Ортобунявирус | |
---|---|
Структура ортобунявируса (слева); просвечивающая электронная микрофотография из Калифорнии вируса энцефалита (справа) | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Класс: | Ellioviricetes |
Заказ: | Буньявиралес |
Семья: | Peribunyaviridae |
Род: | Ортобунявирус |
Типовой вид | |
Ортобуньявирус Буньямвера | |
Виды [1] | |
Orthobunyavirus является родом из Peribunyaviridae семьи [2] в порядке Bunyavirales . В настоящее время известно около 170 вирусов этого рода. Они были объединены в 97 видов [1] и 20 серогрупп.
Название Orthobunyavirus происходит от Bunyamwera , Уганда , [3] где впервые был обнаружен оригинальный типовой вид Bunyamwera orthobunyavirus [4] вместе с приставкой orthos ( ορϑοϛ ), означающей «прямой». [5]
В типовом виде является Bunyamwera orthobunyavirus .
Эпидемиология [ править ]
Род наиболее разнообразен в Африке , Австралии и Океании , но встречается почти во всем мире. Большинство видов ортобуниавирусов передаются комарами и вызывают болезни крупного рогатого скота . [ Править ] В Калифорнии вирус энцефалита , то вирус La Crosse и вирус Джеймстаун Каньон являются североамериканские виды , которые вызывают энцефалит у людей.
Вирусология [ править ]
- Типовой вид - Bunyamwera orthobunyavirus . [6]
- Вирус имеет сферическую форму, диаметр от 80 до 120 нм, и состоит из трех одноцепочечных молекул РНК с отрицательным смыслом, инкапсулированных в рибонуклеокапсид . [7]
- Три РНК описаны как S, M и L (для малых, средних и больших) и имеют длину около 1 килобаз, 4,5 и 6,9 килобайт [8] [7] [9]
- S-РНК кодирует белок нуклеокапсид (белок N) и неструктурный белок (белок NS). [10]
- М-РНК кодирует полипротеин, который расщепляется протеазой хозяина на белки Gn, NSm и Gc. [7]
- L-РНК кодирует вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу или L-белок [11]
Жизненный цикл [ править ]
Векторы [ править ]
Первичные векторы Orthobunyaviruses являются гематофагами насекомых Culicidae семьи, в том числе членов от ряда комаров родов (включая Aedes , Coquillettidia , Culex , комар жгучий , и Anopheles ) и мокрецы (такие как Culicoides paraensis ). [12] [9] Хотя также может происходить передача клещами и постельными клопами. Предпочтение вирусных векторов обычно строгое, только один или очень небольшое количество векторов передают конкретный вирус в регионе, даже если несколько вирусов и векторов перекрываются. [13]Организмы, относящиеся к предпочтительному переносчику, могут переносить вирус, но не могут передавать его компетентно. [9]
Членистоногие-переносчики заражаются вирусом во время приема пищи с кровью инфицированного хозяина. У комаров репликация ортобуньявирусов усиливается за счет иммунной модуляции, которая происходит в результате переваривания белков крови, продуцирующих ГАМК, и активации ГАМКергической передачи сигналов. [14] Инфекция передается новому хозяину через вирусные частицы в слюне переносчиков. [14] Инфекция ортобуниавируса в клетках членистоногих до конца не изучена, но, как правило, не является цитопатологическим и вредные эффекты минимальны. [15] [13] Зараженные комары могут улучшить физическую форму. [13]Трансорвариальная передача наблюдалась среди москитов, инфицированных ортобуньявирусами калифорнийской серогруппы [9]. Как и у комаров, только самки куликоидных мошек питаются кровью; они предпочитают кормление в помещении, особенно во время дождя. [9]
Sylvatic Cycle Hosts [ править ]
В сливатическом цикле вирусы передаются между млекопитающими-хозяевами посредством членистоногих векторов. В качестве хозяев или резервуаров ортобуньявирусов был идентифицирован широкий спектр млекопитающих, включая приматов, ленивцев, диких и домашних птиц, мартышек, грызунов и крупных млекопитающих, таких как олени, лоси и лоси. [12] [9]
