Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Для гаплогруппы Y-хромосомы см. Гаплогруппа R (Y-ДНК) .
Гаплогруппа R
Гаплогруппа R (мтДНК) и субклады.PNG
Возможное время происхождения66,8 ± 14,2 тыс. Лет назад [1]
Возможное место происхожденияЮжная Азия [2] [3] Юго-Восточная Азия [4]
ПредокN
ПотомкиR0 , R1, R1b , R2'JT , R3, R5, R6'7, R8, R9, R11 ' B , R12'21, R14, R22, R23, R30, R31, P , U
Определение мутаций12705, 16223 [5]

Гаплогруппа R - широко распространенная гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК). Гаплогруппа R связана с заселением Евразии примерно 70 000 лет назад и распространена среди современного населения по всему миру за пределами Африки к югу от Сахары . [6]

Гаплогруппа R является потомком макро- гаплогруппы N . Среди потомков гаплогрупп R clade есть B , U (и, следовательно, K ), F , R0 (и, следовательно, HV , H и V ) и JT (наследственная гаплогруппа J и T ).

Происхождение [ править ]

Соарес и др. (2009) оценивают возраст гаплогруппы R до66,8 ± 14,2 тыс. Лет назад ( 95% ДИ ), [1] то есть примерно между 80 000 и 50 000 лет назад, с наиболее вероятным возрастом около 65 000 лет.

Это согласуется с появлением в ходе прибрежной миграции из Восточной Африки в Западную, Южную и Юго-Восточную Азию. [3] Было высказано предположение, что ранняя линия гаплогрупп M, N и R вдоль прибрежного маршрута в период примерно от 70 000 до 60 000 лет назад. [7]

Гаплогруппа R имеет большое разнообразие и древность у коренного населения Южной Азии. Племена и касты Западной и Южной Индии демонстрируют большее разнообразие, чем другие регионы, что, возможно, свидетельствует об их автохтонном статусе. [2] Ларруга и др. (2017) обнаружили, что мтДНК R распространилась в Евразию и Австралию из основного района вдоль побережья Юго-Восточной Азии. [6] усть-Ишим люди ископаемое Сибири, датированные ки 45000 лет, принадлежит к гаплогруппе R * (ранее классифицировалась как U *). [8] [9]

Распространение [ править ]

Гаплогруппа R и ее потомки распространены по всей Австралии , Северной и Южной Америке , Юго-Восточной Азии , Южной Азии , Центральной Азии , Западной Азии , Восточной Азии , Европе , Северной Африке и Африканскому Рогу .

Базальная кладка R * встречается среди Сокотри (1,2%), а также в Северо-Восточной Африке (1,5%), на Ближнем Востоке (0,8%), на Ближнем Востоке (0,8%) и на Аравийском полуострове (0,3%). . [10]

Гаплогруппа R также наблюдалась среди древнеегипетских мумий, раскопанных на археологическом участке Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются периодом доптолемеев / позднего Нового царства , птолемеев и римлян . [11]

Субклад R2 был обнаружен в останках человека эпохи неолита из западного Ирана в Тепе Абдул Хосейн. [12]

Субклады [ править ]

