Вкрапленные повторы (MIR) на уровне млекопитающих являются мобильными элементами в геномах некоторых организмов и принадлежат к группе коротких вкрапленных ядерных элементов (SINE) .
Заболеваемость [ править ]
MIR обнаружены у всех млекопитающих (включая сумчатых ). [1]
В человеческом [ править ]
По оценкам, в геноме человека насчитывается около 368 000 MIR . [2]
Структура [ править ]
Консенсусная последовательность MIR имеет длину 260 пар оснований и имеет A / T-богатый 3'-конец. [1]
Распространение [ править ]
Как и другие короткие вкрапленные ядерные элементы (SINE) , элементы MIR использовали механизм элементов LINE для своего распространения в геноме, что произошло около 130 миллионов лет назад. Они больше не могут ретротранспортироваться из- за потери активности необходимой обратной транскриптазы . [3]
История открытия [ править ]
Элементы MIR были впервые описаны в геноме человека 1989-1991 гг. [4] [5] [6] и впервые были названы повторами семейства MB1 (зеркало последовательностей повторения B1 мыши). Затем повторы этого семейства были обнаружены в геномах других млекопитающих. [7] Затем это семейство было переименовано в "Вкрапленные повторы млекопитающих" в 1992 г. [8] Позже было показано, что это семейство является общим для геномов позвоночных. [9]
Ссылки [ править ]
- ^ a b Смит, Ариан Ф.А.; Риггс, Артур Д. (1995). «MIR - это классические SINE, происходящие от тРНК, которые амплифицировались до облучения млекопитающих» . Исследования нуклеиновых кислот . 23 (1): 98–102. DOI : 10.1093 / NAR / 23.1.98 . PMC 306635 . PMID 7870595 .
- ^ Лендер; и другие. (2001). «Первоначальное секвенирование и анализ генома человека» (PDF) . Природа . 409 (6822): 860–921. Bibcode : 2001Natur.409..860L . DOI : 10.1038 / 35057062 . PMID 11237011 .
- ^ Крулл, М; Петрусма, М; Макаловски, В; Brosius, J; Шмитц, Дж (август 2007 г.). «Функциональная персистентность экзонизированных вкрапленных повторяющихся элементов на уровне млекопитающих (MIR)» . Геномные исследования . 17 (8): 1139–45. DOI : 10.1101 / gr.6320607 . PMC 1933517 . PMID 17623809 .
- ^ Donehower, Лоуренс A .; Slagle, Betty L .; Уайльд, Маргарет; Дарлингтон, Гретхен; Бутель, Джанет С. (1989). «Идентификация консервативной последовательности в некодирующих областях многих генов человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 17 (2): 699–722. DOI : 10.1093 / NAR / 17.2.699 . PMC 331613 . PMID 2536922 .
- ↑ Коротков, Евгений В. (1990). «Семейство зеркальных B1-подобных последовательностей из генома человека». Докл. Акад. Наук СССР . 311 (1): 238–242. PMID 2357927 .
- ↑ Коротков, Евгений В. (1991). «Новое семейство широко распространенных MB1-повторов в геноме человека». Мол Биол (Моск ). 25 (1): 250–263. PMID 1896037 .
- ↑ Коротков, Евгений В. (1992). «Семейство повторов MB1 в клонах из геномов млекопитающих». Изв. АН СССР биол . Июль – август (4): 546–557. PMID 1452902 .
- ^ Юрка, Ежи; Валичевич, Иоланта; Милосавлевич, Александар (октябрь 1992 г.). «Прототипические последовательности для повторяющейся ДНК человека». Журнал молекулярной эволюции . 35 (4): 286–291. Bibcode : 1992JMolE..35..286J . DOI : 10.1007 / BF00161166 . PMID 1404414 .
- ^ Коротков, Евгений В .; Короткова Мария А .; Руденко, Валентина М. (2000). «МИР - семейство повторов, общих для геномов позвоночных». Мол Биол (Моск ). 34 (4): 553–559. DOI : 10.1007 / BF02759556 . PMID 11042848 .
