Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Международный координационный центр нейроинформатики
Логотип Международного координационного центра нейроинформатики, стиль только аббревиатуры.
СокращениеINCF
ДевизОбеспечение открытой и СПРАВЕДЛИВОЙ нейробиологии. [1]
Формирование2005 ; 16 лет назад [2] ( 2005 )
Главное управлениеСекретариат МКФ
Расположение
Координаты59 ° 20'54,46 ″ с.ш., 18 ° 1'25,78 ″ в.д. / 59.3484611 ° с.ш.18.0238278 ° в. / 59.3484611; 18.0238278
Председатель Правления
Мэриэнн Мартоне [3]
Веб-сайтincf .org

Международный координационный Нейроинформатика Facility ( INCF ) является международной некоммерческой организацией с миссией [4] для разработки, оценки и утверждения стандартов и передовой практики , которые охватывают принципы открытой, справедливой, [5] и Citable нейробиологии. INCF также проводит обучение тому, как стандарты и передовые методы способствуют воспроизводимости и позволяют публиковать полные результаты исследований, включая данные и код. INCF был создан в 2005 году по рекомендации рабочей группы Глобального научного форума ОЭСР . [6] INCF проводится в Каролинском институте в Стокгольме , Швеция.. [7] По состоянию на октябрь 2019 года активные узлы INCF находятся в 18 странах. [8] Исполнительным директором является Линда Ланьон [9], а председателем управляющего совета является Мэриэнн Мартоне.

Сеть INCF нацелена [10] на содействие применению вычислительных подходов к пониманию мозга и развитию инфраструктуры, необходимой для использования вычислительных методов для интеграции и анализа разнообразных данных в разных масштабах, методах и видах для понимания мозга и положительного воздействия на здоровье. и благополучие общества ..

Фон [ править ]

См. Также: Нейроинформатика

Ключевым элементом успешного понимания нервной системы является интеграция нейробиологии с информационными науками . Область, изучающая нервную систему, нейробиология, ответила на фантастический вызов понимания того, как работает наш мозг, с использованием самых сложных технологий, от исследований генома до исследований мозга.поведения людей и других видов при различных функциональных состояниях и на всех промежуточных аналитических уровнях. Эти усилия привели к появлению большого количества данных, которые постоянно увеличиваются на более высоких уровнях сложности. Полученные данные неоднородны, поступают с разных уровней изучения и методов анализа. Чтобы справиться с этой задачей интеграции и обеспечить эффективное и максимальное использование этих данных, теперь необходимо разработать и создать следующие общие ресурсы:

  1. базы данных нейробиологии и знаний;
  2. инструменты аналитики и моделирования; и
  3. вычислительные модели.

Эта проблема решается путем слияния нейробиологии с информатикой - областью нейроинформатики.

История [ править ]

Бытие [ править ]

Рекомендация координировать международные усилия в новой области нейроинформатики была впервые сделана в отчете по биоинформатике, разработанном под эгидой тогдашнего Мега-научного форума ОЭСР в 1998 году. [11] После обширных дискуссий в рабочей группе по нейроинформатике под председательством Глобального научного форума доктором Стивеном Х. Кослоу, предложение о создании Международного координационного совета по нейроинформатике и системы грантового финансирования исследований в области нейроинформатики было представлено в 2002 году [12].Этот проект был одобрен министрами науки ОЭСР на встрече в январе 2004 года. Шестнадцать стран (Австралия, Канада, Китай, Чешская Республика, Дания, Финляндия, Франция, Германия, Индия, Италия, Япония, Нидерланды, Норвегия, Швеция, Швейцария , Соединенное Королевство, Соединенные Штаты и Виктория, Австралия), а также Европейская комиссия затем разработали рабочие документы, которые образуют правовую основу для INCF и Программы международной нейроинформатики (PIN). [13]

Учреждение [ править ]

Условия, изложенные для создания INCF [14], были выполнены в июле 2005 г., семь стран (Чешская Республика, Финляндия, Германия, Норвегия, Швеция, Швейцария и США) подписали документ о взаимопонимании и пообещали предоставить свои финансовые ресурсы. вклад. Заявка на размещение Секретариата INCF была объявлена. Было получено два предложения, и 3 ноября по указанию Управляющего совета ОЭСР [15] созвала группу экспертов для рассмотрения и ранжирования предложений. Комиссия присвоила шведскому предложению более высокий рейтинг, и эта рекомендация была одобрена Руководящим советом INCF, когда он собрался в штаб-квартире ОЭСР 28 ноября. После обширных международных дискуссий в феврале 2007 года был официально открыт INCF со штаб-квартирой вКаролинский институт в Стокгольме.

