Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа R0
Возможное время происхожденияОт 23 600 до 54 900 YBP [1]
Возможное место происхожденияСредний Восток
Предокр
ПотомкиR0a, HV
Определение мутаций73, 11719 [2]

Гаплогруппа R0 (ранее известная как гаплогруппа пре-HV [3] ) представляет собой гаплогруппу митохондриальной ДНК человека (мтДНК).

Происхождение [ править ]

Гаплогруппа R 0 происходит от макро-гаплогруппы R . Это наследственные клады к субкладу и R0a гаплогруппы HV , и, следовательно , предшествует гаплогруппу H и V .

Большое разнообразие субкладов R0 на Аравийском полуострове предполагает, что клады возникли и распространились оттуда.

Считается, что R0a образовался в оазисах ледникового периода в Южной Аравии около 22000 лет назад. Затем субклад распространился бы оттуда с наступлением позднего ледникового периода примерно на 15 000 лн. [4]

Распространение [ править ]

Гаплогруппа R0 была обнаружена примерно в 55% остеологических останков, принадлежащих культуре трипольцев эпохи энеолита . [5]

R0 кладов также была обнаружено среди иберо-мавританской культуры образцов на Taforalt и Afalou доисторических сайтах, которые датируются эпипалеолит . Среди тафоральтов около 17% наблюдаемых гаплотипов принадлежали к различным субкладам R0, включая R0a1a (3/24; 13%) и R0a2c (1/24; 4%). Среди особей Афалу был обнаружен один гаплотип R0a1a (1/9; 11%). [6]

R0 имеет также наблюдается среди древних египетских мумий , выкопанных на Абусире эль-Meleq археологических раскопок в Среднем Египте, датируемые предварительного производства Птолемеев / позднего Нового царства , Птолемеев и римских периодов. [7]

Было обнаружено, что католическая церковь 3-го века нашей эры , Фортунато из Серракаприолы , также несет субклад R0a'b. [ необходима цитата ]

В настоящее время R0 обычно встречается на Аравийском полуострове, а его самая высокая частота наблюдается в районе Сокотри (40,7%). [8] Сокотри также имеют наибольшее разнообразие субкладов R0. [9] Клада также часто встречается у калашей в Южной Азии (23%). [10] Кроме того, умеренные частоты R0 встречаются в Северо-Восточной Африке , Анатолии , Иранском нагорье и Далмации . Гаплогруппа наблюдалась среди арабов Чада (19%), [11] суданских коптов (13,8%), [12] тигрей.(13,6%), [8] сомалийцы (13,3%), [8] оромосы (13,3%), [8] афар (12,5%), [8] амхара (11,5%), [8] гураге (10%), [8] Reguibate сахрави (9,26%, 0,93% R0a и 8,33% R0a1a), [13] Gaalien (9%), [12] Бежа (8,3%), [12] нубийцы (8%), [8] Arakien ( 5,9%), [12] йеменцы (5,1–27,7%), [8] иракцы (4,8%), [8] друзы (4,3%), [8] палестинцы(4%), [8] алжирцы (1,67%), [13] и саудиты (0–25%). [8]

Субклады [ править ]

Дерево [ править ]

Филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы R0
Прогнозируемое пространственно-частотное распределение гаплогруппы R0a. Наиболее часто встречается на Аравийском полуострове с пиком на близлежащей Сокотре (~ 40%; см. Наблюдаемые частоты выше)

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы R0 основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека [2] и последующие опубликованные исследования.

  • р
    • R0 (или до HV )
      • R0a (или (до ВН) 1 )
        • R0a1 или (до HV) 1a
          • R0a1a
        • 60,1 т
          • R0a2 или (до HV) 1b
            • R0a2a
            • R0a2b
            • R0a2c
            • R0a2d
            • R0a2e
        • HV
          • HV0
          • HV1
          • 73
          • HV4
          • HV5
          • ЧАС

См. Также [ править ]

  • Генеалогический ДНК-тест
  • Генетическая генеалогия
  • Митохондриальная генетика человека
  • Популяционная генетика

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева ( L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ

Ссылки [ править ]

