Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Ларри Хантер
Ларри Хантер компьютерный ученый.jpg
Ларри Хантер в 2002 году
Родившийся
Лоуренс Э. Хантер

( 1961-01-18 )18 января 1961 г. (60 лет)
Соединенные Штаты
Альма-матерЙельский университет (доктор философии)
ИзвестенИнтеллектуальные системы для молекулярной биологии (ISMB)
Международное общество вычислительной биологии (ISCB)
НаградыСтипендиат ISCB (2010)
Научная карьера
ПоляВычислительная биология
Искусственный интеллект
Биоинформатика [1]
УчрежденияМедицинский факультет Университета Колорадо Университет
Джорджа Мейсона
ТезисПланирование приобретения знаний: приобретение знаний через опыт  (1989)
ДокторантРоджер Шэнк [2]
Интернет сайтcompbio .ucdenver .edu / Охотник

Лоуренс Э. Хантер - профессор и директор Центра вычислительной фармакологии и программы вычислительной биологии Медицинской школы Университета Колорадо и профессор компьютерных наук Университета Колорадо в Боулдере . [3] Он является всемирно известным ученым, [1] [4] сосредоточено на вычислительной биологии, экстракция , основанные на знаниях информации из первичной биомедицинской литературы, [5] семантическая интеграцияресурсов знаний в области молекулярной биологии и использования знаний в анализе данных с высокой пропускной способностью, а также за его фундаментальную работу в области вычислительной биологии, которая привела к возникновению крупной профессиональной организации в этой области и двух международных конференций. [6]

Образование [ править ]

Хантер закончил свою докторскую степень в Йельском университете в 1989 году , защитив диссертацию на тему знаний по планированию приобретения: Получение экспертизы на основе опыта , на диагностике рака легкого от гистологических изображений с помощью рассуждения случая на основе , [7] под руководством Роджера Schank . [2]

Карьера и исследования [ править ]

Столкнувшись с выбором между карьерой в основных приложениях искусственного интеллекта - программированием игр и защитой - Хантер решил создать новую дисциплину - биоинформатику . С 1989 по 2000 год Хантер работал компьютерным специалистом и руководителем секции Национального института здравоохранения, посвященной статистическим и биоинформатическим исследованиям. Он был адъюнкт-преподавателем в университете Джорджа Мейсона с 1991 по 2000 год [ править ] и доцентом в университете Колорадо Денвер школа медицины с 2000 по 2008 он был назначен профессором в 2008 году [8]

ISCB [ править ]

В 1997 году Хантер основал то , что стало крупнейшей профессиональной организацией в вычислительной биологии и биоинформатики , то Международное общество по вычислительной биологии (ISCB) . [9]

Конференции [ править ]

Хантер также был основателем трех успешных международных конференций по биоинформатике, Международной конференции по интеллектуальным системам для молекулярной биологии (ISMB) и Тихоокеанского симпозиума по биокомпьютерам (PSB) [10] и конференции по биоинформатике Скалистых гор. [11] Он также является соорганизатором конференции по биологической визуализации Vizbi. [12] Хантер был соучредителем и членом совета директоров Molecular Mining Corporation с 1997 по 2003 год.

Награды, почести и влияние [ править ]

Охотник Fellow из Американского колледжа медицинской информатики [ править ] [ когда? ] и лауреат премии Энгельмора Ассоциации по развитию искусственного интеллекта (AAAI) 2003 года за инновационные применения искусственного интеллекта . [ необходима цитата ]

Хантеру приписывают то, что он был одним из основателей области биоинформатики . [ необходима цитата ] На протяжении всей своей карьеры Хантер исследовал и руководил исследовательскими группами, исследующими разработку и применение передовых вычислительных методов для биомедицины для высокопроизводительных анализов, в частности, применение статистических и основанных на знаниях методов, в частности био-онтологий, [13 ] к анализу высокопроизводительных данных и биомедицинских текстов. Он предложил нейробиологически и эволюционно обоснованные вычислительные модели познания и этические вопросы, связанные с вычислительной бионаукой. Он выступал за расширение деятельности по науке о данных в биомедицине, чтобы включить в нее методы, основанные на знаниях.[14]

Он стал стипендиатом ISCB в 2010 году. Среди других наград и наград - награда Регента за стипендии и технические достижения 1994 года [ необходима ссылка ] Награда за заслуги перед Национальной медицинской библиотекой , 1991, 1992, 1993, 1994, 1995, 1996, 1997, 1998 [ править ] Совершенство Research Award, университет Колорадо школы медицины кафедры фармакологии, 2007 [ править ] Превосходство в Teaching Award, университет Колорадо школы медицины кафедры профилактической медицины и биометрии, 2004. [ править ]

Публикации [ править ]

Избранные публикации включают:

  • Rindflesch, T .; Tanabe, L .; Weinstein, J .; Хантер, Л. (2000). «Эдгар: Извлечение лекарств, генов и отношений из биомедицинской литературы» . Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу : 517–528. DOI : 10.1142 / 9789814447331_0049 . ISBN 978-981-02-4188-9. PMC  2709525 . PMID  10902199 .
  • Шанк, Р. К.; Коллинз, GC; Хантер, Л. Е. (1986). «Преодоление индуктивного образования категорий в обучении». Поведенческие науки и науки о мозге . 9 (4): 639. DOI : 10,1017 / S0140525X00051578 .
  • Риндфлеш, ТС; Раджан, СП; Хантер, Л. (2000). «Извлечение молекулярных отношений связывания из биомедицинского текста» . Материалы шестой конференции по прикладной обработке естественного языка - . С. 188–195. DOI : 10.3115 / 974147.974173 . S2CID  16166432 .
  • Планируется изучить материалы двенадцатой ежегодной конференции Общества когнитивных наук, Бостон, Массачусетс, июль 1990 г., стр. 26–34, Lawrence Erlbaum Associates, Хиллсдейл, штат Нью-Джерси. дюйм [15]
  • Хантер, Лоуренс (1993). Искусственный интеллект и молекулярная биология . Менло-Парк, Калифорния: AAAI Press. ISBN 978-0-262-58115-8.
  • Баумгартнер, Вашингтон; Коэн, КБ; Fox, LM; Acquaah-Mensah, G .; Хантер, Л. (2007). «Ручного курирования недостаточно для аннотации геномных баз данных» . Биоинформатика . 23 (13): i41 – i48. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btm229 . PMC  2516305 . PMID  17646325 .
  • Хантер, Л .; Lu, Z .; Firby, J .; Баумгартнер-младший, Вашингтон; Джонсон, HL; Огрен П.В.; Коэн, КБ (2008). «OpenDMAP: движок анализа концепций на основе онтологий с открытым исходным кодом, с приложениями для сбора информации о транспорте белков, взаимодействиях белков и экспрессии генов, специфичных для конкретного типа клеток» . BMC Bioinformatics . 9 : 78. DOI : 10,1186 / 1471-2105-9-78 . PMC  2275248 . PMID  18237434 .
  • Выщелачивание, SM; Типни, H .; Feng, W .; Баумгартнер, Вашингтон; Kasliwal, P .; Schuyler, RP; Уильямс, Т .; Spritz, RA; Хантер, Л. (2009). Мияно, Сатору (ред.). «Ускорение биомедицинских открытий с приложениями к черепно-лицевому развитию» . PLOS Вычислительная биология . 5 (3): e1000215. Bibcode : 2009PLSCB ... 5E0215L . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.1000215 . PMC  2653649 . PMID  19325874 .
  • Хантер, Лоуренс (2009). Жизненные процессы: введение в молекулярную биологию . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 0-262-01305-3 . [8] 

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Публикации Лоуренса Хантера, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ a b Хантер, Лоуренс Э. (1989). Планирование приобретения знаний: приобретение знаний через опыт (кандидатская диссертация). Йельский университет. hdl : 10079 / bibid / 9838922 . OCLC 24116492 . ProQuest 303852846 .  
  3. ^ «Лоуренс Хантер, доктор философии». Compbio.ucdenver.edu . Проверено 12 апреля 2018 года .
  4. ^ Лоуренс Хантер насервере библиографии DBLP
  5. ^ Хантер, Л .; Коэн, КБ (2006). «Биомедицинская языковая обработка: что дальше PubMed?» . Молекулярная клетка . 21 (5): 589–594. DOI : 10.1016 / j.molcel.2006.02.012 . PMC 1702322 . PMID 16507357 .  
  6. ^ «Пионер с личностью: Ларри Хантер, основатель Международного общества вычислительной биологии». Мир биоинформатики : 6. Осень 2002.
  7. ^ Гибсон, Тодд А. (2012). «Корни биоинформатики в ISMB» . PLOS Вычислительная биология . 8 (8): e1002679. Bibcode : 2012PLSCB ... 8E2679G . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.1002679 . PMC 3431341 . PMID 22952443 .  
  8. ^ a b Хантер, Лоуренс (2009). Жизненные процессы: введение в молекулярную биологию . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-01305-5.
  9. ^ "Труды 6-й Международной конференции по интеллектуальным системам для молекулярной биологии. Монреаль, Квебек, Канада. 28 июня - 1 июля 1998". Ход работы. Международная конференция по интеллектуальным системам для молекулярной биологии . 6 : 1–223. 1998. PMID 9867411 . 
  10. ^ "Труды 4-й Международной конференции по интеллектуальным системам для молекулярной биологии. ISMB-96". Ход работы. Международная конференция по интеллектуальным системам для молекулярной биологии . 4 : 1–262. 1996. PMID 9005023 . 
  11. ^ "Рокки 09 - Добро пожаловать!" . Iscb.org . Проверено 12 апреля 2018 года .
  12. ^ O'Donoghue, Шон. «ВИЗБИ - Визуализация биологических данных» . Vizbi.org . Проверено 12 апреля 2018 года .
  13. ^ Ливингстон, Кевин М .; Бада, Майкл; Баумгартнер, Уильям А .; Хантер, Лоуренс Э. (2015-04-23). «KaBOB: семантическая интеграция биомедицинских баз данных на основе онтологий» . BMC Bioinformatics . 16 : 126. DOI : 10,1186 / s12859-015-0559-3 . ISSN 1471-2105 . PMC 4448321 . PMID 25903923 .   
  14. ^ Хантер, Лоуренс Э. (2017). «Биомедицинские данные, основанные на знаниях» . EPJ Data Science . 1 (1-2): 19-25. DOI : 10.3233 / DS-170001 . ISSN 2193-1127 . PMC 6171523 . PMID 30294517 .   
  15. ^ Лик, Дэвид Б .; Рам, Эшвин (1995). Целенаправленное обучение . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-18165-5.
Предшественник
None		Президент
Международного общества вычислительной биологии с
1997 по 2000 год.		Преемник
Расс Альтман