Инфекция [ править ]
Заражение начинается с укуса инфицированного компетентного переносчика. Проникновение вируса происходит посредством рецептор-опосредованного (клатрин-зависимого) эндоцитоза, но рецепторы неизвестны. [15] Хотя гепарансульфат и DC-SIGN (CD209 или дендритная клетка- специфическая молекула внутриклеточной адгезии-3-захватывающий неинтегрин) были идентифицированы как компоненты проникновения вируса в некоторых ортобуньявирусах. [13] [15] Гетеродимеры Gn / Gc на вирусной поверхности ответственны за распознавание клеток-мишеней [16], при этом Gc считается первичным белком прикрепления, хотя Gn был предложен как белок прикрепления для LACV в клетках членистоногих. [13]Подкисление эндосомы запускает конформационные изменения в слитом пептиде Gc, освобождая рибонуклеарный белок (RNP), когда он высвобождается в цитоплазму. [16]
После высвобождения в цитоплазму первичная транскрипция начинается с того, что эндонуклеазный домен на L-белке участвует в процессе, известном как «отрывание крышки». [13] [16] Во время захвата кэпа 10-18 нуклеотидов 5'-7-метилгуанилатных праймеров отщепляются от мРНК хозяина и присоединяются к 5'-концу вирусных РНК. [9] Как и все РНК-вирусы с отрицательным смыслом, ортобуньявирусы требуют постоянной параллельной трансляции клеткой-хозяином для получения полноразмерных вирусных мРНК, следовательно, 3'-конец мРНК ортобуньявируса лишен полиаденилирования . [9] Примечательно, что у них также отсутствует сигнал полиаденилирования; вместо этого считается, что 3'-концы образуют структуру стержень-петля. [9] [13]Антигеномы (полноразмерные позитивные РНК), используемые в качестве матриц для репликации вирусного генома, продуцируются L-белком RdRp без необходимости использования праймеров. [9] И геномы с отрицательным смыслом, и антигеномы с положительным смыслом связаны с N-белками (образующими RNP) на всех этапах цикла репликации. [17] Таким образом, N и L являются минимальным количеством белков, необходимых для транскрипции и репликации [16] [13]
Сегмент генома M кодирует полипротеин Gn-NSm-Gc в единственной открытой рамке считывания (ORF), кото-рый котрансляционно расщепляется внутренними сигнальными пептидами и сигнальной пептидазой хозяина. [16] [9] Свободные гликопротеины Gc и Gn вставляются в мембрану эндоплазматического ретикулума и образуют гетеродимеры. Сигнал удержания Гольджи на Gn позволяет транспортировать гетеродимеры к аппарату Гольджи, где происходит гликозилирование. Присутствие вирусных гликопротеинов модифицирует мембрану Гольджи, чтобы сделать возможным отпочкование РНП в производную Гольджи трубчатую вирусную фабрику ( вироплазму ). [15] [9]Ортобуйнавирусы, как сегментированные вирусы, требуют точной упаковки одного из трех геномных сегментов в конечный вирион для получения зрелой инфекционной частицы. Кажется, что упаковкой управляют сигналы, полностью содержащиеся в последовательностях UTR. [13] Упакованные геномы приобретают липидную мембрану по мере того, как они попадают в вирусные фабрики, затем транспортируются к плазматической мембране клетки-хозяина и высвобождаются посредством экзоцитоза. Последняя модификация гилкопротеина при высвобождении дает зрелую инфекционную частицу. [13]
Эволюция [ править ]
Ортобунявирусы частично эволюционируют с помощью ключевого механизма, известного как геномная реассортация, который также имеет место в других сегментированных вирусах. Когда вирусы одной и той же группы одновременно инфицируют клетку-хозяина, могут образовываться смеси и новые комбинации сегментов S, M и L, увеличивая разнообразие. Наиболее частые события перераспределения связаны с сегментами L и S. [18]
Таксономия [ править ]
Виды [ править ]