INCF способствует сотрудничеству в области нейроинформатики и воспроизводимости исследований мозга посредством

  • обеспечение координации глобальной инфраструктуры нейробиологии посредством разработки и утверждения стандартов и передовых практик в поддержку открытой нейробиологии и FAIR (Findable Accessible Interoperable Reusable)
  • обучение исследователей, администраторов и студентов тому, как нейроинформатика способствует строгости и воспроизводимости, открытой и ЧЕСТНОЙ науке и публикации полных результатов своих исследований: повествования, данных и кода
  • поощрение нейробиологии как дисциплины к движению к FORCE (FAIR, Open, Research-object based и Citable Ecosystem)
  • содействие продвижению и постоянному развитию нейроинформатики как научной дисциплины

Основные результаты программы [ править ]

включают

  • Пространство Ваксгольма (WHS), основанное на координатах эталонное пространство мозга грызунов.
  • Scalable Brain Atlas, [16] веб-механизм отображения атласов мозга, данных изображений и топологий.
  • NineML, [17] общий язык описания модели.
  • Координатор мульти-симуляции (MUSIC), [18], который позволяет крупномасштабным симуляторам нейронов и другим приложениям обмениваться данными во время выполнения.
  • Модель данных нейровизуализации информатики (NI-DM), [19] структура для генерации, хранения и запроса метаданных, включая информацию о происхождении.
  • KnowledgeSpace, [20] энциклопедия на уровне сообщества, которая связывает концепции исследования мозга с данными, моделями и литературой со всего мира.
  • TrainingSpace, [21] онлайн-хранилище, объединяющее учебные ресурсы по нейроинформатике, разработанные как INCF, нашими партнерами, так и существующими ресурсами сообщества.

См. Также [ править ]

  • Структура данных изображения мозга (BIDS)
  • Проект Голубой мозг
  • Будапешт Справочный Коннектом
  • Проект Human Connectome
  • Список баз данных неврологии
  • Информационная структура по неврологии

Ссылки [ править ]

  1. ^ «О нас» . INCF . Проверено 9 октября 2019 .
  2. ^ «История» . KI.se . Проверено 9 октября 2019 .
  3. ^ a b "Контакт" . INCF . Проверено 9 октября 2019 .
  4. ^ "Миссия | INCF" . www.incf.org . Проверено 9 октября 2019 .
  5. ^ Хэгстр, Стефани (2014-09-03). «Принципы честных данных» . FORCE11 . Проверено 4 декабря 2017 .
  6. ^ "О" . Консорциум экспертной оценки неврологии . Проверено 19 сентября 2017 года .
  7. ^ "Расположение | INCF" . www.incf.org . Проверено 9 октября 2019 .
  8. ^ "Управляющие и ассоциированные узлы | INCF" . www.incf.org . Проверено 9 октября 2019 .
  9. ^ "Ключевой персональный | INCF" . www.incf.org . Проверено 8 октября 2019 .
  10. ^ "Чем мы занимаемся | INCF" . www.incf.org . Проверено 4 декабря 2017 .
  11. ^ Рабочая группа Megascience Forum по биологической информатике (январь 1999 г.). Итоговый отчет (Отчет). Организация экономического сотрудничества и развития. С. 3–4, 49–50, 70–72 . Проверено 19 сентября 2017 г. - через INCF ownCloud.
  12. ^ Рабочая группа по нейроинформатике Глобального научного форума (июнь 2002 г.). Отчет по нейроинформатике (Отчет). Организация экономического сотрудничества и развития. С. 5, 11–15, 46 . Проверено 19 сентября 2017 г. - через ICNF ownCloud.
  13. ^ "Луч проекта | INCF" . www.OECD.org . Проверено 9 октября 2019 .
  14. ^ "Incf | INCF" . www.incf.org . Проверено 4 декабря 2017 .
  15. ^ "OECD.org - ОЭСР" . www.oecd.org . Проверено 4 декабря 2017 .
  16. ^ «Масштабируемый атлас мозга - нейроанатомия на кончиках ваших пальцев» . scalablebrainatlas.incf.org . Проверено 4 декабря 2017 .
  17. ^ "NineML" . NineML . Проверено 4 декабря 2017 .
  18. ^ МУЗЫКА, координатор MUltiSimulation , Международный координационный центр нейроинформатики (INCF), 2017-11-14 , получено 2017-12-04
  19. ^ "- Модель данных нейровизуализации" . Проверено 4 декабря 2017 .
  20. ^ «Пространство знаний - Дом» . knowledge-space.org . Проверено 4 декабря 2017 .
  21. ^ "TrainingSpace - Дом" . training.incf.org . Проверено 24 апреля 2018 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Официальный сайт
  • Конгресс по нейроинформатике - 2019 (Варшава, Польша); 2018 (Монреаль, Канада); 2017 ; 2016 ; 2015 ; 2014 ; 2013 ; 2012 ; 2011 ; 2010 ; 2009 ; 2008 г.
  • Консорциум экспертной оценки неврологии
  • Ван Эссен, Дэвид (весна 2007 г.). «Послание президента SFN Дэвида Ван Эссена» . Neuroscience Quarterly . Архивировано из оригинала 13 июля 2007 года.