  • Гаплогруппа R
    • R0 или pre-HV
      • R0a или (preHV) 1: обычно встречается на Аравийском полуострове, с наибольшей частотой среди сокотрийцев. [13] Умеренные частоты встречаются в Северной Африке , на Африканском Роге и в Центральной Азии .
      • HV: Это западноевразийская гаплогруппа, которая в основном встречается на Ближнем Востоке , включая Иран . [14] Он также встречается в Северной Африке , Центральной Азии и Южной Азии .
          • V : Встречается на умеренно низких частотах по всей Европе; самая высокая частота у саамов - 40%. [15]
        • HV1: В основном на Ближнем Востоке . [16]
        • HV2: В основном в Южной Азии . [14]
        • HV3: В основном в Восточной Европе . [17]
        • H: В Западной Евразии . Это самая распространенная гаплогруппа мтДНК в Европе .
    • R1
        • R1a * (3337): Найдено у браминов из Уттар-Прадеша (Индия). [7]
        • R1a1: Встречается у народов Северо-Запада Кавказа, таких как кабардинцы и адыги . Наблюдается у жителей Восточной Европы, таких как русские и поляки северо-запада . [17]
        • R1b: Наблюдается у восточного охотника-собирателя из Карелии, Россия, датируется 5500 годом до нашей эры. [18]
          • R1b1: наблюдается в Болгарии, Армении (включая древний образец) и Индии.
            • R1b1a: наблюдается у уйгуров.
            • R1b1b: наблюдается в Финляндии (включая финских шведов )
          • R1b2
            • R1b2a: наблюдается у якутов
            • R1b2b: наблюдается у уйгуров
    • pre-JT или R2'JT
      • R2 : Встречается в основном в Белуджистане (Пакистан) . [14]
        • (13500): Найдено в Раджастане и Уттар-Прадеше (Индия). [3]
        • (150, 303 + 1C): В Иране , Грузии и Турции .
      • JT
        • Дж .: Самая высокая частота на Ближнем Востоке (12%), 21% в Саудовской Аравии . [16] J снижается в сторону Европы на 11%, Кавказа на 8%, Северной Африки на 6% и практически отсутствует в Восточной Азии. [19]
        • Т .: Самая высокая частота в Каспийском регионе ( Кавказ , Северный Иран , Туркменистан ). [14] Это важно в Европе (почти 10%), [20] на Ближнем Востоке , в Центральной Азии , Пакистане и Северной Африке . Небольшая частота в районе Африканского Рога и Индии .
    • R3 : Найден в Армении. [21] Также наблюдается у древнего человека из Венгрии , датируемого 7000 лет назад [22]
    • R5 : Широко распространен на Индийском субконтиненте . Особенно в Мадхья-Прадеше ( Индия ) - 17%. [23]
      • R5a
        • R5a1: Встречается в индоевропейском населении Индии . [24]
        • R5a2: Особенно среди дравидских групп Индии и Шри-Ланки . [24]
    • R6'7 (16362) Наибольшее присутствие наблюдается среди говорящих на австроазиатском языке из Индии (10%). [24]
      • R6 : Небольшие частоты в Индии и Пакистане, заметно проявляющиеся как в тамильском, так и в кашмирском населении с. [23]
      • R7 : На Индийском субконтиненте . [24] [25]
        • R7a: В основном в Восточной Индии , особенно в Санталах из Бихара и Джаркханда . [25]
        • R7b: Специально в дравидских племен в Восточной Индии . [25]
    • R8 : Самая высокая частота происходит в направлении восточной Индии , особенно в штате Орисса (12%), и встречаются среди австроазиатских племен ( мунда и Khasi динамики). Он также присутствует в низкой частоте среди спикеров дравидский, индоевропейская и тибето-бирманской ( например Nyishi , Changpa , шерпа ). [26]
      • R8a: Встречается в основном в Ориссе и Андхра-Прадеше (Индия).
      • R8b: В Ориссе , Гуджарате , Андхра-Прадеше (Индия).
    • R9 (16304)
      • R9b: В основном встречается в Юго-Восточной Азии . [27] Встречается по всей Индонезии , в Индокитае , Малайзия , у аборигенов Малайзии, таких как Семелаи - 28% и Темуан - 21%. [28]
      • (249d)
        • R9c: По всему Малайскому архипелагу и Тайваню . Главным образом в Батака ( Палаван ) на 58%, [29] Tsou из Тайваня (22,9%), [30] и Алор (Индонезия) на 11%. [31]
        • F: Довольно часто встречается в Восточной и Юго-Восточной Азии . Более высокие частоты встречаются в некоторых регионах, таких как Никобар - 50% и Аруначал-Прадеш - 31% ( Индия ) [23] и шорцы из Сибири - 44%. [32] Также значительная частота встречается у аборигенов Тайваня , Гуандуна (Китай), Малуку (Индонезия), Таиланда и Вьетнама .
    • R11'B (16189)
      • R11 : Встречается в Китае , в основном у жителей Лаху из Юньнани ( 12,5%). [33] Кроме того, в Японии , Корее , [34] Шамс , [35] и Раджастан (Индия).
      • B
        • B4: Часто встречается в Восточной Азии , Юго-Восточной Азии , Полинезии , Меланезии , Микронезии , Мадагаскаре и коренных народах Северной и Южной Америки .
        • B5: Распространен в Восточной и Юго-Восточной Азии .
      • R24 : Найден на Филиппинах . [36]
    • R12'21
      • R12 : Найден в Австралии . [37]
      • R21 : В коренных народов Малайзии , как Jahai негритосов на 63% [28] и сенои 37%, а также в Maniq в южном Таиланде и в некоторых других тайских и малайзийских лиц. [38]
    • R14 : Найдено в Папуа - Новой Гвинее [39] и в австронезийскими спикеров Восточного Тимора и Lembata . [40]
    • R22 или R12: Очень часто в Shompen (10/29 = 34,5%). [41] В другом месте в основном в юго-центральной Индонезии (11,4% Матары , 8,0% Уэйнгап , 7,3% Бали , 1,9% Борнео ) и в Ч из Бинь Туан , Вьетнам (7/168 = 4,2%), [42] с одноточечным или единичные случаи в Таиланде , Суматре , Яве , Сулавеси и Алоре . [31]
    • R23 : Небольшая кладовая, найденная на Бали и Сумба (Индонезия). [31]
    • R30
      • R30a: Найдено в Андхра-Прадеше , Уттар-Прадеш (Индия), у народа тару из Непала [43] и у сингальцев из Шри-Ланки . [24]
      • R30b: Найдено в Пенджабе . [24]
      • R30 * (1598, 16189): Найден в Пенджабе , Непале и Японии . [43]
    • R31
      • R31a: У браминов из Уттар-Прадеша [7] и раджпутов из Раджастана (Индия). [24]
      • R31b: В Реддисе из Андхра-Прадеша (Индия). [7]
    • R32

