Буньявиралес | |
---|---|
Вирион и цикл репликации вируса Крымско-Конго геморрагической лихорадки (CCHFV) | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Подтип: | Полипловирикотина |
Учебный класс: | Ellioviricetes |
Заказ: | Буньявиралес |
Семьи [1] | |
Bunyavirales - это отряд сегментированных вирусов РНК с отрицательной цепью, в основном с трехсторонним геномом. Вирусы-члены поражают членистоногих , растения , простейших и позвоночных . [2] Это единственный орден в классе Ellioviricetes . [3] Название Bunyavirales происходит от Bunyamwera , [4] гдевпервые был обнаруженоригинальный типовой вид Bunyamwera orthobunyavirus . [5] Ellioviricetes назван в честь покойного вирусолога Ричарда М. Эллиотта.за ранние работы над буньявирусами. [6]
Буньявирусы принадлежат к пятой группе системы классификации Балтимора , которая включает вирусы с негативный геном одноцепочечной РНК. У них есть сферический вирион с оболочкой . Хотя обычно они обнаруживаются у членистоногих или грызунов, некоторые вирусы в этом порядке иногда заражают людей. Некоторые из них также поражают растения. [7] Кроме того, существует группа буньявирусов, репликация которых ограничена членистоногими и известна как специфичные для насекомых буньявирусы. [8]
Большинство буньявирусов передаются переносчиками. За исключением хантавирусов и аренавирусов , все вирусы отряда Bunyavirales передаются членистоногими (комарами, клещами или москитами). Хантавирусы передаются при контакте с фекалиями грызунов . Заболеваемость инфекцией тесно связана с активностью переносчиков, например, вирусы, переносимые комарами, чаще встречаются летом. [7]
Инфицирование людей некоторыми представителями Bunyavirales , такими как ортонаировирус Крымско-Конго геморрагической лихорадки , связано с высокими уровнями заболеваемости и смертности, следовательно, обработка этих вирусов осуществляется в лабораториях с четвертым уровнем биобезопасности . Они также являются причиной сильной лихорадки с синдромом тромбоцитопении . [9]
Хантавирусы - еще один важный с медицинской точки зрения член отряда Bunyvirales . Они встречаются по всему миру и относительно распространены в Корее , Скандинавии (включая Финляндию ), России , западной части Северной Америки и некоторых частях Южной Америки. Хантавирусные инфекции связаны с высокой температурой, отеком легких и легочной недостаточностью. Уровень смертности значительно варьируется в зависимости от формы: до 50% для хантавирусов Нового Света (Америка), до 15% для хантавирусов Старого Света (Азия и Европа) и всего 0,1% для вируса Пуумала (в основном Скандинавия). ). [10] Реакция антител играет важную роль в снижении уровня виремии..
Вирусология [ править ]
Структура [ править ]
Морфология буниавирусов в чем-то похожа на морфологию семейства Paramyxoviridae ; Bunyavirales образуют обволакивающие сферические вирионы диаметром 80–120 нм . Эти вирусы не содержат матричных белков. [11]
Геном [ править ]
Буньявирусы имеют двух- или трехчастные геномы, состоящие из большого (L) и малого (s), или большого (L), среднего (M) и малого (S) сегментов РНК. Эти сегменты РНК являются одноцепочечными и существуют в спиральном образовании внутри вириона. Кроме того, они имеют псевдокруглую структуру из-за дополнительных концов каждого сегмента. Сегмент L кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу , необходимую для репликации вирусной РНК и синтеза мРНК. Сегмент M кодирует вирусные гликопротеины , которые выступают с поверхности вируса и помогают вирусу прикрепляться к клетке-хозяину и проникать в нее. Сегмент S кодирует белок нуклеокапсида (N). [12]
Большинство буньявирусов имеют сегменты L и M с отрицательным смыслом. S сегмент рода флебовирусы , [13] , и оба М и S сегмент рода Tospovirus является двусмысловыми . [14] Ambisense означает, что некоторые гены цепи РНК имеют отрицательный смысл, а другие - положительный смысл. S-сегмент ambisense кодирует вирусный нуклеопротеин (N) в отрицательном смысле и неструктурный белок (NS) в положительном смысле. Сегмент ambisense M кодирует гликопротеин (GP) в отрицательном смысле и неструктурный белок (NSm) в положительном смысле. [14]
Общий размер генома составляет от 10,5 до 22,7 т.п.н. . [15]
Жизненный цикл [ править ]
Геном амбисенса требует проведения двух раундов транскрипции. Во-первых, РНК с отрицательным смыслом транскрибируется с образованием мРНК и полноразмерного репликативного интермедиата. Из этого промежуточного продукта продуцируется субгеномная мРНК, кодирующая неструктурный белок малого сегмента, в то время как полимераза, полученная после первого раунда транскрипции, теперь может реплицировать полноразмерную РНК для получения вирусных геномов.
