Nitrosopumilus maritimus - чрезвычайно распространенный археон, обитающий в морской воде. Это первый представитель Таумархей Группы 1а, выделенный в чистой культуре. Последовательности генов предполагают, что таумархеи группы 1а распространены повсеместно в олиготрофных поверхностных водах океана и могут быть найдены в большинстве прибрежных морских вод по всей планете. [1] Это один из самых маленьких живых организмов диаметром 0,2 микрометра. Он живет за счет окисления аммиака до нитрита . N. maritimus способен окислять аммиак на уровне до 10 наномолярных единиц, что близко к пределу для поддержания его жизнедеятельности. [2] N. maritimusживет в бедных кислородом местообитаниях. Кислород, необходимый для окисления аммиака, может производиться новым путем, который генерирует кислород и диазот. [3] N. maritimus , таким образом, относится к организмам, способным производить кислород в темноте.
Нитрозопумилус | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | « Протеоархея » |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | Нитрозопумилус Qin et al. 2017 г. |
Типовой вид | |
Nitrosopumilus maritimus Qin et al. 2017 г. | |
Разновидность | |
| |
Синонимы | |
|
Этот организм был выделен из донных отложений в тропическом аквариуме Сиэтлского аквариума группой под руководством Дэвида Стала (Вашингтонский университет). [4] В таксономии , " Candidatus Nitrosopumilus" является родом из Nitrosopumilaceae . [5]
Таксономия
Кладограмма была взята из Annotree v1.2.0. [6] [7], который использует GTDB 05-RS95 ( База данных таксономии генома ). [8] [9]
Нитрозопумилус |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Рекомендации
- ^ Уокер, CB; де ла Торре, младший; Клотц, MG; Urakawa, H .; Pinel, N .; Арп, диджей; Brochier-Armanet, C .; Цепь, ПСЖ; Чан, ПП (11 мая 2010 г.). «Геном Nitrosopumilus maritimus раскрывает уникальные механизмы нитрификации и аутотрофии в глобально распространенных морских кренархиях» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (19): 8818–8823. Bibcode : 2010PNAS..107.8818W . DOI : 10.1073 / pnas.0913533107 . ISSN 1091-6490 . PMC 2889351 . PMID 20421470 .
- ^ http://www.physorg.com/news173538255.html Круговорот азота на планете, нарушенный «крошечной пожирателем аммиака морей» Ханной Хикки, 30 сентября 2009 г., первоначально на основе публикации Nature Уиллма Мартенса-Хаббены, Дэвида Штала
- ^ Крафт, Беате; Jehmlich, Нико; Ларсен, Мортен; Бристоу, Лаура; Коннеке, Мартин; Тамдруп, Бо; Кэнфилд, Дональд Э. (2021-04-01). «Производство кислорода археонами, окисляющими аммиак» . DOI : 10.1101 / 2021.04.01.436977 . Цитировать журнал требует
|journal=
( помощь ) - ^ Коннеке, Мартин; Бернхард, Энн Э .; де ла Торре, Хосе Р.; Уокер, Кристофер Б.; Уотербери, Джон Б.; Шталь, Дэвид А. (22 сентября 2005 г.). «Выделение автотрофного морского архея, окисляющего аммиак». Природа . 437 (7058): 543–546. Bibcode : 2005Natur.437..543K . DOI : 10,1038 / природа03911 . PMID 16177789 .
- ^ См. Веб-страницу NCBI " Candidatus Nitrosopumilus" . Данные извлечены из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 .
- ^ «AnnoTree v1.2.0» . AnnoTree .
- ^ Мендлер, К; Чен, Н; Парки, DH; Hug, LA; Докси, AC (2019). «AnnoTree: визуализация и исследование функционально аннотированного микробного древа жизни» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (9): 4442–4448. DOI : 10.1093 / NAR / gkz246 . PMC 6511854 . PMID 31081040 .
- ^ «ГТДБ выпуск 05-РС95» . База данных таксономии генома .
- ^ Парки, DH; Чувочина, М; Chaumeil, PA; Ринке, С; Mussig, AJ; Гугенгольц, П. (сентябрь 2020 г.). «Полная таксономия от домена к виду для бактерий и архей» . Природа Биотехнологии . 38 (9): 1079–1086. bioRxiv 10.1101 / 771964 . DOI : 10.1038 / s41587-020-0501-8 . PMID 32341564 . S2CID 216560589 .
дальнейшее чтение
Научные журналы
- Меткалф, WW; Гриффин, Б.М.; Cicchillo, RM; Gao, J .; Джанга, Южная Каролина; Кук, штат Гавайи; Чирчелло, ВТ; Evans, BS; Martens-Habbena, W .; Шталь Д.А.; Ван Дер Донк, Вашингтон (2012). «Синтез метилфосфоновой кислоты морскими микробами: источник метана в аэробном океане» . Наука . 337 (6098): 1104–1107. Bibcode : 2012Sci ... 337.1104M . DOI : 10.1126 / science.1219875 . PMC 3466329 . PMID 22936780 ..
- Райчулер, Кристоф; Линс, Филиппс; Вагнер, Андреас Отто; Илмер, Пол (октябрь 2014 г.). «Выращивание неэкстремофильных таумов и эвриархеот, рожденных из лунного молока, в смешанной культуре». Анаэроб . 29 (1): 73–9. DOI : 10.1016 / j.anaerobe.2013.10.002 . PMID 24513652 .
Научные книги
Научные базы данных
- Ссылки PubMed по Nitrosopumilus
- Ссылки PubMed Central на Nitrosopumilus
- Ссылки Google Scholar для Nitrosopumilus
Внешние ссылки
- Страница таксономии NCBI для Nitrosopumilus
- Поиск по страницам таксономии "Древо жизни" для Nitrosopumilus
- 2000 страниц для Nitrosopumilus
- Страница MicrobeWiki для Nitrosopumilus
- Страница LPSN для Nitrosopumilus