гаплотипу, и носители благополучно расширились в Европу до голоцена. Другая возможность состоит в том, что, если он образовался в Западной Африке, но из-за того, что он был менее избирательным в африканском голоцене по сравнению с европейским голоценовым климатом / культурой, гаплотип претерпел уравновешивание в Северной Африке.Одна гипотеза, подтвержденная частотами в Иберии и Северной Африке, предполагает, что A1 :: DQ2 образовался из A1 :: B8-DR7-DQ2 с источником, несущим DR3. Один из возможных источников - HLA Cw.* 1701  : B * 4201  : DRB1 * 0302 (Наиболее распространенный гаплотип у афроамериканцев - расширенный гаплотип) Однако возможно, это потребует введения модифицированного аллеля * 0505. Кроме того, индийская / европейская ветвь DQ2.5 намного старше, поэтому кажется, что для формирования гаплотипа потребовалось по крайней мере 2 основных рекомбинантных этапа, и после его образования эволюция заметно замедлилась.

Варианты [ править ]

Есть вариант A1 ← → B8, найденный в Индии. [5] Этот вариант несет другой Cw * 07 (Cw * 0702 - очень древний аллель, который отличается от Cw * 0701 A1 :: DQ2). Он несет C4A другой аллель DRB3, а также ряд других отличий. Этот вариант, вероятно, произошел от A24 или A26-Cw * 0702-B * 0801-DR3-DQ2, которые независимо прибыли и развились в Индии.

Компоненты [ править ]

Большие гаплотипы можно рассматривать как ступеньки между соседними локусами. Например, A1-Cw * 0701, Cw * 0701-B8, B8 до DR3 и DR3-DQ2 - это шаги. Каждый шаг является самостоятельным гаплотипом, однако, чем ближе два локуса, тем больше времени требуется рекомбинации, чтобы изменить шаг. И Cw-B, и DR-DQ близко друг к другу, A-Cw и B-DR далеко друг от друга. В результате компоненты гаплотипа развиваются с разной скоростью.

A1-Cw7-B8 [ править ]

Ранние исследования семей по всей Европе признали то, что уже показало большинство ассоциаций HLA, что существует унаследованная (генетическая) связь между A1 и B1, которая была распространена на локус Cw7. [6]

Основная статья: гаплотип HLA A1-B8

И хотя уровень связи AB в целом не был близок к связи Cw-B, связь между A1-Cw7-B8 была достаточно сильной.

B8-DR3 [ править ]

Область между B8 и DR3 включительно несет в себе ряд генов, представляющих интерес для изучения болезней человека. Наиболее важным из них является TNF (факторы некроза опухоли) с 3 локусами в регионе. Начиная с B8, сразу за ними следуют MICA и MICB, которые обозначают I-подобную цепь MHC A и B. Эти две молекулы функционального класса I экспрессируются в интероцитах кишечника и могут иметь интерес к аутоиммунным заболеваниям, они вариабельны, но мутанты MICA обнаруженные до сих пор, похоже, не коррелируют с аутоиммунными заболеваниями желудочно-кишечного тракта.

HLA DR3-DQ2 [ править ]

DR3-DQ2 является либо известным, либо очень подозрительным фактором большинства аутоиммунных заболеваний, которые связаны с гаплотипом A1 :: DQ2.

Дополнительная информация: HLA DR3-DQ2

Важность для медицины [ править ]

При трансплантации органов [ править ]

A1 :: DQ2 был в авангарде науки о гистосовместимости, A1 был первым числовым антигеном HL-A1, идентифицированным в конце 1960-х годов. HL-A8, второй уточненный B-серотип, который должен был быть обнаружен, стал HLA-B8. Из-за частоты гаплотипа гомозиготы являются обычным явлением, около 0,6% в популяции, что делает его полезным для создания клеточных линий, которые можно использовать для тестирования антител серотипирования. В результате HLA-A1 и B8 продуцируют одни из лучших серотипирующих антител. Это помогло в правильной идентификации совпадений трансплантата до эры тестирования генов ПЦР.

