Международное общество микробной экологии ( ISME ) является основным научным сообществом развивающейся области микробной экологии и связанных с ней дисциплин. ISME является некоммерческой ассоциацией и является владельцем Международных симпозиумов по микробной экологии, а также владельцем журнала ISME Journal, который публикуется Springer Nature (импакт-фактор 2016 9,6 - Reuters Thomson). Офис ISME находится в Нидерландском институте экологии ( NIOO-KNAW ) в Вагенингене, Нидерланды.
Цели
ISME способствует обмену научной информацией путем организации международных симпозиумов, а также специальных семинаров, спонсирования публикаций и содействия образованию и исследованиям. ISME предоставляет услуги как научному, так и более широкому сообществу. Общество тесно сотрудничает с другими ключевыми научными организациями и наладило эффективное научное взаимодействие во всех географических регионах через сеть научных лидеров, которые служат национальными послами ISME. Любой, кто интересуется микробной экологией, может стать членом ISME.
История микробной экологии
Важная роль микроорганизмов в естественной окружающей среде была признана ведущими микробиологами конца XIX века, в частности М. Бейеринком и С. Виноградским. В своей проницательной лекции о роли микробов в общем круговороте жизни (1897) 1) Виноградский подчеркнул кардинальную роль микроорганизмов в круговороте элементов на Земле. Обсуждая разнообразие микроорганизмов в окружающей среде и микробно-микробные взаимодействия между популяциями, он указал на особые функции различных микроорганизмов в процессах круговорота вещества и последовательность различных функциональных групп в сообществе, в котором они работают. Однако в эпоху Виноградского и Бейеринка единственным средством различения и идентификации микроорганизмов на месте было микроскопическое наблюдение, и количественный анализ роли каждого микроорганизма в сообществе в большинстве случаев не проводился.
В 20-м веке, особенно после Второй мировой войны, мы наблюдаем широкое развитие методов изоляции, подсчета и дифференциации микроорганизмов в окружающей среде. Новая методология таксономии, такая как числовая таксономия и хемотаксономия, вскоре была применена для идентификации экологических изолятов. Кроме того, для наблюдения за микроорганизмами in-situ были внедрены методы дифференциального окрашивания и методы флуоресцентных антител. Различные новые методы, от определения роста и активности микроорганизмов в окружающей среде до их выделения и характеристики, были собраны в «Современные методы изучения микробной экологии» под редакцией Томаса Россвалла в 1973 г.). Книга была основана на встрече, проведенной в Шведском университете сельскохозяйственных наук в Упсале в 1972 году, а симпозиум, предшествовавший официальному ISME, теперь известен как ISME-0, поскольку Р. Герреро представил на ISME-63).
Новые методы и методы оказались успешными для анализа микробного сообщества в различных областях, микробиологии почвы и воды, консервирования и ферментации пищевых продуктов , а также медицинской микробиологии. Микробиологи, работающие в разных областях, быстро осознали единую концепцию - микробную экологию. Работа Т. Брока «Принципы микробной экологии» 1964 г. оказала глубокое влияние на дальнейшее развитие микробной экологии в разных странах.
История
В связи с быстрым распространением микробной экологии IAMS, Международная ассоциация микробиологических обществ (после 1980 года изменила свое название на IUMS), на 10-м Международном конгрессе микробиологов в Мехико в 1970 году решила создать ICOME, Международную комиссию по микробной экологии. ICOME стартовал в следующем году.
Роль, подчеркнутая при создании ICOME, заключалась в его активном участии в решении экологических проблем, загрязнении воды и почвы и ухудшении окружающей среды в результате деятельности человека. Однако годы, прошедшие после Мексики, показали, что интерес Комитета не ограничивается экологическими проблемами, а распространяется на центральные темы микробной экологии, то есть круговорот элементов в почве и отложениях, взаимодействие между микроорганизмами и растениями, животными и между ними. сами по себе влияние факторов окружающей среды на рост и деятельность микроорганизмов. Более того, важная роль микроорганизмов была признана учеными, работающими во многих прикладных областях: формирование и плодородие почвы, водоснабжение, ферментация продуктов питания и напитков, сохранение продуктов питания, пищеварительный тракт и рубец и даже разложение древних останков.
Первый международный симпозиум
Быстрое и широкое развитие микробной экологии привело к проведению первого Международного симпозиума по микробной экологии. Количество участников увеличилось с 380 из 30 стран на первой встрече в Данидине до 2000 из 65 стран на ISME-11 в Вене. Можно сказать, что микробная экология заняла определенную нишу в научном мире. Также расширился круг тем. Наряду с центральными, теоретическими темами, в темы симпозиума вошли темы из прикладных областей, таких как биоремедиация, медицинская микробиология, пищевая, почвенная и водная микробиология. Микроэкология желудочно-кишечного тракта впервые появилась на симпозиуме ISME-3, Ист-Лансинг, темы по технологии ферментации и кишечной флоре на ISME-4, Любляна, и медицинской микробиологии, на ISME-5, Киото. Эти темы продолжали оставаться приоритетными на последующих симпозиумах.