Буниавирусы реплицируются в цитоплазме , в то время как вирусные белки проходят через ER и аппарат Гольджи . Зрелые вирионы прорастают из аппарата Гольджи в пузырьки, которые транспортируются на поверхность клетки.
Трансмиссия [ править ]
Бунявирусы поражают членистоногих , растений , простейших и позвоночных . [2] Растения могут являться хозяевами буньявирусов из семейств Tospoviridae и Fimoviridae (например, томаты, голубиный горох, дыня, пшеница, малина, красная бутонница и роза). Члены некоторых семей насекомых специфические, например phasmavirids, впервые выделен из фантомных мошек , [16] , и с тех пор идентифицированы в различных насекомых , включая моли , ос и пчел , и других истинных мух .
Таксономия [ править ]
В настоящее время в этом порядке распознается 383 вида вирусов. [3] На диаграмме филогенетического дерева представлен полный список видов-членов и хозяев, которых они заражают. [2] Орден разделен на следующие 12 семейств: [3]
- Arenaviridae
- Cruliviridae
- Fimoviridae
- Hantaviridae
- Leishbuviridae
- Mypoviridae
- Nairoviridae
- Peribunyaviridae
- Phasmaviridae
- Phenuiviridae
- Tospoviridae
- Wupedeviridae
Заболевания человека [ править ]
Буньявирусы, вызывающие заболевания у людей, включают:
- Калифорнийский энцефалит вирус , Ли - Кросс вирус энцефалита , Джеймстаун вирус Каньона и вирус зайца снегоступов вектор: комары Семейства: Peribunyaviridae
- Резервуар хантавируса : мелкие млекопитающие или грызуны. Переносчик: аэрозольные экскременты этих млекопитающих. Семейство: Hantaviridae.
- Резервуар и переносчик Крымско-Конго геморрагической лихорадки : клещи, амплифицирующие хозяева и переносчик: мелкие млекопитающие, домашние млекопитающие Семейство Nairoviridae
- Резервуар лихорадки Рифт-Валли : летучие мыши. Переносчик : комары. Хозяева: мелкие, домашние. Семейство: Phenuiviridae.
- Резервуар лихорадки Бвамба : обезьяны Переносчик : комары, усиливающие хозяева: ослы Семейство: Peribunyaviridae
- Сильная лихорадка с синдромом тромбоцитопении
- Резервуар лихорадки Ласса и аргентинской геморрагической лихорадки : грызуны-переносчики: аэрозольные экскременты этих млекопитающих Семейство: Arenaviridae
Буньявирусы имеют сегментированные геномы, что делает их способными к быстрой рекомбинации и увеличивая риск вспышки. [17] Буньявирус, вызывающий тяжелую лихорадку с синдромом тромбоцитопении, может подвергаться рекомбинации как путем перегруппировки сегментов генома, так и путем внутригенной гомологичной рекомбинации . [18] [19] Bunyaviridae передаются гематофагами членистоногими, включая комаров, мошек, мух и клещей. Инкубационный период вируса составляет около 48 часов. Симптоматическая инфекция обычно вызывает неспецифические гриппоподобные симптомы с лихорадкой, продолжающейся около трех дней. Из-за их неспецифических симптомов, Буньявирусные инфекции часто принимают за другие болезни. Например, лихорадку Бвамба часто принимают за малярию. [20]
Профилактика [ править ]
Профилактика зависит от резервуара, размножающихся хозяев и от того, как передаются вирусы, т. Е. От переносчика, клещей или комаров и от того, какие животные вовлечены. Профилактические меры включают общую гигиену, ограничение контакта с переносчиками слюны, мочи, фекалий или постельных принадлежностей. Лицензированной вакцины против буньявирусов нет. В качестве мер предосторожности исследования вируса Cache Valley и хантавируса проводятся в BSL-2 (или выше), исследования вируса лихорадки Рифт-Валли проводятся в BSL-3 (или выше), исследования вируса конго-крымской геморрагической лихорадки проводятся в лабораториях BSL-4.
