Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Orthobunyavirus является родом из Peribunyaviridae семьи [2] в порядке Bunyavirales . В настоящее время известно около 170 вирусов этого рода. Они были объединены в 97 видов [1] и 20 серогрупп.

Название Orthobunyavirus происходит от Bunyamwera , Уганда , [3] где впервые был обнаружен оригинальный типовой вид Bunyamwera orthobunyavirus [4] вместе с приставкой orthos ( ορϑοϛ ), означающей «прямой». [5]

В типовом виде является Bunyamwera orthobunyavirus .

Эпидемиология [ править ]

Род наиболее разнообразен в Африке , Австралии и Океании , но встречается почти во всем мире. Большинство видов ортобуниавирусов передаются комарами и вызывают болезни крупного рогатого скота . [ Править ] В Калифорнии вирус энцефалита , то вирус La Crosse и вирус Джеймстаун Каньон являются североамериканские виды , которые вызывают энцефалит у людей.

Вирусология [ править ]

Геном вируса Буньямвера рода Orthosbunyavirus [3]
  • Типовой вид - Bunyamwera orthobunyavirus . [6]
  • Вирус имеет сферическую форму, диаметр от 80 до 120 нм, и состоит из трех одноцепочечных молекул РНК с отрицательным смыслом, инкапсулированных в рибонуклеокапсид . [7]
  • Три РНК описаны как S, M и L (для малых, средних и больших) и имеют длину около 1 килобаз, 4,5 и 6,9 килобайт [8] [7] [9]
  • S-РНК кодирует белок нуклеокапсид (белок N) и неструктурный белок (белок NS). [10]
  • М-РНК кодирует полипротеин, который расщепляется протеазой хозяина на белки Gn, NSm и Gc. [7]
  • L-РНК кодирует вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу или L-белок [11]

Жизненный цикл [ править ]

Векторы [ править ]

Первичные векторы Orthobunyaviruses являются гематофагами насекомых Culicidae семьи, в том числе членов от ряда комаров родов (включая Aedes , Coquillettidia , Culex , комар жгучий , и Anopheles ) и мокрецы (такие как Culicoides paraensis ). [12] [9] Хотя также может происходить передача клещами и постельными клопами. Предпочтение вирусных векторов обычно строгое, только один или очень небольшое количество векторов передают конкретный вирус в регионе, даже если несколько вирусов и векторов перекрываются. [13]Организмы, относящиеся к предпочтительному переносчику, могут переносить вирус, но не могут передавать его компетентно. [9]

Членистоногие-переносчики заражаются вирусом во время приема пищи с кровью инфицированного хозяина. У комаров репликация ортобуньявирусов усиливается за счет иммунной модуляции, которая происходит в результате переваривания белков крови, продуцирующих ГАМК, и активации ГАМКергической передачи сигналов. [14] Инфекция передается новому хозяину через вирусные частицы в слюне переносчиков. [14] Инфекция ортобуниавируса в клетках членистоногих до конца не изучена, но, как правило, не является цитопатологическим и вредные эффекты минимальны. [15] [13] Зараженные комары могут улучшить физическую форму. [13]Трансорвариальная передача наблюдалась среди москитов, инфицированных ортобуньявирусами калифорнийской серогруппы [9]. Как и у комаров, только самки куликоидных мошек питаются кровью; они предпочитают кормление в помещении, особенно во время дождя. [9]

Sylvatic Cycle Hosts [ править ]

В сливатическом цикле вирусы передаются между млекопитающими-хозяевами посредством членистоногих векторов. В качестве хозяев или резервуаров ортобуньявирусов был идентифицирован широкий спектр млекопитающих, включая приматов, ленивцев, диких и домашних птиц, мартышек, грызунов и крупных млекопитающих, таких как олени, лоси и лоси. [12] [9]

Инфекция [ править ]

