П-тела

Р-тельца или процессинговые тельца представляют собой отдельные очаги, образованные разделением фаз в цитоплазме эукариотической клетки, состоящей из многих ферментов, участвующих в обороте мРНК . Р-тельца представляют собой высококонсервативные структуры и наблюдались в соматических клетках позвоночных и беспозвоночных, растений и дрожжей. На сегодняшний день, P-тела были продемонстрированы играть фундаментальную роль в общем распаде мРНК , нонсенс-опосредованной мРНК распада , аденилат-uridylate богатых элемент опосредованного распада мРНК, и микроРНК (миРНК) индуцированных мРНК глушителей .^[1] Не все мРНК, которые входят в Р-тельца, деградируют, поскольку было продемонстрировано, что некоторые мРНК могут выходить из Р-тельцов и повторно инициировать трансляцию. ^{[2] [3]} Очистка и секвенирование мРНК из очищенных процессинговых телец показали, что эти мРНК в значительной степени трансляционно репрессируются перед инициацией трансляции и защищены от распада 5'-мРНК. ^[4]

Было продемонстрировано, что следующие виды деятельности происходят в P-телах или связаны с ними:

• декапирование и деградация нежелательных мРНК ^[5]
• хранение мРНК до тех пор, пока она не понадобится для трансляции ^[4]
• помощь в репрессии трансляции с помощью миРНК (связанных с миРНК )

В нейронах Р-тела перемещаются моторными белками в ответ на стимуляцию. Вероятно, это связано с локальной трансляцией в дендритах . ^[6]

П-тела впервые были описаны в научной литературе Башкировым и соавт. ^[7] в 1997 г., в котором они описывают «маленькие гранулы… дискретные, выступающие очаги» как цитоплазматическую локализацию экзорибонуклеазы мыши mXrn1p. Только в 2002 году было опубликовано представление о природе и важности этих цитоплазматических очагов. ^{[8] [9] [10]} В 2002 году исследователи продемонстрировали, что несколько белков, участвующих в деградации мРНК, локализуются в очагах. В течение этого времени для идентификации обрабатывающих тел использовалось множество описательных имен, включая «тела GW» и «тела снятия крышки»; однако термин «P-тела» был выбран и в настоящее время широко используется и принимается в научной литературе. ^[5]Недавно были представлены доказательства того, что GW-тельца и P-тельца на самом деле могут быть разными клеточными компонентами. ^[11] Доказательство состоит в том, что GW182 и Ago2, оба ассоциированные с подавлением гена miRNA, обнаруживаются исключительно в мультивезикулярных тельцах или GW-тельцах и не локализуются в P-тельцах. Также следует отметить, что Р-тела не эквивалентны стрессовым гранулам и содержат в основном неперекрывающиеся белки. ^[4] Эти две структуры поддерживают перекрывающиеся клеточные функции, но обычно возникают при разных стимулах. Hoyle et al. предполагает, что новый сайт, называемый тельцами EGP или стрессовыми гранулами, может быть ответственным за хранение мРНК, поскольку в этих сайтах отсутствует расщепляющий фермент. ^[12]

Ассоциации с микроРНК [ править ]

Репрессия, опосредованная микроРНК, происходит двумя путями: репрессия трансляции или стимуляция распада мРНК. miRNA привлекает комплекс RISC к мРНК, с которой они связаны. Связь с P-тельцами происходит благодаря тому факту, что многие, если не большинство, белков, необходимых для подавления гена miRNA, локализованы в P-тельцах, как описано Kulkarni et al. (2010). ^{[1] [13] [14] [15] [16]} Эти белки включают, помимо прочего, каркасный белок GW182, Argonaute (Ago), декапирующие ферменты и РНК-геликазы.. Текущие доказательства указывают на то, что P-тельца являются каркасными центрами функции miRNA, особенно из-за доказательств того, что нокдаун GW182 нарушает образование P-телец. Однако остается много безответных вопросов о Р-тельцах и их связи с активностью miRNA. В частности, неизвестно, существует ли контекстно-зависимая (стрессовое состояние по сравнению с нормальным) специфичность механизма действия P-тела. Основываясь на доказательствах того, что Р-тельца иногда являются местом распада мРНК, а иногда мРНК может выходить из Р-тельца и повторно инициировать трансляцию, остается вопрос, что контролирует это переключение. Другой неоднозначный вопрос, на который следует обратить внимание, это то, активно ли белки, которые локализуются в Р-тельцах, в процессе молчания генов miRNA или просто находятся в режиме ожидания.

Белковый состав обрабатывающих тел [ править ]

В 2017 году был опубликован новый метод очистки обрабатывающих тел. ^[4] Hubstenberger et al. использовали сортировку частиц, активируемых флуоресценцией (метод, основанный на идеях сортировки клеток, активируемых флуоресценцией ), для очистки обрабатывающих тел от эпителиальных клеток человека. Из этих очищенных обрабатывающих тел они смогли использовать масс-спектрометрию и секвенирование РНК, чтобы определить, какие белки и РНК находятся в обрабатывающих телах соответственно. Это исследование выявило 125 белков, которые в значительной степени связаны с процессинговыми телами. ^[4]

В 2018 году Youn et al. взял близость маркировку подхода , называемый BioID для идентификации и прогнозированием протеой обработки тела. ^[17] Они сконструировали клетки для экспрессии нескольких локализованных в организме белков в виде слитых белков с ферментом BirA *. Когда клетки инкубируются с биотином , BirA * будет биотинилировать белки, которые находятся поблизости, таким образом маркируя белки внутри обрабатывающих тел биотиновой меткой. Затем стрептавидин использовали для выделения меченых белков и масс-спектрометрии для их идентификации. Используя этот подход, Youn et al. идентифицировали 42 белка, которые локализуются в обрабатывающих телах. ^[17]

Ссылки [ править ]

Дальнейшее чтение [ править ]

• Kulkarni et al. предоставить обзор Р-телец и таблицу всех белков, обнаруженных в Р-теле по состоянию на 2010 г. Kulkarni, M .; Озгур, С .; Стоклин, Г. (2010). «Идет по пути с кузовами типа P». Труды биохимического общества . 38 (Pt 1): 242–251. DOI : 10.1042 / BST0380242 . PMID 20074068 . 
• Эулалио, Ана; Бем-Ансман, Изабель; Изаурральде, Элиза (январь 2007 г.). «Р-тельца: на перекрестке посттранскрипционных путей». Nat Rev Mol Cell Biol . 8 (1): 9–22. DOI : 10.1038 / nrm2080 . PMID  17183357 . S2CID  41419388 .
• Маркс, Дж. (2005). «МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ: Р-тела - ориентир для контроля производства белка». Наука . 310 (5749): 764–765. DOI : 10.1126 / science.310.5749.764 . PMID  16272094 . S2CID  11106208 .
• Anderson, P .; Кедерша, Н. (2009). «Гранулы РНК: посттранскрипционные и эпигенетические модуляторы экспрессии генов». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 10 (6): 430–436. DOI : 10.1038 / nrm2694 . PMID  19461665 . S2CID  26578027 .