Хронология [ править ]
1940-е: в России открыта Крымско-Конго геморрагическая лихорадка
1951: 3000 случаев хантавируса были зарегистрированы в Южной Корее в 1951 году, когда силы ООН сражались на 38-й параллели во время Корейской войны.
1956: вирус Cache Valley изолирован у комаров Culiseta inornata в Юте.
1960: Вирус Ла-Кросс был впервые обнаружен в смертельном случае энцефалита в Ла-Кросс, штат Висконсин.
1977: вирус лихорадки Рифт-Валли стал причиной около 200000 случаев заболевания и 598 смертей в Египте.
2017: Создан заказ Bunyavirales
Ссылки [ править ]
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2018» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Октябрь 2018 . Проверено 30 января 2019 .
- ^ a b c Герат, Венура; Ромай, Густаво; Urrutia, Cesar D .; Верко, Жанмари (сентябрь 2020 г.). «Филогения на уровне семьи выявляют родственные связи вирусов растений в отряде Bunyavirales» . Вирусы . 12 (9): 1010. DOI : 10,3390 / v12091010 .
- ^ a b c Таксономия вирусов: выпуск 2018 г. , Международный комитет по таксономии вирусов , получено 2 декабря 2018 г.
- ^ «ICTV 9-й отчет (2011) Bunyaviridae » . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 31 января 2019 года .
Бунья: из Буньямвера, места в Уганде, где был выделен типовой вирус.
- ^ Смитберн, KC; Хаддоу, AJ; Mahaffy, AF (март 1946 г.). «Нейротропный вирус, выделенный из комаров Aedes, пойманных в лесу Семлики». Американский журнал тропической медицины и гигиены . s1-26 (2): 189–208. DOI : 10.4269 / ajtmh.1946.s1-26.189 . ISSN 1476-1645 . OCLC 677158400 . PMID 21020339 .
- ↑ Волк, Юрий; Крупович, Март; Чжан, Юн Чжэнь ; Маес, Пит; Доля, Валериан; Кунин, Евгений В .; Кун, Йенс Х. «Мегатаксономия вирусов с отрицательной РНК» (docx) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 12 января 2019 .
- ^ а б Плюснин, А; Эллиотт, Р.М., ред. (2011). Bunyaviridae: молекулярная и клеточная биология . Caister Academic Press . ISBN 978-1-904455-90-5.
- ^ Elrefaey, Ахмед МЭ; Абдельнаби, Рана; Росалес Росас, Ана Люсия; Ван, Ланьцзяо; Басу, Санджай; Деланг, Лин (сентябрь 2020 г.). «Понимание механизмов, лежащих в основе ограничения вирусов, специфичных для насекомых» . Вирусы . 12 (9): 964. DOI : 10,3390 / v12090964 . PMC 7552076 . PMID 32878245 .
- ^ Yu XJ, Liang MF, Zhang SY, et al. (Апрель 2011 г.). «Лихорадка с тромбоцитопенией, связанная с новым буньявирусом в Китае» . N. Engl. J. Med . 364 (16): 1523–32. DOI : 10.1056 / NEJMoa1010095 . PMC 3113718 . PMID 21410387 .