Заражение начинается с укуса инфицированного компетентного переносчика. Проникновение вируса происходит посредством рецептор-опосредованного (клатрин-зависимого) эндоцитоза, но рецепторы неизвестны. [15] Хотя гепарансульфат и DC-SIGN (CD209 или дендритная клетка- специфическая молекула внутриклеточной адгезии-3-захватывающий неинтегрин) были идентифицированы как компоненты проникновения вируса в некоторых ортобуньявирусах. [13] [15] Гетеродимеры Gn / Gc на вирусной поверхности ответственны за распознавание клеток-мишеней [16], при этом Gc считается первичным белком прикрепления, хотя Gn был предложен как белок прикрепления для LACV в клетках членистоногих. [13]Подкисление эндосомы запускает конформационные изменения в слитом пептиде Gc, освобождая рибонуклеарный белок (RNP), когда он высвобождается в цитоплазму. [16]

После высвобождения в цитоплазму первичная транскрипция начинается с того, что эндонуклеазный домен на L-белке участвует в процессе, известном как «отрывание крышки». [13] [16] Во время захвата кэпа 10-18 нуклеотидов 5'-7-метилгуанилатных праймеров отщепляются от мРНК хозяина и присоединяются к 5'-концу вирусных РНК. [9] Как и все РНК-вирусы с отрицательным смыслом, ортобуньявирусы требуют постоянной параллельной трансляции клеткой-хозяином для получения полноразмерных вирусных мРНК, следовательно, 3'-конец мРНК ортобуньявируса лишен полиаденилирования . [9] Примечательно, что у них также отсутствует сигнал полиаденилирования; вместо этого считается, что 3'-концы образуют структуру стержень-петля. [9] [13]Антигеномы (полноразмерные позитивные РНК), используемые в качестве матриц для репликации вирусного генома, продуцируются L-белком RdRp без необходимости использования праймеров. [9] И геномы с отрицательным смыслом, и антигеномы с положительным смыслом связаны с N-белками (образующими RNP) на всех этапах цикла репликации. [17] Таким образом, N и L являются минимальным количеством белков, необходимых для транскрипции и репликации [16] [13]

Сегмент генома M кодирует полипротеин Gn-NSm-Gc в единственной открытой рамке считывания (ORF), кото-рый котрансляционно расщепляется внутренними сигнальными пептидами и сигнальной пептидазой хозяина. [16] [9] Свободные гликопротеины Gc и Gn вставляются в мембрану эндоплазматического ретикулума и образуют гетеродимеры. Сигнал удержания Гольджи на Gn позволяет транспортировать гетеродимеры к аппарату Гольджи, где происходит гликозилирование. Присутствие вирусных гликопротеинов модифицирует мембрану Гольджи, чтобы сделать возможным отпочкование РНП в производную Гольджи трубчатую вирусную фабрику ( вироплазму ). [15] [9]Ортобуйнавирусы, как сегментированные вирусы, требуют точной упаковки одного из трех геномных сегментов в конечный вирион для получения зрелой инфекционной частицы. Кажется, что упаковкой управляют сигналы, полностью содержащиеся в последовательностях UTR. [13] Упакованные геномы приобретают липидную мембрану по мере того, как они попадают в вирусные фабрики, затем транспортируются к плазматической мембране клетки-хозяина и высвобождаются посредством экзоцитоза. Последняя модификация гилкопротеина при высвобождении дает зрелую инфекционную частицу. [13]

Эволюция [ править ]

Ортобунявирусы частично эволюционируют с помощью ключевого механизма, известного как геномная реассортация, который также имеет место в других сегментированных вирусах. Когда вирусы одной и той же группы одновременно инфицируют клетку-хозяина, могут образовываться смеси и новые комбинации сегментов S, M и L, увеличивая разнообразие. Наиболее частые события перераспределения связаны с сегментами L и S. [18]

Таксономия [ править ]

Виды [ править ]

