Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
HLA-C
HLA-C.png
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3BZF , %% s 4NT6 , %% s 1EFX , %% s 1IM9 , 1QQD

Идентификаторы
ПсевдонимыHLA-C , D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, главный комплекс гистосовместимости, класс I, C, MHC
Внешние идентификаторыOMIM : 142840 HomoloGene : 133080 GeneCards : HLA-C
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение HLA-C
Геномное расположение HLA-C
Группа6п21.33Начинать31 268 749 п.н. [1]
Конец31 272 130 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE HLA-B 209140 x at.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание пептида с антигеном
• связывание с белком GO: 0001948
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• фагоцитарной везикулы мембраны
• Гольджи
• раннее эндосома мембрана
• мембрана
• Гольджи мембраны
• клеточная мембрана
• клеточной поверхности
• эндоплазматический ретикулум
• МНС класса I белковый комплекс
• ЭР к Гольджи транспортной везикул мембраны
• интегральный компонент люменальной стороне мембрана эндоплазматического ретикулума
• внеклеточная экзосома
• мембрана секреторных гранул
• рециклирующая мембрана эндосомы
Биологический процесс• процессинг и презентация антигена
• процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса I, TAP-зависимый
• процесс иммунной системы
• опосредованный гамма-интерфероном сигнальный путь
• процессинг антигена и презентация пептидного антигена через MHC класса I
• процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса I, TAP-независимый
• путь передачи сигналов интерферона типа I
• иммунный ответ
• регуляция иммунного ответа
• вирусный процесс GO: 0022415
• дегрануляция нейтрофилов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3107

н / д

Ансамбль
ENSG00000204525
ENSG00000233841
ENSG00000228299
ENSG00000225691
ENSG00000206435

ENSG00000237022
ENSG00000206452

н / д

UniProt

P10321

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_002117
NM_001243042

н / д

RefSeq (белок)

NP_001229971
NP_002108

н / д

Расположение (UCSC)Chr 6: 31,27 - 31,27 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

HLA-C принадлежит к рецепторам тяжелой цепи класса I MHC (человека = HLA) . Рецептор C представляет собой гетеродимер, состоящий из продукта зрелого гена HLA-C и β2-микроглобулина . Зрелая C-цепь закреплена в мембране. Молекулы MHC класса I, такие как HLA-C, экспрессируются почти во всех клетках и представляют небольшие пептиды иммунной системе, которая исследует чужие пептиды.

HLA-C - это локус на хромосоме 6, который кодирует многие аллели HLA-C, которые являются рецепторами MHC класса I. HLA-C, локализованный проксимальнее локуса HLA-B, расположен на дистальном конце области HLA. Большинство гаплотипов HLA-C: B находятся в сильном неравновесном сцеплении, и многие из них столь же древние, как и сам человеческий вид.

Ассоциации болезней [ править ]

По серотипу [ править ]

Cw1: многоузловой зоб [3]

По аллелю [ править ]

C * 16: B хронический лимфоцитарный лейкоз [4]

Номенклатура [ править ]

C * 01

  • Серотип Cw1 : C * 01: 02 и C * 01: 09
  • Cw11
  • C * 01: 04 до * 01: 08


C * 02

  • Серотип Cw2 : C * 02: 02 и * 02: 08
  • C * 02: 03 - * 02: 07 и 02:09


C * 03

  • Cw9 серотип: C * 03: 03
  • Серотип Cw10 : C * 03: 02, * 03: 04 и * 03: 06
  • Серотип Cw3 : C * 03: 07
  • C * 03:05 и 03:08


С * 04

  • Серотип Cw4 : C * 0401, * 0407 и * 0410


C * 05

  • Серотип Cw5 : C * 05: 01 и * 05: 02
  • C * 05: 03 до * 05: 06 и от * 05: 08 до * 05: 10


С * 06

  • Серотип Cw6 : C * 06: 02 и * 06: 05
  • C * 06: 03, * 06: 04 и * 06: 06 до * 06: 11
  • Серотип Cw7 : C * 07: 01 - * 07: 06, * 07: 12, * 07: 14, * 07: 16
  • C * 07: 07 до * 07: 11, * 07: 13, * 07: 15 и * 07: 17 до * 07: 29


C * 08

  • Серотип Cw8 : C * 08: 01, * 08: 02 и * 08: 03
  • C * 08: 05 до * 08: 12


Другие

  • C * 12: 02 до * 12: 15
  • C * 14: 02 до * 14: 05
  • C * 15: 01 до * 15: 11
  • C * 16: 01 до * 16: 06
  • C * 17: 01 до * 17: 03
  • C * 18: 01 и * 18: 02

Общий гаплотип [ править ]

Cw4-B35 (Западная Африка для коренных американцев) Cw7-B7 (Западная Евразия, Южная Африка) Cw7-B8 (Западная Евразия) Cw1-B46 (Китай, Индокитай) Cw5-B44 (Западная Евразия)

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что HLA-C взаимодействует с:

  • KIR2DL1 , [5] [6] [7] [8]
  • LILRA3 [9]
  • Семейство лейкоцитарных иммуноглобулиноподобных рецепторов , в частности активирующий рецептор LILRA1

Ссылки [ править ]