Найдено на Маврикии

    • П: Это характерно для Сахула . Встречается на Филиппинах и в Восточной Индонезии .
      • (16176)
        • P1: Широко распространен в Меланезии . Более высокие частоты встречаются в Папуа-Новой Гвинее . [44] Также встречается в Малуку , Нуса-Тенггаре и Полинезии . [45]
        • P2'10
          • P2: В Меланезия , [44] специально в Новой Гвинее и Новой Каледонии .
          • P10: Найдено на Филиппинах . [36]
        • P9 (или AuE): у аборигенов Австралии из центрального региона. [46]
      • P3: В Австралии и Меланезии . [44]
      • P4: В Австралии и Меланезии . [47]
    • U
      • U1: В основном появляется на Ближнем Востоке и Кавказе . Встречается от Индии до Средиземноморья и остальной Европы. [48]
      • U5: Примерно 11% европейцев и 10% американцев европейского происхождения. Самая высокая частота у саамов . [15]
      • U6: Это обычное явление в Северной Африке и на Африканском Роге , особенно в Магрибе . [49] Наибольшая частота субклада встречается среди алжирских берберов (29%) [50] и египетских коптов (27,6%). [51] U6 также был найден среди образцов иберомавров, относящихся к эпохе эпипалеолита, на доисторической стоянке Тафоральт . [52]
      • U2'3'4'7'8'9 (1811 г.): Широко распространен в Западной Евразии и на Индийском субконтиненте .
        • U8
          • K

Дерево [ править ]

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы R основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека [5] и последующих опубликованных исследований.

  • р
    • R0 (ранее pre-HV)
      • R0a
        • R0a1
        • R0a2
      • HV
        • HV0 (ранее Pre-V)
          • HV0a
            • V
        • ЧАС
    • R1
      • R1a
        • R1a1
          • R1a1a
    • R2'JT
      • R2
      • JT
        • J
        • Т
    • R5
      • R5a
        • R5a1
          • R5a1a
        • R5a2
          • R5a2a
          • R5a2b
            • R5a2b1
            • R5a2b2
            • R5a2b3
            • R5a2b4
    • R6'7
      • R6
        • R6a
          • R6a1
            • R6a1a
      • R7
        • R7a
          • R7a1
            • R7a1a
            • R7a1b
              • R7a1b1
              • R7a1b2
        • R7b
          • R7b1
            • R7b1a
    • R8 - Индия
      • R8a - Шри-Ланка
        • R8a1
          • R8a1a
            • R8a1a1
            • R8a1a2
            • R8a1a3 - Южная Африка, Норвегия
          • R8a1b
        • R8a2
      • R8b
        • R8b1
        • R8b2
    • (16304)
      • R9
        • R9b - Камбоджа, Таиланд ( Лао Isan в Убоне Ратчатханите провинции и Roi Et провинции ), [53] Гвинея
          • R9b1 - Китай, Уйгур, Таиланд ( понедельник в Центральном Таиланде , тайский в Западном Таиланде ), Лаос ( Лаос во Вьентьяне [53] ), Вьетнам ( La Hủ ), Дания.
            • R9b1a
              • R9b1a1 - Филиппины ( Маманва )
                • R9b1a1a - Китай, Таиланд ( Карен и Тай Луэ в Северном Таиланде , Лао Исан в провинции Рой Эт , [53] Тайский язык в Центральном Таиланде и Восточном Таиланде ), Камбоджа ( Бантей Минчей ), Малайзия ( Семелай , коренные малайцы ), Сингапур, Индонезия ( Тенгер , Палембанг , Паданг , Манадо ), Вьетнам ( Джарай )
              • R9b1a2 - Тайвань ( Цоу ), Таиланд ( лао-исан в провинции Лоэй , тайский в западном Таиланде )
                • R9b1a2a - Китай (хань из Тайаня и др. ), Вьетнам ( Тай и др. ), Россия ( Тубалар )
                • R9b1a2b - Китай, Тайвань (Миннан, Хакка), Вьетнам ( Тай ), Таиланд ( Кхон Муанг из провинции Чианграй , Тай Кхуэн из Северного Таиланда)
              • R9b1a3 - Таиланд, Китай ( Han , Dai ), Вьетнам ( Dao , Nùng и др. ), Казахстан
            • R9b1b - Китай, Вьетнам, Камбоджа ( Сием Рип ), Таиланд ( Кхон Муанг из провинции Чиангмай , Тай Юань из Центрального Таиланда , Пн из Северного Таиланда )
          • R9b2 - Таиланд, Камбоджа, Вьетнам
        • R9c - Китай (Баргут из Хулун Буир ), Тайвань
          • R9c1
            • R9c1a - Филиппины, Индонезия, Тайвань ( Макатао ), Таиланд ( Кхон Муанг из провинции Чианграй )
              • R9c1a1 - Тайвань ( Makatao , Rukai , Puyuma , и т.д. ), Гуам
              • R9c1a2 - Тайвань ( Цоу , Бунун )
              • R9c1a3 - Филиппины ( батаки из Палавана )
            • R9c1b
              • R9c1b1 - Китай ( Хан ), Вьетнам ( Кинь , Дао ), Таиланд ( Тай Дам в провинции Канчанабури , Кхон Муанг в провинции Мэхонгсон , Тай Юань в Северном Таиланде , Тай Лю в Северном Таиланде ), Мьянма
              • R9c1b2 - Таиланд ( Кхон Муанг в провинции Чианграй ), Тайвань ( Макатао и др. ), Филиппины ( Ифугао , Бугкалот ), Восточный Тимор
        • F
        • R22
    • R11'B (16189)
      • R11
        • R11a
      • B
      • R24
    • R12'21
      • R12
      • R21
    • R22
    • R14
    • R23
    • R30
      • R30a
      • R30b
        • R30b1
    • R31
      • R31a
        • R31a1
      • R31b
    • R32
    • п
    • U