Таксономия остается несколько гибкой, поскольку секвенировано относительно немного вирусных геномов этого рода. Было показано, что некоторые из перечисленных вирусов являются рекомбинантами других вирусов и могут быть переклассифицированы. В роду 88 видов: [1]
- Акара ортобуньявирус
- Айно ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Акабане
- Ортобуньявирус Алахуэлы
- Анадырь ортобунявирус
- Анхемби ортобуньявирус
- Anopheles A orthobunyavirus
- Ортобуньявирус Anopheles B
- Бакау ортобуньявирус
- Батайский ортобуньявирус
- Батама ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Bellavista
- Беневидес ортобуньявирус
- Бертиога ортобуньявирус
- Бимити ортобуньявирус
- Бирао ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Botambi
- Бозо ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Буньямвера
- Ортобуньявирус кустарника
- Ортобуниавирус пуговичной ивы
- Бвамба ортобуньявирус
- Ортобуниавирус Cache Valley
- Ортобуньявирус Cachoeira Porteira
- Ортобуньявирус Калифорнийского энцефалита
- Capim orthobunyavirus
- Ортобуньявирус карапару
- Кошка Que ортобуньявирус
- Кату ортобуньявирус
- Энсеада ортобуньявирус
- Фейсис загон ортобуньявирус
- Ортобунявирус форта Шерман
- Гамбоа ортобуньявирус
- Ортобуньявирус гуахары
- Гуама ортобуньявирус
- Ортобуньявирус гуароа
- Яко ортобуньявирус
- Илеша ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Ingwavuma
- Ортобуньявирус Джеймстаунского каньона
- Ортобуньявирус ятобала
- Kaeng Khoi orthobunyavirus
- Кайри ортобуньявирус
- Краеугольный ортобуниавирус
- Кунгол ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Ла-Кросс
- Ортобуниавирус Leanyer
- Lumbo orthbunyavirus
- Ортобуньявирус макауа
- Мадридский ортобуньявирус
- Ортобуниавирус магуари
- Ортобуниавирус главного стока
- Manzanilla orthobunyavirus
- Маритуба ортобуньявирус
- Мелао ортобуньявирус
- Ортобунявирус мермет
- Минатитлан ортобуньявирус
- MPoko orthobunyavirus
- Няндо ортобуньявирус
- Олифанцвлей ортобуньявирус
- Орибока ортобуньявирус
- Оропуш ортобуньявирус
- Патуа ортобуньявирус
- Ортобунявирус торфяника
- Ортобунявирус Потоси
- Сабо ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Сан-Анджело
- Санго ортобуньявирус
- Ортобуниавирус Шмалленберга
- Серра-ду-Навио ортобуньявирус
- Шуни ортобуньявирус
- Симбу ортобуньявирус
- Заяц на снегоступах ортобунявирус
- Соророка ортобуньявирус
- Tacaiuma orthobunyavirus
- Тахина ортобуньявирус
- Татагинэ ортобуньявирус
- Ортобунявирус Tensaw
- Тете ортобуньявирус
- Ортобуньявирус тимири
- Ортобуньявирус Тимботуа
- Trivittatus orthobunyavirus
- Ортобунявирус турлока
- Утинга ортобуньявирус
- Витватерсранд ортобуньявирус
- Ортобуньявирус Волькберга
- Виемия ортобуньявирус
- Зегла ортобуньявирус
Организовано серогруппами [ править ]
Восемнадцать серогрупп были идентифицированы на основе результатов ингибирования перекрестной гемагглютинации и нейтрализации антител. Другой - Виемия - с тех пор был признан. Некоторые вирусы еще не отнесены к одной из серогрупп. Серогруппа Симбу является самой крупной и насчитывает не менее 25 членов. Серогруппа группы C состоит как минимум из 13 человек. Важные с медицинской точки зрения вирусы относятся к серогруппам Bwamba, Bunyamwera, California, Group C и Simbu.
Анофелес А серогруппы
- Вирус Anopheles A
- Вирус такайума
- Вирус реки Вирджин
- Комплекс Тромбетас
- Вирус Аруматеуа
- Вирус Караипе
- Вирус тромбета
- Вирус Тукуруи
Anopheles B серогруппы
- Вирус Anopheles B
- Вирус борацеи
Бакау серогруппа
- Вирус Бакау
- Вирус нола
Серогруппа Буньямвера
- Вирус Бирао
- Бозо вирус
- Вирус Буньямвера
- Вирус долины кешей
- Вирус форта Шерман
- Вирус Джермистон
- Вирус гуароа
- Вирус Илеши
- Кайри вирус
- Вирус Магуари
- Вирус Main Drain
- Локерн вирус
- Вирус Northway
- Playas вирус
- Вирус Потоси
- Вирус шокве
- Стэнфилд вирус
- Вирус Тенсо
- Вирус Xingu
- Батайский комплекс
- Batai вирус