Таксономия остается несколько гибкой, поскольку секвенировано относительно немного вирусных геномов этого рода. Было показано, что некоторые из перечисленных вирусов являются рекомбинантами других вирусов и могут быть переклассифицированы. В роду 88 видов: [1]

  • Акара ортобуньявирус
  • Айно ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус Акабане
  • Ортобуньявирус Алахуэлы
  • Анадырь ортобунявирус
  • Анхемби ортобуньявирус
  • Anopheles A orthobunyavirus
  • Ортобуньявирус Anopheles B
  • Бакау ортобуньявирус
  • Батайский ортобуньявирус
  • Батама ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус Bellavista
  • Беневидес ортобуньявирус
  • Бертиога ортобуньявирус
  • Бимити ортобуньявирус
  • Бирао ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус Botambi
  • Бозо ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус Буньямвера
  • Ортобуньявирус кустарника
  • Ортобуниавирус пуговичной ивы
  • Бвамба ортобуньявирус
  • Ортобуниавирус Cache Valley
  • Ортобуньявирус Cachoeira Porteira
  • Ортобуньявирус Калифорнийского энцефалита
  • Capim orthobunyavirus
  • Ортобуньявирус карапару
  • Кошка Que ортобуньявирус
  • Кату ортобуньявирус
  • Энсеада ортобуньявирус
  • Фейсис загон ортобуньявирус
  • Ортобунявирус форта Шерман
  • Гамбоа ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус гуахары
  • Гуама ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус гуароа
  • Яко ортобуньявирус
  • Илеша ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус Ingwavuma
  • Ортобуньявирус Джеймстаунского каньона
  • Ортобуньявирус ятобала
  • Kaeng Khoi orthobunyavirus
  • Кайри ортобуньявирус
  • Краеугольный ортобуниавирус
  • Кунгол ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус Ла-Кросс
  • Ортобуниавирус Leanyer
  • Lumbo orthbunyavirus
  • Ортобуньявирус макауа
  • Мадридский ортобуньявирус
  • Ортобуниавирус магуари
  • Ортобуниавирус главного стока
  • Manzanilla orthobunyavirus
  • Маритуба ортобуньявирус
  • Мелао ортобуньявирус
  • Ортобунявирус мермет
  • Минатитлан ортобуньявирус
  • MPoko orthobunyavirus
  • Няндо ортобуньявирус
  • Олифанцвлей ортобуньявирус
  • Орибока ортобуньявирус
  • Оропуш ортобуньявирус
  • Патуа ортобуньявирус
  • Ортобунявирус торфяника
  • Ортобунявирус Потоси
  • Сабо ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус Сан-Анджело
  • Санго ортобуньявирус
  • Ортобуниавирус Шмалленберга
  • Серра-ду-Навио ортобуньявирус
  • Шуни ортобуньявирус
  • Симбу ортобуньявирус
  • Заяц на снегоступах ортобунявирус
  • Соророка ортобуньявирус
  • Tacaiuma orthobunyavirus
  • Тахина ортобуньявирус
  • Татагинэ ортобуньявирус
  • Ортобунявирус Tensaw
  • Тете ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус тимири
  • Ортобуньявирус Тимботуа
  • Trivittatus orthobunyavirus
  • Ортобунявирус турлока
  • Утинга ортобуньявирус
  • Витватерсранд ортобуньявирус
  • Ортобуньявирус Волькберга
  • Виемия ортобуньявирус
  • Зегла ортобуньявирус

Организовано серогруппами [ править ]

Восемнадцать серогрупп были идентифицированы на основе результатов ингибирования перекрестной гемагглютинации и нейтрализации антител. Другой - Виемия - с тех пор был признан. Некоторые вирусы еще не отнесены к одной из серогрупп. Серогруппа Симбу является самой крупной и насчитывает не менее 25 членов. Серогруппа группы C состоит как минимум из 13 человек. Важные с медицинской точки зрения вирусы относятся к серогруппам Bwamba, Bunyamwera, California, Group C и Simbu.