Мультигенный гаплотип, человек
B8-DR3
Никнеймы«Б8-ДР3»; «B8-DR3»
«B * 0801: DRB1 * 0301» »
LociГенАллельИзоформа
область центомерного класса IHLA-BВ * 0801B8
MICA* 0801MICA5.1
MICB* 0801MICB24
RCCX HVR,
класс III		TNFA--
TNFB--
C4AНулевойC4AQ0
C4BC4BS
CYP21
DR LociHLA-DRB3* 0101DR52
HLA-DRB1* 0301DR3
Узлы
Максимум населенияFreq. Максимум
Западная Ирландия> 15,0%
Размер и расположение
ГеныРасположениеразмер (кбит / с)
-66п21.31400
Сопутствующие заболевания
Гаплотип
(ген)		Заболевания
B8 :: DQ2Аутоиммунный гепатит , Первичный билиарный цирроз печени , Ювенильный диабет.
B8 :: DR3Системная красная волчанка

При целиакии и герпетиформном дерматите [ править ]

До уточнения типирования для HLA-DQ и DR связь с HLA-A1 и B8 была выявлена ​​для целиакии в 1973 г. и герпетиформного дерматита в 1976 г. [7] [8] Благодаря гаплотипу стало возможным идентифицировать генетический риск, даже несмотря на то, что гены, вызывающие заболевание, гаплотип DQ2, находились на расстоянии 1,3 миллиона нуклеотидов .

Дополнительная информация: HLA-DQ2 в глютеновой болезни и HLA-DQ2.5 в иммунохимии глютена

Помимо хорошо изученной связи между DQ2.5 и глютеновой болезнью, существуют дополнительные факторы риска гаплотипа B8 :: DQ2, которые увеличивают риск герпетиформного дерматита при целиакии. [9] Также нельзя исключить участие других аллелей гена A1 :: DQ2 в целиакии. [3] Например, MICA и MICB представляют собой гены mhc класса 1, экспрессируемые в эпителии кишечника.

При инсулинозависимом сахарном диабете [ править ]

При диабете 1 типа как DR3, так и DQ2, по-видимому, играют роль. DR3-DQ2.5 может быть связан с другими генами, такими как TNF-305A (TNF2), что также может повышать риск аутоиммунного заболевания как при глютеновой болезни, так и при диабете 1 типа. У пациентов с системной красной волчанкой (СКВ) HLA DR3-DQ2.5-C4AQ0 был сильно связан с СКВ (отношение шансов [ОШ] 2,8, 95% ДИ 1,7–4,5). В более поздней работе показано, что ген инозитолтрифосфатного рецептора 3, который составляет ~ 1 миллион пар оснований центромер из DQ2.5, также может быть связан с диабетом 1 типа. Кроме того, вариант BAT1 и MICB чаще встречается при диабете 1 типа, когда B8 отсутствует, но присутствует DR3 [10].Эти исследования предполагают, что множественные факторы на B8 :: DQ2, которыми обладают другие гаплотипы, также придают предрасположенность к диабету 1 типа. Диабет 1 типа связан с риском, связанным с вирусом Коксаки 4B , существует вероятность вовлечения локусов класса I, особенно тех, которые экспрессируются в желудочно-кишечном тракте.

При миастении [ править ]

В 1975 году связь с «HL-A1,8» (текущее название: HLA A1-B8) была подтверждена серологическим типированием клеток миастеников. [11] Однако в более крупной выборке связь риска была обнаружена ближе к «HL-A8» (текущее название: HLA-B8). [12] Эта ассоциация позже переместилась в область «B8-DRw3» (в настоящее время: B8-DR3). [13] В Европе существует два основных гаплотипа DR3: A1 :: DQ2 и A30-B18-DR3-DQ2. Связь с заболеванием более прочно может быть отнесена к B8 :: DQ2 части A1 :: DQ2 по сравнению с A30-B18 :: DQ2, что указывает на некоторое участие других аллелей гена B8-DR3 в заболевании. [14] Связь области B8 :: DQ2 в первую очередь наблюдается у женщин с возрастной гиперплазией тимуса.. Позже было обнаружено, что уровень антител к рецепторам ацетилхолина при заболевании коррелирует с B8 :: DR3. [15] Позже было обнаружено, что и DQ2.5, и DQ2.2 (гаплотип DQ DR7-DQ2) были положительно связаны с заболеванием. [16] Остается спорным, является ли DR3 или DQ2 первичной восприимчивостью к миастении. В некоторых исследованиях не наблюдалось никакой связи ни с одним из них. Чтобы разделить группы болезней, были предприняты попытки дополнительно определить популяцию с наиболее ранним началом (предположительно наиболее восприимчивую) и женщин. В этих исследованиях связь с B8 была больше, чем DR3, так что восприимчивость переместилась из класса II в локусы класса III или класса I. [3]Связь с классом I была бы необычной, поскольку продукция аутоантител, опосредованная Т-хелперами, характерна для болезни, тогда как цитотоксичность, опосредованная классом I, - нет. MICA и MICB экспрессируются в кишечнике. Есть много генов, которые лежат по обе стороны от HLA-B, TNF-альфа сверхэкспрессируется. Ближе к DR3, C4A не имеет значения в гаплотипе B8-DR3.

