Гаплогруппа L4 (мтДНК)

Гаплогруппа L4
Возможное время происхождения	90–80 тыс. Лет назад
Возможное место происхождения	Западная Африка
Предок	L3'4
Потомки	L4а , L4б
Определение мутаций	5460, 16362 ^[1]

Гаплогруппа L4 представляет собой гаплогруппу митохондриальной ДНК (мтДНК) человека. Это небольшая материнская клада, в основном ограниченная Африкой. ^[2]

Прогнозируемое пространственное частотное распределение для гаплогруппы L4.

Схематическое дерево гаплогруппы L4 мтДНК. Указанный возраст (в тыс . лет ) представляет собой оценки максимального правдоподобия, полученные для генома цельной мтДНК.

L4 играет важную роль в Восточной Африке и на Африканском Роге . Самые высокие частоты в Танзании среди хадза (60–83%) и сандаве ( 48 %). ^[3]

Он имеет две ветви, L4a и L4b. Подгруппа L4a ранее называлась L7 и считалась отдельным субкладом L3'4'7 . Он был признан субкладом L4, а L3 - внешней группой Behar et al. (2008). ^[4] Родительская клада L3'4 должна была появиться в 106–66 тыс. Лет назад. ^[5] L4 ненамного позже, по оценке Fernandes et al., 87 тыс. лет назад. (2015). ^[6]

филогения

Следующая филогения основана на van Oven and Kayser (2008). ^[1]

L3'4
- L4
  - L4a (ранее известный как L7), мутации: 195C, 3357, 5460, 10373, 11253, 11344, 11485, 12414, 13174, 14302, 16260.
    - L4a1
      - L4a1a
    - L4a2
  - L4b, мутации: 709, 3918.
    - L4b1
    - L4b2 (ранее известный как L3g или L4g)
      - L4b2a
        L4b2a1
        L4b2a2
        L4b2a2a
        L4b2a2b
      - L4b2b

использованная литература

^ ^б ван Овен, Маннис ^;Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное всеобъемлющее филогенетическое древо глобальной вариации митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
^ Гаплогруппы L4.
^ Тишкофф, С. и др. 2007, История кликоязычных популяций Африки, полученная на основе генетической изменчивости мтДНК и Y-хромосомы. Молекулярная биология и эволюция 2007 24(10):2180-2195
^ Бехар, М .; Виллемс, Р.; Судьялл, Х .; Блю-Смит, Дж.; Перейра, Л.; Метспалу, Э.; Скоццари, Р.; Маккан, Х .; Цур, С .; Комас, Д.; Бертранпетит, Дж.; Кинтана-Мурси, Л.; Тайлер-Смит, К.; Уэллс, Р.С.; Россет, С .; Генографик, К. (май 2008 г.). «Рассвет человеческого матрилинейного разнообразия» . Американский журнал генетики человека . 82 (5): 1130–1140. doi : 10.1016/j.ajhg.2008.04.002 . ISSN 0002-9297 . ПМК 2427203 . PMID 18439549 .
^ «Корректировка очищающего отбора: дополнительный материал к усовершенствованным митохондриальным молекулярным часам человека (стр. 83)» (PDF) . 2009: 89. Архивировано из оригинала (PDF) 29 декабря 2009 г. Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
^ Фернандес В., Триска П., Перейра Дж. Б., Алшамали Ф., Рито Т., Мачадо А. и др. (2015) Генетическая стратиграфия ключевых демографических событий в Аравии. PLoS ONE 10(3): e0118625. doi : 10.1371/journal.pone.0118625

внешняя ссылка

Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой L4 (мтДНК) .

Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
Филодерево Манниса ван Овена

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК (мтДНК) человека

Митохондриальная Ева ( L )

L0

Л1–6

L1

L2

L3

L4

L5

L6

М

Н

Чехия

Д

Е

г

Вопрос

О

А

С

р

я

Вт

Икс

Д

С

Z

Б

Ф

R0

до JT

п

U

ВН

Джей Ти

К

ЧАС

В

Дж

Т

Эта статья о генетике является незавершенной . Вы можете помочь Википедии, дополнив ее .

[vanOven-1] б ван Овен, Маннис ^;Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное всеобъемлющее филогенетическое древо глобальной вариации митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .

[2] Гаплогруппы L4.

[3] Тишкофф, С. и др. 2007, История кликоязычных популяций Африки, полученная на основе генетической изменчивости мтДНК и Y-хромосомы. Молекулярная биология и эволюция 2007 24(10):2180-2195

[Behar2008-4] Бехар, М .; Виллемс, Р.; Судьялл, Х .; Блю-Смит, Дж.; Перейра, Л.; Метспалу, Э.; Скоццари, Р.; Маккан, Х .; Цур, С .; Комас, Д.; Бертранпетит, Дж.; Кинтана-Мурси, Л.; Тайлер-Смит, К.; Уэллс, Р.С.; Россет, С .; Генографик, К. (май 2008 г.). «Рассвет человеческого матрилинейного разнообразия» . Американский журнал генетики человека . 82 (5): 1130–1140. doi : 10.1016/j.ajhg.2008.04.002 . ISSN 0002-9297 . ПМК 2427203 . PMID 18439549 .

[soares_supplementary-5] «Корректировка очищающего отбора: дополнительный материал к усовершенствованным митохондриальным молекулярным часам человека (стр. 83)» (PDF) . 2009: 89. Архивировано из оригинала (PDF) 29 декабря 2009 г. Цитировать журнал требует |journal=( помощь )

[6] Фернандес В., Триска П., Перейра Дж. Б., Алшамали Ф., Рито Т., Мачадо А. и др. (2015) Генетическая стратиграфия ключевых демографических событий в Аравии. PLoS ONE 10(3): e0118625. doi : 10.1371/journal.pone.0118625

[1]