Список видов и штаммов ортобнявируса по серогруппам


Вирусы по серогруппе:

Анофелес А серогруппы

  • Вирус Anopheles A
  • Вирус такайума
  • Вирус реки Вирджин
  • Комплекс Тромбетас
    • Вирус Аруматеуа
    • Вирус Караипе
    • Вирус тромбета
    • Вирус Тукуруи

Anopheles B серогруппы

  • Вирус Anopheles B
  • Вирус борацеи

Бакау серогруппа

  • Вирус Бакау
  • Вирус нола

Серогруппа Буньямвера

  • Вирус Бирао
  • Бозо вирус
  • Вирус Буньямвера
  • Вирус долины кешей
  • Вирус форта Шерман
  • Вирус Джермистон
  • Вирус гуароа
  • Вирус Илеши
  • Кайри вирус
  • Вирус Магуари
  • Вирус Main Drain
    • Локерн вирус
  • Вирус Northway
  • Playas вирус
  • Вирус Потоси
  • Вирус шокве
  • Стэнфилд вирус
  • Вирус Тенсо
  • Вирус Xingu
  • Батайский комплекс
    • Batai вирус
    • Чалово вирус
    • Chittoor вирус
  • Комплекс Нгари
    • Вирус Гарисса
    • КВ-141 вирус
    • Вирус Нгари

Бвамба серогруппа

  • Вирус Бвамба
  • Вирус понгола

Калифорнийская серогруппа

  • Вирус калифорнийского энцефалита
  • Вирус чатанги
  • Inkoo вирус
  • Вирус Джеймстаунского каньона
  • Вирус Джерри Слау
  • Keystone вирус
  • Хатангский вирус
  • Вирус Ла Кросса
  • Lumbo вирус
  • Вирус Мелао
  • Вирус Морро Бэй
  • Вирус Сан-Анджело
  • Серра-ду-Навио вирус
  • Вирус зайца-снегоступа
  • Вирус Саут-Ривер
  • Вирус тахина
  • Вирус Trivittatus

Капим серогруппа

  • Акара вирус
  • Беневидес вирус
  • Capim вирус

Серогруппа гамбоа

  • Вирус Алахуэла
  • Вирус гамбоа
    • 75V 2621 штамм вируса
  • Вирус Пуэбло Вьехо
  • Вирус Сан-Хуан

Группа C серогруппа

  • Вирус Bruconha
  • Осса вирус
  • Комплекс Карапару
    • Вирус апеу
    • Вирус Bruconha
    • Вирус Карапару
    • Винсес вирус
  • Мадридский комплекс
    • Мадридский вирус
    • Комплекс Маритуба
    • Гамбо-вирус лимбо
    • Вирус Маритуба
      • 63U-11 вируса штамма
    • Вирус Мурутюку
    • Непуйо вирус
    • Вирус Рестана
  • Орибока комплекс
    • Вирус Итаки
    • Орибока вирус

Серогруппа Гуама

  • Вирус ананиндеуа
  • Вирус Бертиога
  • Вирус Бимити
  • Вирус кананеи
  • Кату вирус
  • Вирус Ган Гана
  • Вирус Гуама
  • Вирус Гуаратуба
  • Итимирим вирус
  • Вирус гамака красного дерева
  • Вирус Мирим
  • Вирус Тимботуа
  • Вирус Трубанамана

Кунгол серогруппа

  • Кунгол вирус
  • Вонгал вирус

Маппутта серогруппа

  • Вирус Buffalo Creek
  • Вирус Маппутта
  • Вирус Маприк
  • Вирус Муррамбиджи
  • Вирус солевой золы

Минатитлан серогруппа

  • Вирус Минатитлан
  • Вирус Палестины

Ньяндо серогруппа

  • Вирус эретмаподитов
  • Вирус Нямдо

Олифанстлей серогруппа

  • Вирус Ботамби
  • Olifanstlei вирус

Патуа серогруппа

  • Вирус абраса
  • Вирус Бабахойо
  • Вирус Пахайоке
  • Патуа вирус
  • Вирус Shark River
  • Zegla вирус