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Соарес, Педро; Эрмини, Лука; Томсон, Ноэль; Мормина, Мару; Рито, Тереза; Рёль, Арне; Салас, Антонио; Оппенгеймер, Стивен; Маколей, Винсент (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2009.05.001 . PMC  2694979 . PMID  19500773 .
  2. ^ а б Маджи, Сувенду; Krithika, S .; Васул, Т.С. (2008). «Распространение митохондриальной ДНК макрогаплогруппы N в Индии со специальной ссылкой на гаплогруппу R и ее субгаплогруппу U» (PDF) . Международный журнал генетики человека . 8 (1–2): 85–96. DOI : 10.1080 / 09723757.2008.11886022 . S2CID 14231815 .  
  3. ^ a b c Кармин, Моника (2005). Гаплогруппа R митохондриальной ДНК человека в Индии: расчленение филогенетического древа южноазиатских специфических линий (диплом магистра). Тартуский университет. ЛВП : 10062/567 . OCLC 692161090 . [ требуется страница ]
  4. ^ Larruga, Jose M (23 мая 2017). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из центральной области Юго-Восточной Азии» . BMC Evolutionary Biology . 17 (1): 115. DOI : 10,1186 / s12862-017-0964-5 . PMC 5442693 . PMID 28535779 .  
  5. ^ а б Ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2009). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386–94. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .  
  6. ^ a b Ларруга, Хосе М. (23 мая 2017 г.). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из центральной области Юго-Восточной Азии» . BMC Evolutionary Biology . 17 (1): 115. DOI : 10,1186 / s12862-017-0964-5 . PMC 5442693 . PMID 28535779 .  
  7. ^ a b c d Паланиками, Маллия Гундер; Сун, Чанг; Агравал, Суракша; Бандельт, Ханс-Юрген; Конг, Цин-Пэн; Хан, Фейсал; Ван, Чэн-Е; Чаудхури, Тапас Кумар; Палла, Венкатрамана (2004). «Филогения макрогаплогруппы N митохондриальной ДНК в Индии, на основе полного секвенирования: последствия для населения Южной Азии» . Американский журнал генетики человека . 75 (6): 966–78. DOI : 10.1086 / 425871 . PMC 1182158 . PMID 15467980 .  
  8. ^ Марреро, Патрисия; Абу-Амеро, Халед К.; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М (2016). «Носители митохондриальной ДНК человека макрогаплогруппы М колонизировали Индию из Юго-Восточной Азии» . BMC Evolutionary Biology . 16 (1): 246. DOI : 10,1186 / s12862-016-0816-8 . PMC 5105315 . PMID 27832758 .  
  9. ^ Ларруга, Хосе М; Марреро, Патрисия; Абу-Амеро, Халед К.; Голубенко Мария В; Кабрера, Висенте М (2017). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из центральной области Юго-Восточной Азии» . BMC Evolutionary Biology . 17 (1): 115. DOI : 10,1186 / s12862-017-0964-5 . PMC 5442693 . PMID 28535779 .  
  10. ^ Черны, Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, выявленное генетическим разнообразием митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. DOI : 10.1002 / ajpa.20960 . PMID 19012329 . Архивировано из оригинального (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 13 июня +2016 .  
  11. ^ Schuenemann, Верена J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков южнее Сахары в постримские периоды» . Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode : 2017NatCo ... 815694S . DOI : 10.1038 / ncomms15694 . PMC 5459999 . PMID 28556824 .  
