Pyrobaculum

Эта статья требует дополнительных ссылок для проверки . Пожалуйста, помогите улучшить эту статью , добавив цитаты из надежных источников . Материал, не полученный от источника, может быть оспорен и удален. Найти источники:  «Pyrobaculum»  -  новости  · газеты  · книги  · ученый  · JSTOR ( июль 2012 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить это сообщение-шаблон )

Pyrobaculum является родом из Thermoproteaceae .

Описание и значение [ править ]

Как следует из латинского названия Pyrobaculum («огненная палка»), археон имеет форму стержня и изолирован от мест с высокими температурами. Он грамотрицательный, и его клетки окружены S-слоем белковых субъединиц.

P. aerophilum - гипертермофильный и метаболически разносторонний организм. В отличие от других гипертермофилов, он может жить в присутствии кислорода и эффективно расти в микроаэробных условиях.

Штамм WP30 Pyrobaculum yellowstonensis был получен из осадка элементарной серы (Joseph's Coat Hot Spring [JCHS], 80 ° C, pH 6,1, 135 мкМ As) в Йеллоустонском национальном парке (YNP), США, он является хемоорганогетеротрофом и требует элементарной серы и / или арсенат в качестве акцептора электронов. Рост в присутствии элементарной серы и арсената приводил к образованию тиоарсенатов и полисульфидов. Полный геном этого организма был секвенирован (1,99 МБ, 58% содержание G + C), что позволило выявить многочисленные метаболические пути деградации углеводов, аминокислот и липидов. Были идентифицированы множественные гены оксидоредуктазы диметилсульфоксид-молибдоптерин (DMSO-MPT), которые участвуют в восстановлении серы и мышьяка. Пути для de novoсинтез почти всех необходимых кофакторов и метаболитов. Сравнительная геномика P. yellowstonensis и собранная последовательность метагенома из JCHS показали, что этот организм сильно родственен (примерно 95% средней идентичности нуклеотидной последовательности) популяциям in situ . Физиологические свойства и метаболические возможности P. yellowstonensis обеспечивают важную основу для развития понимания распределения и функции этих популяций в YNP.

Структура генома [ править ]

Первым секвенированным видом Pyrobaculum был P. aerophilum . Его кольцевая геномная последовательность имеет длину 2222430 п.н. и содержит 2605 кодирующих белок последовательностей (CDS).

Строение клетки и метаболизм [ править ]

В анаэробных условиях археи восстанавливают нитраты до молекулярного азота через путь денитрификации. Большинство видов растут либо хемолитоавтотрофно за счет восстановления серы, либо органотрофно за счет дыхания серой или ферментации. Клетки имеют палочковидную форму с почти прямоугольными концами и имеют размер 1,5–8 * 0,5–0,6 мкм. Pyrobaculum подвижен из-за перитрихоподобного или биполярного политрихоза, его колонии имеют округлую форму, от серого до зеленовато-черного цвета. Эти виды являются либо факультативно аэробными, либо строго анаэробными. Рост наблюдался на дрожжевом экстракте, пептоне , экстракте мяса, но не на галактозе , глюкозе , мальтозе , крахмальном гликогене , этаноле., метанол , формамид , формиат , малат , пропионат , лактат , ацетат и казаминовые кислоты .

Первый из генетически секвенированных видов Pyrobaculum , P. aerophilum (палочковидный, 3–8 * 0,6 мкм), имеет редкую характеристику для архей, поскольку он способен к аэробному дыханию (aerophilum = «воздухолюбивый»). . Об этом свидетельствует тот факт, что археи росли только в присутствии кислорода, когда нитрат отсутствовал. Он дает круглые серовато-желтые колонии. Он использует как органические (максимальная плотность клеток наблюдалась при использовании сложных органических веществ, таких как дрожжевой экстракт, мясной экстракт, триптон и пептон в качестве субстратов), так и неорганические соединения во время аэробного и анаэробного дыхания. Также наблюдалось использование элементарной серы для роста. Кроме того, P. aerophilum растет при температуре от 75 до 104 ° C с оптимальной температурой роста 100 ° C.

