Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа L1
Возможное время происхождения107 600–174 300 YBP [1]
Возможное место происхожденияЦентральная Африка
ПредокL1-6
ПотомкиL1b, L1c
Определение мутаций3666, 7055, 7389, 13789, 14178, 14560 [2]
Прогнозируемое пространственное распределение гаплогруппы L1 в Африке.

Гаплогруппа L1 - это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК). Наиболее распространен в Центральной и Западной Африке . Он отделился от L1-6 примерно 140000 лет назад (140,6+33,7
−33,0 kya 95% ДИ ). [3] Его появление связано с ранним заселении Африки по анатомически современных людей во время Eemian , и теперь встречается в основном африканских пигмеев .

Распространение [ править ]

Гаплогруппа L1 чаще всего встречается в Центральной и Западной Африке . Она достигает своей самой высокой частотой среди Мбенга пигмеев . Вполне вероятно, что раньше он был более широко распространен и был ограничен своей нынешней территорией в результате миграции банту (которая в значительной степени связана с гаплогруппой L2 ). [4] Гаплогруппа L1 наблюдалась в образцах с островного кладбища в Кулубнарти , Судан , которые датируются раннехристианским периодом (550–800 нашей эры). [5] Человек древней культуры кубков на Камино-де-лас-Йесерас в Испании.(Сан-Фернандо-де-Энарес, Мадрид; [I4245 / RISE695] F) также было обнаружено, что он несет митохондриальную гаплогруппу L1b1a. [6]

Филогения [ править ]

Карты интерполяции для гаплогрупп L1b и L1c.

L1 имеет две ветви, L1c и L1b (ранее названные гаплогруппы L1d, L1k, L1a, L1f были [ год необходим ] переклассифицированы в гаплогруппу L0, как L0d, L0k, L0a, L0f; L1e как L5).

L1c [ править ]

Гаплогруппа L1c появилась примерно в 85 тыс. Лет назад. Наиболее часто он встречается в Западной и Центральной Африке, особенно среди пигмеев мбенга . ( см. карту ). [7] Среди мбенга его переносят 100% Ба-Кола , 97% Ба-Бензеле и 77% Биака . [8] Другие группы , в которых L1C особенно распространено включают Tikar (100%), BAKA человек из Габона (97%) и Камеруна (90%), [9] Bakoya (97%) и В-Бонго ( 82%). [7]Обычен также в Сан-Томе (20%) и Анголе (16–24%). [10]

Филогения: [2]

  • L1c
    • L1c1'2'4'6
      • L1c1
        • L1c1a
          • L1c1a1
            • L1c1a1a
              • L1c1a1a1
                • L1c1a1a1a
                • L1c1a1a1b
                  • L1c1a1a1b1
              • L1c1a1a2
            • L1c1a1b
          • L1c1a2
            • L1c1a2a
              • L1c1a2a1
              • L1c1a2a2
            • L1c1a2b
            • L1c1a2c
        • L1c1b'c'd
          • L1c1b
          • L1c1c'd
            • L1c1c
            • L1c1d
      • L1c2'4
        • L1c2
          • L1c2a
            • L1c2a1
              • L1c2a1a
              • L1c2a1b
            • L1c2a2
          • L1c2b
            • L1c2b1
            • L1c2b2
        • L1c4
          • L1c4a
          • L1c4b
      • L1c6
    • L1c3
      • L1c3a
        • L1c3a1
        • L1c3a1a
      • L1c3b'c
        • L1c3b
          • L1c3b1
            • L1c3b1a
            • L1c3b1b
          • L1c3b2
        • L1c3c

L1b [ править ]

Гаплогруппа L1b гораздо более свежая, ее возраст составляет около 10 тысяч лет назад. Часто встречается в Западной Африке . Он также был обнаружен в Мозамбике (1%), Эфиопии (2%), Египте (1%), долине Нила (4%), Кунге (1%), Кабо-Верде (8%), Сенегале (17–20 %). %), Нигер / Нигерия (15%), Гвинея-Бисау (11%), Марокко (4–5%) и Алжир (1-2%). [11]

Филогения: [2]