  12. ^ Брушаки, Фарназ; Thomas, Mark G .; Линк, Вивиан; Лопес, Сайоа; ван Дорп, Люси; Кирсанов, Карола; Хофманова, Зузана; Дикманн, Йоан; Кэссиди, Лара М .; Диес-дель-Молино, Дэвид; Кусатанас, Афанасий; Продам, Кристиан; Робсон, Гарри К .; Мартиниано, Руи; Блёхер, Йенс; Шой, Амели; Крейцер, Сюзанна; Боллонгино, Рут; Бобо, декан; Давуди, Хоссейн; Муньос, Оливия; Куррат, Матиас; Абди, Камьяр; Биглари, Ферейдун; Крейг, Оливер Э .; Брэдли, Дэниел Дж .; Шеннан, Стивен; Veeramah, Krishna R .; Машкур, Марджан; Вегманн, Даниэль; Хелленталь, Гарретт; Бургер, Иоахим (29 июля 2016 г.). «Ранние неолитические геномы Восточного Плодородного Полумесяца» (PDF) . Наука . 353 (6298): 499–503. Bibcode : 2016Научный ... 353..499Б . DOI : 10.1126 / science.aaf7943 . PMC  5113750 . PMID  27417496 . Дата обращения 17 ноября 2019 .
  13. ^ Нет, Эми. «АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДАННЫХ В МЕЖДИСЦИПЛИНАРНОЙ ОСНОВЕ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ПОСЛЕДНИЙ ЭВОЛЮЦИОННОЙ ИСТОРИИ ЧЕЛОВЕКА И КОМПЛЕКСНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ» (PDF) . Университет Флориды . Проверено 22 апреля 2016 года .
  14. ^ a b c d Кинтана-Мурси, Луис; Ша, Рафаэль; Уэллс, Р. Спенсер; Бехар, Дорон М .; Саяр, Хамид; Скоццари, Розария; Ренго, Кьяра; Аль-Захери, Надия; Семино, Орнелла (2004). «Где запад встречается с востоком: сложный ландшафт мтДНК на юго-западе и в коридоре Центральной Азии» . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 827–45. DOI : 10.1086 / 383236 . PMC 1181978 . PMID 15077202 .  
  15. ^ а б Хельгасон, Агнар; Хики, Эйлин; Гудакр, Сара; Боснес, Видар; Стефанссон, Кари; Уорд, Рык; Сайкс, Брайан (2001). «МтДНК и острова Северной Атлантики: оценка пропорций норвежского и гэльского происхождения» . Американский журнал генетики человека . 68 (3): 723–37. DOI : 10.1086 / 318785 . PMC 1274484 . PMID 11179019 .  
  16. ^ а б Абу-Амеро, Халед К.; Ларруга, Хосе М.; Кабрера, Висенте М; Гонсалес, Ана М (2008). «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове» . BMC Evolutionary Biology . 8 : 45. DOI : 10.1186 / 1471-2148-8-45 . PMC 2268671 . PMID 18269758 .  
  17. ^ а б Малярчук, Б .; Grzybowski, T .; Деренко, М .; Перкова, М .; Vanecek, T .; Lazur, J .; Гомолчак, П .; Цыбовский, И. (2008). «Филогения митохондриальной ДНК у восточных и западных славян» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (8): 1651–8. DOI : 10.1093 / molbev / msn114 . PMID 18477584 . 
  18. ^ Миттник, Алисса; Ван, Чуан-Чао; Пфренгл, Саския; Даубарас, Мантас; Зарина, Гунита; Халлгрен, Фредрик; Аллмяэ, Райли; Хартанович Валерий; Моисеев, Вячеслав; Тырв, Мари; Фуртвенглер, Аня (30.01.2018). «Генетическая предыстория региона Балтийского моря» . Nature Communications . 9 (1): 442. Bibcode : 2018NatCo ... 9..442M . DOI : 10.1038 / s41467-018-02825-9 . ISSN 2041-1723 . PMC 5789860 . PMID 29382937 .   
  19. ^ Серк, Пиа (2004). Гаплогруппа J митохондриальной ДНК человека в Европе и на Ближнем Востоке (диплом магистра). Эстония: Тартуский университет. ЛВП : 10062/777 . OCLC 692161303 . [ требуется страница ]
  20. ^ oxfordancestors.com Материнское происхождение, архивировано 15 июля 2017 г. в Wayback Machine.
  21. ^ PhyloTree.org Манниса ван Овена - поддерево мтДНК R Архивировано 13 июня 2009 г. на Wayback Machine
  22. ^ Фу, Qiaomei; Пост, Козимо; Хайдинжак, Матея; Петр, Мартин; Маллик, Свапан; Фернандес, Даниэль; Фуртвенглер, Аня; Хаак, Вольфганг; Мейер, Матиас; Миттник, Алисса; Никель, Биргит (июнь 2016 г.). «Генетическая история Европы ледникового периода» . Природа . 534 (7606): 200–205. Bibcode : 2016Natur.534..200F . DOI : 10.1038 / nature17993 . ЛВП : 10211,3 / 198594 . ISSN 1476-4687 . PMC 4943878 . PMID 27135931 .   
