Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из Streptomycete )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Streptomycetaceae являются семьей из Actinobacteria , что делает до монотипического подотряда Streptomycineae . Он включает важный род Streptomyces . Это был первоисточник многих антибиотиков , а именно стрептомицина , первого антибиотика против туберкулеза .

Геномика [ править ]

Выравнивание последовательностей геномов актинобактерий привело к идентификации трех консервативных инделей сигнатур, которые уникальны для порядка Streptomycetales. Фермент PBGD содержит четыре-амино-кислоты , вставку , которая присутствует во всех Streptomyces видов и Kitasatospora щетинками , но не какой - либо другой Actinobacteria. Точно так же вставка из одной аминокислоты присутствует в консервативной области аденилаткиназы и обнаруживается у всех видов Streptomyces и K. setae , но не обнаруживается ни у каких других актинобактерий. Также были идентифицированы пять консервативных сигнатурных белков, которые присутствуют в различных секвенированных Streptomyces.вид, но не у K. setae ; однако, поскольку полный геном K. setae еще не секвенирован, эти белки могут присутствовать в K. setae . Кроме того, было идентифицировано 11 консервативных сигнатурных белков, которые обнаруживаются у всех секвенированных видов Streptomyces и K. setae . Считается, что эти белки уникальны для отряда Streptomycetales, поэтому они обеспечивают молекулярные маркеры, которые можно использовать для отличия этой группы от остальных актинобактерий. Филогенетические деревья указывают на то, что отряд Catenulisporalesтесно связан с отрядом Streptomycetales. Этот вывод подтверждается консервативной сигнатурой indel, состоящей из одной аминокислоты, которая уникально обнаруживается у всех видов Streptomycetales и Catenulisporales acidiphilia , единственных видов Catenulisporales, полный геном которых был секвенирован. Кроме того, идентифицированы три консервативных сигнатурных белка, которые обнаруживаются у всех видов Streptomycetales и C. acidiphilia . Как консервативные сигнатуры indel, так и консервативные сигнатурные белки свидетельствуют о том, что отряды Streptomycetales и Catenulisporales тесно связаны. [1]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Gao, B .; Гупта, RS (2012). «Филогенетическая основа и молекулярные сигнатуры для основных кладов филума актинобактерий» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 76 (1): 66–112. DOI : 10.1128 / MMBR.05011-11 . PMC  3294427 . PMID  22390973 .

Внешние ссылки [ править ]