Метапланококк


Metaplanococcus — род грамположительных или грамвариабельных кокков или коротких палочковидных бактерий семейства Caryophanaceae из порядка Caryophanales . [1] Типовым видом этого рода является Metaplanococcus flavidus. [2]

Представители Metaplanococcus ранее были видами, принадлежащими Planococcus. Вместо того, чтобы разветвляться с видами Planococcus , этот вид и безымянный вид Planomicrobium образовали монофилетическую ветвь в различных филогенетических деревьях, построенных на основе консервативных последовательностей генома, что указывает на их филогенетическое родство. [1] Семейство Caryophanaceae включает в себя множество аномалий ветвления, подобных этой, частично из-за использования последовательностей 16S рРНК в качестве метода классификации, который, как известно, имеет низкую разрешающую способность и дает разные результаты в зависимости от используемого алгоритма. [3] В 2020 году сравнительное геномное исследование внесло изменения в семейство, в результате чего были выделены три новых рода, включая Metaplanococcus . [1]

Название Metaplanococcus происходит от греческого прилагательного мета , которое переводится как «кроме того», и латинского термина Planococcus , обозначающего название рода. Вместе Metaplanococcus можно перевести как род, помимо Planococcus . [1]

С помощью геномного анализа было идентифицировано 17 консервативных сигнатурных инделей (CSI), которые уникально присутствуют в этом роде в следующих белках: субстрат-связывающий белок-транспортер ABC, лигаза метионин-тРНК , белок-субстрат-связывающий транспортер ABC семейства MetQ/NlpA, пермеаза транспортера ABC, споровая протеаза YyaC, N-ацетил-альфа-D-глюкозаминил-5'L-малатсинтаза BshA, оротидин-5-фосфатдекарбоксилаза и фосфо-N-ацетилмурамоилпентапептид-трансфераза . [1] Эти CSI обеспечивают надежные молекулярные средства для различения представителей Metaplanococcus от других родов семейства Caryophanaceae и всех других бактерий.

Metaplanococcus по состоянию на 2021 год содержит один вид с действительно опубликованным названием. [2] Этот род был идентифицирован как монофилетическая клада и филогенетически не связанный с другими видами семейства Caryophanaceae в исследованиях, изучающих таксономические отношения внутри семейства. [1]