  23. ^ a b c Мецпалу, Майт; Кивисилд, Тоомас; Мецпалу, Эне; Парик, Юри; Худжашов, Георгий; Калдма, Катрин; Серк, Пия; Кармин, Моника; Бехар, Дорон М; Гилберт, М. Томас П.; Эндикотт, Филипп; Мастана, Сарабджит; Папиха, Суриндер С; Скорецкий, Карл; Торрони, Антонио; Виллемс, Ричард (2004). «Большинство существующих границ мтДНК в южной и юго-западной Азии, вероятно, были сформированы во время первоначального заселения Евразии анатомически современными людьми» . BMC Genetics . 5 : 26. DOI : 10.1186 / 1471-2156-5-26 . PMC 516768 . PMID 15339343 .  
  24. ^ a b c d e f g Чауби, Гианешвер; Кармин, Моника; Мецпалу, Эне; Мецпалу, Майт; Сельви-Рани, Дипа; Сингх, Виджай; Парик, Юри; Сольник, Ану; Найду Б. Пратап; Кумар, Аджай; Адарш, Нихарика; Маллик, Чандана; Триведи, Бхаргав; Пракаш, Свами; Редди, Рамеш; Шукла, Парул; Бхагат, Санджана; Верма, Свати; Васник, Самикша; Хан, Имран; Барва, Аншу; Саху, Дипти; Шарма, Арчана; Рашид, Мамун; Чандра, Вишал; Редди, Алла Г; Торрони, Антонио; Фоли, Роберт А; Тангарадж, Кумарасами; Сингх, Лалджи (2008). «Филогеография гаплогруппы R7 мтДНК на Индийском полуострове» . BMC Evolutionary Biology . 8 : 227. doi :10.1186 / 1471-2148-8-227 . PMC  2529308 . PMID  18680585 .
  25. ^ a b c «Рис. 4. Распределение частот клад R7a и R7b на Индийском субконтиненте» .в Чаубее, Гианешвер; Кармин, Моника; Мецпалу, Эне; Мецпалу, Майт; Сельви-Рани, Дипа; Сингх, Виджай; Парик, Юри; Сольник, Ану; Найду Б. Пратап; Кумар, Аджай; Адарш, Нихарика; Маллик, Чандана; Триведи, Бхаргав; Пракаш, Свами; Редди, Рамеш; Шукла, Парул; Бхагат, Санджана; Верма, Свати; Васник, Самикша; Хан, Имран; Барва, Аншу; Саху, Дипти; Шарма, Арчана; Рашид, Мамун; Чандра, Вишал; Редди, Алла Г; Торрони, Антонио; Фоли, Роберт А; Тангарадж, Кумарасами; Сингх, Лалджи (2008). «Филогеография гаплогруппы R7 мтДНК на Индийском полуострове» . BMC Evolutionary Biology . 8 : 227. DOI : 10.1186 / 1471-2148-8-227 . PMC 2529308 . PMID  18680585 .
  26. ^ Рисунок 4 в Thangaraj, Кумарасы; Нандан, Амрита; Шарма, Вишвас; Шарма, Варун Кумар; Eaaswarkhanth, Muthukrishnan; Патра, Прадип Кумар; Сингх, Сандхья; Рекха, саши; Дуа, Моника; и другие. (2009). Ахмед, Нияз (ред.). «Глубокое распространение in-situ мтДНК гаплогруппы R8 в Южной Азии» . PLOS ONE . 4 (8): e6545. Bibcode : 2009PLoSO ... 4.6545T . DOI : 10.1371 / journal.pone.0006545 . PMC 2718812 . PMID 19662095 .  
  27. ^ Ян Логан 2009, Haplogrupo R9b , сайт митохондриальной ДНК
  28. ^ a b Hill, C .; Soares, P .; Мормина, М .; MacAulay, V .; Meehan, W .; Blackburn, J .; Clarke, D .; Раджа, JM; Исмаил, П. (2006). «Филогеография и этногенез аборигенов Юго-Восточной Азии» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (12): 2480–91. DOI : 10.1093 / molbev / msl124 . PMID 16982817 . 
  29. ^ Скоулз, Кларисса; Сиддл, Кэтрин; Дюкурно, Аксель; Кривелларо, Федерика; Ярве, Мари; Рутси, Сиири; Беллатти, Мэгги; Таббада, Кристина; Мормина, Мару (2011). «Генетическое разнообразие и доказательства примеси популяции в Batak Negritos из Палавана». Американский журнал физической антропологии . 146 (1): 62–72. DOI : 10.1002 / ajpa.21544 . PMID 21796613 . 
  30. ↑ Альберт Мин-Шань Ко, Чунг-Ю Чен, Цяомей Фу и др. (2014), «Ранние австронезийцы: на Тайвань и из Тайваня». Американский журнал генетики человека 94, 426–436, 6 марта 2014 г.
  31. ^ a b c Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Кларк, Дуги; Блюмбах, Петя Б .; Визуете-Форстер, Матье; Форстер, Питер; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2007). «Митохондриальная стратиграфия островов Юго-Восточной Азии» . Американский журнал генетики человека . 80 (1): 29–43. DOI : 10.1086 / 510412 . PMC 1876738 . PMID 17160892 .  
