 | Эта статья может быть слишком технической, чтобы ее могло понять большинство читателей . ( Май 2017 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения ) |
| HLA-A3 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ( МНС класса I , клеточной поверхности антиген) | ||||||||||
 HLA-A3 | ||||||||||
| О | ||||||||||
| Протеин | трансмембранный рецептор / лиганд | |||||||||
| Состав | αβ гетеродимер | |||||||||
| Подразделения | HLA-A * 03-, β 2 -микроглобулин | |||||||||
| Старые имена | HL-A3 | |||||||||
| Подтипы | ||||||||||
| ||||||||||
| Редкие аллели | ||||||||||
| ||||||||||
| Ссылка аллелей на базу данных IMGT / HLA в EBI | ||||||||||
HLA-A3 (A3) представляет собой серотип лейкоцитарного антигена человека в группе серотипа HLA-A . Серотип определяется по распознаванию антителом α 3 подмножества α-цепей HLA-A. Для A3 альфа, «A», цепь кодируется группой аллеля HLA-A * 03, а β-цепь кодируется локусом B2M . [1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 0301. A3 и A * 03 почти синонимы по значению. A3 более распространен в Европе, он является частью самого длинного известного мультигенного гаплотипа A3-B7-DR15-DQ6. [2]
Серотип [ править ]
| A * 03 | A3 | Образец |
| аллель | % | размер (N) |
| * 0301 | 99 | 3504 |
| * 0302 | 78 | 342 |
| * 0305 | 20 | 5 |
A3 в основном состоит из A * 0301 и * 0302, которые хорошо серотипируются с антителами против A3. Существует 26 несинонимичных вариантов A * 03, 4 нулевых и 22 варианта белка.
Сопутствующие заболевания [ править ]
Серотип A3 является вторичным фактором риска миастении [4] и более низкого уровня CD8 + у пациентов с гемохроматозом . [5] [6] Локус HFE (гемохроматоз) находится между A3 и B7 в супергаплотипе A3 :: DQ6. [7]
В ВИЧ [ править ]
HLA-A3 выбирает эволюцию ВИЧ по мутационному эпитопу Gag KK9 и приводит к быстрому снижению Т-клеточного ответа CD8. CD8 Т-клетки отвечают за быстрое уничтожение ВИЧ-инфицированных CD4 + клеток. [8] Этот тип развитого ответа может не быть специфичным для HLA-A3, и поскольку ВИЧ способен быстро адаптироваться in situ к селективным факторам.
Аллели [ править ]
| Исследуемая популяция | Freq. (в%) [9] |
|---|---|
| Финляндия | 25,0 |
| Индия Тамил Наду Надар | 20,5 |
| Республика Чехия | 18,9 |
| Бельгия | 17,1 |
| Ирландия Северная | 14,3 |
| Австралия Новый Южный Уэльс | 13,8 |
| Грузия Сванети Сваны | 13,8 |
| Грузия Тибилиси Грузинская… | 13,8 |
| Пакистан Бурушо | 13,0 |
| Кабо-Верде, северо-запад I… | 12.0 |
| Южная Ирландия | 11,6 |
| румынский | 11,6 |
| Хорватия | 11.0 |
| Кавказцы США (3) | 10,8 |
| Северная Италия (1) | 9,7 |
| Афроамериканцы в США (2) | 9,4 |
| Индия Мумбаи Маратхи | 9,3 |
| Индия Вест Бхилс | 9.0 |
| Центр Португалии | 9.0 |
| Пакистан Патан | 8,7 |
| Камерун Бети | 8,6 |
| Камерун Бамилеке | 7,8 |
| Пакистанские калаши | 7,5 |
| Саудовская Аравия Гураят и… | 7,5 |
| США испаноязычный | 7.3 |
| Индия Северный Дели | 7.2 |
| Мадейра | 7.0 |
| Россия Тува (2) | 6.9 |
| Тунис | 6,7 |
| США Уроженец Северной Америки… | 6,7 |
| Кабо-Верде Юго-восток I… | 6.5 |
| Азорские острова Санта-Мария и Са ... | 6.4 |
| Пакистанский белудж | 6.3 |
| Гвинея-Бисау | 6.2 |
| Израильские арабские друзы | 6.0 |
| Южноафриканский Натал Зулу | 6.0 |
| США, латиноамериканцы из Южного Техаса | 6.0 |
| Индусы Севера Индии | 5,8 |
| Замбия Лусака | 5,8 |
| Иран Белудж | 5,6 |
| Уганда Кампала | 5.5 |
| Иордания Амман | 5.2 |
| Кения | 5.2 |
| Бразилия | 5.1 |
| Оман | 5.1 |
| Камерунский карликовый бака | 5.0 |
| Грузия Тибилиси Курды | 5.0 |
| Суданский | 4.8 |
| Болгария | 4.6 |
| Пакистан Брахуи | 4.6 |
| Китай Пекин | 4.5 |
| Австралия Индиг. Мыс Йор… | 4.4 |
| Китай Внутренняя Монголия | 4.4 |
| Мали Бандиагара | 4.4 |
| Пакистанский синдхи | 4.4 |
| Китай Цинхай Хуэй | 4.1 |
| Зимбабве Хараре Шона | 4.0 |
| Камерун Сава | 3.8 |
| Сенегал Ниохоло Манденка | 3.8 |
| Кения Луо | 3,6 |
| Марокко Надор Металса Кла… | 3,4 |
| Кения Нанди | 3.1 |
| Мекс. Гвадалахара Метис… | 3.1 |
| Китай Гуанчжоу | 2,9 |
| Китай Северная Хань | 2,9 |
| Монголия Бурят | 2,9 |
| Китайские тибетцы | 2,5 |