При аутоиммунном гепатите [ править ]

В 1972 г. была установлена ​​связь между «HLA A1,8» (в настоящее время: HLA A1-B8) активным хроническим гепатитом , впоследствии B8 более ассоциированным с аутоиммунным гепатитом . [17] [18] С открытием DR3 связь была расширена на DR3, а затем на DQ2-DP4. [19] [20] В то время как HLA A * 0101 , Cw * 0701 и DPB1 * 0402 связаны с заболеванием, самая сильная связь находится между B8 и DR3-DQ2 или субрегионом B8 :: DQ2. [21] [22] [23] Другие гены в этом регионе, C4A- null и TNF, могут быть связаны с аутоиммунным гепатитом [24] [25]

Было обнаружено, что появление антиядерных антител при аутоиммунном гепатите коррелирует с A1-B8-DR3. [26] Одна из проблем аутоиммунного гепатита - повышенный риск целиакии. [27] Первичный билиарный цирроз, который часто следует за хроническим активным гепатитом, связан с геном DRw3, DR3. [28] Целиакия часто увеличивается при аутоиммунном гепатите и наоборот. Недавние исследования указывают на более коварную связь между чувствительностью к глютену и аутоиммунным гепатитом. В одном исследовании 65% пациентов с конечной стадией аутоиммунного гепатита имели глютен-ассоциированный HLA-DQ (DQ2, DQ8), у половины из них были антитела к трансглутаминазе , но у немногих были эндомизиальные антитела.[29] Это может указывать на связь с субклинической энтеропатией или, альтернативно, на результат хронической вирусной инфекции, которая, как известно, также повышает уровень антител к транглутаминазе. Немецкое исследование показало, что риск был больше связан с B8, чем с DQ2, эти противоречивые результаты показывают, что существует как минимум две ассоциации риска в области B8 :: DQ2. [30]

При саркоидозе [ править ]

Подобно этим другим исследованиям связь между «HL-A1,8» в конечном итоге приводит к восприимчивости, близкой к локусу DR-DQ, саркоидоз, по-видимому, связан с HLA-DR3-DQ2.

Дополнительная информация: DR3-DQ2 при саркоидозе.

При системной красной волчанке [ править ]

Было обнаружено, что «фенотип HL-A1,8» связан с тяжелой системной красной волчанкой (СКВ) (поражение почек и центральной нервной системы) у пациентов европеоидной расы. [31] Двухточечный гаплотипический анализ между TNFB (аллель B * 01) и HLA показывает, что аллель находится в неравновесном сцеплении с HLA-A1, Cw7, B8, C4A (Null), DR3, DQ2.5. [32] Полный гаплотип, A1-Cw7-B8-TNFB * 1-C4A (Null) -DR3-DQ2, повышен у пациентов, и генетическая предрасположенность к СКВ не может быть определена. [33] Не удалось расширить сцепление до локуса HLA-DPB1. [34] За пределами Европы локусы DRB1 * 0301 и DR3-DQ2 были связаны с заболеванием независимо от гаплотипа A1 :: DQ2. [35]Установлено, что DR3 коррелирует с антителами против Ro / La при СКВ. [36]

В миозит с тельцами включения, полимиозит и дерматомиозит [ править ]

HLA-DR3 постоянно наблюдается с высокой частотой при миозите с тельцами включения у жителей европеоидной расы. [37] Было обнаружено, что DR3 также коррелирует с наличием антибоида Jo-1. [38] Исследования спорадического миозита с тельцами включения указывают на связь с гаплотипом A1: DQ2. [39] Более поздние исследования показывают, что риск лежит исключительно между областью B8-DR3, включая 3 гена класса I, область гена класса III и 2 гена класса II. [40] В исследовании, опубликованном в октябре 2015 года Национальным институтом гигиены окружающей среды, сравнивались 1710 случаев миозита с началом у взрослых или подростков с 4724 контрольными субъектами. Они обнаружили, что несколько генов, составляющих AH8.1, определяют генетический риск для всех типов миозита. [41]