  32. ^ Деренко, Мирослава; Малярчук, Борис; Гжибовски, Томаш; Денисова, Галина; Дамбуева Ирина; Перкова, Мария; Доржу, Чодураа; Лузина, Фаина; Ли, Хон Гю (2007). «Филогеографический анализ митохондриальной ДНК в популяциях Северной Азии» . Американский журнал генетики человека . 81 (5): 1025–41. DOI : 10.1086 / 522933 . PMC 2265662 . PMID 17924343 .  
  33. ^ Танака, М .; Кабрера, ВМ; Гонсалес, AM; Ларруга, JM; Takeyasu, T; Fuku, N; Guo, LJ; Hirose, R; Фудзита, Y (2004). «Вариации митохондриального генома в Восточной Азии и население Японии» . Геномные исследования . 14 (10a): 1832–50. DOI : 10.1101 / gr.2286304 . PMC 524407 . PMID 15466285 .  
  34. ^ Хван Ён Ли, Джи-Ын Ю, Мён Джин Парк, Ухи Чунг, Чонг-Юл Ким и Кён-Джин Шин, «Определение гаплогруппы восточноазиатской мтДНК у корейцев: анализ SNP на уровне гаплогруппы и контрольный регион на уровне субгаплогрупп. анализ последовательности ". Электрофорез (2006). DOI 10.1002 / elps.200600151.
  35. ^ Он, JD; Peng, MS; Куанг, HH; Данг, КП; Trieu, AV; и другие. (2012). «Патрилинейная перспектива австронезийской диффузии в континентальной части Юго-Восточной Азии» . PLOS ONE . 7 (5): e36437. Bibcode : 2012PLoSO ... 736437H . DOI : 10.1371 / journal.pone.0036437 . PMC 3346718 . PMID 22586471 .  
  36. ^ а б Таббада, штат Калифорния; Trejaut, J .; Loo, J.-H .; Чен, Ю.-М .; Lin, M .; Mirazon-Lahr, M .; Кивисилд, Т .; Де Унгриа, MCA (2009). "Разнообразие митохондриальной ДНК Филиппин: густонаселенный виадук между Тайванем и Индонезией?" . Молекулярная биология и эволюция . 27 (1): 21–31. DOI : 10.1093 / molbev / msp215 . PMID 19755666 . 
  37. ^ Пирсон, MJ; Мартинес-Ариас, Р. Голландия, Бразилия; Геммелл, штат Нью-Джерси; Hurles, ME; Пенни, Д. (2006). «Расшифровка прошлых перемещений населения в Океании: доказательно оптимальные деревья из 127 геномов мтДНК» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (10): 1966–75. DOI : 10.1093 / molbev / msl063 . PMC 2674580 . PMID 16855009 .  
  38. ^ Кутанан, Вибху; Кампуансай, Джатупол; Чангмай, Пия; и другие. (2018). «Противопоставление материнской и отцовской генетической изменчивости групп охотников-собирателей в Таиланде» . Научные отчеты . 8 : 1536. Bibcode : 2018NatSR ... 8.1536K . DOI : 10.1038 / s41598-018-20020-0 . PMC 5784115 . PMID 29367746 .  
  39. ^ Гаплогруппа R14 , сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
  40. ^ Мона, S .; Grunz, KE; Брауэр, С .; Pakendorf, B .; Castri, L .; Sudoyo, H .; Марзуки, С .; Barnes, RH; Шмидтке, Дж. (2009). «История генетических примесей Восточной Индонезии, выявленная анализом Y-хромосомы и митохондриальной ДНК» . Молекулярная биология и эволюция . 26 (8): 1865–77. DOI : 10.1093 / molbev / msp097 . PMID 19414523 . 
  41. ^ Триведи, Раджни; Sitalaximi, T .; Банерджи, Джилам; и другие. (2006). «Молекулярное понимание происхождения Шомпена, сокращающегося населения Никобарского архипелага» . J Hum Genet . 51 (3): 217–226. DOI : 10.1007 / s10038-005-0349-2 . PMID 16453062 . 
  42. ^ Пэн, Мин-Шэн; Хо Куанг, Хай; Фам Данг, Кхоа; и другие. (2010). «Прослеживание австронезийского следа в материковой части Юго-Восточной Азии: взгляд на митохондриальную ДНК» . Мол. Биол. Evol . 27 (10): 2417–2430. DOI : 10.1093 / molbev / msq131 . PMID 20513740 . 
