Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа G1
Карта частотного распределения Y-хромосомы гаплогруппы G1-M285.PNG
Возможное время происхождения18 500 (95% ДИ 16 800 <-> 20 200) лн [1]
Возможное место происхождениявозможно Иран
ПредокГаплогруппа G (Y-ДНК)
ПотомкиG1a, G1b, G1c
Определение мутацийM285 (G1), P20 (G1a), L201, L202, L203 (G1a1), L830, L831, L832, L834, L835 (G1b)

В области генетики человека , Гаплогруппа G-M285 , также известный как Haplogroup G1 , представляет собой Y-хромосомы гаплогруппы . Гаплогруппа G1 является первичным субкладом из гаплогруппы G .

Предполагается, что G1 возник в Иране . Он имеет чрезвычайно низкую частоту в современных популяциях, за исключением (i) Ирана и его западных соседей, и (ii) региона, охватывающего юг Центральной Сибири (Россия) и северный Казахстан . Наиболее базальные примеры G1, идентифицированные у живых людей, которые принадлежат к субкладу G-L830, были обнаружены на территории от Аравийского полуострова ( регион северных границ Саудовской Аравии, Ад-Давха в Катаре) до Беларуси ( Минская область ). и Китай ( Аньхой ). [1]

Генетические особенности [ править ]

Почти все люди G1 имеют значение 12 на маркере коротких тандемных повторов (STR) DYS392, и все будут иметь мутацию SNP M285, которая характеризует эту группу. Это значение 12 также необычно для других гаплогрупп. Обозначение M для M285 указывает на то, что он был впервые обнаружен в Стэнфордском университете .

M285 имеет следующие характеристики: Идентификационный номер ссылки - rs13447378 ..... Положение Y - 21151128 .... Последовательность прямого праймера - ttatcctgagccgttgtccctg и обратная последовательность tgtagagacacggttgtaccct.... Мутация G в C. [2] M285 впервые была описана в 2004 г. Cinnioglu et al. [3]

На данный момент все протестированные люди с мутацией M285 также являются положительными по мутации M342 SNP. Если кто-то проведет тестирование по-другому, его результаты станут основой новой категории G1. M342 расположен в позиции последовательности 21653330 и являетсяAGAGAGTTTTCTAACAGGGCG в переднем праймере и TGGGAATCACTTTTGCAACTнаоборот. Это мутация от C до T. [3] M342 также был идентифицирован в Стэнфордском университете,

Кроме того, внутри гаплогруппы G те люди G1, которые были протестированы до сих пор, однозначно положительны (производные) для SNP L89, в то время как все другие люди G отрицательны (предки). Мутация L89 SNP также была обнаружена в других гаплогруппах. L89 расположен в позиции последовательности 8038725, а идентификационный номер ссылки - rs35160044. Это мутация от T до C. Обозначение L89 было предоставлено Family Tree DNA .

Датировка происхождения G1 [ править ]

Хотя научные исследования еще не датировали происхождение мутации SNP M285 G1, она, по-видимому, представляет собой одну из более старых групп G, возникшую, возможно, на полпути между происхождением G и сегодняшним днем, исходя из количества мутаций маркера STR.

Географическое распространение [ править ]

Географическое распространение [ править ]

Хотя в большинстве исследований не удалось проверить G1, вероятные или проверенные примеры были обнаружены в четырех группах (по географическому признаку и / или и / или вторичному подкладу):

  • Иран / Центральная Азия (включая российскую Среднюю Сибирь, Казахстан и Пакистан );
  • Ближний Восток / Юго-Восточная Европа (например , Греция , Турция , Ирак , Дубай , Палестина , Иордания , Саудовская Аравия и Йемен );
  • в очень небольшом количестве в Южной Азии (например, в Непале , Индии и Шри-Ланке ), и;
  • на очень низких частотах в остальной Европе . [4]