Симбу серогруппа

  • Вирус Икитос
  • Вирус Ятобаль
  • Вирус Leanyer
  • Вирус Мермет
  • Оя вирус
  • Вирус тимири
  • Серокомплекс Акабане
    • Вирус Акабане
    • Вирус Тинару
  • Серокомплекс оропуша
    • Вирус Мадре де Диос (MDDV)
    • Вирус Оропуш
  • Серокомплекс Sathuperi
    • Вирус Дугласа
    • Вирус Sathuperi
  • Серокомплекс Шамонда
    • Вирус торфа
    • Вирус Шамонда
  • Серокомплекс шуни
    • Вирус Айно
    • Вирус шуни
  • Комплекс Симбу
    • Вирус Шмалленберга [19]
    • Симбу вирус

Тете серогруппа

  • Вирус Bahig
  • Вирус Батама
  • Вирус Матруха
  • Тете вирус
  • Цурусский вирус
  • Вирус Велдона

Серогруппа турлока

  • Кедах вирус
  • Вирус Леднице
  • M'Poko вирус
  • Вирус Turlock
  • Вирус Umbre

Виемия серогруппа

  • Вирус Анхемби
  • Вирус Cachoeira Porteira
  • Вирус Иако
  • Вирус макауа
  • Соророка вирус
  • Вирус Тайассуи
  • Вирус Тукундуба
  • Виемия вирус

Неклассифицированный

  • Вирус Батама
  • Вирус Беллависта
  • Вирус Бельмона
  • Энсеада вирус
  • Эстеро Реал вирус
  • Вирус Герберта
  • Jonchet вирус
  • Юрона вирус
  • Вирус Kaeng Khei
  • Вирус Кибале
  • Вирус Кованьяма
  • Вирус Mojuí dos Campos
  • Вирус Нтветве [20]
  • Вирус Taï
  • Tataguine вирус
  • Вирус Тринити
  • Вирус Витватерсранда
  • Вирус Волькберга
  • Вирус Якааба