- ^ Вальтер Muranyi; Удо Бахр; Мартин Зайер; Фокко Й. ван дер Вуде (2005). «Хантавирусная инфекция» . Журнал Американского общества нефрологов . 16 (12): 3669–3679. DOI : 10,1681 / ASN.2005050561 . PMID 16267154 .
- ^ «Bunyaviridae - Вирусы с отрицательной РНК - Вирусы с отрицательной РНК (2011)» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 8 сентября 2020 .
- ^ Ариза, А .; Таннер, SJ; Уолтер, штат Коннектикут; Dent, KC; Шеперд, DA; Wu, W .; Мэтьюз, SV; Hiscox, JA; Грин, TJ (2013-06-01). «Структуры нуклеокапсидных белков из ортобуньявирусов раскрывают понимание архитектуры рибонуклеопротеидов и полимеризации РНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (11): 5912–5926. DOI : 10.1093 / NAR / gkt268 . ISSN 0305-1048 . PMC 3675483 . PMID 23595147 .
- ^ Эллиотт, Ричард М; Бреннан, Бенджамин (апрель 2014 г.). «Новые флебовирусы» . Текущее мнение в вирусологии . 5 (100): 50–57. DOI : 10.1016 / j.coviro.2014.01.011 . PMC 4031632 . PMID 24607799 .
- ^ а б Лима, РН; Де Оливейра, А.С.; Леастро, Миссури; Blawid, R .; Nagata, T .; Ресенде, РО; Мело, Флорида (7 июля 2016 г.). «Полный геном тосповируса вируса летального хлороза кабачков» . Журнал вирусологии . 13 (1): 123. DOI : 10,1186 / s12985-016-0577-4 . PMC 4936248 . PMID 27388209 .
- ^ "00.011. Bunyaviridae " . ICTVdB-База данных Вирус Универсальная, версия 4. 2006 . Проверено 1 января 2009 .
- ^ Баллинджер, MJ; Bruenn, JA; Хэй, Дж; Чеховский, Д; Тейлор, ди-джей (2014). «Открытие и эволюция буньявиридов у арктических фантомных мошек и древних буньявиридоподобных последовательностей в геномах насекомых» . J Virol . 88 (16): 8783–94. DOI : 10,1128 / JVI.00531-14 . PMC 4136290 . PMID 24850747 .
- ^ Хорн, Кейт МакЭлрой; Ванландингем, Дана Л. (13 ноября 2014 г.). «Взаимодействие буньявируса и вектора» . Вирусы . 6 (11): 4373–4397. DOI : 10,3390 / v6114373 . ISSN 1999-4915 . PMC 4246228 . PMID 25402172 .
- ^ Lv Q, Zhang H, Tian L, Zhang R, Zhang Z, Li J, Tong Y, Fan H, Carr MJ, Shi W. Новые суб-линии, рекомбинанты и реассортанты тяжелой лихорадки с вирусом синдрома тромбоцитопении. Клещи Tick Borne Dis. 2017 Март; 8 (3): 385-390. DOI: 10.1016 / j.ttbdis.2016.12.015. Epub 3 января 2017 г. PMID 28117273
- ↑ He CQ, Ding NZ. Обнаружение тяжелой лихорадки с синдромом тромбоцитопении штаммами буньявируса, происходящими в результате внутригенной рекомбинации. J Virol. 2012 ноя; 86 (22): 12426-30. DOI: 10.1128 / JVI.01317-12. Epub 2012 29 августа. PMID 22933273
- ^ Патрик Р. Мюррей, Кен С. Розенталь и Майкл А. Пфаллер (2008-12-24). Медицинская микробиология, 6д (6 изд.). Филадельфия: Мосби. ISBN 9780323054706.
Внешние ссылки [ править ]
- Вирусная зона : Bunyaviridae
- Индекс вирусов ICTVdb - Bunyaviridae
- Большая книга вирусов: Bunyaviridae
- Bunyaviridae Genomes - результаты поиска в базе данных Ресурсного центра по вирусной биоинформатике.
- База данных и анализ вирусных патогенов (ViPR): Bunyaviridae
- « Bunyaviridae » . Браузер таксономии NCBI . 11571.