Наибольшая зарегистрированная концентрация G1 и его подгрупп в отдельной стране находится в Иране , за ним следуют наиболее частые концентрации в соседних странах на западе. В частности, G1 был обнаружен в 5% из 177 образцов из южного Ирана в одном исследовании. То же исследование обнаружило G1 в 3% из 33 проб на севере Ирана. Процент на юге был почти равен проценту G2, единственному региону в мире, где не было обнаружено сильного доминирования типов G2. [5] Более ранние исследования, в которых было обнаружено примерно одинаковое процентное содержание G в различных частях Ирана, не проводились специально для G1. [6] [7]

В Турции Чинниоглу обнаружил 1% из 523 образцов всех типов, принадлежащих к гаплогруппе G1, и, как и все доступные G1 за пределами Ирана, G1 затмевается гораздо большим количеством мужчин G2 в выборке. Все образцы G1 в этом исследовании, кроме одного, принадлежали к дополнительной подгруппе G1a, и все образцы были из северо-восточной Турции. [8]

Исследование Ливана Zalloua et al. не удалось проверить на G1, но 26% из 38 образцов G имели значение 12 для STR-маркера DYS392, почти всегда характерного для G1. Эти образцы G1 представляют только 2% от общего числа 587 ливанских выборок и были хорошо распределены среди всех религиозных групп. [9]

Более широкое исследование Леванта Эль-Сибай и др. также не удалось проверить на G1, но 12% из 17 сирийских образцов G имели значение 12 на DYS392. Эти образцы G1 представляют менее 1% из 354 сирийских образцов. В том же исследовании 21% из 14 иорданских образцов G имели значение 12. Эти образцы G1 представляют 1% от 274 иорданских образцов. Ни один из 8 египетских образцов G не имел значения 12. [10]

Вероятные образцы G в базе данных YHRD [11] из района Южного Кавказа ( Азербайджан , Грузия , Армения , абазиния , Абхазия ) и с Северного Кавказа (Северная осетины, кабардинцы , Ingushians, даргинцев , Lezginians, Rutulians и чеченцы) имеют только несколько сэмплов DYS392 с 12 значениями, которые могут быть G1.

Сайты с концентрацией G1 [ править ]

Наибольшая концентрация G1 в отдельной группе , внутри страны была отмечена среди маджар в Казахстане , где G1 человек составляли 87% из 45 образцов, Аргын - 67%. [12]

Подгруппы G1 [ править ]

Подгруппы, определенные SNP [ править ]

Подгруппа G1a (P20) довольно распространена среди лиц G1, но надежность SNP P20 при идентификации лиц G1a делает некоторые тесты на P20 проблемой. [13] Результаты P20 могут быть представлены как P20.1, P20.2 и P20.3, и люди могут иметь разные результаты для каждого. Технические характеристики P20: позиция Y - 25029911; 23396163 ..... передний праймерtggatctgattcacaggtag..... обратный праймер ccaacaatatgtcacaatctc... мутация представляет собой делецию C. [2] Мутация была идентифицирована в Университете Аризоны и впервые сообщена Консорциумом Y-хромосомы в 2002 году. [14] Категория G1a имеет отдельную подгруппу в зависимости от наличия значения из 8 на маркере короткого тандемного повтора DYS494. За исключением этой подгруппы G1a, все другие люди G имеют 9 на этом медленно мутирующем маркере. Пока что около половины людей G1a, которые иначе не сгруппированы, имеют это значение 8. [15]

G1a1 (L201, L202 и L203) были идентифицированы у человека из G1a, протестированного на ДНК Семейного древа осенью 2009 г. Последующее тестирование показало, что только некоторые люди G1a имеют эти мутации, и до сих пор все они принадлежат к близкородственной группе мужчин-евреев- ашкенази. . Были отмечены следующие позиции Y: 2718285 для L201, 13001714 для L202 и 13001715 для L203. В L201 мутация от C до T; в L202 от Т до С; и в L203 от A до G. Если у какого-либо человека должна быть одна из этих мутаций SNP без других, эта информация станет основой новой классификации G1a1.

Старый G1b (P76) был удален из официального списка в августе 2012 года, поскольку его обнаружение у одного человека делает его пока только частным SNP.

G1b (L830, L831, L832, L834, L835) были идентифицированы в конце 2011 года в генеалогическом древе ДНК . Мутации G1c: L830 (от T к C в положении 6923908), L831 (от T к C в положении 6991562), L832 (от T к G в положении 12796626), L834 (от T к A в положении 16019950), L835 (от G к A в позиции 16291409).

Кластеры значений маркеров STR [ править ]

Существуют две отличительные группы евреев - ашкенази европейского происхождения в пределах G1a1 и G1c и отличительная группа казахов G1a - все три основаны на значениях маркеров коротких тандемных повторов (STR). [16] Мужчины в еврейском кластере G1c имеют значение 12 для STR-маркера DYS446, что на несколько значений ниже, чем почти все люди G, но в двух других группах отсутствует одно конкретное значение маркера в качестве идентификатора. Когда при сравнении образцов доступны примерно 30 или более маркеров STR, легко определить членов каждой из трех групп. Одна из отличительных комбинаций значений STR-маркеров G1c ашкеназских евреев европейского происхождения обнаружена также у иракского еврея в одном исследовании. [17] См. Также обложку страницыЕвреи с гаплогруппой G (Y-ДНК) .

Среди доступных 67-маркерных выборок G1 STR [16] еврейский кластер G1a1 ашкенази представляет ближайших родственников казахстанскому кластеру G1a на основании сходства значений STR-маркеров.

Кластер G1c ашкенази лишь отдаленно связан с кластером G1a1 ашкенази, а кластер G1c ашкенази имеет ближайших родственников среди различных европейцев.

Миграции лиц G1 [ править ]

Концентрация G1, обнаруженная сегодня в Иране и прилегающей территории к его западу, предполагает, но не доказывает, что эта же территория была местом происхождения G1. Из-за длительного возраста G1 отдаленные миграции небольшого числа людей G1 могли произойти в любое время в течение исторического периода посредством различных типов перемещений населения. Было бы спекулятивно предполагать, каким образом ашкеназские группы G1 или казахстанские группы мужчин G1 прибыли в Северо-Восточную Европу и Казахстан соответственно.

См. Также [ править ]

  • генетическая генеалогия
  • Гаплогруппы Y-ДНК по этническим группам
  • Гаплогруппа G (Y-ДНК) Страна по стране