См. Также [ править ]

  • Компонент дополнения 4
    • Компонент комплемента 4А
    • Компонент комплемента 4B

Предлагаемое чтение [ править ]

  • Прайс П., Витт С., Оллкок Р. и др. (Февраль 1999 г.). «Генетическая основа ассоциации предкового гаплотипа 8.1 (A1, B8, DR3) с множественными иммунопатологическими заболеваниями» . Иммунол. Ред . 167 : 257–74. DOI : 10.1111 / j.1600-065X.1999.tb01398.x . PMID  10319267 . Архивировано из оригинала на 2013-01-05.
  • Хортон Р., Гибсон Р., Коггилл П. и др. (Январь 2008 г.). «Вариационный анализ и аннотация генов восьми гаплотипов MHC: проект гаплотипов MHC» . Иммуногенетика . 60 (1): 1–18. DOI : 10.1007 / s00251-007-0262-2 . PMC  2206249 . PMID  18193213 .
  • Traherne JA, Horton R, Roberts AN, et al. (Январь 2006 г.). «Генетический анализ полностью секвенированных гаплотипов MHC, связанных с заболеванием, выявляет перетасовку сегментов в недавней истории человечества» . PLOS Genet . 2 (1): e9. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0020009 . PMC  1331980 . PMID  16440057 .

Ссылки [ править ]