  1. ^ Соарес, P; Эрмини, L; Томсон, Н. Мормина, М; Рито, Т; Рель, А; Салас, А; Оппенгеймер, S; и другие. (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2009.05.001 . PMC  2694979 . PMID  19500773 .
  2. ^ а б ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386 – E394. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 . Архивировано из оригинала 4 декабря 2012 года . Проверено 20 мая 2009 .  
  3. ^ Подклады гаплогруппы H , генеалогическое древо ДНК
  4. ^ Франческа Гандини; Алессандро Ахилли; Мария Пала; Мартин Боднер; Стефания Брандини; Габриэла Хубер; Балаш египетский; Лука Ферретти; Альберто Гомес-Карбалла; Антонио Салас; Розария Скоццари; Фульвио Кручиани; Альфредо Коппа; Вальтер Парсон; Орнелла Семино; Педро Соарес; Антонио Торрони; Мартин Б. Ричардс; Анна Оливьери (5 мая 2016 г.). «Картирование расселения людей в Африканском Роге из рефугиумов Аравийского ледникового периода с использованием митогеномов» . Научные отчеты . 6 : 25472. Bibcode : 2016NatSR ... 625472G . DOI : 10.1038 / srep25472 . PMC 4857117 . PMID 27146119 .  
  5. ^ Никитин, Алексей Г .; Сохацкий, Михаил П .; Ковалюх, Николай М .; Видеейко, Михаил Юрьевич (14 апреля 2011 г.). "Комплексная хронология памятника и анализ древней митохондриальной ДНК из пещеры Вертеба - памятника трипольской культуры в эпоху энеолита Украины" (PDF) . Interdisciplinaria Archaeologica - Естественные науки в археологии . Археологический центр Оломоуц, финансируемая государством организация (1-2): 9-18. DOI : 10,24916 / iansa.2011.1.1 . Проверено 14 мая 2013 года .
  6. ^ Кефи, Рим; и другие. (2018). «О происхождении иберомавров: новые данные, основанные на древней митохондриальной ДНК и филогенетическом анализе популяций афалу и тафоральта». Митохондриальная ДНК Часть А . 29 (1): 147–157. DOI : 10.1080 / 24701394.2016.1258406 . PMID 28034339 . S2CID 4490910 .  
  7. ^ Schuenemann, Верена J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды» . Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode : 2017NatCo ... 815694S . DOI : 10.1038 / ncomms15694 . PMC 5459999 . PMID 28556824 .  
  8. ^ Б с д е е г ч я J к л м Номера, Эй. «АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДАННЫХ В МЕЖДИСЦИПЛИНАРНОЙ ОСНОВЕ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ПОСЛЕДНИЙ ЭВОЛЮЦИОННОЙ ИСТОРИИ ЧЕЛОВЕКА И КОМПЛЕКСНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ» (PDF) . Университет Флориды . Проверено 11 апреля +2016 .
  9. ^ Черны, Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, выявленное генетическим разнообразием митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. DOI : 10.1002 / ajpa.20960 . PMID 19012329 . Архивировано из оригинального (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 12 июня +2016 .  
  10. ^ Quintana-Murci L, et al. (2004). «Где запад встречается с востоком: сложный ландшафт мтДНК на юго-западе и в коридоре Центральной Азии» (PDF) . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 827–45. DOI : 10.1086 / 383236 . PMC 1181978 . PMID 15077202 . Архивировано из оригинального (PDF) 23 ноября 2009 года . Проверено 23 августа 2009 .   
  11. ^ Сересо, Мария; и другие. (2011). «Новое понимание структуры населения бассейна озера Чад, выявленное с помощью высокопроизводительного генотипирования митохондриальной ДНК, кодирующей SNP» . PLOS ONE . 6 (4): e18682. Bibcode : 2011PLoSO ... 618682C . CiteSeerX 10.1.1.291.8871 . DOI : 10.1371 / journal.pone.0018682 . PMC 3080428 . PMID 21533064 .   
  12. ^ a b c d Мохамед, Хишам Юсиф Хасан. "Генетические паттерны Y-хромосомы и вариации митохондриальной ДНК, с последствиями для населения Судана" (PDF) . Хартумский университет . Проверено 16 апреля 2016 года .
  13. ^ a b Асмахан Бекада; Лара Р. Арауна; Тахрия Деба; Франческ Калафель; Сорайя Бенхамамуш; Дэвид Комас (24 сентября 2015 г.). «Генетическая неоднородность в алжирских популяциях человека» . PLOS ONE . 10 (9): e0138453. Bibcode : 2015PLoSO..1038453B . DOI : 10.1371 / journal.pone.0138453 . PMC 4581715 . PMID 26402429 .  ; Стол S5

Внешние ссылки [ править ]

  • Общий
    • Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
    • Филодерево Манниса ван Овена
  • Гаплогруппа R0
  • Распространение гаплогруппы pre-HV от National Geographic