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.» . talk.ictvonline.org . Международный комитет по таксономии вирусов . Дата обращения 6 мая 2020 .
  2. ^ Хьюз, HR; Адкинс, S; Альховский, С; Пиво, M; Блэр, C; Калишер, Швейцария; Дребот, М; Ламберт, AJ; де Соуза, штат Висконсин; Marklewitz, M; Nunes, MRT; Shí 石晓宏, X; Консорциум отчетов ICTV (январь 2020 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Peribunyaviridae " . Журнал общей вирусологии . 101 (1): 1-2. DOI : 10,1099 / jgv.0.001365 . PMC 7414433 . PMID 31846417 .  
  3. ^ a b "Отчет ICTV Peribunyaviridae" .
  4. ^ Smithburn KC, Haddow AJ, Mahaffy AF (март 1946 г.). «Нейротропный вирус, выделенный из комаров Aedes, пойманных в лесу Семлики». Американский журнал тропической медицины и гигиены . 26 (2): 189–208. DOI : 10.4269 / ajtmh.1946.s1-26.189 . OCLC 677158400 . PMID 21020339 .  
  5. Перейти ↑ Griffith C (2005). «Словарь ботанических эпитетов» . Словарь ботанических эпитетов . Проверено 31 января 2019 года . orthos orth adj ορϑοϛ прямо
  6. ^ "Международный комитет по таксономии вирусов, Bunyaviridae" . bio-mirror.cn . Архивировано из оригинала 9 сентября 2013 года . Проверено 20 декабря 2018 года .
  7. ^ a b c "Страница ViralZone" . viralzone.expasy.org . Проверено 20 декабря 2018 года .
  8. ^ Kascsak RJ, Lyons MJ (октябрь 1977). «Вирус Буньямвера. I. Молекулярная сложность РНК вириона». Вирусология . 82 (1): 37–47. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (77) 90030-7 . PMID 898678 . 
  9. ^ Б с д е е г ч я J K L Эванс А.Б., Петерсон КА (август 2019). «Выбросьте карту: нейропатогенез глобально расширяющейся калифорнийской серогруппы ортобуньявирусов» . Вирусы . 11 (9): 794. DOI : 10,3390 / v11090794 . PMC 6784171 . PMID 31470541 .  
  10. ^ Genbank: сегмент S вируса Bunyamwera, полная последовательность
  11. ^ Genbank: сегмент L вируса Bunyamwera, полная последовательность
  12. ^ a b Sakkas H, Bozidis P, Franks A, Papadopoulou C (апрель 2018 г.). «Лихорадка оропуша: обзор» . Вирусы . 10 (4): 175. DOI : 10,3390 / v10040175 . PMC 5923469 . PMID 29617280 .  
  13. ^ a b c d e f g h i j Elliott RM (октябрь 2014 г.). «Ортобунявирусы: последние генетические и структурные открытия» . Обзоры природы. Микробиология . 12 (10): 673–85. DOI : 10.1038 / nrmicro3332 . PMID 25198140 . 
  14. ↑ a b Wu P, Yu X, Wang P, Cheng G (март 2019). «Жизненный цикл арбовируса у комаров: приобретение, распространение и передача» . Обзоры экспертов в области молекулярной медицины . 21 : e1. DOI : 10.1017 / erm.2018.6 . PMID 30862324 . 
  15. ^ a b c d Дутузе М.Ф., Нзаирамбахо М., Морес С.Н., Кристоферсон Р.К. (2018-04-12). «Ортобунявирусы с потенциальными последствиями для здоровья» . Границы ветеринарии . 5 : 69. DOI : 10,3389 / fvets.2018.00069 . PMC 5906542 . PMID 29707545 .  
  16. ^ а б в г д Павайя Р.В., Гупта В.К. (21.11.2013). «Обзор инфекции вируса Шмалленберга: недавно возникшее заболевание крупного рогатого скота, овец и коз» . Veterinární Medicína . 58 (10): 516–526. DOI : 10,17221 / 7083-vetmed . ISSN 0375-8427 . 
  17. Zheng W, Tao YJ (май 2013 г.). «Инкапсидация генома нуклеопротеинами ортобуниавируса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (22): 8769–70. Bibcode : 2013PNAS..110.8769Z . DOI : 10.1073 / pnas.1306838110 . PMC 3670359 . PMID 23696659 .  
  18. ^ да Роса, Хорхе Фернандо Травассос; де Соуза, Уильям Марсель; де Паула Пиньейро, Франсиско; Фигейредо, Марио Луис; Кардосо, Джедсон Феррейра; Акрани, Густаво Ольшанский; Нуньес, Марсио Роберто Тейшейра (06.02.2017). «Вирус оропуша: клинические, эпидемиологические и молекулярные аспекты забытого ортобуньявируса» . Американский журнал тропической медицины и гигиены . 96 (5): 16–0672. DOI : 10.4269 / ajtmh.16-0672 . ISSN 0002-9637 . PMC 5417190 . PMID 28167595 .   
  19. ^ Nachrichten, n-tv. "Unbekanntes Virus entdeckt" . n-tv.de . Проверено 20 декабря 2018 года .
  20. ^ Эдридж А.В., Дейс М., Намаззи Р., Кристелла С., Джеббинк М.Ф., Маурер И. и др. (Январь 2019). «Новый ортобуньявирус, обнаруженный в спинномозговой жидкости ребенка из Уганды с тяжелой энцефалопатией» . Клинические инфекционные болезни . 68 (1): 139–142. DOI : 10,1093 / CID / ciy486 . PMC 6293039 . PMID 29893821 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Отчет ICTV : Peribunyaviridae
  • Viralzone : ортобуниавирус