Экология [ править ]

К настоящему времени штаммы Pyrobaculum выделены из нейтральных и слабощелочных кипящих солфатарных вод и мелководных морских гидротермальных систем. P. aerophilum был изолирован из кипящей морской воды на пляже Маронти, Искья, Италия. Дальнейшие исследования показывают, что P. aerophilum растет в строго анаэробных условиях с нитратом в качестве акцептора электронов. ^[1]

См. Также [ править ]

• Pyrobaculum asR3 малая РНК

Ссылки [ править ]

Дальнейшее чтение [ править ]

Научные журналы [ править ]

• Джей, З.Дж.; JP Beam; А. Дохналкова; Р. Ломайер; Б. Бодле; Б. Планер-Фридрих; М. Ромайн; WP Inskeep (2015). «Штамм WP30 Pyrobaculum yellowstonensis дышит элементарной серой и / или арсенатом в круговых сернистых геотермальных отложениях Йеллоустонского национального парка» . Прил. Environ. Microbiol . 81 (17): 5907–5916. DOI : 10,1128 / AEM.01095-15 . PMID  26092468 .
• Джей ZJ и Inskeep WP. (2015). «Распределение, разнообразие и важность интронов гена 16S рРНК в порядке Thermoproteales» . Биология Директ . 10 (35): 35. DOI : 10,1186 / s13062-015-0065-6 . PMC  4496867 . PMID  26156036 .
• Burggraf S; Huber H; Стеттер К.О. (1997). «Реклассификация порядков и семейств crenarchael в соответствии с данными последовательности 16S рРНК» . Int. J. Syst. Бактериол . 47 (3): 657–660. DOI : 10.1099 / 00207713-47-3-657 . PMID  9226896 .
• Huber R; Кристьянссон JK; Стеттер К.О. (1987). «Pyrobaculum gen. Nov., Новый род нейтрофильных палочковидных архебактерий из континентальных сольфатар, оптимально растущих при 100 ° C». Arch. Microbiol . 149 (2): 95–101. DOI : 10.1007 / BF00425072 .
• Zillig W; Стеттер К.О.; Schafer W; Janekovic D; и другие. (1981). «Thermoproteales: новый тип чрезвычайно термоацидофильных анаэробных архебактерий, выделенных из исландских сольфатар». Zentralbl. Микробиол. Parasitenkd. Инфектионскр. Hyg. Abt. 1 Ориг . C2 : 205–227.
• Lai, Lien B .; Чан, Патрисия П .; Cozen, Aaron E .; Берник, Дэвид Л .; и другие. (28 декабря 2010 г.). «Открытие минимальной формы РНКазы P в Pyrobaculum» . Труды Национальной академии наук . 107 (52): 22493–22498. Bibcode : 2010PNAS..10722493L . DOI : 10.1073 / pnas.1013969107 . PMC  3012483 . PMID  21135215 .
• Уэллс, Стивен А .; Креннелл, Сьюзен Дж .; Дэнсон, Майкл Дж. (Октябрь 2014 г.). «Структуры мезофильных и экстремофильных цитрат-синтаз демонстрируют жесткость и гибкость функции» (PDF) . Белки: структура, функции и биоинформатика . 82 (10): 2657–70. DOI : 10.1002 / prot.24630 . PMID  24948467 .

Научные книги [ править ]

Научные базы данных [ править ]

• Ссылки PubMed на Pyrobaculum
• Ссылки PubMed Central на Pyrobaculum
• Ссылки Google Scholar для Pyrobaculum

Внешние ссылки [ править ]

• Страница таксономии NCBI для Pyrobaculum
• Искать Pyrobaculum на страницах таксономии Tree of Life
• 2000 страниц для Pyrobaculum
• Страница MicrobeWiki, посвященная Pyrobaculum
• Страница LPSN для Pyrobaculum