  1. ^ Б с ENSG00000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000204525, ENSG00000233841, ENSG00000228299, ENSG00000225691, ENSG00000206435, ENSG00000237022, ENSG00000206452 - Ensembl , май 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ↑ Ríos A, Rodríguez JM, Moya MR, Galindo PJ, Canteras M, Alvarez MR, Parrilla P (2006). «Ассоциации аллелей HLA-C с многоузловым зобом: исследование в популяции из юго-восточной Испании» . Arch Surg . 141 (2): 123–8. DOI : 10,1001 / archsurg.141.2.123 . PMID 16490887 . 
  4. ^ Монтес-Арес О, Мойя-Квилес MR, Монтес-Касадо М, Герра-Перес N, Кампильо Х.А., Гонсалес С, Лопес-Бермехо А, Тамайо М, Маджадо МД, Паррадо А, Муро М, Марин Л, Альварес-Лопес MR (2006). «Человеческий лейкоцитарный антиген-С при хроническом лимфолейкозе В». Br J Haematol . 135 (4): 517–9. DOI : 10.1111 / j.1365-2141.2006.06334.x . PMID 17054674 . S2CID 23018830 .  
  5. ^ Бойсон JE, Эрскин R, Whitman MC, Chiu M, Lau JM, Koopman LA, Valter MM, Angelisova P, Horejsi V, Strominger JL (декабрь 2002). «Опосредованная дисульфидной связью димеризация HLA-G на поверхности клетки» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (25): 16180–5. Bibcode : 2002PNAS ... 9916180B . DOI : 10.1073 / pnas.212643199 . PMC 138585 . PMID 12454284 .  
  6. ^ Баба Е, Р Эрскин, Boyson JE, Коген Г. Б., Дэвис Д., Малик Р, Mandelboim О, Reyburn НТ, Стромингер ДЛ (декабрь 2000). «N-связанный углевод на человеческом лейкоцитарном антигене-C и распознавание рецепторами, ингибирующими естественные клетки-киллеры». Гм. Иммунол . 61 (12): 1202–18. DOI : 10.1016 / s0198-8859 (00) 00184-1 . PMID 11163076 . 
  7. ^ VALES-Гомес M, Reyburn HT, Mandelboim M, Стромингер JL (сентябрь 1998). «Кинетика взаимодействия лигандов HLA-C с рецепторами, ингибирующими естественные клетки-киллеры». Иммунитет . 9 (3): 337–44. DOI : 10.1016 / s1074-7613 (00) 80616-0 . PMID 9768753 . 
  8. ↑ Fan QR, Long EO, Wiley DC (май 2001 г.). «Кристаллическая структура комплекса человеческого ингибитора естественных клеток-киллеров KIR2DL1-HLA-Cw4». Nat. Иммунол . 2 (5): 452–60. DOI : 10.1038 / 87766 . PMID 11323700 . S2CID 24707532 .  
  9. ^ Джонс постоянного тока, Kosmoliaptsis В, приложения R, Lapaque Н, Смит Я, Коно А, Чан С, Бойл ЛГ, Тейлор CJ, Trowsdale Дж, Аллен RL (март 2011 г.). «Аллельная последовательность и конформация HLA класса I регулируют связывание лейкоцитарного Ig-подобного рецептора» . J. Immunol . 186 (5): 2990–7. DOI : 10.4049 / jimmunol.1003078 . PMID 21270408 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Гейер М., Факлер О. Т., Петерлин Б. М. (2001). «Структурно-функциональные отношения в ВИЧ-1 Неф» . EMBO Rep . 2 (7): 580–5. DOI : 10.1093 / embo-reports / kve141 . PMC  1083955 . PMID  11463741 .
  • Гринуэй А.Л., Холлоуэй Г., Макфи Д.А., Эллис П., Корнолл А., Лидман М. (2004). «Контроль Nef ВИЧ-1 клеточных сигнальных молекул: несколько стратегий для стимулирования репликации вируса». J. Biosci . 28 (3): 323–35. DOI : 10.1007 / BF02970151 . PMID  12734410 . S2CID  33749514 .
  • Бенишу С., Бенмера А. (2003). «[Nef ВИЧ и белки K3 / K5 вируса Капоши-саркомы:« паразиты »пути эндоцитоза]» . Med Sci (Париж) . 19 (1): 100–6. DOI : 10.1051 / medsci / 2003191100 . PMID  12836198 .
  • Ливитт С.А., Шон А., Кляйн Дж. К., Манджаппара У., Чайкен И. М., Фрейре Э. (2004). «Взаимодействие белков gp120 и Nef ВИЧ-1 с клеточными партнерами определяет новую аллостерическую парадигму». Curr. Protein Pept. Sci . 5 (1): 1–8. DOI : 10.2174 / 1389203043486955 . PMID  14965316 .
  • Толструп М., Остергард Л., Лаурсен А.Л., Педерсен С.Ф., Дуч М. (2004). «Ускользание от иммунного надзора за ВИЧ / ВИП: внимание на Неф». Curr. HIV Res . 2 (2): 141–51. DOI : 10.2174 / 1570162043484924 . PMID  15078178 .
  • Джозеф А.М., Кумар М., Митра Д. (2005). «Неф:« необходимый и усиливающий фактор »при ВИЧ-инфекции». Curr. HIV Res . 3 (1): 87–94. DOI : 10.2174 / 1570162052773013 . PMID  15638726 .
  • Андерсон Дж. Л., Надежда Т. Дж. (2005). «Вспомогательные белки ВИЧ и выживание в клетке-хозяине». Текущие отчеты о ВИЧ / СПИДе . 1 (1): 47–53. DOI : 10.1007 / s11904-004-0007-х . PMID  16091223 . S2CID  34731265 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Молекулярная антропология Yahoo Group
  • База данных частот аллелей и гаплотипов HLA