- Чалово вирус
- Chittoor вирус
- Комплекс Нгари
- Вирус Гарисса
- КВ-141 вирус
- Вирус Нгари
Бвамба серогруппа
- Вирус Бвамба
- Вирус понгола
Калифорнийская серогруппа
- Вирус калифорнийского энцефалита
- Вирус чатанги
- Inkoo вирус
- Вирус Джеймстаунского каньона
- Вирус Джерри Слау
- Keystone вирус
- Хатангский вирус
- Вирус Ла Кросса
- Lumbo вирус
- Вирус Мелао
- Вирус Морро Бэй
- Вирус Сан-Анджело
- Серра-ду-Навио вирус
- Вирус зайца-снегоступа
- Вирус Саут-Ривер
- Вирус тахина
- Вирус Trivittatus
Капим серогруппа
- Акара вирус
- Беневидес вирус
- Capim вирус
Серогруппа гамбоа
- Вирус Алахуэла
- Вирус гамбоа
- 75V 2621 штамм вируса
- Вирус Пуэбло Вьехо
- Вирус Сан-Хуан
Группа C серогруппа
- Вирус Bruconha
- Осса вирус
- Комплекс Карапару
- Вирус апеу
- Вирус Bruconha
- Вирус Карапару
- Винсес вирус
- Мадридский комплекс
- Мадридский вирус
- Комплекс Маритуба
- Гамбо-вирус лимбо
- Вирус Маритуба
- 63U-11 вируса штамма
- Вирус Мурутюку
- Непуйо вирус
- Вирус Рестана
- Орибока комплекс
- Вирус Итаки
- Орибока вирус
Серогруппа Гуама
- Вирус ананиндеуа
- Вирус Бертиога
- Вирус Бимити
- Вирус кананеи
- Кату вирус
- Вирус Ган Гана
- Вирус Гуама
- Вирус Гуаратуба
- Итимирим вирус
- Вирус гамака красного дерева
- Вирус Мирим
- Вирус Тимботуа
- Вирус Трубанамана
Кунгол серогруппа
- Кунгол вирус
- Вонгал вирус
Маппутта серогруппа
- Вирус Buffalo Creek
- Вирус Маппутта
- Вирус Маприк
- Вирус Муррамбиджи
- Вирус солевой золы
Минатитлан серогруппа
- Вирус Минатитлан
- Вирус Палестины
Ньяндо серогруппа
- Вирус эретмаподитов
- Вирус Нямдо
Олифанстлей серогруппа
- Вирус Ботамби
- Olifanstlei вирус
Патуа серогруппа
- Вирус абраса
- Вирус Бабахойо
- Вирус Пахайоке
- Патуа вирус
- Вирус Shark River
- Zegla вирус
Симбу серогруппа
- Вирус Икитос
- Вирус Ятобаль
- Вирус Leanyer
- Вирус Мермет
- Оя вирус
- Вирус тимири
- Серокомплекс Акабане
- Вирус Акабане
- Вирус Тинару
- Серокомплекс оропуша
- Вирус Мадре де Диос (MDDV)
- Вирус Оропуш
- Серокомплекс Sathuperi
- Вирус Дугласа
- Вирус Sathuperi
- Серокомплекс Шамонда
- Вирус торфа
- Вирус Шамонда
- Серокомплекс шуни
- Вирус Айно
- Вирус шуни
- Комплекс Симбу
- Вирус Шмалленберга [19]
- Симбу вирус
Тете серогруппа
- Вирус Bahig
- Вирус Батама
- Вирус Матруха
- Тете вирус
- Цурусский вирус
- Вирус Велдона
Серогруппа турлока
- Кедах вирус
- Вирус Леднице
- M'Poko вирус
- Вирус Turlock
- Вирус Umbre
Виемия серогруппа
- Вирус Анхемби
- Вирус Cachoeira Porteira
- Вирус Иако
- Вирус макауа
- Соророка вирус
- Вирус Тайассуи
- Вирус Тукундуба
- Виемия вирус
Неклассифицированный
- Вирус Батама
- Вирус Беллависта
- Вирус Бельмона
- Энсеада вирус
- Эстеро Реал вирус
- Вирус Герберта
- Jonchet вирус
- Юрона вирус
- Вирус Kaeng Khei
- Вирус Кибале
- Вирус Кованьяма
- Вирус Mojuí dos Campos
- Вирус Нтветве [20]
- Вирус Taï
- Tataguine вирус
- Вирус Тринити
- Вирус Витватерсранда
- Вирус Волькберга
- Вирус Якааба
Ссылки [ править ]
- ^ a b c «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.» . talk.ictvonline.org . Международный комитет по таксономии вирусов . Дата обращения 6 мая 2020 .
- ^ Хьюз, HR; Адкинс, S; Альховский, С; Пиво, M; Блэр, C; Калишер, Швейцария; Дребот, М; Ламберт, AJ; де Соуза, штат Висконсин; Marklewitz, M; Nunes, MRT; Shí 石晓宏, X; Консорциум отчетов ICTV (январь 2020 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Peribunyaviridae " . Журнал общей вирусологии . 101 (1): 1-2. DOI : 10,1099 / jgv.0.001365 . PMC 7414433 . PMID 31846417 .
- ^ a b "Отчет ICTV Peribunyaviridae" .
- ^ Smithburn KC, Haddow AJ, Mahaffy AF (март 1946 г.). «Нейротропный вирус, выделенный из комаров Aedes, пойманных в лесу Семлики». Американский журнал тропической медицины и гигиены . 26 (2): 189–208. DOI : 10.4269 / ajtmh.1946.s1-26.189 . OCLC 677158400 . PMID 21020339 .