  43. ^ a b Форнарино, Симона; Пала, Мария; Батталья, Винченца; Маранта, Рамона; Ахилли, Алессандро; Модиано, Гвидо; Торрони, Антонио; Семино, Орнелла; Сантачиара-Бенеречетти, Сильвана А (2009). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие Tharus (Непал): резервуар генетической изменчивости» . BMC Evolutionary Biology . 9 : 154. DOI : 10.1186 / 1471-2148-9-154 . PMC 2720951 . PMID 19573232 .  
  44. ^ a b c Friedlaender, J .; Schurr, T; Gentz, F; Коки, G; Friedlaender, F; Хорват, Г; Бабб, П; Cerchio, S; Kaestle, F (2005). «Расширение митохондриальных гаплогрупп P и Q в юго-западной части Тихого океана» . Молекулярная биология и эволюция . 22 (6): 1506–17. DOI : 10.1093 / molbev / msi142 . PMID 15814828 . 
  45. ^ Кайзер, М .; Брауэр, S; Cordaux, R; Касто, А; Лао, О; Животовский, Л.А.; Мойз-Фори, К; Рутледж, РБ; Schiefenhoevel, W. (2006). «Меланезийское и азиатское происхождение полинезийцев: мтДНК и градиенты Y-хромосомы через Тихий океан» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2234–44. DOI : 10.1093 / molbev / msl093 . PMID 16923821 . 
  46. ^ Хардинг, Розалинд 2006, Анализ генного дерева австралийских аборигенов. Архивировано 20 сентября 2009 г. в Оксфордском университете Wayback Machine.
  47. ^ Худжашов, Г .; Кивисилд, Т .; Андерхилл, Пенсильвания; Endicott, P .; Санчес, JJ; Lin, AA; Shen, P .; Oefner, P .; Renfrew, C .; и другие. (2007). «Выявление доисторического поселения Австралии с помощью анализа Y-хромосомы и мтДНК» . Труды Национальной академии наук . 104 (21): 8726–30. Bibcode : 2007PNAS..104.8726H . DOI : 10.1073 / pnas.0702928104 . JSTOR 25427741 . PMC 1885570 . PMID 17496137 .   
  48. ^ Страница мтДНК гаплогруппы U1a на cagetti.com [ ненадежный источник? ]
  49. ^ Карима Fadhlaoui-Zid; Лаура Родригес-Ботиге; Неджиб Науи; Амель Бенаммар-Эльгаайед; Франческ Калафель; Дэвид Комас (май 2011 г.). «Структура митохондриальной ДНК в Северной Африке выявляет генетический разрыв в долине Нила» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 145 (1): 107–117. DOI : 10.1002 / ajpa.21472 . hdl : 10261/42802 . PMID 21312180 . Проверено 22 апреля 2016 года .  
  50. ^ Мака-Мейер, Николь; Гонсалес, Ана М; Пестано, Хосе; Флорес, Карлос; Ларруга, Хосе М.; Кабрера, Висенте М (2003). «Транзит митохондриальной ДНК между Западной Азией и Северной Африкой, выведенный из филогеографии U6» . BMC Genetics . 4 : 15. DOI : 10.1186 / 1471-2156-4-15 . PMC 270091 . PMID 14563219 .  
  51. ^ Мохамед, Хишам Юсиф Хасан. «Генетические паттерны Y-хромосомы и вариации митохондриальной ДНК с последствиями для населения Судана» (PDF) . Хартумский университет . Проверено 22 апреля 2016 года .
  52. ^ Бернард Секер; Роза Фрегель; Хосе М. Ларруга; Висенте М. Кабрера; Филип Эндикотт; Хосе Дж. Пестано; Ана М. Гонсалес (2014). «История потока гена гаплогруппы U6 митохондриальной ДНК Северной Африки на африканский, евразийский и американский континенты» . BMC Evolutionary Biology . 14 : 109. DOI : 10.1186 / 1471-2148-14-109 . PMC 4062890 . PMID 24885141 .  
  53. ^ a b c Кутанан, Вибху; Кампуансай, Джатупол; Шрикуммул, Метави; Кангванпонг, Даорунг; Гиротто, Сильвия; Брунелли, Андреа; Стоункинг, Марк (2016). «Полные митохондриальные геномы тайского и лаосского населения указывают на древнее происхождение австроазиатских групп и демическое распространение в распространении языков тай-кадай» . Hum Genet . 136 (1): 85–98. DOI : 10.1007 / s00439-016-1742-у . PMC 5214972 . PMID 27837350 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • PhyloTree.org Манниса ван Овена - поддерево мтДНК R
  • Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева ( L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