Семейство пластоцианиновых белков, связывающих медь

Семейство пластоцианин / азурин медьсвязывающих белков (или синий (тип 1) медный домен) представляет собой семейство небольших белков, которые связывают один атом меди и которые характеризуются интенсивной полосой электронного поглощения около 600 нм (см. Белки меди ). ^[2]^[3] Наиболее известными представителями этого класса белков являются хлоропластические пластоцианы растений , которые обмениваются электронами с цитохромом с6, и отдаленно родственные бактериальные азурины , которые обмениваются электронами с цитохромом с551. Это семейство белков также включает амицианин из бактерий, таких как Methylobacterium extorquens илиParacoccus versutus (Thiobacillus versutus), которые могут расти на метиламине; аутичанины А и В из Chloroflexus aurantiacus ;^[4] белок голубой меди из Alcaligenes faecalis ; купредоксин (CPC) из кожуры Cucumis sativus (огурца);^[5] кузацианин (основной белок синего цвета; плантацианин, CBP) из огурца; галоцианин из Natronomonas pharaonis (Natronobacterium pharaonis)^[6] , ассоциированный с мембраной медьсвязывающий белок; псевдоазурин из Pseudomonas; рустицианин из Thiobacillus ferrooxidans ;^[7] стеллацианин из Rhus vernicifera.(Японское лаковое дерево); умецианин из корней Armoracia rusticana (Хрен); и аллерген Ra3 из амброзии. Этот белок пыльцы эволюционно связан с указанными выше белками, но, по-видимому, утратил способность связывать медь. Хотя существует значительная дивергенция в последовательностях всех этих белков, сайты лиганда меди сохранены.

Ссылки [ править ]

^ Guss JM, Bartunik HD, Freeman HC (декабрь 1992). «Точность и прецизионность анализа структуры белка: уточнение структуры пластоцианина тополя с ограничением по методу наименьших квадратов при разрешении 1,33 A». Acta Crystallogr. B . 48 (6): 790–811. DOI : 10.1107 / S0108768192004270 . PMID 1492962 .
^ Clingeleffer DJ, Guss JM, Роджерс SJ, Freeman HC, Garrett TP (1984). «Кристаллическая структура апопластоцианина тополя с разрешением 1,8-А. Геометрия сайта связывания меди создается полипептидом». J. Biol. Chem . 259 (5): 2822–2825. DOI : 10,2210 / pdb2pcy / PDB . PMID 6698995 .
^ Hunt LT, Райден LG (1993). «Эволюция белковой сложности: синие медьсодержащие оксидазы и родственные белки». J. Mol. Evol . 36 (1): 41–66. DOI : 10.1007 / BF02407305 . PMID 8433378 . S2CID 28527197 .
↑ Meyer TE, Han J, McManus JD, Brune DC, Sanders-Loehr J, Cusanovich MA, Tollin G, Blankenship RE (1992). «Выделение, характеристика и аминокислотные последовательности аравчанинов, белков голубой меди из зеленой фотосинтетической бактерии Chloroflexus aurantiacus». J. Biol. Chem . 267 (10): 6531–6540. PMID 1313011 .
^ Мессершмидт А, Манн К, Thoenes U, Мехрабьян Z, R Налбандяна, Schafer W (1992). «Аминокислотная последовательность белка меди типа I с необычным С-концевым доменом, богатым серином и гидроксипролином, выделенным из кожуры огурца» . FEBS Lett . 314 (3): 220–223. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (92) 81475-2 . PMID 1468551 . S2CID 24911765 .
^ Oesterhelt D, Mattar S, Scharf В, Родевальд К, М Энгельхард, Кент С. Б. (1994). «Первичная структура галоцианина, синего медного белка архей, предсказывает липидный якорь для фиксации мембраны». J. Biol. Chem . 269 (21): 14939–14945. PMID 8195126 .
^ Яно Т, Fukumori Y, Яманака Т (1991). «Аминокислотная последовательность рустицианина, выделенного из Thiobacillus ferrooxidans» . FEBS Lett . 288 (1): 159–162. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (91) 81025-4 . PMID 1879547 . S2CID 37485952 .

[pmid1492962-1] Guss JM, Bartunik HD, Freeman HC (декабрь 1992). «Точность и прецизионность анализа структуры белка: уточнение структуры пластоцианина тополя с ограничением по методу наименьших квадратов при разрешении 1,33 A». Acta Crystallogr. B . 48 (6): 790–811. DOI : 10.1107 / S0108768192004270 . PMID 1492962 .

[PUB00002400-2] Clingeleffer DJ, Guss JM, Роджерс SJ, Freeman HC, Garrett TP (1984). «Кристаллическая структура апопластоцианина тополя с разрешением 1,8-А. Геометрия сайта связывания меди создается полипептидом». J. Biol. Chem . 259 (5): 2822–2825. DOI : 10,2210 / pdb2pcy / PDB . PMID 6698995 .

[PUB00003425-3] Hunt LT, Райден LG (1993). «Эволюция белковой сложности: синие медьсодержащие оксидазы и родственные белки». J. Mol. Evol . 36 (1): 41–66. DOI : 10.1007 / BF02407305 . PMID 8433378 . S2CID 28527197 .

[PUB00002762-4] Meyer TE, Han J, McManus JD, Brune DC, Sanders-Loehr J, Cusanovich MA, Tollin G, Blankenship RE (1992). «Выделение, характеристика и аминокислотные последовательности аравчанинов, белков голубой меди из зеленой фотосинтетической бактерии Chloroflexus aurantiacus». J. Biol. Chem . 267 (10): 6531–6540. PMID 1313011 .

[PUB00001648-5] Мессершмидт А, Манн К, Thoenes U, Мехрабьян Z, R Налбандяна, Schafer W (1992). «Аминокислотная последовательность белка меди типа I с необычным С-концевым доменом, богатым серином и гидроксипролином, выделенным из кожуры огурца» . FEBS Lett . 314 (3): 220–223. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (92) 81475-2 . PMID 1468551 . S2CID 24911765 .

[PUB00002847-6] Oesterhelt D, Mattar S, Scharf В, Родевальд К, М Энгельхард, Кент С. Б. (1994). «Первичная структура галоцианина, синего медного белка архей, предсказывает липидный якорь для фиксации мембраны». J. Biol. Chem . 269 (21): 14939–14945. PMID 8195126 .

[PUB00001621-7] Яно Т, Fukumori Y, Яманака Т (1991). «Аминокислотная последовательность рустицианина, выделенного из Thiobacillus ferrooxidans» . FEBS Lett . 288 (1): 159–162. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (91) 81025-4 . PMID 1879547 . S2CID 37485952 .

[2]