Последовательность Характеристика Вариант Тип (SFVT) относится к определенной вариации последовательности (мутация) данный признак последовательности в белке . Рассмотрим белок, его аминокислотная последовательность определяет его структуру и функцию. Некоторые области последовательности в первую очередь связаны с укладкой белка , то есть со структурой, в то время как другие области связаны с функцией белка , например с каталитическим сайтом фермента . У многих родственных видов, области в соответствующем белке будут оставаться консервативными от вида к виду, в то время как точная аминокислота в каждом месте может и часто изменяется. Чтобы четко проиллюстрировать как консервативную природу функциональных областей, так и точное изменение фактической аминокислоты, определен тип варианта признака последовательности.
Функция последовательности [ править ]
Признак последовательности - это в основном набор аминокислот в белке, где набор может представлять собой непрерывный диапазон или несколько дискретных остатков. Большинство характеристик последовательности взято из экспериментальных результатов, но есть некоторые из результатов вычислительного анализа.
Тип варианта элемента последовательности [ править ]
Для каждого признака последовательности существуют различия между многими белками разных родственных видов. Типы вариантов определяют точную аминокислоту в каждом месте функции. Чем больше мутация в каждом месте функции, тем больше у нее типов вариантов. Для данного белка после определения его аминокислотной последовательности определяется его вариантный тип признака последовательности.
Заявление [ править ]
SFVT можно использовать для изучения функций белков у многих родственных видов. Такие исследования были проведены на нескольких патогенах человека.
SFVT также доступны в базе данных исследований гриппа для белков гриппа и в базе данных вирусных патогенов и ресурсах для анализа вируса денге.
Внешние ссылки [ править ]