ICOME долгое время действовал на неформальной основе, и основным направлением его деятельности было проведение раз в три года международных симпозиумов. Однако прогресс и развитие микробной экологии были настолько быстрыми и ошеломляющими, что нам пришлось еще больше усилить роль ICOME, который был международной комиссией, входящей в IUMS и IUBS, и создать независимую международную организацию, основанную на микробной экологии.
ISME создан
На пути перехода от комитета к обществу было много препятствий. Тем не менее, профессор Дж. Тидже, который действовал в качестве председателя ICOME с 1995 года, выступил с активной инициативой по созданию нового Общества и консультировался с различными международными организациями, а также с редакторами и издателями журналов. Он предложил изменить статус ICOME на Международное общество микробной экологии (ISME), у которого есть собственный журнал. Он попросил исполнительный комитет ICOME рассмотреть и обсудить его предложение и выдвинул дальнейшие шаги, необходимые для создания Общества. Согласно его схеме, Исполнительный комитет устанавливает рамки Общества и журнала, включая объем, редакционный совет и политику журнала.
Предложение об учреждении Общества было представлено и одобрено на ISME-8 в Галифаксе, Канада, 1998. Основание ISME, несомненно, является важным шагом для будущего развития микробной экологии, и мы обязаны профессору Тьедже за его неустанные усилия и терпение в течение длительного процесса создания Общества. Ассоциация была основана и зарегистрирована в Ист-Лансинге, Мичиган, США, а затем переехала и открыла свой зарегистрированный офис в Женеве.
Тем временем профессор Тидже проконсультировался со Springer, издателем журнала «Microbial Ecology». В результате переговоров Microbial Ecology присоединилась к недавно созданной Международной ассоциации микробной экологии, издатель назначил редактора и редакционную коллегию журнала по согласованию с ISME.
Количество участников симпозиумов ISME продолжало расти. На ISME-10 в Канкуне в 2004 году у нас было 2000 участников. Микробиологи, работающие в различных областях, познакомились с экологическими концепциями, и новые методы развивались очень быстро. Учитывая рост числа участников, очень быстрое развитие микробной экологии и быстро возникающие современные проблемы, Общество решило проводить симпозиумы каждые два года после ISME-10.
Симпозиумы ISME
Сегодня симпозиумы ISME, которые проводятся каждые два года, являются крупнейшими международными встречами, посвященными широкому кругу тем в области микробной экологии.
Год | Конференция | Место расположения | Заголовок |
---|---|---|---|
2018 г. | ИСМЕ-17 | Лейпциг, Германия | Инновации в микробной экологии |
2016 г. | ИСМЭ-16 | Монреаль, Южная Канада | Микробная экология |
2014 г. | ИСМЭ-15 | Сеул, Южная Корея | Микробы |
2012 г. | ИСМЭ-14 | Копенгаген, Дания | Сила малого |
2010 г. | ИСМЭ-13 | Сиэтл, США | Микробы - хранители изменяющейся планеты |
2008 г. | ИСМЭ-12 | Кэрнс, Австралия | Поддерживая голубую планету |
2006 г. | ИСМЭ-11 | Вена, Австрия | Скрытые силы - микробные сообщества в действии |
2004 г. | ИСМЭ-10 | Канкун, Мексика | Планета микробов: от поверхности до космоса |
2001 г. | ISME-09 | Амстердам, Нидерланды | Взаимодействия в микробном мире |
1998 г. | ИСМЭ-08 | Галифакс, Канада | Микробные биосистемы: новые рубежи |
1995 г. | ISME-07 | Сан-Паулу, Бразилия | Прогресс в микробной экологии |
1992 г. | ISME-06 | Барселона, Испания | Тенденции микробной экологии |
1989 г. | ISME-05 | Киото, Япония | Последние достижения в микробной экологии |
1986 г. | ISME-04 | Любляна, Словения | Перспективы микробной экологии |
1983 г. | ISME-03 | Ист-Лансинг, США | Современные перспективы микробной экологии |
1980 г. | ISME-02 | Уорик, Великобритания | Современная микробная экология |
1977 г. | ИСМЭ-01 | Данидин, Новая Зеландия | Микробная экология |
Журнал ISME
В мае 2007 года Международное общество микробной экологии (ISME) и издательская группа Nature Publishing Group (NPG) выпустили новую публикацию: ISME Journal . Проф. Коэн, который был президентом ISME с 2000 года, вместе со своими преемниками профессором С. Челлебергом и профессором Хилари Лаппин-Скотт приложили большие усилия для основания журнала. Журнал полностью проиндексирован Medline, и теперь весь контент размещен на PubMed.
Текущий (2015 г.) импакт-фактор журнала составляет 9,3, и полное название журнала, The ISME Journal: Multidisciplinary Journal of Microbial Ecology, отражает комплексный характер современной микробной экологии, а цели и масштабы журнала это подтверждают.
Темы, представляющие особый интерес в рамках журнала, включают перечисленные ниже:
- I: Микробная популяция и экология сообщества
- II: Взаимодействие микроб-микроб и микроб-хозяин
- III: Эволюционная генетика
- IV: Интегрированные геномические и постгеномические подходы в микробной экологии
- V: Микробная инженерия
- VI: Геомикробиология и вклад микробов в геохимические циклы
- VII: Микробная экология и функциональное разнообразие естественной среды обитания
- VIII: Воздействие на микробную экосистему