RybB представляет собой небольшую некодирующую РНК, идентифицированную при крупномасштабном скрининге Escherichia coli . [1] Функция этой короткой РНК была изучена с использованием транскриптомного подхода и кинетического анализа распада целевой мРНК in vivo . RybB был идентифицирован как фактор, который избирательно ускоряет распад нескольких основных мРНК omp при индукции стрессовой реакции оболочки. [2] Было показано, что эта РНК связывается с белком Hfq .
У сальмонелл экспериментально подтверждены прямые взаимодействия RybB со следующими мишенями: STM2391 ( fadL ), STM1070 ( ompA ), STM2267 ( ompC ), STM1572 ( ompD ), STM0999 ( ompF ), STM1473 ( ompN ), STM1995 ( ompS ). , STM1732 ( ompW ), STM0413 ( tsx ), STM0687 ( ybfM , chiP ) и STM1530. [3] [4] [5] [6]
В Escherichia coli экспериментально подтверждены прямые взаимодействия RybB со следующими мишенями: b0805 ( fiu ), b0721 ( sdhC ), b2215 ( ompC ), b1256 ( ompW ), b2594 ( rluD ) и b0081 ( mraZ ). [7] [8] [9] [10]