| Кворум регуляторной РНК | |
|---|---|
 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | Qrr |
| Альт. Символы | Qrr1–5 |
| Рфам | RF00378 |
| Прочие данные | |
| Тип РНК | мРНК |
| Домен (ы) | Вибрион |
| Структуры PDB | PDBe |
Qrr (регуляторная РНК кворума) [1] представляет собой некодирующую РНК, которая, как полагают, участвует в регуляции восприятия кворума у видов Vibrio . Считается , что эти РНК, руководствуясь белком , Hfq , может опосредовать дестабилизацию кворумных зондирования мастер - регуляторов LuxR / HapR / Вант мРНК . [2] [3]
Qrr действует как часть цепи отрицательной обратной связи, которая регулирует изменение состояния клеток от состояния популяций с низкой плотностью к состоянию в популяциях с высокой плотностью. [4] У Vibrio harveyi Qrr связывает и подавляет экспрессию транскрипта мРНК luxR , главного регулятора генов, воспринимающих кворум. [5] При более высоких плотностях населения, увеличение аутоиндуктора концентрация приводит к прекращению Qrr транскрипции , следовательно , дерепрессия LuxR . [4]
Есть 5 различных Qrr генов (Qrr1-5) в В. harveyi ; из них qrr2, 3 и 4 активируются LuxR. [6]
Ссылки [ править ]
- ^ Ленц, DH; Mok KC; Лилли Б.Н.; Кулькарни Р.В.; Вингрин НС; Басслер Б.Л. (2004). «Малая РНК шаперон Hfq и множественные малые РНК контролируют кворум зондирования в Vibrio harveyi и Vibrio cholerae». Cell . 118 (1): 69–82. DOI : 10.1016 / j.cell.2004.06.009 . PMID 15242645 .
- ^ Svenningsen SL, Tu KC, Bassler BL (2009). «Компенсация дозы гена калибрует четыре регуляторных РНК для контроля чувствительности кворума холерного вибриона» . EMBO J . 28 (4): 429–439. DOI : 10.1038 / emboj.2008.300 . PMC 2632942 . PMID 19165149 .
- ^ Tu, K .; Waters, C .; Svenningsen, S .; Басслер, Б. (ноябрь 2008 г.). «Петля отрицательной обратной связи, опосредованная малой РНК, контролирует динамику восприятия кворума у Vibrio harveyi» . Молекулярная микробиология . 70 (4): 896–907. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2008.06452.x . ISSN 0950-382X . PMC 2680268 . PMID 18808382 .
- ^ a b Tu KC, Long T, Svenningsen SL, Wingreen NS, Bassler BL (2010). «Петли отрицательной обратной связи с участием малых регуляторных РНК точно контролируют реакцию кворума Vibrio harveyi» . Mol Cell . 37 (4): 567–579. DOI : 10.1016 / j.molcel.2010.01.022 . PMC 2844700 . PMID 20188674 .
- ^ Миямото, CM; Smith, EE; Swartzman, E; Цао, JG; Грэм, AF; Мейген, Э.А. (октябрь 1994 г.). «Проксимальный и дистальный сайты связывают LuxR независимо и активируют экспрессию оперона Vibrio harveyi lux». Молекулярная микробиология . 14 (2): 255–262. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1994.tb01286.x . PMID 7830570 .
- ^ Вт, KC; Waters, CM; Свеннингсен, SL; Басслер, Б.Л. (ноябрь 2008 г.). «Петля отрицательной обратной связи, опосредованная малой РНК, контролирует динамику восприятия кворума у Vibrio harveyi» . Молекулярная микробиология . 70 (4): 896–907. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2008.06452.x . PMC 2680268 . PMID 18808382 .
Дальнейшее чтение [ править ]
- Шао, Y; Басслер, BL (3 апреля 2014 г.). «Кворум регуляторных малых РНК подавляет секрецию типа VI у Vibrio cholerae» . Молекулярная микробиология . 92 (5): 921–930. DOI : 10.1111 / mmi.12599 . PMC 4038675 . PMID 24698180 .
Внешние ссылки [ править ]
- Страница для Qrr РНК в Rfam
