Mycobacterium africanum - это вид Mycobacterium, который чаще всего встречается в странах Западной Африки, где, по оценкам, вызывает до 40% случаев туберкулеза легких. [2] Симптомы инфекции напоминают симптомы M. tuberculosis .
Mycobacterium africanum | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Заказ: | |
Подотряд: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | М. africanum |
Биномиальное имя | |
Mycobacterium africanum Castets et al. 1969, [1] ATCC 25420 |
Он является членом комплекса Mycobacterium tuberculosis . [3]
Таксономия
В комплексе Mycobacterium tuberculosis (MTBC) есть семь основных линий , из которых линии 5 и 6 классифицируются как Mycobacterium africanum . Линия 5 MTBC представляет собой M. africanum типа 1, западноафриканский 1 (MAF1) и классифицируется на основе характерной делеции региона дифференцировки (RD) 711. MAF1 обычно встречается в районе Гвинейского залива. Линия 6 MTBC также известна как M. africanum типа 1, западноафриканская 2 (MAF2) и классифицируется на основе делеции RD702. MAF2 распространен в Западной Африке. M. africanum типа 2, восточноафриканский, ранее был признан штаммом Mycobacterium africanum ; недавно он был реклассифицирован как генотип Mycobacterium tuberculosis «Уганда» в подлинии к линии MTBC 4. [4]
История
M. africanum был впервые описан как подвид в рамках MTBC с фенотипическими характеристиками, промежуточными между M. tuberculosis и M. bovis , на основании биохимического тестирования Castets в 1968 году. Ранний генетический анализ показал, что он отличался от M. tuberculosis из-за геномная делеция RD9 и отдельная нуклеотидная последовательность GyrB , отличная от M. bovis из-за интактных RD12 и RD4. [5]
Микробиология
M. africanum выращивают в среде, содержащей пируват, в условиях низкого содержания кислорода и образуют характерные «дисгонические» колонии. В отличие от M. tuberculosis , M. africanum проявляет каталазную активность, является нитрат-отрицательным и чувствителен к гидразиду тиопен-2-карбоновой кислоты (TCH) и пиразинамиду (PZA). M. africanum также растет медленнее, чем M. tuberculosis , для образования колоний обычно требуется 10 недель, а не 3–4 для M. tuberculosis . [6]
Эпидемиология
M. africanum чаще всего встречается в странах Западной Африки. [7] Это инфекция только у людей и распространяется воздушно-капельным путем от людей с открытыми случаями заболевания.
Не совсем понятно, почему распространение M. africanum ограничено Западной Африкой, и только спорадические случаи обнаруживаются в других регионах. [8] Филогенетические данные показывают, что M. africanum на ранней стадии разветвился от современных линий Mtb в Америке, Европе и Азии. Некоторые исследования показывают, что M. africanum адаптирован к западноафриканскому населению. M. africanum, возможно, проигрывает другим линиям Mtb в других регионах; однако генетические исследования не обнаружили разницы в количестве генов вирулентности или генетическом разнообразии между M. tuberculosis и M. africanum . Животных- резервуаров для Mycobacterium africanum не выявлено, несмотря на то, что были обнаружены различные дикие животные. [9]
Он имеет такую же степень инфекционности, что и обычный микроорганизм M. tuberculosis, но с меньшей вероятностью прогрессирует до клинического заболевания у иммунокомпетентного индивидуума. [10] Однако M. africanum с большей вероятностью перейдет от инфекции к заболеванию у ВИЧ-положительного пациента. В странах, где M. africanum является эндемичным, он представляет собой важную оппортунистическую инфекцию на более поздних стадиях заболевания ВИЧ. [11]
Патогенез
Не совсем понятно, как генетические различия между M. africanum и M. tuberculosis приводят к более низкой патогенности первых. Однако известно, что область различия 9 (RD9) отсутствует у M. africanum, но присутствует у M. tuberculosis . [12]
M. africanum также имеет заметные различия в катаболизме и метаболизме липидов. Кроме того, у M. africanum нарушаются пути вирулентности, такие как регулон dosR / Rv0081 или регуляция ESAT-6 . [13]
Уход
Из-за схожих симптомов и различных условий роста Mycobacterium tuberculosis и africanum методы культивирования ненадежны для диагностики. Генотипирование на основе молекулярной биологии улучшило идентификацию. В частности, «сполиготипирование» или «типирование спейсерного олигонуклеотида» представляет собой основанный на быстрой полимеразной цепной реакции метод генотипирования штаммов в MTBC. Недавно были разработаны экспресс-тесты бокового кровотока на основе антигена mpt64, обнаруженного у всех членов MTBC. [14]
M. africanum имеет более низкую скорость прогрессирования от латентного периода к активному заболеванию, чем M. tuberculosis . Лечение M. africanum tuberculosis осуществляется по той же схеме, что и туберкулез, вызываемый M. tuberculosis . Общая скорость излечения аналогична, но, поскольку больше пациентов с M. africanum могут быть ВИЧ-положительными, у них может быть более высокая смертность от других заболеваний, связанных с ВИЧ. [15]
Тип штамма
ATCC 25420 = CIP 105147
Рекомендации
- ^ Кастеты, М .; Rist, N .; Бойсверт, Х. (1969). "La varété africaine du bacille tuberculeux humain". Médecine d'Afrique Noire . 16 : 321–2.