  • L1b
    • L1b1
      • L1b1a
        • L1b1a1'4
          • L1b1a1
          • L1b1a4
        • L1b1a2
          • L1b1a2a
        • 189
          • L1b1a3
            • L1b1a3a
              • L1b1a3a1
        • L1b1a5
        • L1b1a6
        • L1b1b7

См. Также [ править ]

  • Генеалогический ДНК-тест
  • Генетическая генеалогия
  • Митохондриальная генетика человека
  • Популяционная генетика
  • Гаплогруппы митохондриальной ДНК человека

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева ( L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ

Ссылки [ править ]

  1. ^ Соарес, Педро; Лука Эрмини; Ноэль Томсон; Мару Мормина; Тереза ​​Рито; Арне Рёль; Антонио Салас; Стивен Оппенгеймер; Винсент Маколей; Мартин Б. Ричардс (4 июня 2009 г.). «Коррекция дополнительных данных для очищающего отбора: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 82–93. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2009.05.001 . PMC  2694979 . PMID  19500773 .
  2. ^ a b c ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386 – E394. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 . Архивировано из оригинала 4 декабря 2012 года . Проверено 20 мая 2009 .  
  3. ^ «Исправление для очищающего отбора: дополнительный материал по улучшенным митохондриальным молекулярным часам человека (стр. 82)» (PDF) . 2009: 89. Архивировано из оригинального (PDF) 29 декабря 2009 года . Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  4. ^ Сильва, Марина; Альшамали, Фарида; Сильва, Паула; Каррильо, Карла; Мандлат, Флавио; Хесус Тровоада, Мария; Черный Виктор; Перейра, Луиза; Соарес, Педро (2015). «60 000 лет взаимодействий между Центральной и Восточной Африкой, документально подтвержденных основной африканской митохондриальной гаплогруппой L2» . Sci. Rep . 5 : 12526. Bibcode : 2015NatSR ... 512526S . DOI : 10.1038 / srep12526 . PMC 4515592 . PMID 26211407 .  
  5. ^ Сирак, Кендра; Френандес, Даниэль; Новак, Марио; Ван Гервен, Деннис; Пинхаси, Рон (2016). Тезисы докладов Межконгресса IUAES 2016 - Сообщество разделилось? Выявление генома (ов) сообщества средневековой Кулубнарти с использованием секвенирования следующего поколения . IUAES.
  6. ^ Иньиго Олальде и др. Феномен стакана и геномная трансформация Северо-Западной Европы , 2017
  7. ^ a b Кинтана-Мурси; и другие. (2008). «Материнские следы глубокого общего предка и асимметричный поток генов между пигмеями-охотниками-собирателями и фермерами, говорящими на банту» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (5): 1596–601. Bibcode : 2008PNAS..105.1596Q . DOI : 10.1073 / pnas.0711467105 . PMC 2234190 . PMID 18216239 .  
  8. ^ Сара А. Тишкофф и др. 2007, История говорящих по клику популяций Африки, полученная на основе генетической изменчивости мтДНК и Y-хромосомы. Молекулярная биология и эволюция 2007 24 (10): 2180-2195.
  9. ^ Lluis Quintana-Murci et al. Разнообразие мтДНК в Центральной Африке: от собирательства охотников до земледелия. CNRS-Institut Pasteur, Париж
  10. ^ Batini, Chiara et al 2006, Филогеография митохондриальной гаплогруппы L1c человека: Генетические подписи доисторического периода Центральной Африки
  11. ^ Роза, Александра; и другие. (2004). «Профиль мтДНК гвинейцев Западной Африки: к лучшему пониманию региона Сенегамбия» (PDF) . Анналы генетики человека . 68 (4): 340–52. DOI : 10.1046 / j.1529-8817.2004.00100.x . PMID 15225159 . S2CID 15391342 . Дата обращения 5 июня 2017 .   

Заметки [ править ]

Внешние ссылки [ править ]

  • PhyloTree.org - поддерево мтДНК L , ван Овен и Кайзер М. 2009.
  • Распространение гаплогруппы L1 от National Geographic
  • Последовательности мтДНК африканской гаплогруппы L демонстрируют нарушения часовой эволюции
  • Гаплогруппа Яна Логана L1b.
  • Гаплогруппа L1c Яна Логана .
  • L1 YFull MTree 1.02.00 (в разработке)