- Перейти ↑ Griffith C (2005). «Словарь ботанических эпитетов» . Словарь ботанических эпитетов . Проверено 31 января 2019 года .
orthos orth adj ορϑοϛ прямо
- ^ "Международный комитет по таксономии вирусов, Bunyaviridae" . bio-mirror.cn . Архивировано из оригинала 9 сентября 2013 года . Проверено 20 декабря 2018 года .
- ^ a b c "Страница ViralZone" . viralzone.expasy.org . Проверено 20 декабря 2018 года .
- ^ Kascsak RJ, Lyons MJ (октябрь 1977). «Вирус Буньямвера. I. Молекулярная сложность РНК вириона». Вирусология . 82 (1): 37–47. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (77) 90030-7 . PMID 898678 .
- ^ Б с д е е г ч я J K L Эванс А.Б., Петерсон КА (август 2019). «Выбросьте карту: нейропатогенез глобально расширяющейся калифорнийской серогруппы ортобуньявирусов» . Вирусы . 11 (9): 794. DOI : 10,3390 / v11090794 . PMC 6784171 . PMID 31470541 .
- ^ Genbank: сегмент S вируса Bunyamwera, полная последовательность
- ^ Genbank: сегмент L вируса Bunyamwera, полная последовательность
- ^ a b Sakkas H, Bozidis P, Franks A, Papadopoulou C (апрель 2018 г.). «Лихорадка оропуша: обзор» . Вирусы . 10 (4): 175. DOI : 10,3390 / v10040175 . PMC 5923469 . PMID 29617280 .
- ^ a b c d e f g h i j Elliott RM (октябрь 2014 г.). «Ортобунявирусы: последние генетические и структурные открытия» . Обзоры природы. Микробиология . 12 (10): 673–85. DOI : 10.1038 / nrmicro3332 . PMID 25198140 .
- ↑ a b Wu P, Yu X, Wang P, Cheng G (март 2019). «Жизненный цикл арбовируса у комаров: приобретение, распространение и передача» . Обзоры экспертов в области молекулярной медицины . 21 : e1. DOI : 10.1017 / erm.2018.6 . PMID 30862324 .
- ^ a b c d Дутузе М.Ф., Нзаирамбахо М., Морес С.Н., Кристоферсон Р.К. (2018-04-12). «Ортобунявирусы с потенциальными последствиями для здоровья» . Границы ветеринарии . 5 : 69. DOI : 10,3389 / fvets.2018.00069 . PMC 5906542 . PMID 29707545 .
- ^ а б в г д Павайя Р.В., Гупта В.К. (21.11.2013). «Обзор инфекции вируса Шмалленберга: недавно возникшее заболевание крупного рогатого скота, овец и коз» . Veterinární Medicína . 58 (10): 516–526. DOI : 10,17221 / 7083-vetmed . ISSN 0375-8427 .
- ↑ Zheng W, Tao YJ (май 2013 г.). «Инкапсидация генома нуклеопротеинами ортобуниавируса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (22): 8769–70. Bibcode : 2013PNAS..110.8769Z . DOI : 10.1073 / pnas.1306838110 . PMC 3670359 . PMID 23696659 .
- ^ да Роса, Хорхе Фернандо Травассос; де Соуза, Уильям Марсель; де Паула Пиньейро, Франсиско; Фигейредо, Марио Луис; Кардосо, Джедсон Феррейра; Акрани, Густаво Ольшанский; Нуньес, Марсио Роберто Тейшейра (06.02.2017). «Вирус оропуша: клинические, эпидемиологические и молекулярные аспекты забытого ортобуньявируса» . Американский журнал тропической медицины и гигиены . 96 (5): 16–0672. DOI : 10.4269 / ajtmh.16-0672 . ISSN 0002-9637 . PMC 5417190 . PMID 28167595 .
- ^ Nachrichten, n-tv. "Unbekanntes Virus entdeckt" . n-tv.de . Проверено 20 декабря 2018 года .
- ^ Эдридж А.В., Дейс М., Намаззи Р., Кристелла С., Джеббинк М.Ф., Маурер И. и др. (Январь 2019). «Новый ортобуньявирус, обнаруженный в спинномозговой жидкости ребенка из Уганды с тяжелой энцефалопатией» . Клинические инфекционные болезни . 68 (1): 139–142. DOI : 10,1093 / CID / ciy486 . PMC 6293039 . PMID 29893821 .
Внешние ссылки [ править ]
- Отчет ICTV : Peribunyaviridae
- Viralzone : ортобуниавирус