- ^ де Йонг, В .; Антонио, М .; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum - Обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке» . PLOS «Забытые тропические болезни» . 4 (9): e744. DOI : 10.1371 / journal.pntd.0000744 . PMC 2946903 . PMID 20927191 .
- ^ Vasconcellos SE, Huard RC, Niemann S и др. (2010). «Отличные генотипические профили двух основных клад Mycobacterium africanum » . BMC Infect. Дис . 10 : 80. DOI : 10,1186 / 1471-2334-10-80 . PMC 2859774 . PMID 20350321 .
- ^ де Йонг, В .; Антонио, М .; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum - Обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке» . PLOS «Забытые тропические болезни» . 4 (9): e744. DOI : 10.1371 / journal.pntd.0000744 . PMC 2946903 . PMID 20927191 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Изменчивость штамма в комплексе Mycobacterium tuberculosis: его роль в биологии, эпидемиологии и контроле . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019 . Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. DOI : 10.1007 / 978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Изменчивость штамма в комплексе Mycobacterium tuberculosis: его роль в биологии, эпидемиологии и контроле . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019 . Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. DOI : 10.1007 / 978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632 .
- ^ де Йонг, В .; Антонио, М .; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum - Обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке» . PLOS «Забытые тропические болезни» . 4 (9): e744. DOI : 10.1371 / journal.pntd.0000744 . PMC 2946903 . PMID 20927191 .
- ^ де Йонг, В .; Антонио, М .; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum - Обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке» . PLOS «Забытые тропические болезни» . 4 (9): e744. DOI : 10.1371 / journal.pntd.0000744 . PMC 2946903 . PMID 20927191 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Изменчивость штамма в комплексе Mycobacterium tuberculosis: его роль в биологии, эпидемиологии и контроле . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019 . Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. DOI : 10.1007 / 978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632 .
- ^ де Йонг, В .; Hill, P .; Aiken, A .; Awine, T .; Martin, A .; Adetifa, I .; Jackson-Sillah, D .; Fox, A .; DeRiemer, K .; Gagneux, S .; Borgdorff, M .; McAdam, K .; Corrah, T .; Small, P .; Адегбола Р. (2008). «Развитие активного туберкулеза, но не передача, зависит от линии Mycobacterium tuberculosis в Гамбии» . Журнал инфекционных болезней . 198 (7): 1037–1043. DOI : 10.1086 / 591504 . PMC 2597014 . PMID 18702608 .
- ^ де Йонг, В .; Hill, P .; Brookes, R .; Otu, J .; Петерсон, К .; Small, P .; Адегбола Р. (14 октября 2005 г.). «Mycobacterium africanum: новый условно-патогенный микроорганизм при ВИЧ-инфекции?». СПИД . 19 (15): 1714–1715. DOI : 10.1097 / 01.aids.0000185991.54595.41 . PMID 16184053 .
- ^ Брош Р., Гордон С.В., Мармисс М. и др. (Март 2002 г.). «Новый эволюционный сценарий комплекса Mycobacterium tuberculosis » . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (6): 3684–9. Bibcode : 2002PNAS ... 99.3684B . DOI : 10.1073 / pnas.052548299 . PMC 122584 . PMID 11891304 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Изменчивость штамма в комплексе Mycobacterium tuberculosis: его роль в биологии, эпидемиологии и контроле . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019 . Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. DOI : 10.1007 / 978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632 .
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Изменчивость штамма в комплексе Mycobacterium tuberculosis: его роль в биологии, эпидемиологии и контроле . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019 . Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. DOI : 10.1007 / 978-3-319-64371-7_6 . ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632 .
- ^ де Йонг, В .; Hill, P .; Brookes, R .; Otu, J .; Петерсон, К .; Small, P .; Адегбола Р. (14 октября 2005 г.). «Mycobacterium africanum: новый условно-патогенный микроорганизм при ВИЧ-инфекции?». СПИД . 19 (15): 1714–1715. DOI : 10.1097 / 01.aids.0000185991.54595.41 . PMID 16184053 .
Библиография
- Скерман, ВБД; McGowan, V .; Sneath, PHA (январь 1980 г.). «Утвержденные списки бактериальных названий» . Int. J. Syst. Бактериол . 30 (1): 225–420. DOI : 10.1099 / 00207713-30-1-225 .
Внешние ссылки
- Mycobacterium africanum в браузере таксономии NCBI
- Типовой штамм Mycobacterium africanum в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию