Процесс мессенджер РНК decapping состоит из гидролиза части колпачка 5' структуры на РНК обнажая 5' монофосфат. У эукариот этот 5'-монофосфат является субстратом для 5'- экзонуклеазы Xrn1 [1], и мРНК быстро разрушается. Есть много ситуаций, которые могут привести к снятию крышки, некоторые из которых обсуждаются ниже. [2]
У прокариот исходный транскрипт мРНК естественным образом обладает 5'-трифосфатной группой после бактериальной транскрипции ; фермент RppH удаляет молекулу пирофосфата с 5'-конца, превращая 5'-трифосфат в 5'-монофосфат, запуская деградацию мРНК рибонуклеазами. [3] [4]
Перевод и распад [ править ]
Внутри клеток существует баланс между процессами трансляции и распада мРНК. [2] Активно транслируемые сообщения связаны полисомами и факторами инициации эукариот eIF-4E и eIF-4G (у эукариот). Это блокирует доступ к кэпу ферментом DCP2 и защищает молекулу мРНК. В условиях нехватки питательных веществ или вирусной инфекции трансляция может быть нарушена, и снятие крышки будет стимулироваться. Этот баланс отражается в размере и обилии цитоплазматических структур, известных как Р-тельца . [5] [6]
Конкретные пути распада [ править ]
Существует ряд конкретных путей распада, которые распознают аберрантные сообщения и способствуют их удалению. Нонсенс-опосредованный распад распознает преждевременные стоп-кодоны и способствует расщеплению, а также распаду экзосомой . Также было показано, что определенные классы miRNA стимулируют декапирование.
Ссылки [ править ]
- ^ Пул, Тони Л .; Стивенс, Одри (июнь 1997 г.). «Структурные модификации РНК влияют на 5'-экзорибонуклеолитический гидролиз с помощью XRN1 и HKE1 из Saccharomyces cerevisiae» (PDF) . Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 235 (3): 799–805. DOI : 10.1006 / bbrc.1997.6877 . PMID 9207242 .
- ^ а б Мейер, Силк; Темме, Клаудиа; Вале, Эльмар (январь 2004 г.). «Обмен РНК-мессенджера в эукариотах: пути и ферменты». Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии . 39 (4): 197–216. DOI : 10.1080 / 10409230490513991 . PMID 15596551 .
- ^ Дина, Атилио; Целесник, Елена; Беласко, Джоэл Г. (17 января 2008 г.). «Бактериальный фермент RppH запускает деградацию информационной РНК за счет удаления 5'-пирофосфата». Природа . 451 (7176): 355–358. DOI : 10,1038 / природа06475 . PMID 18202662 .
- ^ Се, Пинг-кун; Ричардс, Джейми; Лю, Цюаньшэн; Беласко, Джоэл Г. (22 апреля 2013 г.). «Специфичность RppH-зависимой деградации РНК в Bacillus subtilis» . Труды Национальной академии наук . 110 (22): 8864–8869. DOI : 10.1073 / pnas.1222670110 . PMC 3670361 . PMID 23610425 .
- ^ Шет, Уджвал; Паркер, Рой (2 мая 2003 г.). «Декаппинг и распад матричной РНК происходят в телах цитоплазматической обработки» . Наука . 300 (5620): 805–808. DOI : 10.1126 / science.1082320 . PMC 1876714 . PMID 12730603 .
- ^ Паркер, Рой; Шет, Уджвал (март 2007 г.). «Р-тела и контроль трансляции и деградации мРНК». Молекулярная клетка . 25 (5): 635–646. DOI : 10.1016 / j.molcel.2007.02.011 . PMID 17349952 .