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b YFull YTree v8.07.00 по состоянию на 30 августа 2020 г.
  2. ^ а б Карафат, Т .; и другие. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–38. DOI : 10.1101 / gr.7172008 . PMC  2336805 . PMID  18385274 .
  3. ^ a b Cinnioglu, C .; и другие. (2004). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии» (PDF) . Генетика человека . 114 (2): 127–48. DOI : 10.1007 / s00439-003-1031-4 . PMID 14586639 . S2CID 10763736 . Архивировано из оригинального (PDF) 19 июня 2006 года.   
  4. ^ | url = https://sites.google.com/site/haplogroupgproject/project-roster Примеры проекта Haplogroup G
  5. ^ Regueiro M, Каденас AM, Gayden T, Андерхилл PA, Herrera RJ (2006). «Иран: триконтинентальный нексус для миграции, вызванной Y-хромосомой» . Человеческая наследственность . 61 (3): 132–43. DOI : 10.1159 / 000093774 . PMID 16770078 . S2CID 7017701 .  
  6. ^ Насидзе, я; и другие. (2006). «Сопутствующая замена языка и мтДНК в южно-каспийских популяциях Ирана». Текущая биология . 16 (7): 668–73. DOI : 10.1016 / j.cub.2006.02.021 . PMID 16581511 . S2CID 7883334 .  
  7. ^ Насидзе, я; и другие. (2008). «Тесная генетическая связь между семитоязычными и индоевропейскоязычными группами в Иране». Анналы генетики человека . 72 (Pt 2): 241–52. DOI : 10.1111 / j.1469-1809.2007.00413.x . PMID 18205892 . S2CID 5873833 .  
  8. ^ Cinnioglu, C .; и другие. (2004). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека . 114 (2): 127–48. DOI : 10.1007 / s00439-003-1031-4 . PMID 14586639 . S2CID 10763736 .  
  9. ^ Zalloua, P .; и другие. (2008). «Выявление генетических следов исторической экспансии: финикийские следы в Средиземном море» . Американский журнал генетики человека . 83 (5): 633–42. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2008.10.012 . PMC 2668035 . PMID 18976729 .  
  10. ^ Эль-Сибай, М .; и другие. (2009). «Географическая структура Y-хромосомного генетического ландшафта Леванта: контраст между прибрежными и внутренними территориями» . Анналы генетики человека . 73 (6): 568–81. DOI : 10.1111 / j.1469-1809.2009.00538.x . PMC 3312577 . PMID 19686289 .  
  11. ^ | url = http://www.yhrd.org/Search
  12. ^ Биро, А .; Залан, А .; и другие. (2009). «Сравнение Y-хромосомы маджаров (Казахстан) и мадьяр (Венгрия)» . Американский журнал физической антропологии . 139 (3): 305–10. DOI : 10.1002 / ajpa.20984 . PMID 19170200 . Архивировано из оригинала на 2013-01-05. 
  13. ^ http://archiver.rootsweb.ancestry.com/th/read/GENEALOGY-DNA/2007-07/1185576938 Отчет Томаса Крана
  14. ^ Консорциум Y-хромосомы (2002). «Система номенклатуры дерева бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 12 (2): 339–48. DOI : 10.1101 / gr.217602 . PMC 155271 . PMID 11827954 .  
  15. ^ Результаты проекта Haplogroup G | url = https://sites.google.com/site/haplogroupgproject/nonstandard-markers
  16. ^ a b | url = https://sites.google.com/site/haplogroupgproject/project-roster
  17. ^ Хаммер, М .; и другие. (2009). «Расширенные гаплотипы Y-хромосомы разрешают множественные и уникальные линии еврейского священства» . Генетика человека . 126 (5): 719–24. DOI : 10.1007 / s00439-009-0727-5 . PMC 2771134 . PMID 19669163 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Сайт проекта гаплогруппы G
  • Распространение гаплогруппы G от National Geographic
  • Учебник по гаплогруппе G от Genebase
  • Y-ДНК Гаплогруппа G и ее субклады из гаплотерева ISOGG 2010 г.
  • Балановский Олег; Жабагин, Максат; Агджоян Анастасия; Чухряева, Марина; Запорожченко, Валерий; Утевская, Ольга; Хайнам, Гарет; Сабитов, Жаксылык; Гринспен, Эллиотт; Дибирова, Хадижат; Схаляхо, Роза; Кузнецова, Марина; Кошель, Сергей; Юсупов, Юлдаш; Нимадава, Пагбаджабын; Жумадилов, Жакыбай; Почешхова Эльвира; Габер, Марк; а. Заллуа, Пьер; Епископосян, Левон; Дыбо, Анна; Тайлер-Смит, Крис; Балановская, Елена (2015). «Глубокий филогенетический анализ гаплогруппы G1 обеспечивает оценку скорости мутаций SNP и STR на Y-хромосоме человека и выявляет миграции иранских носителей» . PLOS ONE . 10 (4): e0122968. Bibcode : 2015PLoSO..1022968B . doi :10.1371 / journal.pone.0122968 . PMC  4388827 . PMID  25849548 .