| Нитроспиры | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | Нитроспиры Гаррити и Холт 2001 |
| Класс: | Нитроспирия |
| Заказ: | Нитроспиралы |
| Семья: | Nitrospiraceae |
| Роды | |
| |
| Синонимы | |
| |
Нитроспиры - это тип бактерий. Он содержит только один класс, Nitrospira , который сам включает один отряд ( Nitrospirales ) и одно семейство ( Nitrospiraceae ). Он включает несколько родов, например самый крупный из них - Nitrospira . Первый член этого типа, Nitrospira marina , был открыт в 1985 году. [1] Второй член, Nitrospira moscoviensis , был обнаружен в 1995 году. [2] [3]
Нитроспиры содержат нитрифицирующие таксоны, которые окисляют нитрит до нитрата (нитритокисляющие бактерии, NOB [4] ), и коммамокс- бактерии Nitrospira inopinata, открытые в 2015 году [5] [6] и культивированные в 2017 году [7]
Филогения [ править ]
Филогения основана на работе All-Species Living Tree Project . [8]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Таксономия [ править ]
В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN) [9] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [3]
- Тип " Nitrospirae " Garrity & Holt 2001 [Nitrospiraeota Oren et al. 2015]
- Класс Nitrospiria Oren et al. 2015 [«Нитроспира»]
- Заказать « Нитроспиралес »
- Семья « Nitrospiraceae »
- Род « Candidatus Magnetobacterium » Весна и др. 1993 г.
- Виды " Ca. M. bavaricum " Spring et al. 1993 г.
- Вид " Ca. M. casensis " Lin et al. 2014 г.
- Род « Candidatus Magnetoovum » Лефевр и др. 2011 г.
- Вид " Ca. M. mohavensis " Lefevre et al. 2011 г.
- Вид " Ca. M. chiemensis " Колинко 2014 г.
- Род Leptospirillum (ex Markosyan 1972) Hippe 2000
- Виды L. ferrodiazotrophum ♠ Tyson et al. 2005 г.
- Виды L. rubarum ♠ Алиага Гольцман и др. 2009 г.
- Виды L. thermoferrooxidans Hippe 2000
- Виды L. ferriphilum Coram and Rawlings, 2002 г.
- Вид L. ferrooxidans (ex Markosyan 1972) Hippe 2000 (тип sp.)
- Род Nitrospira Watson et al. 1986 г.
- Вид " Ca. N. bockiana " ♠ Лебедева и др. 2008 г.
- Вид " Ca. N. inopinata " ♠ Daims et al. 2015 г.
- Виды " Ca. N. nitrificans " ♠ van Kessel et al. 2015 г.
- Виды " Ca. N. nitrosa " ♠ van Kessel et al. 2015 г.
- Виды " Ca. N. salsa " ♠ Haaijer et al. 2013
- Виды N. calida ♠ Lebedeva et al. 2011 г.
- Виды N. defluvii ♠ Nowka et al. 2015 [" Candidatus Nitrospira defluvii " Spieck et al. 2006 ]
- Виды N. japonica ♠ Ushiki et al. 2013
- Виды N. lenta Nowka et al. 2015 г.
- Виды N. marina Watson et al. 1986 (тип sp.)
- Виды N. moscoviensis Ehrich et al. 1995 г.
- Виды N. inopinata Daims et al. 2015, ван Кессель и др. 2015 г.
- Род Thermodesulfovibrio Henry et al. 1994 исправление. Sekiguchi et al. 2008 г.
- Виды T. aggregans Sekiguchi et al. 2008 г.
- Виды T. Hydrogeniphilus Haouari et al. 2009 г.
- Виды T. islandicus Sonne-Hansen and Ahring 2000
- Виды T. thiophilus Sekiguchi et al. 2008 г.
- Виды T. yellowstonii Henry et al. 1994 (тип sp.)
- Род « Candidatus Magnetobacterium » Весна и др. 1993 г.
- Семья « Nitrospiraceae »
- Заказать « Нитроспиралес »
- Класс Nitrospiria Oren et al. 2015 [«Нитроспира»]
Примечания:
♠ Штамм обнаружен в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не включен в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)
См. Также [ править ]
- Нитроспира
- Нитросомонады
- Nitrobacteraceae
- Нитробактер
- Азотный цикл
- Нитриты
- Нитрат
- Список бактериальных заказов
- Comammox
Ссылки [ править ]
- ^ Watson SW, Bock E, Валуа FW, Уотербери JB, Шлоссер U (1986). «Nitrospira marina gen. Nov. Sp. Nov .: хемолитотрофная нитритокисляющая бактерия». Arch Microbiol . 144 (1): 1–7. DOI : 10.1007 / BF00454947 . S2CID 29796511 .
- ^ Ehrich S, Бехренс Д, Е Лебедева, Людвиг Вт, Бок Е (июль 1995 года). «Новая облигатно хемолитоавтотрофная нитритокисляющая бактерия, Nitrospira moscoviensis sp. Nov. И ее филогенетические отношения». Архив микробиологии . 164 (1): 16–23. DOI : 10.1007 / BF02568729 . PMID 7646315 . S2CID 2702110 .
- ^ а б Сэйерс. «Нитроспира» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2016 .
- ^ Формуле изобретени Н, Нильсен ДЛ, Нильсен PH, Шлейфер КН, Вагнер М (ноябрь 2001 г.). «In situ характеристика нитроспираподобных нитритокисляющих бактерий, действующих на очистных сооружениях» . Прикладная и экологическая микробиология . 67 (11): 5273–84. DOI : 10,1128 / AEM.67.11.5273-5284.2001 . PMC 93301 . PMID 11679356 .
- ^ Daims H, Lebedeva EV, Pjevac P, Han P, Herbold C, Albertsen M и др. (Декабрь 2015 г.). «Полная нитрификация бактериями Nitrospira» . Природа . 528 (7583): 504–9. Bibcode : 2015Natur.528..504D . DOI : 10,1038 / природа16461 . PMC 5152751 . PMID 26610024 .
- ^ van Kessel MA, Speth DR, Albertsen M, Nielsen PH, Op den Camp HJ, Kartal B, et al. (Декабрь 2015 г.). «Полная нитрификация одним микроорганизмом» . Природа . 528 (7583): 555–9. Bibcode : 2015Natur.528..555V . DOI : 10,1038 / природа16459 . PMC 4878690 . PMID 26610025 .
- ^ Наборы KD, Sedlacek CJ, Lebedeva EV, Han P, Bulaev A, Pjevac P, et al. (Сентябрь 2017 г.). «Кинетический анализ полного нитрификатора показывает олиготрофный образ жизни» . Природа . 549 (7671): 269–272. Bibcode : 2017Natur.549..269K . DOI : 10.1038 / nature23679 . PMC 5600814 . PMID 28847001 .
- ^ «Выпуск 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF) . Silva Полная база данных рибосомных РНК . Проверено 20 марта 2016 .
- ^ Euzéby JP. «Нитроспира» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) . Проверено 20 марта 2016 .
Дальнейшее чтение [ править ]
- Lefèvre CT, Frankel RB, Abreu F, Lins U, Bazylinski DA (февраль 2011 г.). «Культурно-независимая характеристика нового, некультивируемого магнитотаксического члена филума Nitrospirae» . Экологическая микробиология . 13 (2): 538–49. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2010.02361.x . PMID 20977572 .
Внешние ссылки [ править ]
- « Leptospirillum sp.» .