  1. ^ а б в Хортон Р., Гибсон Р., Коггилл П. и др. (Январь 2008 г.). «Вариационный анализ и аннотация генов восьми гаплотипов MHC: проект гаплотипов MHC» . Иммуногенетика . 60 (1): 1–18. DOI : 10.1007 / s00251-007-0262-2 . PMC 2206249 . PMID 18193213 .  
  2. ^ Рокка Р, коды L, M Шевалье, Trépo C, Zoulim F (ноябрь 2004 г.). «[Аутоиммунизация, вызванная терапией интерфероном альфа при хроническом гепатите С]». Гастроэнтерол. Clin. Биол. (На французском). 28 (11): 1173–6. DOI : 10.1016 / S0399-8320 (04) 95201-3 . PMID 15657545 . 
  3. ^ a b c d e Прайс П., Витт С., Оллкок Р. и др. (Февраль 1999 г.). «Генетическая основа ассоциации предкового гаплотипа 8.1 (A1, B8, DR3) с множественными иммунопатологическими заболеваниями». Иммунол. Ред . 167 : 257–74. DOI : 10.1111 / j.1600-065X.1999.tb01398.x . PMID 10319267 . 
  4. ^ a b Майерс М., Грагерт Л., Клитц В. (сентябрь 2007 г.). «Аллели и гаплотипы HLA высокого разрешения в популяции Соединенных Штатов». Гм. Иммунол . 68 (9): 779–88. DOI : 10.1016 / j.humimm.2007.04.005 . PMID 17869653 . 
  5. ^ а б Каур Г., Кумар Н., Силаги А. и др. (Июль 2008 г.). «Аутоиммунно-ассоциированные гаплотипы HLA-B8-DR3 у азиатских индейцев уникальны по количеству копий гена комплемента C4 и HSP-2 1267A / G». Гм. Иммунол . 69 (9): 580–7. DOI : 10.1016 / j.humimm.2008.06.007 . PMID 18657583 . 
  6. Перейти ↑ Hiller C, Bischoff M, Schmidt A, Bender K (апрель 1978). «Анализ неравновесия сцепления HLA-ABC: уменьшение силы гаметической ассоциации с увеличением расстояния карты». Гм. Genet . 41 (3): 301–12. DOI : 10.1007 / BF00284764 . PMID 649158 . 
  7. ^ Людвиг Н, Polymenidis Z, Granditsch G, G Фитиль (ноябрь 1973 г.). «[Ассоциация HL-A1 и HL-A8 с детской глютеновой болезнью]». Z Immunitatsforsch Exp Klin Immunol (на немецком языке). 146 (2): 158–67. PMID 4282973 . 
  8. ^ Реунала T, Сало OP, Тииликайнен A, Mattila MJ (февраль 1976). «Антигены гистосовместимости и герпетиформный дерматит с особым упором на аномалии тощей кишки и фенотип ацетилирования». Br. J. Dermatol . 94 (2): 139–43. DOI : 10.1111 / j.1365-2133.1976.tb04362.x . PMID 1252348 . 
  9. ^ Ахмед А.Р., Юнис Дж. Дж., Маркус-Бэгли Д. и др. (Декабрь 1993 г.). «Основные гены восприимчивости комплекса гистосовместимости для герпетиформного дерматита по сравнению с генами чувствительной к глютену энтеропатии» . J. Exp. Med . 178 (6): 2067–75. DOI : 10,1084 / jem.178.6.2067 . PMC 2191293 . PMID 8245782 .  
  10. ^ Чонг KY, Оллкок RJ, Eerligh P и др. (Декабрь 2001 г.). «Локализация центральных генов MHC, влияющих на диабет I типа». Гм. Иммунол . 62 (12): 1363–70. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (01) 00351-2 . PMID 11756005 . 
  11. ^ Hammarström L, Smith E, Мёллер E, Franksson C, Matell G, Von Reis G (август 1975). «Миастения гравис: исследования антигенов HL-A и субпопуляций лимфоцитов у пациентов с миастенией гравис» . Clin. Exp. Иммунол . 21 (2): 202–15. PMC 1538268 . PMID 1081023 .  
  12. ^ Pirskanen R (январь 1976). «Генетические ассоциации между миастенией и системой HL-A» . J. Neurol. Нейрохирургия. Психиатрия . 39 (1): 23–33. DOI : 10.1136 / jnnp.39.1.23 . PMC 492209 . PMID 1255208 .  
  13. ^ Keesey Дж, Naeim Ж, Линдстром Дж, Zeller Е, Херрмэнн С, Уолфорд R (1978). «Корреляция между титром антител к рецептору ацетилхолина и антигенами HLA-B8 и HLA-DRw3 при миастении гравис». Trans Am Neurol Assoc . 103 : 188–90. PMID 757055 . 
  14. ^ Виейра ML, Caillat-Zucman S, P Гайдос, Cohen-Каминский S, Casteur A, Бах JF (сентябрь 1993). «Идентификация геномным типированием генов не-DR3 HLA класса II, связанных с миастенией гравис». J. Neuroimmunol . 47 (2): 115–22. DOI : 10.1016 / 0165-5728 (93) 90021-P . PMID 8370765 . 
  15. ^ Naeim F, Keesey JC, Херрмэнн С, Линдстром Дж, Zeller Е, Уолфорд RL (ноябрь 1978). «Ассоциация HLA-B8, DRw3 и антител против рецептора ацетилхолина при миастении гравис». Тканевые антигены . 12 (5): 381–6. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01347.x . PMID 85353 . 
  16. ^ Hjelmström P, Giscombe R, Lefvert AK, et al. (1995). «Различные HLA-DQ положительно и отрицательно связаны у шведских пациентов с миастенией гравис». Аутоиммунитет . 22 (1): 59–65. DOI : 10.3109 / 08916939508995300 . PMID 8882423 . 
  17. ↑ Mackay IR, Morris PJ (октябрь 1972 г.). «Ассоциация аутоиммунного хронического активного гепатита с HL-A1,8». Ланцет . 2 (7781): 793–5. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (72) 92149-6 . PMID 4116233 . 
  18. ^ Freudenberg Дж, Баумана Н, Арнольд Вт, Бергер Дж, Büschenfelde КН (1977). «HLA при различных формах хронического активного гепатита. Сравнение взрослых пациентов и детей». Пищеварение . 15 (4): 260–70. DOI : 10.1159 / 000198011 . PMID 863130 . 
  19. ^ Donaldson PT, Доэрти Д., Hayllar К.М., Макфарлейн IG, Johnson PJ, Williams R (апрель 1991). «Восприимчивость к аутоиммунному хроническому активному гепатиту: человеческие лейкоцитарные антигены DR4 и A1-B8-DR3 являются независимыми факторами риска». Гепатология . 13 (4): 701–6. DOI : 10.1002 / hep.1840130415 . PMID 2010165 . 
  20. ^ Manabe K, Donaldson PT, Underhill JA и др. (Декабрь 1993 г.). «Расширенный гаплотип человеческого лейкоцитарного антигена A1-B8-DR3-DQ2-DPB1 * 0401 при аутоиммунном гепатите». Гепатология . 18 (6): 1334–7. DOI : 10.1002 / hep.1840180608 . PMID 8244257 . 
  21. ^ Strettell MD, Thomson LJ, Donaldson PT, Bunce M, O'Neill CM, Williams R (октябрь 1997). «Гены HLA-C и предрасположенность к аутоиммунному гепатиту 1 типа». Гепатология . 26 (4): 1023–6. DOI : 10.1002 / hep.510260434 . PMID 9328330 . 
  22. ^ Андерхилл JA, Donaldson PT, Doherty DG, Манабэ K, Williams R (апрель 1995). «Полиморфизм HLA DPB при первичном склерозирующем холангите и первичном билиарном циррозе». Гепатология . 21 (4): 959–62. DOI : 10.1002 / hep.1840210411 . PMID 7705806 . 
  23. ^ Muratori P, Czaja AJ, Muratori L, et al. (Март 2005 г.). «Генетические различия между аутоиммунным гепатитом в Италии и Северной Америке» . Мир J. Gastroenterol . 11 (12): 1862–6. DOI : 10,3748 / wjg.v11.i12.1862 . PMC 4305892 . PMID 15793882 . Архивировано из оригинала на 2011-09-29.  
  24. ^ Скалли LJ, то зе C, Sengar DP, Goldstein R (май 1993). «Ранний аутоиммунный гепатит связан с делецией гена C4A». Гастроэнтерология . 104 (5): 1478–84. DOI : 10.1016 / 0016-5085 (93) 90359-K . PMID 8482459 . 
  25. ^ Куксон С., Константини П.К., Клэр М. и др. (Октябрь 1999 г.). «Частота и природа полиморфизма генов цитокинов при аутоиммунном гепатите 1 типа» . Гепатология . 30 (4): 851–6. DOI : 10.1002 / hep.510300412 . PMID 10498633 . 
  26. ^ Czaja AJ, Карпентер HA, Santrach PJ, Moore SB (январь 1995). «Иммунологические особенности и ассоциации HLA при хроническом вирусном гепатите». Гастроэнтерология . 108 (1): 157–64. DOI : 10.1016 / 0016-5085 (95) 90020-9 . PMID 7806037 . 
  27. ^ Volta U, De Franceschi L, Molinaro N и др. (Октябрь 1998 г.). «Частота и значение антиглиадиновых и антиэндомизиальных антител при аутоиммунном гепатите» (PDF) . Копать землю. Дис. Sci . 43 (10): 2190–5. DOI : 10,1023 / A: 1026650118759 . PMID 9790453 .  
  28. ^ Ercilla G, Парес А, Арриаг Ф, и др. (Ноябрь 1979 г.). «Первичный билиарный цирроз печени, связанный с HLA-DRw3». Тканевые антигены . 14 (5): 449–52. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1979.tb00874.x . PMID 12731577 . 
  29. ↑ Rubio-Tapia A, Abdulkarim AS, Wiesner RH, Moore SB, Krause PK, Murray JA (апрель 2008 г.). «Аутоантитела к целиакии при тяжелом аутоиммунном заболевании печени и эффект трансплантации печени» . Liver Int . 28 (4): 467–76. DOI : 10.1111 / j.1478-3231.2008.01681.x . PMC 2556252 . PMID 18339073 .  
  30. ^ Teufel A, Wörns M, Weinmann A и др. (Сентябрь 2006 г.). «Генетическая ассоциация аутоиммунного гепатита и человеческого лейкоцитарного антигена у немецких пациентов» . Мир J. Gastroenterol . 12 (34): 5513–6. DOI : 10,3748 / wjg.v12.i34.5513 . PMC 4088235 . PMID 17006990 . Архивировано из оригинала на 2011-09-29.  
  31. Перейти ↑ Goldberg MA, Arnett FC, Bias WB, Shulman LE (1976). «Антигены гистосовместимости при системной красной волчанке» . Ревматоидный артрит . 19 (2): 129–32. DOI : 10.1002 / art.1780190201 . PMID 1259797 . 
  32. ^ Парки CG, Пандей JP, Дули М., и др. (Июнь 2004 г.). «Генетические полиморфизмы фактора некроза опухоли (TNF) -альфа и TNF-бета в популяционном исследовании системной красной волчанки: ассоциации и взаимодействие с полиморфизмом интерлейкина-1альфа-889 C / T» . Гм. Иммунол . 65 (6): 622–31. DOI : 10.1016 / j.humimm.2004.03.001 . PMID 15219382 . 
  33. ^ Bettinotti MP, Hartung K, Deicher H, et al. (1993). «Полиморфизм гена фактора некроза опухоли бета при системной красной волчанке: гаплотипы TNFB-MHC». Иммуногенетика . 37 (6): 449–54. DOI : 10.1007 / BF00222469 . PMID 8436420 . 
  34. ^ Бишоф Н.А., Welch TR, Beischel LS, Carson D, Доннелли PA (июнь 1993). «Полиморфизм DP в расширенных гаплотипах HLA-A1, -B8, -DR3, связанных с мембранопролиферативным гломерулонефритом и системной красной волчанкой». Педиатр. Нефрол . 7 (3): 243–6. DOI : 10.1007 / BF00853205 . PMID 8100139 . 
  35. Перейти ↑ Castaño-Rodríguez N, Diaz-Gallo LM, Pineda-Tamayo R, Rojas-Villarraga A, Anaya JM (февраль 2008 г.). «Мета-анализ полиморфизмов HLA-DRB1 и HLA-DQB1 у пациентов из Латинской Америки с системной красной волчанкой». Autoimmun Ред . 7 (4): 322–30. DOI : 10.1016 / j.autrev.2007.12.002 . PMID 18295738 . 
  36. ^ Christian N, Smikle MF, DeCeulaer K, L Daniels, Уолравенс MJ, Barton EN (март 2007). «Антинуклеарные антитела и аллели HLA класса II у ямайских пациентов с системной красной волчанкой» . West Indian Med J . 56 (2): 130–3. DOI : 10.1590 / S0043-31442007000200005 . PMID 17910142 . 
  37. ^ Hirsch TJ, Enlow RW, Bias WB, Арнетт FC (октябрь 1981). «HLA-D-родственные (DR) антигены при различных видах миозита». Гм. Иммунол . 3 (2): 181–6. DOI : 10.1016 / 0198-8859 (81) 90055-0 . PMID 6948801 . 
  38. ^ Арнетт FC, Hirsch TJ, Bias WB, Nishikai M, Райхлин M (1981). «Система антител Jo-1 при миозите: взаимосвязь с клиническими особенностями и HLA». J. Rheumatol . 8 (6): 925–30. PMID 6977032 . 
  39. ^ Прайс П, Сантосо Л., Масталья Ф и др. (Ноябрь 2004 г.). «Два основных гаплотипа комплекса гистосовместимости влияют на восприимчивость к спорадическому миозиту с тельцами включения: критическая оценка связи с HLA-DR3». Тканевые антигены . 64 (5): 575–80. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.2004.00310.x . PMID 15496200 . 
  40. ^ O'Hanlon TP, Carrick DM, Arnett FC и др. (Ноябрь 2005 г.). «Иммуногенетический риск и защитные факторы для идиопатических воспалительных миопатий: различные аллельные профили и мотивы HLA-A, -B, -Cw, -DRB1 и -DQA1 определяют клинико-патологические группы у жителей Кавказа». Медицина (Балтимор) . 84 (6): 338–49. DOI : 10.1097 / 01.md.0000189818.63141.8c . PMID 16267409 . 
  41. ↑ Miller FW, Chen W, O'Hanlon TP, Cooper RG, Vencovsky J, Rider LG, Danko K, Wedderburn LR, Lundberg IE, Pachman LM, Reed AM, Ytterberg SR, Padyukov L, Selva-O'Callaghan A, Radstake Т.Р., Изенберг Д.А., Чиной Х., Оллиер В.Е., Шит П., Пэн Б., Ли А., Бьюн Дж., Лэмб Дж. А., Грегерсен П.К., Амос К.И. (2015). «Полногеномное ассоциативное исследование идентифицирует аллели предковых гаплотипов HLA 8.1 как основные генетические факторы риска фенотипов миозита» . Гены и иммунитет . 16 (7): 470–80. DOI : 10.1038 / gene.2015.28 . PMC 4840953 . PMID 26291516 .