| Китай Юньнань Ну | 2,5 |
| Мексика Местис | 2,4 |
| американское Самоа | 2.0 |
| Сингапур яванский индон… | 2.0 |
| Представлены только частоты аллелей | |
| Исследуемая популяция | Freq. (в%) [9] |
|---|---|
| Грузия Тибилиси Курды | 8,3 |
| Марокко Надор Металса Кла… | 4.1 |
| Пакистан Карачи Парси | 2,8 |
| Израильские арабские друзы | 2,5 |
| Индия Нью-Дели | 2.3 |
| Суданский | 2.3 |
| Индия Северный Дели | 2.2 |
| Парсы западного побережья Индии | 2.0 |
| Центр Португалии | 2.0 |
| Индия Андхра-Прадеш Голл… | 1,7 |
| Пакистанские калаши | 1,7 |
| Пакистанский белудж | 1.6 |
| Грузия Тибилиси Грузинская… | 1.4 |
| Саудовская Аравия Гураят и… | 1.4 |
| Оман | 1.3 |
| Пакистанский синдхи | 1.3 |
| Индусы Севера Индии | 1.0 |
| Пакистан Патан | 1.0 |
| Южная Африка Натал Тамил | 1.0 |
| США, латиноамериканцы из Южного Техаса | 0,8 |
| Представлены только частоты аллелей | |
Сопутствующие заболевания [ править ]
A * 0301 модулирует повышенный риск рассеянного склероза [10]
Гаплотипы A3-B [ править ]
A3-B7 является частью супергаплотипа A3 :: DQ2 A3-B8 (Румыния, svanS)
A3-B35 (Болгария, Хорватия, E. Черное море)
A3-B55 (E. Черное море)
A3-Cw7-B7 [ править ]
A3-B7 является бимодальным по частоте в Европе с одним узлом в Ирландии, а другой в Швейцарии, относительно Швейцарии, кажется, выше. A3-Cw7-B7 - один из наиболее распространенных мультигенных гаплотипов в западном мире, особенно в Центральной и Восточной Европе.
A * 0301 : C * 0702 : B * 0702 : DRB1 * 1501 : DQA1 * 0102 : DQB1 * 0602
Ссылки [ править ]
- Перейти ↑ Arce-Gomez B, Jones EA, Barnstable CJ, Solomon E, Bodmer WF (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены . 11 (2): 96–112. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x . PMID 77067 .
- ^ Хортон Р., Гибсон Р., Коггилл П. и др. (Январь 2008 г.). «Вариационный анализ и аннотация генов восьми гаплотипов MHC: проект гаплотипов MHC» . Иммуногенетика . 60 (1): 1–18. DOI : 10.1007 / s00251-007-0262-2 . PMC 2206249 . PMID 18193213 .
- ^ Форма запроса аллеля IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Machens А, Löliger С, Pichlmeier U, Emskötter Т, Busch С, Izbicki J (1999). «Взаимосвязь патологии тимуса с HLA при миастении». Клиническая иммунология . 91 (3): 296–301. DOI : 10,1006 / clim.1999.4710 . PMID 10370374 .
- Перейти ↑ Barton J, Wiener H, Acton R, Go R (2005). «Гаплотип HLA A * 03-B * 07 у пробандов гемохроматоза с гомозиготностью по HFE C282Y: несоответствие частоты у мужчин и женщин и отсутствие связи с серьезностью перегрузки железом». Blood Cells Mol Dis . 34 (1): 38–47. DOI : 10.1016 / j.bcmd.2004.08.022 . PMID 15607698 .
- Перейти ↑ Cruz E, Vieira J, Almeida S, Lacerda R, Gartner A, Cardoso C, Alves H, Porto G (2006). «Исследование 82 расширенных гаплотипов HLA у субъектов с гомозиготным гемохроматозом HFE-C282Y: связь с генетическим контролем числа CD8 + Т-лимфоцитов и тяжестью перегрузки железом» . BMC Med Genet . 7 : 16. DOI : 10,1186 / 1471-2350-7-16 . PMC 1413516 . PMID 16509978 .
- ↑ Olsson KS, Ritter B, Hansson N, Chowdhury RR (июль 2008 г.). «HLA-гаплотипическая карта популяций речных долин с гемохроматозом, прослеженная на протяжении пяти веков в Центральной Швеции». Евро. J. Haematol . 81 (1): 36–46. DOI : 10.1111 / j.1600-0609.2008.01078.x . PMID 18363869 .
- ^ Allen TM, Altfeld M, Yu XG и др. (Июль 2004 г.). «Отбор, передача и реверсия мутации ускользания цитотоксических Т-лимфоцитов процессинга антигена при инфекции вируса иммунодефицита человека типа 1» . J. Virol . 78 (13): 7069–78. DOI : 10,1128 / JVI.78.13.7069-7078.2004 . PMC 421658 . PMID 15194783 .
- ^ а б Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены . 61 (5): 403–407. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x . PMID 12753660 .
- ^ Fogdell-Хан А, Лигерс А, Grønning М, Hillert Дж, Olerup O (2000). «Рассеянный склероз: модифицирующее влияние генов HLA класса I на аутоиммунное заболевание, ассоциированное с HLA класса II». Тканевые антигены . 55 (2): 140–8. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2000.550205.x . PMID 10746785 .
